MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899a

Total Repeats: 4411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020060	GCG	2	6	27323	27328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228594
502	NC_020060	CGAAA	2	10	27337	27346	60 %	0 %	20 %	20 %	440228594
503	NC_020060	TGG	2	6	27369	27374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228594
504	NC_020060	TGC	2	6	27388	27393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228594
505	NC_020060	GC	3	6	27405	27410	0 %	0 %	50 %	50 %	440228594
506	NC_020060	TGG	2	6	27430	27435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228594
507	NC_020060	GGC	2	6	27469	27474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228594
508	NC_020060	TGC	2	6	27478	27483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228594
509	NC_020060	CGC	2	6	27493	27498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228594
510	NC_020060	GGAT	2	8	27510	27517	25 %	25 %	50 %	0 %	440228594
511	NC_020060	TTC	2	6	27548	27553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228594
512	NC_020060	CAT	2	6	27556	27561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228594
513	NC_020060	GGA	2	6	27572	27577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228594
514	NC_020060	CGT	2	6	27598	27603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228594
515	NC_020060	TGCGC	2	10	27661	27670	0 %	20 %	40 %	40 %	440228594
516	NC_020060	AAACC	2	10	27761	27770	60 %	0 %	0 %	40 %	440228594
517	NC_020060	GAATT	2	10	27795	27804	40 %	40 %	20 %	0 %	440228594
518	NC_020060	ACA	2	6	27809	27814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228594
519	NC_020060	GCA	2	6	27996	28001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228594
520	NC_020060	CA	3	6	28006	28011	50 %	0 %	0 %	50 %	440228594
521	NC_020060	GTCG	2	8	28126	28133	0 %	25 %	50 %	25 %	440228594
522	NC_020060	TCGA	2	8	28187	28194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_020060	TCGCCG	2	12	28419	28430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440228595
524	NC_020060	GCC	3	9	28451	28459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228595
525	NC_020060	TCAG	2	8	28493	28500	25 %	25 %	25 %	25 %	440228595
526	NC_020060	ACG	2	6	28676	28681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228595
527	NC_020060	CGC	2	6	28690	28695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228595
528	NC_020060	ATT	2	6	28760	28765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440228595
529	NC_020060	CGA	2	6	28768	28773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228595
530	NC_020060	TCG	2	6	28788	28793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228595
531	NC_020060	GGC	2	6	28979	28984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228595
532	NC_020060	GAG	2	6	29018	29023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228595
533	NC_020060	TGGA	2	8	29088	29095	25 %	25 %	50 %	0 %	440228595
534	NC_020060	GAC	2	6	29168	29173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228595
535	NC_020060	CTA	2	6	29203	29208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228595
536	NC_020060	GTC	2	6	29382	29387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020060	GTC	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020060	CGA	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020060	GGCC	2	8	29591	29598	0 %	0 %	50 %	50 %	440228596
540	NC_020060	TTCA	2	8	29649	29656	25 %	50 %	0 %	25 %	440228596
541	NC_020060	GCAC	2	8	29683	29690	25 %	0 %	25 %	50 %	440228596
542	NC_020060	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228596
543	NC_020060	GAT	2	6	29748	29753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228596
544	NC_020060	CGC	2	6	29857	29862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228596
545	NC_020060	AGC	2	6	29901	29906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228596
546	NC_020060	GTCC	2	8	29932	29939	0 %	25 %	25 %	50 %	440228596
547	NC_020060	TCG	2	6	29988	29993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_020060	GACC	2	8	30009	30016	25 %	0 %	25 %	50 %	440228597
549	NC_020060	CAT	2	6	30030	30035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228597
550	NC_020060	A	6	6	30052	30057	100 %	0 %	0 %	0 %	440228597
551	NC_020060	GCAA	2	8	30130	30137	50 %	0 %	25 %	25 %	440228597
552	NC_020060	TCC	2	6	30156	30161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228597
553	NC_020060	TCG	2	6	30202	30207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228597
554	NC_020060	CG	3	6	30250	30255	0 %	0 %	50 %	50 %	440228597
555	NC_020060	GA	3	6	30291	30296	50 %	0 %	50 %	0 %	440228597
556	NC_020060	CAG	2	6	30333	30338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228597
557	NC_020060	AGC	2	6	30361	30366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228597
558	NC_020060	TGCC	2	8	30450	30457	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
559	NC_020060	TGC	2	6	30487	30492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228597
560	NC_020060	TGCGGC	2	12	30524	30535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	440228597
561	NC_020060	ATCG	2	8	30545	30552	25 %	25 %	25 %	25 %	440228597
562	NC_020060	GAT	2	6	30566	30571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228597
563	NC_020060	CGG	2	6	30673	30678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228597
564	NC_020060	CGTC	2	8	30679	30686	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
565	NC_020060	GCG	2	6	30716	30721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228597
566	NC_020060	CCG	2	6	30832	30837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228597
567	NC_020060	GCG	2	6	30868	30873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228597
568	NC_020060	TCG	2	6	30919	30924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228597
569	NC_020060	TCGC	2	8	30975	30982	0 %	25 %	25 %	50 %	440228597
570	NC_020060	TCG	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228598
571	NC_020060	CGC	2	6	31121	31126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228598
572	NC_020060	CAAT	2	8	31162	31169	50 %	25 %	0 %	25 %	440228598
573	NC_020060	TCG	2	6	31206	31211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228598
574	NC_020060	AGC	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228598
575	NC_020060	TGA	2	6	31342	31347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228598
576	NC_020060	CCG	2	6	31406	31411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228598
577	NC_020060	CG	4	8	31440	31447	0 %	0 %	50 %	50 %	440228598
578	NC_020060	TCG	2	6	31470	31475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228598
579	NC_020060	GGC	2	6	31531	31536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228598
580	NC_020060	CGT	2	6	31540	31545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228598
581	NC_020060	GAA	2	6	31576	31581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440228598
582	NC_020060	TGC	2	6	31582	31587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228598
583	NC_020060	CCAT	2	8	31627	31634	25 %	25 %	0 %	50 %	440228598
584	NC_020060	GC	3	6	31648	31653	0 %	0 %	50 %	50 %	440228598
585	NC_020060	ATC	2	6	31686	31691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228598
586	NC_020060	CGA	2	6	31714	31719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228598
587	NC_020060	TGCG	2	8	31731	31738	0 %	25 %	50 %	25 %	440228598
588	NC_020060	AGG	2	6	31878	31883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	440228598
589	NC_020060	GACG	2	8	31932	31939	25 %	0 %	50 %	25 %	440228599
590	NC_020060	CGC	2	6	31993	31998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
591	NC_020060	CG	3	6	32119	32124	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
592	NC_020060	CG	3	6	32131	32136	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
593	NC_020060	CGC	2	6	32183	32188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
594	NC_020060	TC	3	6	32362	32367	0 %	50 %	0 %	50 %	440228599
595	NC_020060	ATCA	2	8	32494	32501	50 %	25 %	0 %	25 %	440228599
596	NC_020060	GGCG	2	8	32541	32548	0 %	0 %	75 %	25 %	440228599
597	NC_020060	GGAT	2	8	32557	32564	25 %	25 %	50 %	0 %	440228599
598	NC_020060	CGATCG	2	12	32567	32578	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	440228599
599	NC_020060	CGA	2	6	32593	32598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
600	NC_020060	AGC	2	6	32636	32641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
601	NC_020060	CGC	2	6	32652	32657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
602	NC_020060	GTC	2	6	32704	32709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
603	NC_020060	CGA	2	6	32754	32759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
604	NC_020060	AGC	2	6	32762	32767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228599
605	NC_020060	CGGC	2	8	32770	32777	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
606	NC_020060	CCT	2	6	32823	32828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228599
607	NC_020060	GATC	2	8	32905	32912	25 %	25 %	25 %	25 %	440228599
608	NC_020060	CGGC	2	8	32948	32955	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
609	NC_020060	TCT	2	6	33113	33118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440228599
610	NC_020060	CGT	2	6	33140	33145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
611	NC_020060	GGCC	2	8	33174	33181	0 %	0 %	50 %	50 %	440228599
612	NC_020060	GCG	3	9	33222	33230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
613	NC_020060	GTC	2	6	33260	33265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228599
614	NC_020060	TGA	2	6	33267	33272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228599
615	NC_020060	CGG	2	6	33312	33317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
616	NC_020060	CAA	2	6	33325	33330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440228599
617	NC_020060	GGT	2	6	33385	33390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440228599
618	NC_020060	GCC	2	6	33404	33409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228599
619	NC_020060	CCT	2	6	33423	33428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440228599
620	NC_020060	GCG	2	6	33475	33480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228599
621	NC_020060	CGA	2	6	33667	33672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020060	CGGG	2	8	33694	33701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
623	NC_020060	TCC	2	6	33783	33788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_020060	ACG	2	6	33789	33794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_020060	CGC	2	6	33857	33862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_020060	CGG	2	6	33957	33962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228600
627	NC_020060	CCTGTT	2	12	33965	33976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	440228600
628	NC_020060	GTC	2	6	33986	33991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
629	NC_020060	CGA	3	9	34015	34023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228600
630	NC_020060	CGC	2	6	34054	34059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440228600
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637	NC_020060	TGC	2	6	34284	34289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228600
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647	NC_020060	AGCA	2	8	34802	34809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
648	NC_020060	A	6	6	34829	34834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_020060	GACG	2	8	34970	34977	25 %	0 %	50 %	25 %	440228601
651	NC_020060	CGA	2	6	34993	34998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228601
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654	NC_020060	CG	3	6	35134	35139	0 %	0 %	50 %	50 %	440228601
655	NC_020060	TCG	2	6	35158	35163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228601
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662	NC_020060	CGG	2	6	35772	35777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228602
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670	NC_020060	ATCTCA	2	12	36334	36345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440228602
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729	NC_020060	TTTG	2	8	39933	39940	0 %	75 %	25 %	0 %	440228606
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744	NC_020060	GAT	2	6	40577	40582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440228606
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749	NC_020060	GC	3	6	40728	40733	0 %	0 %	50 %	50 %	440228607
750	NC_020060	GTC	2	6	40779	40784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228607
751	NC_020060	CGA	2	6	40946	40951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440228607
752	NC_020060	GCG	2	6	40966	40971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228607
753	NC_020060	GACG	2	8	40988	40995	25 %	0 %	50 %	25 %	440228607
754	NC_020060	CGG	2	6	41005	41010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440228607
755	NC_020060	ATCGT	2	10	41121	41130	20 %	40 %	20 %	20 %	440228607
756	NC_020060	CCTG	2	8	41134	41141	0 %	25 %	25 %	50 %	440228607
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760	NC_020060	CTG	2	6	41301	41306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440228607
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888	NC_020060	GA	3	6	47909	47914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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