MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899

Total Repeats: 86090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020059	CGG	2	6	238971	238976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225100
5502	NC_020059	GAT	2	6	239040	239045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225100
5503	NC_020059	ATT	2	6	239060	239065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	440225100
5504	NC_020059	CGC	2	6	239114	239119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225100
5505	NC_020059	GCT	2	6	239147	239152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5506	NC_020059	CGG	2	6	239163	239168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225100
5507	NC_020059	CGA	2	6	239217	239222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5508	NC_020059	CGCC	2	8	239241	239248	0 %	0 %	25 %	75 %	440225100
5509	NC_020059	CGT	2	6	239307	239312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5510	NC_020059	CGG	2	6	239346	239351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225100
5511	NC_020059	TCT	2	6	239361	239366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225100
5512	NC_020059	GTC	2	6	239391	239396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5513	NC_020059	CTG	2	6	239416	239421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5514	NC_020059	ATC	2	6	239422	239427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225100
5515	NC_020059	TGC	2	6	239435	239440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5516	NC_020059	TTC	2	6	239449	239454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225100
5517	NC_020059	TCG	2	6	239495	239500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5518	NC_020059	GC	3	6	239508	239513	0 %	0 %	50 %	50 %	440225100
5519	NC_020059	GC	3	6	239527	239532	0 %	0 %	50 %	50 %	440225100
5520	NC_020059	GC	3	6	239547	239552	0 %	0 %	50 %	50 %	440225100
5521	NC_020059	CAA	2	6	239571	239576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	440225100
5522	NC_020059	CAT	2	6	239583	239588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225100
5523	NC_020059	CTG	2	6	239599	239604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5524	NC_020059	CAC	2	6	239661	239666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	440225100
5525	NC_020059	GCC	2	6	239700	239705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225100
5526	NC_020059	CTT	2	6	239781	239786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225100
5527	NC_020059	GCT	2	6	239808	239813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225100
5528	NC_020059	GCT	2	6	239888	239893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5529	NC_020059	TCA	2	6	239921	239926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225101
5530	NC_020059	GGGC	2	8	239927	239934	0 %	0 %	75 %	25 %	440225101
5531	NC_020059	TCCGGC	2	12	240006	240017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	440225101
5532	NC_020059	TCCG	2	8	240059	240066	0 %	25 %	25 %	50 %	440225101
5533	NC_020059	GC	3	6	240134	240139	0 %	0 %	50 %	50 %	440225101
5534	NC_020059	GAT	2	6	240161	240166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225101
5535	NC_020059	TCGA	2	8	240204	240211	25 %	25 %	25 %	25 %	440225101
5536	NC_020059	CG	3	6	240263	240268	0 %	0 %	50 %	50 %	440225101
5537	NC_020059	CGG	2	6	240350	240355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225101
5538	NC_020059	CCAGCG	2	12	240356	240367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440225101
5539	NC_020059	TGA	2	6	240370	240375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225101
5540	NC_020059	CGA	2	6	240416	240421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5541	NC_020059	CGA	2	6	240424	240429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5542	NC_020059	TGC	2	6	240469	240474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5543	NC_020059	CA	3	6	240488	240493	50 %	0 %	0 %	50 %	440225101
5544	NC_020059	TCA	2	6	240511	240516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225101
5545	NC_020059	TCG	2	6	240580	240585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5546	NC_020059	GCA	2	6	240620	240625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225101
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5548	NC_020059	CG	3	6	240658	240663	0 %	0 %	50 %	50 %	440225101
5549	NC_020059	GCC	2	6	240668	240673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225101
5550	NC_020059	GGT	2	6	240695	240700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225101
5551	NC_020059	GTC	2	6	240759	240764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5552	NC_020059	GGCC	2	8	240806	240813	0 %	0 %	50 %	50 %	440225101
5553	NC_020059	CGT	2	6	240824	240829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5554	NC_020059	TCC	2	6	240885	240890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225101
5555	NC_020059	GGT	2	6	240971	240976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225101
5556	NC_020059	GTCG	2	8	241013	241020	0 %	25 %	50 %	25 %	440225101
5557	NC_020059	ATC	2	6	241026	241031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225101
5558	NC_020059	CGCT	2	8	241056	241063	0 %	25 %	25 %	50 %	440225101
5559	NC_020059	CTG	2	6	241091	241096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5560	NC_020059	ATCC	2	8	241120	241127	25 %	25 %	0 %	50 %	440225101
5561	NC_020059	GCCAGC	2	12	241162	241173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	440225101
5562	NC_020059	CGA	2	6	241223	241228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5563	NC_020059	GGT	2	6	241265	241270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225101
5564	NC_020059	GCA	2	6	241289	241294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5565	NC_020059	TCA	2	6	241318	241323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225101
5566	NC_020059	GTG	2	6	241338	241343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225101
5567	NC_020059	GTC	2	6	241386	241391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5568	NC_020059	CCG	2	6	241405	241410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225101
5569	NC_020059	GA	3	6	241427	241432	50 %	0 %	50 %	0 %	440225101
5570	NC_020059	GCT	2	6	241448	241453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225101
5571	NC_020059	GCC	3	9	241455	241463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225101
5572	NC_020059	CCG	2	6	241486	241491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225101
5573	NC_020059	ACC	2	6	241508	241513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_020059	TCG	2	6	241539	241544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225102
5575	NC_020059	GCA	2	6	241605	241610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225102
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5577	NC_020059	GC	3	6	241699	241704	0 %	0 %	50 %	50 %	440225102
5578	NC_020059	TCT	2	6	241722	241727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225102
5579	NC_020059	GCG	2	6	241731	241736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225102
5580	NC_020059	TCGAT	2	10	241743	241752	20 %	40 %	20 %	20 %	440225102
5581	NC_020059	GCCT	2	8	241767	241774	0 %	25 %	25 %	50 %	440225102
5582	NC_020059	CGT	2	6	241783	241788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225102
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5584	NC_020059	GCA	2	6	241906	241911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225102
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5586	NC_020059	GCA	2	6	242025	242030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225102
5587	NC_020059	GCC	2	6	242063	242068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225102
5588	NC_020059	GC	3	6	242087	242092	0 %	0 %	50 %	50 %	440225102
5589	NC_020059	GAC	2	6	242131	242136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225102
5590	NC_020059	T	6	6	242157	242162	0 %	100 %	0 %	0 %	440225102
5591	NC_020059	GCCG	2	8	242210	242217	0 %	0 %	50 %	50 %	440225102
5592	NC_020059	CGG	2	6	242272	242277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225102
5593	NC_020059	TCA	3	9	242346	242354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225102
5594	NC_020059	CGC	2	6	242355	242360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225102
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5596	NC_020059	GCA	2	6	242443	242448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225102
5597	NC_020059	TGG	3	9	242490	242498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_020059	TTTC	2	8	242559	242566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_020059	T	6	6	242590	242595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_020059	CGG	2	6	242634	242639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_020059	ATC	2	6	242739	242744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225103
5602	NC_020059	TGC	2	6	242782	242787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5603	NC_020059	GAT	2	6	242789	242794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225103
5604	NC_020059	CGA	2	6	242873	242878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5605	NC_020059	AAG	2	6	242928	242933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225103
5606	NC_020059	GAT	2	6	242936	242941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225103
5607	NC_020059	CTGG	2	8	242942	242949	0 %	25 %	50 %	25 %	440225103
5608	NC_020059	CG	3	6	242970	242975	0 %	0 %	50 %	50 %	440225103
5609	NC_020059	GGAA	2	8	243082	243089	50 %	0 %	50 %	0 %	440225103
5610	NC_020059	ACG	2	6	243090	243095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5611	NC_020059	ATC	2	6	243120	243125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225103
5612	NC_020059	CGCTCC	2	12	243135	243146	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	440225103
5613	NC_020059	CG	3	6	243192	243197	0 %	0 %	50 %	50 %	440225103
5614	NC_020059	CCG	2	6	243269	243274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225103
5615	NC_020059	GAAG	2	8	243317	243324	50 %	0 %	50 %	0 %	440225103
5616	NC_020059	TGC	2	6	243358	243363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5617	NC_020059	CGC	2	6	243422	243427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225103
5618	NC_020059	A	6	6	243437	243442	100 %	0 %	0 %	0 %	440225103
5619	NC_020059	TGC	2	6	243475	243480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5620	NC_020059	GGC	2	6	243501	243506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225103
5621	NC_020059	TCG	2	6	243514	243519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5622	NC_020059	TGC	2	6	243520	243525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5623	NC_020059	CTTC	2	8	243544	243551	0 %	50 %	0 %	50 %	440225103
5624	NC_020059	GCG	2	6	243622	243627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225103
5625	NC_020059	AGA	2	6	243628	243633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225103
5626	NC_020059	TGG	2	6	243642	243647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	440225103
5627	NC_020059	AAG	2	6	243648	243653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225103
5628	NC_020059	GCT	2	6	243677	243682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225103
5629	NC_020059	TCT	2	6	243685	243690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225103
5630	NC_020059	TCGATG	2	12	243700	243711	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	440225103
5631	NC_020059	CAT	2	6	243713	243718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	440225103
5632	NC_020059	TTGG	2	8	243760	243767	0 %	50 %	50 %	0 %	440225103
5633	NC_020059	CCGA	2	8	243804	243811	25 %	0 %	25 %	50 %	440225103
5634	NC_020059	CGGC	3	12	243863	243874	0 %	0 %	50 %	50 %	440225103
5635	NC_020059	TTC	2	6	243942	243947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225103
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5637	NC_020059	GAA	2	6	244091	244096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5638	NC_020059	TCCG	2	8	244120	244127	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5639	NC_020059	GCT	2	6	244156	244161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225104
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5642	NC_020059	GGC	2	6	244332	244337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225104
5643	NC_020059	CGGCG	2	10	244341	244350	0 %	0 %	60 %	40 %	440225104
5644	NC_020059	CCG	2	6	244351	244356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225104
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5646	NC_020059	CCG	2	6	244568	244573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225104
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5652	NC_020059	CGA	2	6	244688	244693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225104
5653	NC_020059	CG	3	6	244697	244702	0 %	0 %	50 %	50 %	440225104
5654	NC_020059	CGC	2	6	244733	244738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225104
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5660	NC_020059	GGC	3	9	245007	245015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225104
5661	NC_020059	CAG	2	6	245137	245142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5662	NC_020059	GGC	2	6	245173	245178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5663	NC_020059	AAG	2	6	245266	245271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5664	NC_020059	GAA	2	6	245284	245289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5665	NC_020059	GGC	2	6	245297	245302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5666	NC_020059	T	6	6	245325	245330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5667	NC_020059	CCG	2	6	245399	245404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	440225105
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5684	NC_020059	CGG	2	6	246059	246064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225105
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5693	NC_020059	TCGC	2	8	246582	246589	0 %	25 %	25 %	50 %	440225105
5694	NC_020059	CGG	2	6	246598	246603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225105
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5702	NC_020059	GTC	2	6	246848	246853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225105
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5743	NC_020059	CGG	2	6	248553	248558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5744	NC_020059	TTC	2	6	248588	248593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5745	NC_020059	CAA	2	6	248632	248637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5746	NC_020059	A	6	6	248666	248671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5747	NC_020059	CGAT	2	8	248721	248728	25 %	25 %	25 %	25 %	440225107
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5861	NC_020059	GTTT	2	8	253655	253662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5862	NC_020059	GAA	2	6	253688	253693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	440225113
5863	NC_020059	AGC	2	6	253695	253700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225113
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5986	NC_020059	TCC	2	6	259030	259035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225119
5987	NC_020059	TCC	2	6	259051	259056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	440225119
5988	NC_020059	GCG	2	6	259059	259064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225119
5989	NC_020059	CGA	2	6	259145	259150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	440225119
5990	NC_020059	CTT	2	6	259194	259199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	440225119
5991	NC_020059	ATCACG	2	12	259276	259287	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	440225119
5992	NC_020059	TCG	2	6	259335	259340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225119
5993	NC_020059	GCG	2	6	259421	259426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5994	NC_020059	CGCT	2	8	259428	259435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5995	NC_020059	GAG	2	6	259437	259442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_020059	ATG	2	6	259457	259462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	440225120
5997	NC_020059	CGG	3	9	259473	259481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	440225120
5998	NC_020059	CCTTC	2	10	259578	259587	0 %	40 %	0 %	60 %	440225120
5999	NC_020059	TCG	2	6	259629	259634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225120
6000	NC_020059	CTG	2	6	259639	259644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	440225120

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