MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019679	CT	3	6	821	826	0 %	50 %	0 %	50 %	427740401
2	NC_019679	CA	3	6	2549	2554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_019679	TA	3	6	2918	2923	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
4	NC_019679	AT	3	6	3014	3019	50 %	50 %	0 %	0 %	427740408
5	NC_019679	AT	3	6	3125	3130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019679	AT	3	6	3339	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	427740409
7	NC_019679	AC	3	6	3655	3660	50 %	0 %	0 %	50 %	427740409
8	NC_019679	TA	3	6	4946	4951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019679	AC	3	6	5154	5159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_019679	AT	3	6	5228	5233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019679	AT	3	6	5274	5279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019679	AT	3	6	5409	5414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019679	AT	3	6	5455	5460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019679	GT	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019679	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019679	AT	3	6	6843	6848	50 %	50 %	0 %	0 %	427740413
17	NC_019679	GA	3	6	7199	7204	50 %	0 %	50 %	0 %	427740413
18	NC_019679	AT	3	6	8066	8071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019679	TA	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	427740416
20	NC_019679	TA	3	6	11006	11011	50 %	50 %	0 %	0 %	427740416
21	NC_019679	CA	3	6	11232	11237	50 %	0 %	0 %	50 %	427740416
22	NC_019679	AG	3	6	11956	11961	50 %	0 %	50 %	0 %	427740416
23	NC_019679	TC	3	6	12545	12550	0 %	50 %	0 %	50 %	427740417
24	NC_019679	CT	3	6	12678	12683	0 %	50 %	0 %	50 %	427740417
25	NC_019679	TA	3	6	12999	13004	50 %	50 %	0 %	0 %	427740417
26	NC_019679	AG	3	6	13201	13206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019679	GA	4	8	13239	13246	50 %	0 %	50 %	0 %	427740418
28	NC_019679	AT	3	6	13832	13837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019679	AT	3	6	13900	13905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019679	AT	3	6	16619	16624	50 %	50 %	0 %	0 %	427740422
31	NC_019679	TA	3	6	19450	19455	50 %	50 %	0 %	0 %	427740424
32	NC_019679	TG	3	6	19858	19863	0 %	50 %	50 %	0 %	427740425
33	NC_019679	CT	3	6	20403	20408	0 %	50 %	0 %	50 %	427740426
34	NC_019679	CT	3	6	20683	20688	0 %	50 %	0 %	50 %	427740427
35	NC_019679	AC	3	6	21249	21254	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019679	CA	3	6	21544	21549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019679	AT	3	6	21978	21983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019679	TA	3	6	22689	22694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019679	AG	3	6	22707	22712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019679	TA	3	6	23163	23168	50 %	50 %	0 %	0 %	427740430
41	NC_019679	CT	3	6	23296	23301	0 %	50 %	0 %	50 %	427740430
42	NC_019679	GA	3	6	23432	23437	50 %	0 %	50 %	0 %	427740430
43	NC_019679	AT	3	6	23445	23450	50 %	50 %	0 %	0 %	427740430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.