MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 6300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TGGAA	2	10	2833	2842	40 %	20 %	40 %	0 %	427733621
2	NC_019678	TGTTT	2	10	4560	4569	0 %	80 %	20 %	0 %	427733622
3	NC_019678	GAATT	2	10	4604	4613	40 %	40 %	20 %	0 %	427733622
4	NC_019678	CAATC	2	10	11054	11063	40 %	20 %	0 %	40 %	427733627
5	NC_019678	AATAC	2	10	11374	11383	60 %	20 %	0 %	20 %	427733627
6	NC_019678	TAATC	2	10	12812	12821	40 %	40 %	0 %	20 %	427733628
7	NC_019678	AAATA	2	10	13580	13589	80 %	20 %	0 %	0 %	427733629
8	NC_019678	GATGA	2	10	16783	16792	40 %	20 %	40 %	0 %	427733630
9	NC_019678	TGATT	2	10	17645	17654	20 %	60 %	20 %	0 %	427733631
10	NC_019678	TAAAT	2	10	19131	19140	60 %	40 %	0 %	0 %	427733633
11	NC_019678	AGCGA	2	10	27516	27525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_019678	TAATT	2	10	30359	30368	40 %	60 %	0 %	0 %	427733642
13	NC_019678	CTCTT	2	10	30431	30440	0 %	60 %	0 %	40 %	427733642
14	NC_019678	ACGTC	2	10	32330	32339	20 %	20 %	20 %	40 %	427733642
15	NC_019678	TGCCG	2	10	40081	40090	0 %	20 %	40 %	40 %	427733649
16	NC_019678	CATTT	2	10	40160	40169	20 %	60 %	0 %	20 %	427733649
17	NC_019678	TTAAG	2	10	41148	41157	40 %	40 %	20 %	0 %	427733651
18	NC_019678	CAATC	2	10	44027	44036	40 %	20 %	0 %	40 %	427733654
19	NC_019678	TTTAG	2	10	44423	44432	20 %	60 %	20 %	0 %	427733654
20	NC_019678	GTAGT	2	10	45015	45024	20 %	40 %	40 %	0 %	427733654
21	NC_019678	GCAAC	2	10	45206	45215	40 %	0 %	20 %	40 %	427733654
22	NC_019678	AAATC	2	10	45257	45266	60 %	20 %	0 %	20 %	427733654
23	NC_019678	ACAAA	2	10	46605	46614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019678	TTGAT	2	10	48100	48109	20 %	60 %	20 %	0 %	427733656
25	NC_019678	AAATA	2	10	48670	48679	80 %	20 %	0 %	0 %	427733656
26	NC_019678	AAAAC	2	10	50826	50835	80 %	0 %	0 %	20 %	427733658
27	NC_019678	ACCTT	2	10	51232	51241	20 %	40 %	0 %	40 %	427733658
28	NC_019678	TAATT	2	10	51583	51592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019678	ACAGT	2	10	53997	54006	40 %	20 %	20 %	20 %	427733660
30	NC_019678	GGTTG	2	10	54741	54750	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019678	GTTCT	2	10	55535	55544	0 %	60 %	20 %	20 %	427733662
32	NC_019678	GCTTA	2	10	56074	56083	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_019678	ATATT	2	10	56865	56874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019678	TAAAT	2	10	60314	60323	60 %	40 %	0 %	0 %	427733665
35	NC_019678	TTTCT	2	10	60482	60491	0 %	80 %	0 %	20 %	427733666
36	NC_019678	ATTCA	2	10	61172	61181	40 %	40 %	0 %	20 %	427733667
37	NC_019678	AAAAG	2	10	61510	61519	80 %	0 %	20 %	0 %	427733667
38	NC_019678	TATTT	2	10	62825	62834	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019678	CTAAG	2	10	68924	68933	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019678	TTTTC	2	10	70145	70154	0 %	80 %	0 %	20 %	427733674
41	NC_019678	TTGTT	2	10	71480	71489	0 %	80 %	20 %	0 %	427733675
42	NC_019678	GTTTA	2	10	71662	71671	20 %	60 %	20 %	0 %	427733675
43	NC_019678	GTTTT	2	10	71793	71802	0 %	80 %	20 %	0 %	427733675
44	NC_019678	ATTAG	2	10	73763	73772	40 %	40 %	20 %	0 %	427733677
45	NC_019678	GAAAA	2	10	76707	76716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019678	TTTAC	2	10	79751	79760	20 %	60 %	0 %	20 %	427733684
47	NC_019678	TACGG	2	10	80214	80223	20 %	20 %	40 %	20 %	427733684
48	NC_019678	GAAGT	2	10	80292	80301	40 %	20 %	40 %	0 %	427733684
49	NC_019678	TTTAC	2	10	80390	80399	20 %	60 %	0 %	20 %	427733684
50	NC_019678	TATTT	2	10	81015	81024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019678	TAATT	2	10	81776	81785	40 %	60 %	0 %	0 %	427733685
52	NC_019678	ATGCC	2	10	82606	82615	20 %	20 %	20 %	40 %	427733686
53	NC_019678	TTGTT	2	10	84079	84088	0 %	80 %	20 %	0 %	427733687
54	NC_019678	AATAA	2	10	84573	84582	80 %	20 %	0 %	0 %	427733687
55	NC_019678	ACTTA	2	10	84898	84907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019678	GTTTT	2	10	86287	86296	0 %	80 %	20 %	0 %	427733688
57	NC_019678	TAAAA	2	10	86813	86822	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019678	ATTAA	2	10	86832	86841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019678	ATTTC	2	10	87133	87142	20 %	60 %	0 %	20 %	427733689
60	NC_019678	ACTTT	2	10	89718	89727	20 %	60 %	0 %	20 %	427733691
61	NC_019678	ATATA	2	10	90570	90579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019678	CCTTT	2	10	90975	90984	0 %	60 %	0 %	40 %	427733692
63	NC_019678	CGTTG	2	10	91587	91596	0 %	40 %	40 %	20 %	427733693
64	NC_019678	AAGTA	2	10	92551	92560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019678	CGAAT	2	10	94436	94445	40 %	20 %	20 %	20 %	427733696
66	NC_019678	TTGTC	2	10	96920	96929	0 %	60 %	20 %	20 %	427733698
67	NC_019678	CATGT	2	10	100694	100703	20 %	40 %	20 %	20 %	427733702
68	NC_019678	CTTTT	2	10	102455	102464	0 %	80 %	0 %	20 %	427733703
69	NC_019678	TTGAT	2	10	102963	102972	20 %	60 %	20 %	0 %	427733703
70	NC_019678	AATCA	2	10	103595	103604	60 %	20 %	0 %	20 %	427733704
71	NC_019678	AGAAA	2	10	103891	103900	80 %	0 %	20 %	0 %	427733704
72	NC_019678	GCATT	2	10	103963	103972	20 %	40 %	20 %	20 %	427733704
73	NC_019678	TCGGT	2	10	104393	104402	0 %	40 %	40 %	20 %	427733704
74	NC_019678	TTATG	2	10	107087	107096	20 %	60 %	20 %	0 %	427733706
75	NC_019678	TCAAG	2	10	113864	113873	40 %	20 %	20 %	20 %	427733710
76	NC_019678	TGCCG	2	10	116424	116433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_019678	TTTCC	2	10	116597	116606	0 %	60 %	0 %	40 %	427733712
78	NC_019678	ATTCC	2	10	118908	118917	20 %	40 %	0 %	40 %	427733714
79	NC_019678	TTTCA	2	10	119288	119297	20 %	60 %	0 %	20 %	427733715
80	NC_019678	TACAA	2	10	119471	119480	60 %	20 %	0 %	20 %	427733715
81	NC_019678	TAGTT	2	10	120275	120284	20 %	60 %	20 %	0 %	427733715
82	NC_019678	AAATT	2	10	120361	120370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019678	CAGCC	2	10	120759	120768	20 %	0 %	20 %	60 %	427733716
84	NC_019678	ATTGC	2	10	120797	120806	20 %	40 %	20 %	20 %	427733716
85	NC_019678	GTAAA	2	10	121069	121078	60 %	20 %	20 %	0 %	427733716
86	NC_019678	TCAAA	2	10	123031	123040	60 %	20 %	0 %	20 %	427733718
87	NC_019678	AAAGA	2	10	123596	123605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019678	GTTTG	2	10	127139	127148	0 %	60 %	40 %	0 %	427733720
89	NC_019678	ACAAG	2	10	127192	127201	60 %	0 %	20 %	20 %	427733720
90	NC_019678	AAAGT	2	10	128411	128420	60 %	20 %	20 %	0 %	427733721
91	NC_019678	GCTTT	2	10	129956	129965	0 %	60 %	20 %	20 %	427733723
92	NC_019678	CAAAC	2	10	130817	130826	60 %	0 %	0 %	40 %	427733723
93	NC_019678	AAAAT	2	10	131523	131532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019678	CAAAA	2	10	134939	134948	80 %	0 %	0 %	20 %	427733726
95	NC_019678	TTTGG	2	10	135529	135538	0 %	60 %	40 %	0 %	427733726
96	NC_019678	CGGTG	2	10	135603	135612	0 %	20 %	60 %	20 %	427733726
97	NC_019678	ATGCA	2	10	137264	137273	40 %	20 %	20 %	20 %	427733727
98	NC_019678	GAAAT	2	10	137441	137450	60 %	20 %	20 %	0 %	427733727
99	NC_019678	CTGTA	2	10	139860	139869	20 %	40 %	20 %	20 %	427733729
100	NC_019678	AATTG	2	10	140856	140865	40 %	40 %	20 %	0 %	427733729
101	NC_019678	AACCT	2	10	141204	141213	40 %	20 %	0 %	40 %	427733729
102	NC_019678	ATATT	2	10	144989	144998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019678	AAATC	2	10	145977	145986	60 %	20 %	0 %	20 %	427733732
104	NC_019678	GATTA	2	10	149986	149995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019678	GATTT	2	10	152748	152757	20 %	60 %	20 %	0 %	427733738
106	NC_019678	TTGAG	2	10	155545	155554	20 %	40 %	40 %	0 %	427733740
107	NC_019678	TCGAT	2	10	156396	156405	20 %	40 %	20 %	20 %	427733740
108	NC_019678	GATTA	2	10	157011	157020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019678	TGCAG	2	10	159050	159059	20 %	20 %	40 %	20 %	427733742
110	NC_019678	AACTT	2	10	160475	160484	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019678	AAGAA	2	10	162102	162111	80 %	0 %	20 %	0 %	427733745
112	NC_019678	TATGA	2	10	164677	164686	40 %	40 %	20 %	0 %	427733746
113	NC_019678	TTTAA	2	10	165796	165805	40 %	60 %	0 %	0 %	427733748
114	NC_019678	GCTTT	2	10	167787	167796	0 %	60 %	20 %	20 %	427733749
115	NC_019678	AAAGT	2	10	173529	173538	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019678	TTCCT	2	10	173662	173671	0 %	60 %	0 %	40 %	427733753
117	NC_019678	GATGG	2	10	173723	173732	20 %	20 %	60 %	0 %	427733753
118	NC_019678	ATTTA	2	10	174420	174429	40 %	60 %	0 %	0 %	427733754
119	NC_019678	TTCAA	2	10	175040	175049	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_019678	ACAAA	2	10	175720	175729	80 %	0 %	0 %	20 %	427733756
121	NC_019678	ATATT	2	10	177461	177470	40 %	60 %	0 %	0 %	427733758
122	NC_019678	GTTTG	2	10	178638	178647	0 %	60 %	40 %	0 %	427733758
123	NC_019678	AATAT	2	10	181065	181074	60 %	40 %	0 %	0 %	427733759
124	NC_019678	TTGAT	2	10	181482	181491	20 %	60 %	20 %	0 %	427733759
125	NC_019678	TAATT	2	10	183022	183031	40 %	60 %	0 %	0 %	427733759
126	NC_019678	ATTTT	2	10	186152	186161	20 %	80 %	0 %	0 %	427733762
127	NC_019678	GGGAA	2	10	186948	186957	40 %	0 %	60 %	0 %	427733763
128	NC_019678	TGCGG	2	10	192609	192618	0 %	20 %	60 %	20 %	427733766
129	NC_019678	GATTT	2	10	194333	194342	20 %	60 %	20 %	0 %	427733767
130	NC_019678	TGGTT	2	10	195078	195087	0 %	60 %	40 %	0 %	427733768
131	NC_019678	ATTTC	2	10	195295	195304	20 %	60 %	0 %	20 %	427733768
132	NC_019678	ATTTT	2	10	196040	196049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019678	AATAA	2	10	199047	199056	80 %	20 %	0 %	0 %	427733770
134	NC_019678	TATCT	2	10	208212	208221	20 %	60 %	0 %	20 %	427733773
135	NC_019678	CAAAG	2	10	208390	208399	60 %	0 %	20 %	20 %	427733773
136	NC_019678	GCAAA	2	10	211419	211428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019678	CATTT	2	10	213650	213659	20 %	60 %	0 %	20 %	427733776
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139	NC_019678	TCTTT	2	10	215263	215272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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141	NC_019678	AATTT	2	10	218006	218015	40 %	60 %	0 %	0 %	427733779
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263	NC_019678	ACTTC	2	10	387751	387760	20 %	40 %	0 %	40 %	427733912
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267	NC_019678	TGCAA	2	10	396270	396279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_019678	AAACC	2	10	397352	397361	60 %	0 %	0 %	40 %	427733918
269	NC_019678	TAATT	2	10	398028	398037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019678	TGCAA	2	10	398351	398360	40 %	20 %	20 %	20 %	427733919
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