MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 27184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019678	TATT	2	8	273	280	25 %	75 %	0 %	0 %	427733620
2	NC_019678	AAAG	2	8	313	320	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
3	NC_019678	GTAT	2	8	408	415	25 %	50 %	25 %	0 %	427733620
4	NC_019678	GGAA	2	8	488	495	50 %	0 %	50 %	0 %	427733620
5	NC_019678	AAGA	2	8	839	846	75 %	0 %	25 %	0 %	427733620
6	NC_019678	ATTA	2	8	1020	1027	50 %	50 %	0 %	0 %	427733620
7	NC_019678	TTAA	2	8	1751	1758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019678	TATT	2	8	1831	1838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019678	CAAG	2	8	2502	2509	50 %	0 %	25 %	25 %	427733621
10	NC_019678	AGAA	2	8	2725	2732	75 %	0 %	25 %	0 %	427733621
11	NC_019678	TGGG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019678	GATT	2	8	3393	3400	25 %	50 %	25 %	0 %	427733622
13	NC_019678	CATT	2	8	3472	3479	25 %	50 %	0 %	25 %	427733622
14	NC_019678	GCTC	2	8	3768	3775	0 %	25 %	25 %	50 %	427733622
15	NC_019678	AATT	2	8	3953	3960	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
16	NC_019678	TGCT	2	8	4037	4044	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
17	NC_019678	AATT	2	8	4364	4371	50 %	50 %	0 %	0 %	427733622
18	NC_019678	TTGC	2	8	4552	4559	0 %	50 %	25 %	25 %	427733622
19	NC_019678	TATT	2	8	5422	5429	25 %	75 %	0 %	0 %	427733622
20	NC_019678	TTTC	2	8	6040	6047	0 %	75 %	0 %	25 %	427733622
21	NC_019678	GTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	25 %	0 %	427733622
22	NC_019678	ATTT	2	8	6531	6538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019678	TAAG	2	8	7100	7107	50 %	25 %	25 %	0 %	427733623
24	NC_019678	CATC	2	8	7477	7484	25 %	25 %	0 %	50 %	427733623
25	NC_019678	ATTT	2	8	7833	7840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019678	ATTC	2	8	8136	8143	25 %	50 %	0 %	25 %	427733624
27	NC_019678	ACTC	2	8	8320	8327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_019678	TTCT	2	8	8409	8416	0 %	75 %	0 %	25 %	427733625
29	NC_019678	TGCT	2	8	8779	8786	0 %	50 %	25 %	25 %	427733625
30	NC_019678	AATC	2	8	10565	10572	50 %	25 %	0 %	25 %	427733627
31	NC_019678	CAAT	2	8	10679	10686	50 %	25 %	0 %	25 %	427733627
32	NC_019678	TTGC	2	8	10826	10833	0 %	50 %	25 %	25 %	427733627
33	NC_019678	ACCA	2	8	11110	11117	50 %	0 %	0 %	50 %	427733627
34	NC_019678	TCTG	3	12	11515	11526	0 %	50 %	25 %	25 %	427733627
35	NC_019678	GGTC	2	8	11725	11732	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_019678	TTGG	2	8	12011	12018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019678	TCAA	2	8	12111	12118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019678	TGCT	2	8	12450	12457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019678	TTTA	2	8	12983	12990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019678	ACTT	2	8	12996	13003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019678	CTAA	2	8	13056	13063	50 %	25 %	0 %	25 %	427733629
42	NC_019678	AATC	2	8	14062	14069	50 %	25 %	0 %	25 %	427733629
43	NC_019678	GATC	2	8	14122	14129	25 %	25 %	25 %	25 %	427733629
44	NC_019678	TAGT	2	8	15182	15189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019678	TAAT	2	8	15529	15536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019678	CAAC	2	8	15889	15896	50 %	0 %	0 %	50 %	427733630
47	NC_019678	AATT	2	8	15905	15912	50 %	50 %	0 %	0 %	427733630
48	NC_019678	GTTG	2	8	16037	16044	0 %	50 %	50 %	0 %	427733630
49	NC_019678	AAGC	2	8	16804	16811	50 %	0 %	25 %	25 %	427733630
50	NC_019678	TAAA	2	8	17035	17042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019678	TTTG	2	8	17061	17068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019678	AAAT	2	8	17255	17262	75 %	25 %	0 %	0 %	427733631
53	NC_019678	TAAA	2	8	17992	17999	75 %	25 %	0 %	0 %	427733631
54	NC_019678	AGAT	2	8	18011	18018	50 %	25 %	25 %	0 %	427733631
55	NC_019678	TAGC	2	8	18932	18939	25 %	25 %	25 %	25 %	427733633
56	NC_019678	GATT	2	8	19255	19262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019678	GAGT	2	8	19439	19446	25 %	25 %	50 %	0 %	427733634
58	NC_019678	TTTA	2	8	19585	19592	25 %	75 %	0 %	0 %	427733634
59	NC_019678	TCGT	2	8	21325	21332	0 %	50 %	25 %	25 %	427733634
60	NC_019678	ATTC	2	8	21440	21447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019678	CTAG	2	8	21569	21576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_019678	TGAT	2	8	21724	21731	25 %	50 %	25 %	0 %	427733635
63	NC_019678	ACAA	2	8	22093	22100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019678	ATTC	2	8	22142	22149	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019678	AGAA	2	8	22186	22193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019678	ATTA	2	8	22734	22741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019678	TTAG	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019678	TAAA	2	8	22963	22970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019678	CTAA	2	8	23018	23025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_019678	TCAA	2	8	23706	23713	50 %	25 %	0 %	25 %	427733637
71	NC_019678	GTTT	2	8	23792	23799	0 %	75 %	25 %	0 %	427733637
72	NC_019678	CAAA	2	8	24256	24263	75 %	0 %	0 %	25 %	427733637
73	NC_019678	ATTA	2	8	24605	24612	50 %	50 %	0 %	0 %	427733637
74	NC_019678	AACG	2	8	24625	24632	50 %	0 %	25 %	25 %	427733637
75	NC_019678	AGTA	2	8	25055	25062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019678	TATT	2	8	25426	25433	25 %	75 %	0 %	0 %	427733638
77	NC_019678	TCAA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	427733640
78	NC_019678	CTGA	2	8	26568	26575	25 %	25 %	25 %	25 %	427733640
79	NC_019678	AGTT	2	8	26629	26636	25 %	50 %	25 %	0 %	427733640
80	NC_019678	TGAT	2	8	27120	27127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019678	TTAT	2	8	27151	27158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019678	TATC	2	8	27354	27361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019678	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019678	AGTT	2	8	27997	28004	25 %	50 %	25 %	0 %	427733641
85	NC_019678	GTAA	2	8	28065	28072	50 %	25 %	25 %	0 %	427733641
86	NC_019678	TTTC	2	8	28288	28295	0 %	75 %	0 %	25 %	427733641
87	NC_019678	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019678	AAAT	2	8	29155	29162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019678	GGAA	2	8	29789	29796	50 %	0 %	50 %	0 %	427733642
90	NC_019678	GATT	2	8	30532	30539	25 %	50 %	25 %	0 %	427733642
91	NC_019678	CTAC	2	8	31071	31078	25 %	25 %	0 %	50 %	427733642
92	NC_019678	AATT	2	8	31183	31190	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
93	NC_019678	AATT	2	8	31336	31343	50 %	50 %	0 %	0 %	427733642
94	NC_019678	AGCA	2	8	31585	31592	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
95	NC_019678	AGCA	2	8	31838	31845	50 %	0 %	25 %	25 %	427733642
96	NC_019678	TTCC	2	8	32096	32103	0 %	50 %	0 %	50 %	427733642
97	NC_019678	GGTT	2	8	32141	32148	0 %	50 %	50 %	0 %	427733642
98	NC_019678	AAGT	2	8	32560	32567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019678	TTGT	2	8	33446	33453	0 %	75 %	25 %	0 %	427733643
100	NC_019678	TACT	2	8	34287	34294	25 %	50 %	0 %	25 %	427733644
101	NC_019678	ATTA	2	8	34484	34491	50 %	50 %	0 %	0 %	427733644
102	NC_019678	TCTT	2	8	34961	34968	0 %	75 %	0 %	25 %	427733644
103	NC_019678	TTCT	2	8	35481	35488	0 %	75 %	0 %	25 %	427733645
104	NC_019678	TTGC	2	8	35676	35683	0 %	50 %	25 %	25 %	427733645
105	NC_019678	CAAA	2	8	35790	35797	75 %	0 %	0 %	25 %	427733645
106	NC_019678	CAAC	2	8	35849	35856	50 %	0 %	0 %	50 %	427733645
107	NC_019678	TGAT	2	8	36369	36376	25 %	50 %	25 %	0 %	427733645
108	NC_019678	ATTG	2	8	36456	36463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019678	CTTG	2	8	36527	36534	0 %	50 %	25 %	25 %	427733646
110	NC_019678	TTGA	2	8	37652	37659	25 %	50 %	25 %	0 %	427733647
111	NC_019678	CCAA	2	8	37684	37691	50 %	0 %	0 %	50 %	427733647
112	NC_019678	TCTT	2	8	37701	37708	0 %	75 %	0 %	25 %	427733647
113	NC_019678	GCGA	2	8	37852	37859	25 %	0 %	50 %	25 %	427733647
114	NC_019678	AACT	2	8	37876	37883	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
115	NC_019678	ATAA	2	8	37952	37959	75 %	25 %	0 %	0 %	427733647
116	NC_019678	GCTT	2	8	38115	38122	0 %	50 %	25 %	25 %	427733647
117	NC_019678	ACCA	2	8	38154	38161	50 %	0 %	0 %	50 %	427733647
118	NC_019678	TTCT	2	8	38170	38177	0 %	75 %	0 %	25 %	427733647
119	NC_019678	TCCT	2	8	38201	38208	0 %	50 %	0 %	50 %	427733647
120	NC_019678	TAAC	2	8	38305	38312	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
121	NC_019678	TAAC	2	8	38671	38678	50 %	25 %	0 %	25 %	427733647
122	NC_019678	CGTT	2	8	38804	38811	0 %	50 %	25 %	25 %	427733647
123	NC_019678	CAAG	2	8	38814	38821	50 %	0 %	25 %	25 %	427733647
124	NC_019678	CATT	2	8	39607	39614	25 %	50 %	0 %	25 %	427733649
125	NC_019678	GTAG	2	8	40267	40274	25 %	25 %	50 %	0 %	427733649
126	NC_019678	ATCT	2	8	40577	40584	25 %	50 %	0 %	25 %	427733649
127	NC_019678	CAAA	2	8	40864	40871	75 %	0 %	0 %	25 %	427733651
128	NC_019678	TTTC	2	8	41228	41235	0 %	75 %	0 %	25 %	427733651
129	NC_019678	TAAA	2	8	41596	41603	75 %	25 %	0 %	0 %	427733651
130	NC_019678	TTGC	2	8	41812	41819	0 %	50 %	25 %	25 %	427733651
131	NC_019678	AATT	2	8	41908	41915	50 %	50 %	0 %	0 %	427733651
132	NC_019678	GTTA	2	8	42295	42302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019678	TTTA	2	8	42431	42438	25 %	75 %	0 %	0 %	427733652
134	NC_019678	CATT	2	8	42669	42676	25 %	50 %	0 %	25 %	427733652
135	NC_019678	CAAG	2	8	43023	43030	50 %	0 %	25 %	25 %	427733652
136	NC_019678	AAAT	2	8	43378	43385	75 %	25 %	0 %	0 %	427733653
137	NC_019678	GCTG	2	8	43453	43460	0 %	25 %	50 %	25 %	427733653
138	NC_019678	TTGG	2	8	43466	43473	0 %	50 %	50 %	0 %	427733653
139	NC_019678	AATC	2	8	44529	44536	50 %	25 %	0 %	25 %	427733654
140	NC_019678	AATT	2	8	45118	45125	50 %	50 %	0 %	0 %	427733654
141	NC_019678	GGAT	2	8	45776	45783	25 %	25 %	50 %	0 %	427733654
142	NC_019678	AATT	2	8	45981	45988	50 %	50 %	0 %	0 %	427733654
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144	NC_019678	ATGA	2	8	46465	46472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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