MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019678	T	6	6	162435	162440	0 %	100 %	0 %	0 %	427733745
3502	NC_019678	AGCA	2	8	162512	162519	50 %	0 %	25 %	25 %	427733745
3503	NC_019678	TAAT	2	8	162665	162672	50 %	50 %	0 %	0 %	427733745
3504	NC_019678	TAC	2	6	162738	162743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733745
3505	NC_019678	GGA	2	6	162772	162777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733745
3506	NC_019678	AGA	2	6	162831	162836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733745
3507	NC_019678	TAA	2	6	162894	162899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733745
3508	NC_019678	GAG	2	6	162935	162940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733745
3509	NC_019678	ATT	2	6	162959	162964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733745
3510	NC_019678	AGA	2	6	162975	162980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733745
3511	NC_019678	AGC	2	6	163007	163012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733745
3512	NC_019678	AAAAGG	2	12	163047	163058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733745
3513	NC_019678	CAA	2	6	163063	163068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733745
3514	NC_019678	GAA	2	6	163113	163118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733745
3515	NC_019678	CAG	3	9	163120	163128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733745
3516	NC_019678	ACA	2	6	163134	163139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733745
3517	NC_019678	AGA	2	6	163209	163214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_019678	ACTA	2	8	163378	163385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_019678	TTTA	2	8	163422	163429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019678	GGA	2	6	163476	163481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019678	CAA	2	6	163499	163504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019678	TA	3	6	163505	163510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019678	TTCG	2	8	163579	163586	0 %	50 %	25 %	25 %	427733746
3524	NC_019678	GGA	2	6	163611	163616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733746
3525	NC_019678	TTA	2	6	163657	163662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733746
3526	NC_019678	ACC	2	6	163722	163727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733746
3527	NC_019678	TA	3	6	163861	163866	50 %	50 %	0 %	0 %	427733746
3528	NC_019678	CTA	2	6	163880	163885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733746
3529	NC_019678	TAA	2	6	163947	163952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733746
3530	NC_019678	ATC	2	6	163960	163965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733746
3531	NC_019678	AGC	2	6	164040	164045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733746
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3533	NC_019678	GTC	2	6	164069	164074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733746
3534	NC_019678	TTA	2	6	164106	164111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733746
3535	NC_019678	GCCC	2	8	164185	164192	0 %	0 %	25 %	75 %	427733746
3536	NC_019678	TCT	2	6	164284	164289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733746
3537	NC_019678	TGC	2	6	164307	164312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733746
3538	NC_019678	A	6	6	164486	164491	100 %	0 %	0 %	0 %	427733746
3539	NC_019678	ATA	2	6	164549	164554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733746
3540	NC_019678	TCC	2	6	164565	164570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733746
3541	NC_019678	ATT	2	6	164598	164603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733746
3542	NC_019678	TGG	2	6	164611	164616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733746
3543	NC_019678	TATGA	2	10	164677	164686	40 %	40 %	20 %	0 %	427733746
3544	NC_019678	ACT	2	6	164699	164704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733746
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3546	NC_019678	TGAA	2	8	164783	164790	50 %	25 %	25 %	0 %	427733746
3547	NC_019678	GAT	2	6	164835	164840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733746
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3549	NC_019678	GCA	2	6	164896	164901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733746
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3554	NC_019678	AT	3	6	165069	165074	50 %	50 %	0 %	0 %	427733746
3555	NC_019678	A	6	6	165170	165175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_019678	A	6	6	165202	165207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_019678	TTA	2	6	165269	165274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_019678	CTC	2	6	165442	165447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733747
3559	NC_019678	GCA	2	6	165474	165479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733747
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3561	NC_019678	TCA	2	6	165517	165522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733747
3562	NC_019678	TC	3	6	165534	165539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_019678	GT	3	6	165600	165605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_019678	TA	3	6	165618	165623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_019678	ATT	2	6	165640	165645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_019678	A	6	6	165664	165669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_019678	TGG	2	6	165675	165680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019678	A	6	6	165732	165737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019678	TTTAA	2	10	165796	165805	40 %	60 %	0 %	0 %	427733748
3570	NC_019678	T	6	6	165811	165816	0 %	100 %	0 %	0 %	427733748
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3575	NC_019678	ATTA	2	8	165993	166000	50 %	50 %	0 %	0 %	427733748
3576	NC_019678	TAAG	2	8	166035	166042	50 %	25 %	25 %	0 %	427733748
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3579	NC_019678	CAA	3	9	166258	166266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733748
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3584	NC_019678	TAGC	2	8	166666	166673	25 %	25 %	25 %	25 %	427733748
3585	NC_019678	TA	3	6	166696	166701	50 %	50 %	0 %	0 %	427733748
3586	NC_019678	TTTA	2	8	166713	166720	25 %	75 %	0 %	0 %	427733748
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3594	NC_019678	GAAT	2	8	167175	167182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_019678	TCC	2	6	167250	167255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_019678	AAAG	2	8	167274	167281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_019678	ATG	2	6	167321	167326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733749
3598	NC_019678	TAT	2	6	167463	167468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733749
3599	NC_019678	AAT	2	6	167523	167528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733749
3600	NC_019678	AATA	2	8	167554	167561	75 %	25 %	0 %	0 %	427733749
3601	NC_019678	CTG	2	6	167583	167588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733749
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3603	NC_019678	GAG	2	6	167646	167651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733749
3604	NC_019678	CTG	2	6	167679	167684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733749
3605	NC_019678	GCTTT	2	10	167787	167796	0 %	60 %	20 %	20 %	427733749
3606	NC_019678	CAA	2	6	167865	167870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733749
3607	NC_019678	T	6	6	167916	167921	0 %	100 %	0 %	0 %	427733749
3608	NC_019678	GCT	2	6	167939	167944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733749
3609	NC_019678	GTG	2	6	167954	167959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733749
3610	NC_019678	TTC	2	6	167962	167967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733749
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3612	NC_019678	CAC	3	9	168203	168211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733750
3613	NC_019678	TTC	2	6	168261	168266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733750
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3615	NC_019678	GAT	2	6	168392	168397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733750
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3618	NC_019678	CAT	2	6	168689	168694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733750
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3620	NC_019678	TTC	2	6	168732	168737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733750
3621	NC_019678	CTT	2	6	168752	168757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733750
3622	NC_019678	AAG	2	6	168829	168834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733750
3623	NC_019678	GAA	2	6	168856	168861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733750
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