MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019678	TAA	2	6	137319	137324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733727
3002	NC_019678	TTG	2	6	137429	137434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733727
3003	NC_019678	GAAAT	2	10	137441	137450	60 %	20 %	20 %	0 %	427733727
3004	NC_019678	TTTA	2	8	137457	137464	25 %	75 %	0 %	0 %	427733727
3005	NC_019678	GA	3	6	137516	137521	50 %	0 %	50 %	0 %	427733727
3006	NC_019678	TGG	2	6	137607	137612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733727
3007	NC_019678	ATC	2	6	137717	137722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733727
3008	NC_019678	T	6	6	137791	137796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019678	ATTT	2	8	137805	137812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019678	ATTT	2	8	137824	137831	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019678	AG	3	6	137855	137860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019678	CCT	2	6	137863	137868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_019678	GAA	2	6	137913	137918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_019678	TTG	2	6	137972	137977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_019678	ATTA	2	8	138081	138088	50 %	50 %	0 %	0 %	427733728
3016	NC_019678	ATC	2	6	138094	138099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733728
3017	NC_019678	CTT	2	6	138173	138178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733728
3018	NC_019678	TA	3	6	138377	138382	50 %	50 %	0 %	0 %	427733728
3019	NC_019678	GAT	2	6	138470	138475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733728
3020	NC_019678	ACC	2	6	138558	138563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733728
3021	NC_019678	CTTT	2	8	138586	138593	0 %	75 %	0 %	25 %	427733728
3022	NC_019678	AAT	2	6	138654	138659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733728
3023	NC_019678	CTT	2	6	138668	138673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733728
3024	NC_019678	ATT	2	6	138742	138747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733728
3025	NC_019678	CCGCCA	2	12	138748	138759	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	427733728
3026	NC_019678	AAC	2	6	138892	138897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733728
3027	NC_019678	ATA	2	6	138932	138937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733728
3028	NC_019678	CGC	2	6	139154	139159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_019678	TAT	2	6	139185	139190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019678	AAT	2	6	139275	139280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019678	A	6	6	139307	139312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019678	AGTA	2	8	139366	139373	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_019678	CTG	2	6	139396	139401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_019678	GCAA	2	8	139534	139541	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_019678	A	6	6	139540	139545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_019678	TTAC	2	8	139590	139597	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_019678	GAG	2	6	139624	139629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_019678	CTAG	2	8	139660	139667	25 %	25 %	25 %	25 %	427733729
3039	NC_019678	AGA	2	6	139745	139750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733729
3040	NC_019678	GAA	2	6	139819	139824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733729
3041	NC_019678	CTGTA	2	10	139860	139869	20 %	40 %	20 %	20 %	427733729
3042	NC_019678	TG	3	6	139926	139931	0 %	50 %	50 %	0 %	427733729
3043	NC_019678	AAT	2	6	139947	139952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733729
3044	NC_019678	TGC	2	6	139964	139969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3045	NC_019678	TGT	2	6	139973	139978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733729
3046	NC_019678	GAT	2	6	139983	139988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733729
3047	NC_019678	TTG	2	6	140002	140007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733729
3048	NC_019678	TGC	2	6	140036	140041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3049	NC_019678	GTAA	2	8	140070	140077	50 %	25 %	25 %	0 %	427733729
3050	NC_019678	ATT	2	6	140087	140092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733729
3051	NC_019678	GTT	2	6	140178	140183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733729
3052	NC_019678	TCC	2	6	140318	140323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733729
3053	NC_019678	TGT	2	6	140336	140341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733729
3054	NC_019678	AGT	2	6	140429	140434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733729
3055	NC_019678	GCT	2	6	140451	140456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3056	NC_019678	GCG	2	6	140581	140586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733729
3057	NC_019678	CAT	2	6	140608	140613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733729
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3059	NC_019678	AAACCC	2	12	140703	140714	50 %	0 %	0 %	50 %	427733729
3060	NC_019678	CAG	2	6	140725	140730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3061	NC_019678	CAA	2	6	140794	140799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733729
3062	NC_019678	TA	3	6	140807	140812	50 %	50 %	0 %	0 %	427733729
3063	NC_019678	AATTG	2	10	140856	140865	40 %	40 %	20 %	0 %	427733729
3064	NC_019678	TAAA	2	8	140933	140940	75 %	25 %	0 %	0 %	427733729
3065	NC_019678	AGC	2	6	140975	140980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3066	NC_019678	CAT	2	6	141001	141006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733729
3067	NC_019678	CTG	2	6	141112	141117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3068	NC_019678	TA	3	6	141118	141123	50 %	50 %	0 %	0 %	427733729
3069	NC_019678	TCT	2	6	141168	141173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733729
3070	NC_019678	AACCT	2	10	141204	141213	40 %	20 %	0 %	40 %	427733729
3071	NC_019678	GGC	2	6	141285	141290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733729
3072	NC_019678	CGA	2	6	141297	141302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733729
3073	NC_019678	A	6	6	141415	141420	100 %	0 %	0 %	0 %	427733730
3074	NC_019678	TCA	2	6	141477	141482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733730
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3080	NC_019678	T	7	7	141674	141680	0 %	100 %	0 %	0 %	427733730
3081	NC_019678	CGC	2	6	141773	141778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733730
3082	NC_019678	CAA	2	6	141824	141829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733730
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3087	NC_019678	TCAA	2	8	142079	142086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_019678	AAAT	2	8	142177	142184	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019678	ATT	2	6	142233	142238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_019678	TGG	2	6	142516	142521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733731
3094	NC_019678	CTG	2	6	142674	142679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733731
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3096	NC_019678	ATCT	2	8	142764	142771	25 %	50 %	0 %	25 %	427733731
3097	NC_019678	ATTT	2	8	142776	142783	25 %	75 %	0 %	0 %	427733731
3098	NC_019678	T	6	6	142798	142803	0 %	100 %	0 %	0 %	427733731
3099	NC_019678	TTG	2	6	142828	142833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733731
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3102	NC_019678	CTT	2	6	142956	142961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733731
3103	NC_019678	TGC	2	6	142979	142984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733731
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3105	NC_019678	GAC	3	9	143019	143027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733731
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3109	NC_019678	AGTG	2	8	143268	143275	25 %	25 %	50 %	0 %	427733731
3110	NC_019678	CAA	2	6	143314	143319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733731
3111	NC_019678	CTTC	2	8	143336	143343	0 %	50 %	0 %	50 %	427733731
3112	NC_019678	TCG	2	6	143369	143374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733731
3113	NC_019678	TCT	2	6	143420	143425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733731
3114	NC_019678	CTG	2	6	143439	143444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733731
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3116	NC_019678	ACC	2	6	143671	143676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733731
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3119	NC_019678	TGC	4	12	143759	143770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733731
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3123	NC_019678	CTT	3	9	143970	143978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733731
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3125	NC_019678	CTA	2	6	144342	144347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733731
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3139	NC_019678	AT	3	6	145068	145073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_019678	T	6	6	145131	145136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_019678	TAAA	2	8	145139	145146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3142	NC_019678	A	7	7	145163	145169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3148	NC_019678	A	8	8	145534	145541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3233	NC_019678	GAA	2	6	150165	150170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3235	NC_019678	TCA	2	6	150203	150208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3236	NC_019678	A	7	7	150346	150352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_019678	ACAA	2	8	150391	150398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3238	NC_019678	AGCA	2	8	150421	150428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3239	NC_019678	TGC	2	6	150439	150444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_019678	TACT	2	8	150524	150531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3241	NC_019678	AACA	2	8	150559	150566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3242	NC_019678	CGT	2	6	150570	150575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_019678	ATT	2	6	150591	150596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_019678	T	7	7	150599	150605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_019678	AAT	2	6	150671	150676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_019678	GCT	2	6	150687	150692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_019678	A	6	6	150700	150705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_019678	AGT	2	6	150719	150724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_019678	TA	3	6	150801	150806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_019678	GCA	2	6	150857	150862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_019678	TGA	3	9	150896	150904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_019678	AATG	2	8	150927	150934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_019678	T	8	8	151029	151036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3255	NC_019678	TGC	2	6	151112	151117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3377	NC_019678	T	6	6	156953	156958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3378	NC_019678	GCT	2	6	156960	156965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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