MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019678	TGC	2	6	46592	46597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_019678	ACAAA	2	10	46605	46614	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_019678	T	7	7	46665	46671	0 %	100 %	0 %	0 %	427733655
1004	NC_019678	CAA	2	6	46696	46701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733655
1005	NC_019678	CAG	2	6	46829	46834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733655
1006	NC_019678	A	7	7	46871	46877	100 %	0 %	0 %	0 %	427733655
1007	NC_019678	AGA	2	6	46944	46949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733655
1008	NC_019678	AGA	2	6	47017	47022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733655
1009	NC_019678	AGA	2	6	47106	47111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733655
1010	NC_019678	ATA	2	6	47152	47157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733655
1011	NC_019678	CAA	2	6	47258	47263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733655
1012	NC_019678	TGA	2	6	47319	47324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733655
1013	NC_019678	ACA	2	6	47338	47343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733655
1014	NC_019678	TAC	2	6	47363	47368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733655
1015	NC_019678	AGCA	2	8	47528	47535	50 %	0 %	25 %	25 %	427733655
1016	NC_019678	AAG	2	6	47540	47545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733655
1017	NC_019678	T	6	6	47566	47571	0 %	100 %	0 %	0 %	427733655
1018	NC_019678	TTTA	2	8	47630	47637	25 %	75 %	0 %	0 %	427733655
1019	NC_019678	ATC	2	6	47681	47686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733655
1020	NC_019678	TATT	2	8	47761	47768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019678	TAA	2	6	47774	47779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019678	ATTA	2	8	47793	47800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019678	TA	3	6	47799	47804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019678	TGA	2	6	47831	47836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733656
1025	NC_019678	AATA	2	8	47926	47933	75 %	25 %	0 %	0 %	427733656
1026	NC_019678	T	6	6	48011	48016	0 %	100 %	0 %	0 %	427733656
1027	NC_019678	CTG	2	6	48029	48034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733656
1028	NC_019678	CTG	2	6	48061	48066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733656
1029	NC_019678	TTGAT	2	10	48100	48109	20 %	60 %	20 %	0 %	427733656
1030	NC_019678	AGC	2	6	48154	48159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733656
1031	NC_019678	TA	3	6	48170	48175	50 %	50 %	0 %	0 %	427733656
1032	NC_019678	AAT	2	6	48206	48211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733656
1033	NC_019678	A	6	6	48262	48267	100 %	0 %	0 %	0 %	427733656
1034	NC_019678	GTA	2	6	48339	48344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733656
1035	NC_019678	CAT	2	6	48498	48503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733656
1036	NC_019678	AAT	2	6	48604	48609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733656
1037	NC_019678	TGC	2	6	48613	48618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733656
1038	NC_019678	AAATA	2	10	48670	48679	80 %	20 %	0 %	0 %	427733656
1039	NC_019678	ATC	2	6	48692	48697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733656
1040	NC_019678	T	7	7	48708	48714	0 %	100 %	0 %	0 %	427733656
1041	NC_019678	ATT	2	6	48847	48852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733656
1042	NC_019678	AAT	2	6	48859	48864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733656
1043	NC_019678	AGTT	2	8	48871	48878	25 %	50 %	25 %	0 %	427733656
1044	NC_019678	AT	4	8	48930	48937	50 %	50 %	0 %	0 %	427733656
1045	NC_019678	ACCT	2	8	49047	49054	25 %	25 %	0 %	50 %	427733656
1046	NC_019678	TGT	2	6	49150	49155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733656
1047	NC_019678	A	7	7	49177	49183	100 %	0 %	0 %	0 %	427733656
1048	NC_019678	AAAT	2	8	49201	49208	75 %	25 %	0 %	0 %	427733656
1049	NC_019678	A	6	6	49325	49330	100 %	0 %	0 %	0 %	427733656
1050	NC_019678	AAC	2	6	49379	49384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733656
1051	NC_019678	ACA	2	6	49491	49496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733656
1052	NC_019678	ACA	2	6	49508	49513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733656
1053	NC_019678	GTTT	2	8	49603	49610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019678	CAAA	2	8	49640	49647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_019678	TAAC	2	8	49654	49661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_019678	AT	3	6	49746	49751	50 %	50 %	0 %	0 %	427733657
1057	NC_019678	A	7	7	49793	49799	100 %	0 %	0 %	0 %	427733657
1058	NC_019678	GAA	2	6	49806	49811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733657
1059	NC_019678	ATC	2	6	49819	49824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733657
1060	NC_019678	ACC	2	6	49958	49963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733657
1061	NC_019678	CGT	2	6	50016	50021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733657
1062	NC_019678	AATT	2	8	50092	50099	50 %	50 %	0 %	0 %	427733657
1063	NC_019678	AGC	2	6	50151	50156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733657
1064	NC_019678	GAT	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733657
1065	NC_019678	AATT	2	8	50185	50192	50 %	50 %	0 %	0 %	427733657
1066	NC_019678	TGG	2	6	50198	50203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733657
1067	NC_019678	ATA	2	6	50263	50268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733657
1068	NC_019678	A	7	7	50274	50280	100 %	0 %	0 %	0 %	427733657
1069	NC_019678	A	6	6	50296	50301	100 %	0 %	0 %	0 %	427733657
1070	NC_019678	TCA	2	6	50303	50308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733657
1071	NC_019678	CGAG	2	8	50312	50319	25 %	0 %	50 %	25 %	427733657
1072	NC_019678	AAG	2	6	50363	50368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733657
1073	NC_019678	AGCTAC	2	12	50463	50474	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019678	A	7	7	50492	50498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019678	GAG	2	6	50558	50563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019678	TTC	2	6	50598	50603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_019678	CTC	2	6	50630	50635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733658
1078	NC_019678	CTT	2	6	50645	50650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1079	NC_019678	T	6	6	50666	50671	0 %	100 %	0 %	0 %	427733658
1080	NC_019678	GAT	2	6	50683	50688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733658
1081	NC_019678	CTT	2	6	50713	50718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1082	NC_019678	ATC	2	6	50738	50743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733658
1083	NC_019678	AAAAC	2	10	50826	50835	80 %	0 %	0 %	20 %	427733658
1084	NC_019678	TCT	2	6	50856	50861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1085	NC_019678	GGT	2	6	50862	50867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733658
1086	NC_019678	CTT	2	6	50869	50874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1087	NC_019678	GCC	2	6	50891	50896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733658
1088	NC_019678	CTT	2	6	50911	50916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1089	NC_019678	AAG	2	6	50938	50943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733658
1090	NC_019678	TACT	2	8	51085	51092	25 %	50 %	0 %	25 %	427733658
1091	NC_019678	ATT	2	6	51138	51143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733658
1092	NC_019678	T	7	7	51224	51230	0 %	100 %	0 %	0 %	427733658
1093	NC_019678	ACCTT	2	10	51232	51241	20 %	40 %	0 %	40 %	427733658
1094	NC_019678	A	6	6	51315	51320	100 %	0 %	0 %	0 %	427733658
1095	NC_019678	CTT	2	6	51373	51378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733658
1096	NC_019678	TAATT	2	10	51583	51592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_019678	TAA	2	6	51640	51645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019678	ATC	2	6	51702	51707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_019678	TC	3	6	51706	51711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_019678	GAT	2	6	51775	51780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019678	A	7	7	51790	51796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019678	CCTA	2	8	51798	51805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_019678	CATT	2	8	51824	51831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_019678	TAA	2	6	51845	51850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019678	ATTT	2	8	51857	51864	25 %	75 %	0 %	0 %	427733659
1106	NC_019678	CTA	2	6	51966	51971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733659
1107	NC_019678	ATC	2	6	51996	52001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733659
1108	NC_019678	CAA	2	6	52009	52014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733659
1109	NC_019678	ATAC	2	8	52015	52022	50 %	25 %	0 %	25 %	427733659
1110	NC_019678	ATT	2	6	52037	52042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733659
1111	NC_019678	AGC	2	6	52067	52072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733659
1112	NC_019678	TTCT	2	8	52135	52142	0 %	75 %	0 %	25 %	427733659
1113	NC_019678	TAT	2	6	52227	52232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019678	ATT	2	6	52260	52265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019678	ATA	2	6	52379	52384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019678	ACA	2	6	52491	52496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733660
1117	NC_019678	AAC	2	6	52567	52572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733660
1118	NC_019678	ATCC	2	8	52603	52610	25 %	25 %	0 %	50 %	427733660
1119	NC_019678	ACG	2	6	52624	52629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733660
1120	NC_019678	AACC	2	8	52631	52638	50 %	0 %	0 %	50 %	427733660
1121	NC_019678	ATTA	2	8	52657	52664	50 %	50 %	0 %	0 %	427733660
1122	NC_019678	AATT	2	8	52801	52808	50 %	50 %	0 %	0 %	427733660
1123	NC_019678	GAC	2	6	52827	52832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733660
1124	NC_019678	TAA	2	6	52923	52928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733660
1125	NC_019678	CAA	2	6	52962	52967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733660
1126	NC_019678	ATT	2	6	52978	52983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733660
1127	NC_019678	CAA	2	6	53022	53027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733660
1128	NC_019678	GCA	2	6	53045	53050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733660
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