MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019678	GAA	2	6	22922	22927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019678	A	7	7	22936	22942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_019678	TAAA	2	8	22963	22970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_019678	CTAA	2	8	23018	23025	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_019678	CCA	2	6	23086	23091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
506	NC_019678	AT	3	6	23106	23111	50 %	50 %	0 %	0 %	427733637
507	NC_019678	TCA	2	6	23163	23168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733637
508	NC_019678	AGC	2	6	23174	23179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733637
509	NC_019678	CAA	2	6	23248	23253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733637
510	NC_019678	GAA	2	6	23288	23293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733637
511	NC_019678	ACG	2	6	23369	23374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733637
512	NC_019678	AAT	2	6	23390	23395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733637
513	NC_019678	CAC	2	6	23458	23463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
514	NC_019678	ACC	2	6	23519	23524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
515	NC_019678	CCA	2	6	23577	23582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
516	NC_019678	CTT	2	6	23587	23592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733637
517	NC_019678	TCAA	2	8	23706	23713	50 %	25 %	0 %	25 %	427733637
518	NC_019678	CAC	2	6	23731	23736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
519	NC_019678	TTC	2	6	23771	23776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733637
520	NC_019678	GTTT	2	8	23792	23799	0 %	75 %	25 %	0 %	427733637
521	NC_019678	CTT	2	6	23851	23856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733637
522	NC_019678	TAA	2	6	23917	23922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733637
523	NC_019678	CTGCAA	2	12	23986	23997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427733637
524	NC_019678	GAT	2	6	24012	24017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733637
525	NC_019678	AGC	2	6	24104	24109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733637
526	NC_019678	TTG	2	6	24110	24115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733637
527	NC_019678	TTC	2	6	24157	24162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733637
528	NC_019678	CAAA	2	8	24256	24263	75 %	0 %	0 %	25 %	427733637
529	NC_019678	TCA	2	6	24351	24356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733637
530	NC_019678	ACA	3	9	24438	24446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733637
531	NC_019678	TTC	2	6	24474	24479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733637
532	NC_019678	CCA	2	6	24541	24546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733637
533	NC_019678	CAA	2	6	24598	24603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733637
534	NC_019678	ATTA	2	8	24605	24612	50 %	50 %	0 %	0 %	427733637
535	NC_019678	AACG	2	8	24625	24632	50 %	0 %	25 %	25 %	427733637
536	NC_019678	TC	4	8	24666	24673	0 %	50 %	0 %	50 %	427733637
537	NC_019678	GTT	2	6	24759	24764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733637
538	NC_019678	ATA	2	6	24786	24791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733637
539	NC_019678	TA	3	6	24843	24848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_019678	AGTA	2	8	25055	25062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_019678	ATT	2	6	25081	25086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_019678	A	6	6	25150	25155	100 %	0 %	0 %	0 %	427733638
543	NC_019678	TGC	2	6	25196	25201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733638
544	NC_019678	TGG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733638
545	NC_019678	TGA	2	6	25298	25303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733638
546	NC_019678	AGG	2	6	25361	25366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733638
547	NC_019678	ATG	2	6	25369	25374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733638
548	NC_019678	CTT	2	6	25411	25416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733638
549	NC_019678	CTG	2	6	25417	25422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733638
550	NC_019678	TATT	2	8	25426	25433	25 %	75 %	0 %	0 %	427733638
551	NC_019678	GAA	2	6	25486	25491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733638
552	NC_019678	TGC	2	6	25574	25579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733638
553	NC_019678	ATG	2	6	25594	25599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733638
554	NC_019678	ATT	2	6	25602	25607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733638
555	NC_019678	GGT	2	6	25704	25709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733638
556	NC_019678	A	6	6	25711	25716	100 %	0 %	0 %	0 %	427733638
557	NC_019678	T	6	6	25777	25782	0 %	100 %	0 %	0 %	427733638
558	NC_019678	A	6	6	25798	25803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_019678	ATT	2	6	25812	25817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_019678	TAT	2	6	25834	25839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_019678	T	6	6	25981	25986	0 %	100 %	0 %	0 %	427733639
562	NC_019678	TTG	2	6	26045	26050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733639
563	NC_019678	CAA	2	6	26077	26082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733639
564	NC_019678	AT	4	8	26121	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	427733639
565	NC_019678	CTA	2	6	26197	26202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733639
566	NC_019678	TCG	2	6	26208	26213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733639
567	NC_019678	T	6	6	26215	26220	0 %	100 %	0 %	0 %	427733639
568	NC_019678	TCAA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	427733640
569	NC_019678	TTC	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733640
570	NC_019678	GAA	2	6	26543	26548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733640
571	NC_019678	TTA	2	6	26556	26561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733640
572	NC_019678	CTGA	2	8	26568	26575	25 %	25 %	25 %	25 %	427733640
573	NC_019678	AGTT	2	8	26629	26636	25 %	50 %	25 %	0 %	427733640
574	NC_019678	TCG	2	6	26683	26688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733640
575	NC_019678	TTA	2	6	26796	26801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733640
576	NC_019678	AGG	2	6	26809	26814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733640
577	NC_019678	TGG	2	6	26848	26853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733640
578	NC_019678	TTC	2	6	26854	26859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733640
579	NC_019678	CTC	2	6	26881	26886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733640
580	NC_019678	CTA	2	6	26898	26903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733640
581	NC_019678	CAC	2	6	26923	26928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733640
582	NC_019678	CTT	2	6	26943	26948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733640
583	NC_019678	CTG	2	6	26970	26975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733640
584	NC_019678	GTT	2	6	27086	27091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733640
585	NC_019678	TGAT	2	8	27120	27127	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_019678	TTAT	2	8	27151	27158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_019678	A	6	6	27218	27223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_019678	AGA	2	6	27250	27255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_019678	TATC	2	8	27354	27361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_019678	GT	3	6	27389	27394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_019678	TCC	2	6	27499	27504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_019678	AGCGA	2	10	27516	27525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
593	NC_019678	GGAG	2	8	27542	27549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
594	NC_019678	TGA	2	6	27695	27700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733641
595	NC_019678	ATT	2	6	27751	27756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733641
596	NC_019678	AGC	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733641
597	NC_019678	TGC	2	6	27953	27958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733641
598	NC_019678	AGTT	2	8	27997	28004	25 %	50 %	25 %	0 %	427733641
599	NC_019678	GTAA	2	8	28065	28072	50 %	25 %	25 %	0 %	427733641
600	NC_019678	CAAGCA	2	12	28113	28124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427733641
601	NC_019678	CAG	2	6	28155	28160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733641
602	NC_019678	GCA	2	6	28179	28184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733641
603	NC_019678	GAT	2	6	28188	28193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733641
604	NC_019678	CAG	2	6	28200	28205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733641
605	NC_019678	TTTC	2	8	28288	28295	0 %	75 %	0 %	25 %	427733641
606	NC_019678	GTA	2	6	28509	28514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733641
607	NC_019678	GTA	2	6	28587	28592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733641
608	NC_019678	TAA	2	6	28631	28636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733641
609	NC_019678	AGT	2	6	28700	28705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733641
610	NC_019678	AGC	2	6	28912	28917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733641
611	NC_019678	TTG	2	6	28990	28995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733641
612	NC_019678	GAG	2	6	29050	29055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427733641
613	NC_019678	AG	3	6	29054	29059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019678	G	6	6	29076	29081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
615	NC_019678	A	6	6	29093	29098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_019678	TAAA	2	8	29126	29133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_019678	AT	3	6	29137	29142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019678	AAAT	2	8	29155	29162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_019678	AAT	2	6	29269	29274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_019678	AC	3	6	29302	29307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_019678	TTC	2	6	29365	29370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733642
622	NC_019678	T	6	6	29372	29377	0 %	100 %	0 %	0 %	427733642
623	NC_019678	TAC	2	6	29495	29500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733642
624	NC_019678	GGAA	2	8	29789	29796	50 %	0 %	50 %	0 %	427733642
625	NC_019678	G	6	6	29864	29869	0 %	0 %	100 %	0 %	427733642
626	NC_019678	GAA	2	6	29904	29909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733642
627	NC_019678	AGC	2	6	29939	29944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733642
628	NC_019678	CAG	2	6	29961	29966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733642
629	NC_019678	CAA	2	6	29973	29978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733642
630	NC_019678	TAGAAG	2	12	30043	30054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427733642
631	NC_019678	TTC	2	6	30095	30100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733642
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755	NC_019678	CAAA	2	8	35790	35797	75 %	0 %	0 %	25 %	427733645
756	NC_019678	CAAC	2	8	35849	35856	50 %	0 %	0 %	50 %	427733645
757	NC_019678	CAA	2	6	35872	35877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733645
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