MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019678	TTA	2	6	276308	276313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733835
6002	NC_019678	TTG	2	6	276347	276352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019678	AGGAG	2	10	276367	276376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_019678	TC	3	6	276427	276432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_019678	TAA	2	6	276434	276439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019678	TGC	2	6	276482	276487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_019678	ATTTCT	2	12	276606	276617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6008	NC_019678	ATT	2	6	276670	276675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019678	ATG	2	6	276825	276830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019678	CAG	2	6	276839	276844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_019678	ATT	2	6	276853	276858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019678	ACA	2	6	276876	276881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019678	TAAA	2	8	276890	276897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019678	ATT	2	6	276911	276916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019678	GA	3	6	276929	276934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019678	AAT	2	6	276939	276944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733836
6017	NC_019678	A	7	7	276949	276955	100 %	0 %	0 %	0 %	427733836
6018	NC_019678	AGA	2	6	276966	276971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6019	NC_019678	ACAA	2	8	276974	276981	75 %	0 %	0 %	25 %	427733836
6020	NC_019678	ATT	2	6	276987	276992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733836
6021	NC_019678	AGA	2	6	277017	277022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6022	NC_019678	TTGG	2	8	277035	277042	0 %	50 %	50 %	0 %	427733836
6023	NC_019678	TTAC	2	8	277105	277112	25 %	50 %	0 %	25 %	427733836
6024	NC_019678	TGA	3	9	277152	277160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6025	NC_019678	GTAT	2	8	277182	277189	25 %	50 %	25 %	0 %	427733836
6026	NC_019678	AGC	2	6	277266	277271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6027	NC_019678	TGC	2	6	277302	277307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6028	NC_019678	TTGA	2	8	277357	277364	25 %	50 %	25 %	0 %	427733836
6029	NC_019678	TAC	2	6	277386	277391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733836
6030	NC_019678	AGT	2	6	277401	277406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6031	NC_019678	CGT	2	6	277420	277425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6032	NC_019678	TGA	2	6	277479	277484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6033	NC_019678	AAT	2	6	277518	277523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733836
6034	NC_019678	GAT	2	6	277600	277605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6035	NC_019678	TTG	2	6	277606	277611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733836
6036	NC_019678	ACG	2	6	277632	277637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6037	NC_019678	TGT	2	6	277869	277874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733836
6038	NC_019678	AAT	2	6	277876	277881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733836
6039	NC_019678	GCT	2	6	277891	277896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6040	NC_019678	ATA	2	6	277919	277924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733836
6041	NC_019678	AAG	2	6	278000	278005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6042	NC_019678	TTA	2	6	278021	278026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733836
6043	NC_019678	ATTGCG	2	12	278055	278066	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	427733836
6044	NC_019678	T	6	6	278125	278130	0 %	100 %	0 %	0 %	427733836
6045	NC_019678	GAT	2	6	278131	278136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6046	NC_019678	GGTT	2	8	278151	278158	0 %	50 %	50 %	0 %	427733836
6047	NC_019678	GAA	2	6	278187	278192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6048	NC_019678	GAT	2	6	278281	278286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6049	NC_019678	GAA	2	6	278373	278378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6050	NC_019678	TAT	2	6	278545	278550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733836
6051	NC_019678	TGC	2	6	278553	278558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6052	NC_019678	TTGA	2	8	278635	278642	25 %	50 %	25 %	0 %	427733836
6053	NC_019678	GAT	2	6	278680	278685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6054	NC_019678	TGA	2	6	278766	278771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6055	NC_019678	A	6	6	278794	278799	100 %	0 %	0 %	0 %	427733836
6056	NC_019678	CAG	2	6	278870	278875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6057	NC_019678	TTTA	2	8	278877	278884	25 %	75 %	0 %	0 %	427733836
6058	NC_019678	GGT	2	6	278917	278922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733836
6059	NC_019678	GAT	2	6	278964	278969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6060	NC_019678	TGA	2	6	278984	278989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6061	NC_019678	TTA	2	6	279057	279062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733836
6062	NC_019678	TGA	2	6	279216	279221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6063	NC_019678	A	7	7	279236	279242	100 %	0 %	0 %	0 %	427733836
6064	NC_019678	AGA	2	6	279249	279254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6065	NC_019678	A	6	6	279268	279273	100 %	0 %	0 %	0 %	427733836
6066	NC_019678	ACCA	2	8	279305	279312	50 %	0 %	0 %	50 %	427733836
6067	NC_019678	GAT	2	6	279405	279410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6068	NC_019678	GAA	2	6	279475	279480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6069	NC_019678	CTC	2	6	279500	279505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733836
6070	NC_019678	ATA	3	9	279572	279580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733836
6071	NC_019678	GCT	2	6	279613	279618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733836
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6073	NC_019678	ACA	2	6	279845	279850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733836
6074	NC_019678	GGAATC	2	12	279870	279881	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	427733836
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6076	NC_019678	TACA	2	8	280022	280029	50 %	25 %	0 %	25 %	427733836
6077	NC_019678	GTG	2	6	280048	280053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733836
6078	NC_019678	GCA	2	6	280054	280059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733836
6079	NC_019678	AAAG	2	8	280126	280133	75 %	0 %	25 %	0 %	427733836
6080	NC_019678	AGA	3	9	280134	280142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733836
6081	NC_019678	AAGA	2	8	280318	280325	75 %	0 %	25 %	0 %	427733836
6082	NC_019678	TTA	2	6	280343	280348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733836
6083	NC_019678	GTA	2	6	280353	280358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733836
6084	NC_019678	ACT	2	6	280374	280379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6087	NC_019678	AAGA	2	8	280666	280673	75 %	0 %	25 %	0 %	427733837
6088	NC_019678	GTC	2	6	280688	280693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733837
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6090	NC_019678	TAT	2	6	280824	280829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733837
6091	NC_019678	GTT	2	6	280873	280878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733837
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6093	NC_019678	TAG	2	6	281004	281009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733837
6094	NC_019678	CAA	2	6	281017	281022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733837
6095	NC_019678	TTC	2	6	281044	281049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733837
6096	NC_019678	AAGC	2	8	281081	281088	50 %	0 %	25 %	25 %	427733837
6097	NC_019678	ATA	2	6	281105	281110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733837
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6101	NC_019678	GAT	2	6	281287	281292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733837
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6103	NC_019678	GCA	2	6	281377	281382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733837
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6105	NC_019678	GCT	2	6	281433	281438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733837
6106	NC_019678	A	6	6	281440	281445	100 %	0 %	0 %	0 %	427733837
6107	NC_019678	TAAGGA	2	12	281496	281507	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427733837
6108	NC_019678	CAG	2	6	281534	281539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733837
6109	NC_019678	TGC	2	6	281568	281573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733838
6110	NC_019678	TAG	2	6	281680	281685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733838
6111	NC_019678	GAA	2	6	281715	281720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733838
6112	NC_019678	GAA	2	6	281763	281768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733838
6113	NC_019678	ATTCA	2	10	281815	281824	40 %	40 %	0 %	20 %	427733838
6114	NC_019678	AAT	2	6	281859	281864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733838
6115	NC_019678	A	7	7	281893	281899	100 %	0 %	0 %	0 %	427733838
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6118	NC_019678	CAA	2	6	282048	282053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733838
6119	NC_019678	ACTTT	2	10	282082	282091	20 %	60 %	0 %	20 %	427733838
6120	NC_019678	TGATG	2	10	282113	282122	20 %	40 %	40 %	0 %	427733838
6121	NC_019678	ACG	2	6	282145	282150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733838
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6123	NC_019678	TAA	2	6	282282	282287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733838
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6242	NC_019678	AGTTG	2	10	287457	287466	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_019678	AT	3	6	288081	288086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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