MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019678	GCAAG	2	10	253589	253598	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5502	NC_019678	TAGC	2	8	253638	253645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5503	NC_019678	AATT	2	8	253670	253677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019678	A	6	6	253745	253750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_019678	T	7	7	253815	253821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_019678	TCA	2	6	253872	253877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_019678	CAAT	2	8	253879	253886	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_019678	GAT	2	6	253925	253930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733817
5509	NC_019678	CAA	2	6	253950	253955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733817
5510	NC_019678	A	6	6	253954	253959	100 %	0 %	0 %	0 %	427733817
5511	NC_019678	GCT	2	6	253964	253969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733817
5512	NC_019678	GAT	2	6	254054	254059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733817
5513	NC_019678	AAC	2	6	254066	254071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733817
5514	NC_019678	AGCA	2	8	254160	254167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_019678	TAA	2	6	254223	254228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_019678	TGC	2	6	254250	254255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_019678	A	6	6	254268	254273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_019678	AAC	2	6	254322	254327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_019678	ATTT	2	8	254344	254351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_019678	TTA	2	6	254352	254357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_019678	A	6	6	254357	254362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_019678	A	6	6	254369	254374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019678	ATT	2	6	254407	254412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_019678	GAA	2	6	254657	254662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_019678	GAA	2	6	254708	254713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_019678	CAA	2	6	254720	254725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_019678	AAG	2	6	254787	254792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_019678	AGC	2	6	254812	254817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_019678	GA	3	6	254824	254829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_019678	GAT	2	6	254846	254851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_019678	TAAAA	2	10	254855	254864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_019678	A	8	8	254885	254892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_019678	TGCC	2	8	254914	254921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_019678	T	6	6	254985	254990	0 %	100 %	0 %	0 %	427733818
5535	NC_019678	CTT	2	6	255056	255061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733818
5536	NC_019678	AATT	2	8	255125	255132	50 %	50 %	0 %	0 %	427733818
5537	NC_019678	T	6	6	255131	255136	0 %	100 %	0 %	0 %	427733818
5538	NC_019678	TTC	2	6	255138	255143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733818
5539	NC_019678	T	8	8	255171	255178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_019678	GC	3	6	255208	255213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_019678	AT	3	6	255253	255258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_019678	GT	3	6	255262	255267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_019678	GCG	2	6	255355	255360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733819
5544	NC_019678	CTG	2	6	255368	255373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5545	NC_019678	CGCAAA	2	12	255512	255523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427733819
5546	NC_019678	TGG	2	6	255527	255532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733819
5547	NC_019678	TTA	2	6	255544	255549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733819
5548	NC_019678	TGT	2	6	255585	255590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733819
5549	NC_019678	CGG	2	6	255606	255611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733819
5550	NC_019678	GCA	2	6	255624	255629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5551	NC_019678	AG	3	6	255729	255734	50 %	0 %	50 %	0 %	427733819
5552	NC_019678	GCT	2	6	255769	255774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5553	NC_019678	TCG	2	6	255848	255853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5554	NC_019678	GAA	2	6	255880	255885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733819
5555	NC_019678	ACC	2	6	255891	255896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733819
5556	NC_019678	A	6	6	255929	255934	100 %	0 %	0 %	0 %	427733819
5557	NC_019678	AATT	2	8	255953	255960	50 %	50 %	0 %	0 %	427733819
5558	NC_019678	TTG	2	6	256010	256015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733819
5559	NC_019678	GTC	2	6	256016	256021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5560	NC_019678	TTA	2	6	256042	256047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733819
5561	NC_019678	ACC	2	6	256096	256101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733819
5562	NC_019678	GGC	2	6	256132	256137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733819
5563	NC_019678	AGA	2	6	256179	256184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733819
5564	NC_019678	AGC	2	6	256230	256235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5565	NC_019678	CAA	2	6	256262	256267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733819
5566	NC_019678	AATT	2	8	256289	256296	50 %	50 %	0 %	0 %	427733819
5567	NC_019678	TAA	2	6	256335	256340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733819
5568	NC_019678	TTA	2	6	256348	256353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733819
5569	NC_019678	ATC	2	6	256371	256376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733819
5570	NC_019678	CAG	3	9	256415	256423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5571	NC_019678	A	6	6	256425	256430	100 %	0 %	0 %	0 %	427733819
5572	NC_019678	GAA	2	6	256441	256446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733819
5573	NC_019678	AGC	2	6	256527	256532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733819
5574	NC_019678	ATTA	2	8	256536	256543	50 %	50 %	0 %	0 %	427733819
5575	NC_019678	GAA	2	6	256657	256662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733819
5576	NC_019678	TAGA	2	8	256679	256686	50 %	25 %	25 %	0 %	427733819
5577	NC_019678	ATT	2	6	256823	256828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_019678	TAAT	2	8	256839	256846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_019678	TTCT	2	8	256857	256864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5580	NC_019678	TA	3	6	256866	256871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_019678	ATT	2	6	256888	256893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_019678	ACT	2	6	256907	256912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_019678	A	7	7	256924	256930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_019678	TAAA	2	8	256932	256939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_019678	A	6	6	256969	256974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_019678	ACT	2	6	256990	256995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_019678	TGA	2	6	257022	257027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_019678	TAA	2	6	257041	257046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_019678	AAT	2	6	257115	257120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_019678	ACCA	2	8	257139	257146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_019678	TAA	2	6	257163	257168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_019678	GTG	2	6	257237	257242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733820
5593	NC_019678	TCG	2	6	257286	257291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733820
5594	NC_019678	CTT	2	6	257313	257318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733820
5595	NC_019678	GA	3	6	257328	257333	50 %	0 %	50 %	0 %	427733820
5596	NC_019678	A	6	6	257397	257402	100 %	0 %	0 %	0 %	427733820
5597	NC_019678	AAT	3	9	257405	257413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733820
5598	NC_019678	A	6	6	257420	257425	100 %	0 %	0 %	0 %	427733820
5599	NC_019678	ACG	2	6	257579	257584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733821
5600	NC_019678	TCT	2	6	257597	257602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733821
5601	NC_019678	ACA	2	6	257726	257731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_019678	AACT	2	8	257777	257784	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_019678	AAAT	2	8	257796	257803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_019678	TGAT	2	8	258036	258043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_019678	TTGC	2	8	258061	258068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_019678	GTA	2	6	258070	258075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_019678	TGC	2	6	258138	258143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
5608	NC_019678	A	6	6	258223	258228	100 %	0 %	0 %	0 %	427733822
5609	NC_019678	AAC	2	6	258312	258317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733822
5610	NC_019678	CTG	2	6	258333	258338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
5611	NC_019678	CAGT	2	8	258380	258387	25 %	25 %	25 %	25 %	427733822
5612	NC_019678	ATT	2	6	258497	258502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733822
5613	NC_019678	AAC	2	6	258504	258509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733822
5614	NC_019678	AAT	2	6	258545	258550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733822
5615	NC_019678	CCAA	2	8	258595	258602	50 %	0 %	0 %	50 %	427733822
5616	NC_019678	GCT	2	6	258737	258742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
5617	NC_019678	CTC	2	6	258756	258761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427733822
5618	NC_019678	CAA	2	6	258809	258814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733822
5619	NC_019678	TAA	2	6	258883	258888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733822
5620	NC_019678	CAA	2	6	258910	258915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733822
5621	NC_019678	GCTG	2	8	258938	258945	0 %	25 %	50 %	25 %	427733822
5622	NC_019678	TGC	2	6	258952	258957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
5623	NC_019678	AAAC	2	8	259040	259047	75 %	0 %	0 %	25 %	427733822
5624	NC_019678	CAAA	2	8	259231	259238	75 %	0 %	0 %	25 %	427733822
5625	NC_019678	ATC	2	6	259299	259304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733822
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5628	NC_019678	GCT	4	12	259388	259399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733822
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