MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019678	AGG	2	6	230110	230115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019678	G	6	6	230114	230119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019678	A	6	6	230149	230154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019678	ACT	2	6	230165	230170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019678	AAT	2	6	230367	230372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733794
5006	NC_019678	CTT	2	6	230387	230392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733794
5007	NC_019678	T	6	6	230421	230426	0 %	100 %	0 %	0 %	427733794
5008	NC_019678	CGT	2	6	230477	230482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733794
5009	NC_019678	AAT	2	6	230483	230488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733794
5010	NC_019678	T	6	6	230529	230534	0 %	100 %	0 %	0 %	427733794
5011	NC_019678	TATC	2	8	230554	230561	25 %	50 %	0 %	25 %	427733794
5012	NC_019678	GGT	2	6	230658	230663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733794
5013	NC_019678	CAG	2	6	230705	230710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733794
5014	NC_019678	CTC	2	6	230735	230740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_019678	TAC	2	6	230795	230800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_019678	TGT	2	6	230879	230884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019678	AAT	2	6	230998	231003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019678	CAAA	2	8	231032	231039	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_019678	TGA	2	6	231117	231122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019678	A	8	8	231178	231185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019678	CAA	2	6	231211	231216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_019678	AAC	2	6	231265	231270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_019678	AAT	2	6	231320	231325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019678	AT	3	6	231324	231329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019678	ATT	3	9	231334	231342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019678	ATT	2	6	231348	231353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019678	ATTGTT	2	12	231427	231438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019678	A	7	7	231447	231453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019678	A	8	8	231533	231540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019678	TCG	2	6	231556	231561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_019678	CAA	2	6	231604	231609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019678	CAGT	2	8	231635	231642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_019678	ACAA	2	8	231678	231685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_019678	GAAA	2	8	231724	231731	75 %	0 %	25 %	0 %	427733795
5035	NC_019678	AGCG	2	8	231740	231747	25 %	0 %	50 %	25 %	427733795
5036	NC_019678	TGT	2	6	231769	231774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733795
5037	NC_019678	AGTC	2	8	231925	231932	25 %	25 %	25 %	25 %	427733795
5038	NC_019678	CAA	2	6	231938	231943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733795
5039	NC_019678	GGC	2	6	231953	231958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733795
5040	NC_019678	TTA	2	6	231971	231976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733795
5041	NC_019678	AAGG	2	8	231977	231984	50 %	0 %	50 %	0 %	427733795
5042	NC_019678	AGC	2	6	232035	232040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733795
5043	NC_019678	CAC	2	6	232087	232092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427733795
5044	NC_019678	CGC	2	6	232159	232164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733795
5045	NC_019678	ACA	2	6	232196	232201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733795
5046	NC_019678	CTG	2	6	232320	232325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733795
5047	NC_019678	AGA	2	6	232330	232335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733795
5048	NC_019678	AAGTT	2	10	232365	232374	40 %	40 %	20 %	0 %	427733795
5049	NC_019678	GAA	2	6	232379	232384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733795
5050	NC_019678	AG	3	6	232423	232428	50 %	0 %	50 %	0 %	427733795
5051	NC_019678	AAG	2	6	232443	232448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733795
5052	NC_019678	A	6	6	232465	232470	100 %	0 %	0 %	0 %	427733795
5053	NC_019678	GTA	2	6	232478	232483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733795
5054	NC_019678	AGA	2	6	232531	232536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733795
5055	NC_019678	TCG	2	6	232569	232574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733795
5056	NC_019678	TGG	2	6	232618	232623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733795
5057	NC_019678	ATT	2	6	232649	232654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733795
5058	NC_019678	CAGT	2	8	232693	232700	25 %	25 %	25 %	25 %	427733795
5059	NC_019678	TGA	2	6	232725	232730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733795
5060	NC_019678	ACT	2	6	232732	232737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733795
5061	NC_019678	TGC	2	6	232786	232791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733795
5062	NC_019678	GTG	2	6	232806	232811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733795
5063	NC_019678	AAT	2	6	232904	232909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019678	GAAT	2	8	232953	232960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_019678	TAAT	2	8	232983	232990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019678	TTAA	2	8	232999	233006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_019678	TAA	2	6	233008	233013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_019678	TTA	2	6	233014	233019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_019678	T	7	7	233084	233090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019678	TGC	2	6	233111	233116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733796
5071	NC_019678	TTTG	2	8	233117	233124	0 %	75 %	25 %	0 %	427733796
5072	NC_019678	CTT	2	6	233137	233142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733796
5073	NC_019678	TTA	2	6	233158	233163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733796
5074	NC_019678	TTG	2	6	233242	233247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733796
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5076	NC_019678	T	6	6	233330	233335	0 %	100 %	0 %	0 %	427733796
5077	NC_019678	TGC	2	6	233350	233355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733796
5078	NC_019678	AGTT	2	8	233376	233383	25 %	50 %	25 %	0 %	427733796
5079	NC_019678	TAG	2	6	233400	233405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_019678	ATC	2	6	233449	233454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_019678	AAC	2	6	233459	233464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_019678	AAC	2	6	233466	233471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_019678	AAC	2	6	233494	233499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_019678	ATC	2	6	233519	233524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_019678	TGC	2	6	233597	233602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5086	NC_019678	AAG	2	6	233625	233630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733797
5087	NC_019678	GTAAT	2	10	233659	233668	40 %	40 %	20 %	0 %	427733797
5088	NC_019678	GCT	2	6	233670	233675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5089	NC_019678	TGT	2	6	233683	233688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733797
5090	NC_019678	TTG	2	6	233695	233700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733797
5091	NC_019678	CT	3	6	233704	233709	0 %	50 %	0 %	50 %	427733797
5092	NC_019678	CAG	2	6	233715	233720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733797
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5095	NC_019678	G	6	6	233840	233845	0 %	0 %	100 %	0 %	427733797
5096	NC_019678	TTCTGC	2	12	233846	233857	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	427733797
5097	NC_019678	TAG	2	6	233860	233865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733797
5098	NC_019678	TGC	2	6	233932	233937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5099	NC_019678	CGG	2	6	233951	233956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427733797
5100	NC_019678	GTA	2	6	233971	233976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733797
5101	NC_019678	TAT	2	6	234157	234162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733797
5102	NC_019678	GGT	2	6	234177	234182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5103	NC_019678	GGT	2	6	234194	234199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5104	NC_019678	GCT	5	15	234231	234245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5105	NC_019678	TGA	2	6	234256	234261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733797
5106	NC_019678	ATC	2	6	234273	234278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733797
5107	NC_019678	TGG	2	6	234289	234294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5108	NC_019678	TGG	2	6	234374	234379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5109	NC_019678	TGG	3	9	234386	234394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5110	NC_019678	TGC	2	6	234395	234400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5111	NC_019678	TGG	2	6	234401	234406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733797
5112	NC_019678	AGA	2	6	234443	234448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733797
5113	NC_019678	GAT	2	6	234455	234460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733797
5114	NC_019678	GCTC	2	8	234471	234478	0 %	25 %	25 %	50 %	427733797
5115	NC_019678	GAA	2	6	234601	234606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733797
5116	NC_019678	TTGC	2	8	234627	234634	0 %	50 %	25 %	25 %	427733797
5117	NC_019678	AGC	2	6	234655	234660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5118	NC_019678	ATT	2	6	234714	234719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733797
5119	NC_019678	CAG	2	6	234742	234747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733797
5120	NC_019678	AGCAA	2	10	234803	234812	60 %	0 %	20 %	20 %	427733797
5121	NC_019678	GGTA	2	8	234917	234924	25 %	25 %	50 %	0 %	427733797
5122	NC_019678	TGAAG	2	10	234935	234944	40 %	20 %	40 %	0 %	427733797
5123	NC_019678	ATT	2	6	234983	234988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_019678	TAA	2	6	234989	234994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_019678	GTATTA	2	12	235022	235033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_019678	TA	3	6	235045	235050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5500	NC_019678	AAAT	2	8	253574	253581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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