MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 187426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019678	GAA	2	6	208535	208540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4502	NC_019678	ATCA	2	8	208553	208560	50 %	25 %	0 %	25 %	427733773
4503	NC_019678	TGC	2	6	208623	208628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4504	NC_019678	AAAT	2	8	208656	208663	75 %	25 %	0 %	0 %	427733773
4505	NC_019678	AGT	3	9	208668	208676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4506	NC_019678	GTTC	2	8	208717	208724	0 %	50 %	25 %	25 %	427733773
4507	NC_019678	AGA	2	6	208815	208820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4508	NC_019678	A	7	7	208869	208875	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
4509	NC_019678	AGC	2	6	208878	208883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4510	NC_019678	AAG	2	6	208916	208921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4511	NC_019678	GCT	3	9	208942	208950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4512	NC_019678	AGC	2	6	208977	208982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4513	NC_019678	GAT	2	6	209008	209013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4514	NC_019678	TGC	2	6	209037	209042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4515	NC_019678	AAG	2	6	209052	209057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4516	NC_019678	AGC	2	6	209070	209075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4517	NC_019678	GCT	2	6	209131	209136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4518	NC_019678	CAG	2	6	209165	209170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4519	NC_019678	TTA	2	6	209180	209185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4520	NC_019678	CCG	2	6	209214	209219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733773
4521	NC_019678	A	6	6	209251	209256	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
4522	NC_019678	GCA	2	6	209257	209262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4523	NC_019678	ATA	2	6	209297	209302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733773
4524	NC_019678	TA	3	6	209356	209361	50 %	50 %	0 %	0 %	427733773
4525	NC_019678	GAA	2	6	209443	209448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4526	NC_019678	AAC	2	6	209506	209511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733773
4527	NC_019678	A	7	7	209544	209550	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
4528	NC_019678	GCA	2	6	209611	209616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4529	NC_019678	ATT	2	6	209620	209625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4530	NC_019678	TTC	2	6	209635	209640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733773
4531	NC_019678	TTA	2	6	209644	209649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4532	NC_019678	TAT	2	6	209660	209665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4533	NC_019678	GCT	2	6	209682	209687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4534	NC_019678	TCAA	2	8	209693	209700	50 %	25 %	0 %	25 %	427733773
4535	NC_019678	TGG	2	6	209742	209747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733773
4536	NC_019678	ATT	2	6	209770	209775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4537	NC_019678	TATC	2	8	209790	209797	25 %	50 %	0 %	25 %	427733773
4538	NC_019678	CGT	2	6	209904	209909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4539	NC_019678	A	6	6	209968	209973	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
4540	NC_019678	TAGATG	2	12	210116	210127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4541	NC_019678	AGTT	2	8	210209	210216	25 %	50 %	25 %	0 %	427733773
4542	NC_019678	AGA	2	6	210351	210356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4543	NC_019678	AAC	2	6	210378	210383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733773
4544	NC_019678	TCA	2	6	210418	210423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733773
4545	NC_019678	TGA	2	6	210468	210473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
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4547	NC_019678	TGG	2	6	210512	210517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427733773
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4549	NC_019678	TGA	2	6	210591	210596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4550	NC_019678	GAT	2	6	210604	210609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4551	NC_019678	AT	3	6	210642	210647	50 %	50 %	0 %	0 %	427733773
4552	NC_019678	GAA	2	6	210735	210740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4553	NC_019678	GTA	2	6	210755	210760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4554	NC_019678	GAT	2	6	210769	210774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733773
4555	NC_019678	CAT	2	6	210820	210825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733773
4556	NC_019678	A	6	6	210830	210835	100 %	0 %	0 %	0 %	427733773
4557	NC_019678	ATT	2	6	210844	210849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733773
4558	NC_019678	GCT	2	6	210913	210918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4559	NC_019678	AAGATA	2	12	210944	210955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	427733773
4560	NC_019678	ATGG	2	8	210957	210964	25 %	25 %	50 %	0 %	427733773
4561	NC_019678	GCT	2	6	210976	210981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427733773
4562	NC_019678	TTG	2	6	211035	211040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733773
4563	NC_019678	TG	3	6	211039	211044	0 %	50 %	50 %	0 %	427733773
4564	NC_019678	AGA	2	6	211053	211058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733773
4565	NC_019678	GTT	2	6	211102	211107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733773
4566	NC_019678	TAC	2	6	211152	211157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_019678	ATT	2	6	211162	211167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_019678	TC	3	6	211184	211189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_019678	A	6	6	211190	211195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_019678	AAT	2	6	211278	211283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_019678	CAA	2	6	211284	211289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_019678	ATA	2	6	211330	211335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_019678	GTA	2	6	211346	211351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_019678	CTA	2	6	211355	211360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_019678	GCAAA	2	10	211419	211428	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4576	NC_019678	A	7	7	211468	211474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_019678	TTA	2	6	211477	211482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_019678	AAT	2	6	211574	211579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_019678	ATC	2	6	211614	211619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733774
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4582	NC_019678	GAA	2	6	211759	211764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733774
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4588	NC_019678	CAT	2	6	211952	211957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733774
4589	NC_019678	ATG	2	6	211967	211972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733774
4590	NC_019678	TGA	2	6	211992	211997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733774
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4593	NC_019678	CA	3	6	212121	212126	50 %	0 %	0 %	50 %	427733774
4594	NC_019678	A	6	6	212145	212150	100 %	0 %	0 %	0 %	427733774
4595	NC_019678	AAT	2	6	212170	212175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733774
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4598	NC_019678	CAAG	2	8	212436	212443	50 %	0 %	25 %	25 %	427733775
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4601	NC_019678	AG	3	6	212635	212640	50 %	0 %	50 %	0 %	427733775
4602	NC_019678	AGC	2	6	212766	212771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427733775
4603	NC_019678	AAG	2	6	212774	212779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427733775
4604	NC_019678	GCC	2	6	212824	212829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427733775
4605	NC_019678	TGT	2	6	212919	212924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733775
4606	NC_019678	TAC	2	6	212981	212986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427733775
4607	NC_019678	ATA	2	6	213017	213022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733775
4608	NC_019678	ATA	2	6	213050	213055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427733775
4609	NC_019678	TAT	2	6	213132	213137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733775
4610	NC_019678	TAAT	2	8	213157	213164	50 %	50 %	0 %	0 %	427733775
4611	NC_019678	TTTA	2	8	213165	213172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_019678	AT	3	6	213192	213197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_019678	CT	3	6	213302	213307	0 %	50 %	0 %	50 %	427733776
4614	NC_019678	TGA	2	6	213330	213335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427733776
4615	NC_019678	AAAG	2	8	213406	213413	75 %	0 %	25 %	0 %	427733776
4616	NC_019678	TC	3	6	213427	213432	0 %	50 %	0 %	50 %	427733776
4617	NC_019678	TA	3	6	213475	213480	50 %	50 %	0 %	0 %	427733776
4618	NC_019678	TTG	2	6	213486	213491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427733776
4619	NC_019678	TCT	2	6	213510	213515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427733776
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4621	NC_019678	ATT	2	6	213620	213625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427733776
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4623	NC_019678	CAA	2	6	213691	213696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427733776
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