MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018609	A	6	6	135193	135198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_018609	CTA	2	6	135240	135245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3003	NC_018609	AATG	2	8	135369	135376	50 %	25 %	25 %	0 %	407450903
3004	NC_018609	T	6	6	135378	135383	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3005	NC_018609	ACAA	2	8	135386	135393	75 %	0 %	0 %	25 %	407450903
3006	NC_018609	TCT	2	6	135416	135421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3007	NC_018609	GCT	2	6	135449	135454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450903
3008	NC_018609	TCC	2	6	135557	135562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450903
3009	NC_018609	TAA	2	6	135639	135644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450903
3010	NC_018609	CTCA	2	8	135712	135719	25 %	25 %	0 %	50 %	407450903
3011	NC_018609	GTG	2	6	135740	135745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450903
3012	NC_018609	CT	3	6	135877	135882	0 %	50 %	0 %	50 %	407450903
3013	NC_018609	T	6	6	135907	135912	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3014	NC_018609	T	7	7	135953	135959	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3015	NC_018609	T	6	6	135961	135966	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3016	NC_018609	T	6	6	136239	136244	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3017	NC_018609	TTG	3	9	136249	136257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450903
3018	NC_018609	ATA	2	6	136268	136273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450903
3019	NC_018609	CTT	2	6	136476	136481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3020	NC_018609	AGA	2	6	136485	136490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450903
3021	NC_018609	CAT	2	6	136528	136533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3022	NC_018609	TTC	2	6	136564	136569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3023	NC_018609	ATCA	2	8	136624	136631	50 %	25 %	0 %	25 %	407450903
3024	NC_018609	TCC	2	6	136645	136650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450903
3025	NC_018609	TTA	2	6	136667	136672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450903
3026	NC_018609	AAT	2	6	136717	136722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450903
3027	NC_018609	TGA	2	6	136813	136818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450903
3028	NC_018609	TC	3	6	136931	136936	0 %	50 %	0 %	50 %	407450903
3029	NC_018609	GGT	2	6	136967	136972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450903
3030	NC_018609	CTT	2	6	136983	136988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3031	NC_018609	TCT	2	6	137030	137035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3032	NC_018609	AAT	2	6	137112	137117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450903
3033	NC_018609	TCA	2	6	137235	137240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3034	NC_018609	TAG	2	6	137241	137246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450903
3035	NC_018609	CAT	2	6	137277	137282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3036	NC_018609	T	6	6	137339	137344	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3037	NC_018609	CCA	2	6	137514	137519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450903
3038	NC_018609	GAC	2	6	137559	137564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450903
3039	NC_018609	TTC	2	6	137613	137618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3040	NC_018609	T	6	6	137641	137646	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3041	NC_018609	GCGTG	2	10	137668	137677	0 %	20 %	60 %	20 %	407450903
3042	NC_018609	GCA	2	6	137795	137800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450903
3043	NC_018609	T	6	6	137812	137817	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3044	NC_018609	ATC	2	6	137848	137853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3045	NC_018609	CTT	2	6	137961	137966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3046	NC_018609	AAGT	2	8	138009	138016	50 %	25 %	25 %	0 %	407450903
3047	NC_018609	TCA	2	6	138072	138077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450903
3048	NC_018609	CTT	3	9	138153	138161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3049	NC_018609	TCT	2	6	138272	138277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3050	NC_018609	AAGA	2	8	138300	138307	75 %	0 %	25 %	0 %	407450903
3051	NC_018609	TTC	2	6	138320	138325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450903
3052	NC_018609	GCC	2	6	138368	138373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407450903
3053	NC_018609	T	6	6	138384	138389	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3054	NC_018609	CT	3	6	138403	138408	0 %	50 %	0 %	50 %	407450903
3055	NC_018609	GCC	2	6	138458	138463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407450903
3056	NC_018609	T	6	6	138623	138628	0 %	100 %	0 %	0 %	407450903
3057	NC_018609	GTC	2	6	138644	138649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450903
3058	NC_018609	AGA	2	6	138708	138713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_018609	TTACTT	2	12	138718	138729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407450904
3060	NC_018609	T	7	7	138753	138759	0 %	100 %	0 %	0 %	407450904
3061	NC_018609	CTT	2	6	138776	138781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450904
3062	NC_018609	TCC	2	6	138797	138802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450904
3063	NC_018609	TC	3	6	138846	138851	0 %	50 %	0 %	50 %	407450904
3064	NC_018609	C	6	6	138855	138860	0 %	0 %	0 %	100 %	407450904
3065	NC_018609	TAT	2	6	138861	138866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450904
3066	NC_018609	TGG	2	6	138969	138974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450904
3067	NC_018609	A	6	6	138977	138982	100 %	0 %	0 %	0 %	407450904
3068	NC_018609	CAAA	2	8	139044	139051	75 %	0 %	0 %	25 %	407450904
3069	NC_018609	T	6	6	139101	139106	0 %	100 %	0 %	0 %	407450904
3070	NC_018609	ATAA	2	8	139108	139115	75 %	25 %	0 %	0 %	407450904
3071	NC_018609	CTTG	2	8	139154	139161	0 %	50 %	25 %	25 %	407450904
3072	NC_018609	CAT	2	6	139303	139308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450904
3073	NC_018609	ATC	2	6	139309	139314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450904
3074	NC_018609	TTG	2	6	139352	139357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450904
3075	NC_018609	CAA	2	6	139362	139367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450904
3076	NC_018609	ATTAT	2	10	139379	139388	40 %	60 %	0 %	0 %	407450904
3077	NC_018609	TCC	2	6	139437	139442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450904
3078	NC_018609	GTT	2	6	139461	139466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450904
3079	NC_018609	ATTT	2	8	139527	139534	25 %	75 %	0 %	0 %	407450904
3080	NC_018609	TAT	2	6	139546	139551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450904
3081	NC_018609	TCATA	2	10	139560	139569	40 %	40 %	0 %	20 %	407450904
3082	NC_018609	T	6	6	139595	139600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_018609	CAAG	2	8	139641	139648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_018609	CTA	2	6	139675	139680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_018609	AAT	2	6	139716	139721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_018609	CT	3	6	139726	139731	0 %	50 %	0 %	50 %	407450905
3087	NC_018609	ACA	2	6	139737	139742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450905
3088	NC_018609	AAT	2	6	139786	139791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450905
3089	NC_018609	TAC	2	6	139812	139817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450905
3090	NC_018609	CCA	2	6	139818	139823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450905
3091	NC_018609	AGCC	2	8	139867	139874	25 %	0 %	25 %	50 %	407450905
3092	NC_018609	GGT	2	6	139901	139906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450905
3093	NC_018609	AAT	2	6	139959	139964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450905
3094	NC_018609	TCC	2	6	140039	140044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450905
3095	NC_018609	ATA	3	9	140089	140097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450905
3096	NC_018609	TTTCTT	2	12	140106	140117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	407450905
3097	NC_018609	T	6	6	140136	140141	0 %	100 %	0 %	0 %	407450905
3098	NC_018609	T	7	7	140202	140208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_018609	TTAT	2	8	140211	140218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_018609	T	8	8	140284	140291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_018609	T	7	7	140295	140301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_018609	CT	3	6	140324	140329	0 %	50 %	0 %	50 %	407450906
3103	NC_018609	CAA	2	6	140332	140337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450906
3104	NC_018609	CTG	2	6	140371	140376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450906
3105	NC_018609	G	6	6	140440	140445	0 %	0 %	100 %	0 %	407450906
3106	NC_018609	AC	3	6	140530	140535	50 %	0 %	0 %	50 %	407450906
3107	NC_018609	GAA	2	6	140539	140544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450906
3108	NC_018609	ATAA	2	8	140552	140559	75 %	25 %	0 %	0 %	407450906
3109	NC_018609	GT	3	6	140645	140650	0 %	50 %	50 %	0 %	407450906
3110	NC_018609	TAA	2	6	140754	140759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450906
3111	NC_018609	TA	3	6	140803	140808	50 %	50 %	0 %	0 %	407450906
3112	NC_018609	TTTTGA	2	12	140818	140829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	407450906
3113	NC_018609	ACC	2	6	140836	140841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450906
3114	NC_018609	T	6	6	140873	140878	0 %	100 %	0 %	0 %	407450906
3115	NC_018609	T	6	6	140985	140990	0 %	100 %	0 %	0 %	407450906
3116	NC_018609	TTG	2	6	141019	141024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450906
3117	NC_018609	GAT	2	6	141071	141076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450906
3118	NC_018609	ATT	2	6	141103	141108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450906
3119	NC_018609	TAC	2	6	141129	141134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450906
3120	NC_018609	AAAT	2	8	141148	141155	75 %	25 %	0 %	0 %	407450906
3121	NC_018609	TGAT	2	8	141203	141210	25 %	50 %	25 %	0 %	407450906
3122	NC_018609	AT	3	6	141209	141214	50 %	50 %	0 %	0 %	407450906
3123	NC_018609	TAA	2	6	141220	141225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450906
3124	NC_018609	TTC	2	6	141319	141324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450906
3125	NC_018609	TAA	2	6	141384	141389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450906
3126	NC_018609	TCA	2	6	141401	141406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450906
3127	NC_018609	CT	3	6	141471	141476	0 %	50 %	0 %	50 %	407450906
3128	NC_018609	T	6	6	141505	141510	0 %	100 %	0 %	0 %	407450907
3129	NC_018609	TTG	2	6	141527	141532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450907
3130	NC_018609	AAT	2	6	141563	141568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450907
3131	NC_018609	A	6	6	141669	141674	100 %	0 %	0 %	0 %	407450907
3132	NC_018609	CGGT	2	8	141687	141694	0 %	25 %	50 %	25 %	407450907
3133	NC_018609	GTC	2	6	141830	141835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450907
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3155	NC_018609	T	6	6	142876	142881	0 %	100 %	0 %	0 %	407450907
3156	NC_018609	ATC	2	6	142904	142909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450907
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3159	NC_018609	TCC	2	6	143213	143218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3163	NC_018609	AGG	2	6	143287	143292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_018609	T	6	6	143303	143308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_018609	GAGC	2	8	143324	143331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3166	NC_018609	TA	3	6	143344	143349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_018609	AAT	2	6	143378	143383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3170	NC_018609	TATT	2	8	143486	143493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_018609	T	7	7	143508	143514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_018609	TAC	2	6	143527	143532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3176	NC_018609	TAA	2	6	143681	143686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3239	NC_018609	GACT	2	8	146177	146184	25 %	25 %	25 %	25 %	407450913
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3244	NC_018609	A	8	8	146385	146392	100 %	0 %	0 %	0 %	407450914
3245	NC_018609	AC	3	6	146406	146411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3246	NC_018609	A	7	7	146468	146474	100 %	0 %	0 %	0 %	407450915
3247	NC_018609	TAA	2	6	146554	146559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450915
3248	NC_018609	A	6	6	146572	146577	100 %	0 %	0 %	0 %	407450915
3249	NC_018609	A	6	6	146581	146586	100 %	0 %	0 %	0 %	407450915
3250	NC_018609	GGT	2	6	146587	146592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450915
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