MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_018609	AAG	2	6	111486	111491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450886
2503	NC_018609	TGTA	2	8	111505	111512	25 %	50 %	25 %	0 %	407450886
2504	NC_018609	TAT	2	6	111703	111708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_018609	T	7	7	111708	111714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_018609	TAA	2	6	111832	111837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450887
2507	NC_018609	AT	3	6	111898	111903	50 %	50 %	0 %	0 %	407450887
2508	NC_018609	TCCG	2	8	111954	111961	0 %	25 %	25 %	50 %	407450887
2509	NC_018609	AAT	2	6	111977	111982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450887
2510	NC_018609	TAT	2	6	111989	111994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450887
2511	NC_018609	TTTC	2	8	112010	112017	0 %	75 %	0 %	25 %	407450887
2512	NC_018609	TTA	2	6	112028	112033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450887
2513	NC_018609	ATA	3	9	112098	112106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450887
2514	NC_018609	AT	3	6	112115	112120	50 %	50 %	0 %	0 %	407450887
2515	NC_018609	TTATT	2	10	112160	112169	20 %	80 %	0 %	0 %	407450887
2516	NC_018609	TGA	2	6	112184	112189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450887
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2518	NC_018609	CCT	2	6	112336	112341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450887
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2522	NC_018609	TGG	2	6	112565	112570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450887
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2525	NC_018609	AAGCC	2	10	112932	112941	40 %	0 %	20 %	40 %	407450887
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2530	NC_018609	TCCAAA	2	12	113271	113282	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407450887
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2532	NC_018609	TGG	2	6	113357	113362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450887
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2534	NC_018609	TCC	2	6	113376	113381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450887
2535	NC_018609	TAAA	2	8	113429	113436	75 %	25 %	0 %	0 %	407450887
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2545	NC_018609	CAT	2	6	114152	114157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450887
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2547	NC_018609	CTT	2	6	114181	114186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450887
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2550	NC_018609	GATA	2	8	114236	114243	50 %	25 %	25 %	0 %	407450887
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2553	NC_018609	CATA	2	8	114395	114402	50 %	25 %	0 %	25 %	407450887
2554	NC_018609	ACC	2	6	114553	114558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450887
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2557	NC_018609	T	6	6	114802	114807	0 %	100 %	0 %	0 %	407450887
2558	NC_018609	ACT	2	6	114850	114855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450887
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2560	NC_018609	T	8	8	114906	114913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_018609	AT	3	6	114953	114958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_018609	TTTA	2	8	114971	114978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_018609	AATAAA	2	12	114980	114991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2573	NC_018609	TA	3	6	115275	115280	50 %	50 %	0 %	0 %	407450889
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2583	NC_018609	TAG	2	6	115690	115695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450889
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2591	NC_018609	AAAAT	2	10	115992	116001	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_018609	AC	3	6	116010	116015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_018609	TCAT	2	8	116019	116026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2594	NC_018609	TTA	2	6	116032	116037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_018609	TAA	2	6	116083	116088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2598	NC_018609	A	7	7	116156	116162	100 %	0 %	0 %	0 %	407450890
2599	NC_018609	GGT	3	9	116225	116233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450890
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2604	NC_018609	TAG	2	6	116511	116516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450890
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2607	NC_018609	TAA	2	6	116683	116688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450890
2608	NC_018609	TAT	2	6	116697	116702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450890
2609	NC_018609	AGT	2	6	116713	116718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450890
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2611	NC_018609	GAA	2	6	116783	116788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450890
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2613	NC_018609	T	6	6	116867	116872	0 %	100 %	0 %	0 %	407450890
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2623	NC_018609	A	6	6	117395	117400	100 %	0 %	0 %	0 %	407450890
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2999	NC_018609	CT	3	6	135177	135182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3000	NC_018609	TCA	2	6	135185	135190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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