MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_018609	A	6	6	64831	64836	100 %	0 %	0 %	0 %	407450845
1503	NC_018609	TAA	2	6	64845	64850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450845
1504	NC_018609	T	6	6	64873	64878	0 %	100 %	0 %	0 %	407450845
1505	NC_018609	AGC	2	6	64909	64914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450845
1506	NC_018609	AAAT	2	8	64991	64998	75 %	25 %	0 %	0 %	407450845
1507	NC_018609	AAGCAT	2	12	65037	65048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407450845
1508	NC_018609	CCA	2	6	65106	65111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450845
1509	NC_018609	A	6	6	65144	65149	100 %	0 %	0 %	0 %	407450845
1510	NC_018609	CT	3	6	65161	65166	0 %	50 %	0 %	50 %	407450845
1511	NC_018609	CCA	2	6	65174	65179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450845
1512	NC_018609	TATT	2	8	65210	65217	25 %	75 %	0 %	0 %	407450845
1513	NC_018609	GCA	2	6	65225	65230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450845
1514	NC_018609	T	6	6	65268	65273	0 %	100 %	0 %	0 %	407450845
1515	NC_018609	CTC	2	6	65308	65313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450845
1516	NC_018609	GGTA	2	8	65319	65326	25 %	25 %	50 %	0 %	407450845
1517	NC_018609	T	7	7	65446	65452	0 %	100 %	0 %	0 %	407450845
1518	NC_018609	ACT	2	6	65505	65510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1519	NC_018609	T	6	6	65558	65563	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
1520	NC_018609	TCT	2	6	65576	65581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1521	NC_018609	TCT	2	6	65588	65593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1522	NC_018609	ATA	2	6	65638	65643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450846
1523	NC_018609	GGTAA	2	10	65683	65692	40 %	20 %	40 %	0 %	407450846
1524	NC_018609	TTC	2	6	65701	65706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1525	NC_018609	ATCT	2	8	65898	65905	25 %	50 %	0 %	25 %	407450846
1526	NC_018609	TCA	2	6	65936	65941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1527	NC_018609	TTC	2	6	65968	65973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1528	NC_018609	AGCC	2	8	65982	65989	25 %	0 %	25 %	50 %	407450846
1529	NC_018609	AAT	2	6	66009	66014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450846
1530	NC_018609	T	6	6	66079	66084	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
1531	NC_018609	T	6	6	66114	66119	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
1532	NC_018609	TGA	2	6	66132	66137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450846
1533	NC_018609	T	6	6	66201	66206	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
1534	NC_018609	T	6	6	66228	66233	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
1535	NC_018609	CAT	2	6	66237	66242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1536	NC_018609	CTTGAG	2	12	66252	66263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407450846
1537	NC_018609	ACC	2	6	66269	66274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450846
1538	NC_018609	A	6	6	66322	66327	100 %	0 %	0 %	0 %	407450846
1539	NC_018609	TA	3	6	66340	66345	50 %	50 %	0 %	0 %	407450846
1540	NC_018609	CAAT	2	8	66425	66432	50 %	25 %	0 %	25 %	407450846
1541	NC_018609	TCTTG	2	10	66443	66452	0 %	60 %	20 %	20 %	407450846
1542	NC_018609	CTT	2	6	66453	66458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1543	NC_018609	TTCT	2	8	66472	66479	0 %	75 %	0 %	25 %	407450846
1544	NC_018609	TC	3	6	66501	66506	0 %	50 %	0 %	50 %	407450846
1545	NC_018609	TCA	2	6	66512	66517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1546	NC_018609	CT	3	6	66523	66528	0 %	50 %	0 %	50 %	407450846
1547	NC_018609	TTA	2	6	66560	66565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450846
1548	NC_018609	CAT	2	6	66600	66605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1549	NC_018609	CCT	2	6	66677	66682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450846
1550	NC_018609	TTG	2	6	66857	66862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450846
1551	NC_018609	T	6	6	67000	67005	0 %	100 %	0 %	0 %	407450846
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1553	NC_018609	TCAC	2	8	67121	67128	25 %	25 %	0 %	50 %	407450846
1554	NC_018609	AGC	2	6	67135	67140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450846
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1556	NC_018609	TCT	2	6	67229	67234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1557	NC_018609	CCTTTT	2	12	67236	67247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1558	NC_018609	TAG	2	6	67276	67281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450846
1559	NC_018609	CAT	2	6	67293	67298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1560	NC_018609	TCT	2	6	67319	67324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450846
1561	NC_018609	TCA	2	6	67352	67357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450846
1562	NC_018609	ATTC	2	8	67394	67401	25 %	50 %	0 %	25 %	407450847
1563	NC_018609	ACTC	2	8	67484	67491	25 %	25 %	0 %	50 %	407450847
1564	NC_018609	TCG	2	6	67534	67539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450847
1565	NC_018609	TCC	2	6	67572	67577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450847
1566	NC_018609	AT	3	6	67597	67602	50 %	50 %	0 %	0 %	407450847
1567	NC_018609	ATA	2	6	67614	67619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450847
1568	NC_018609	CCA	2	6	67645	67650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450847
1569	NC_018609	TCA	2	6	67713	67718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450847
1570	NC_018609	GCA	2	6	67737	67742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450847
1571	NC_018609	T	7	7	67756	67762	0 %	100 %	0 %	0 %	407450847
1572	NC_018609	TTGA	2	8	67766	67773	25 %	50 %	25 %	0 %	407450847
1573	NC_018609	TTC	3	9	67778	67786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450847
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1576	NC_018609	TGA	2	6	68122	68127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450847
1577	NC_018609	TGA	3	9	68178	68186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450847
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1580	NC_018609	TCA	2	6	68612	68617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450848
1581	NC_018609	CAAA	2	8	68622	68629	75 %	0 %	0 %	25 %	407450848
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1585	NC_018609	TTC	2	6	68899	68904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450848
1586	NC_018609	CATAG	2	10	68917	68926	40 %	20 %	20 %	20 %	407450848
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1588	NC_018609	TCT	2	6	69008	69013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450848
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1590	NC_018609	TCT	2	6	69098	69103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450848
1591	NC_018609	CTG	2	6	69118	69123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450848
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1593	NC_018609	AAAG	2	8	69242	69249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_018609	TATC	2	8	69280	69287	25 %	50 %	0 %	25 %	407450849
1595	NC_018609	CTT	2	6	69311	69316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450849
1596	NC_018609	TGA	2	6	69320	69325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450849
1597	NC_018609	GAT	2	6	69383	69388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450849
1598	NC_018609	T	7	7	69452	69458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018609	GCC	2	6	69506	69511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_018609	CTT	2	6	69550	69555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450850
1601	NC_018609	TCT	2	6	69612	69617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450850
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1603	NC_018609	TCT	2	6	69654	69659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450850
1604	NC_018609	TA	3	6	69691	69696	50 %	50 %	0 %	0 %	407450850
1605	NC_018609	T	6	6	69703	69708	0 %	100 %	0 %	0 %	407450850
1606	NC_018609	TCT	2	6	69761	69766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450850
1607	NC_018609	TAG	2	6	69852	69857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450850
1608	NC_018609	CCT	2	6	69968	69973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450850
1609	NC_018609	TAC	2	6	70006	70011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450850
1610	NC_018609	ATT	2	6	70024	70029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450850
1611	NC_018609	TGT	2	6	70036	70041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450850
1612	NC_018609	ACTTCC	2	12	70087	70098	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	407450850
1613	NC_018609	ATT	2	6	70102	70107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450850
1614	NC_018609	AT	3	6	70149	70154	50 %	50 %	0 %	0 %	407450850
1615	NC_018609	CTA	2	6	70296	70301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450850
1616	NC_018609	CCT	2	6	70346	70351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450850
1617	NC_018609	AT	3	6	70355	70360	50 %	50 %	0 %	0 %	407450850
1618	NC_018609	AAG	2	6	70386	70391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450850
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1621	NC_018609	TAA	2	6	70600	70605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450850
1622	NC_018609	T	6	6	70678	70683	0 %	100 %	0 %	0 %	407450850
1623	NC_018609	AAAT	2	8	70705	70712	75 %	25 %	0 %	0 %	407450850
1624	NC_018609	TCC	2	6	70714	70719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450850
1625	NC_018609	CAT	2	6	70752	70757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450850
1626	NC_018609	GTA	2	6	70813	70818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450850
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