MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018609	ATC	2	6	42481	42486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450827
1002	NC_018609	AACG	2	8	42497	42504	50 %	0 %	25 %	25 %	407450827
1003	NC_018609	CAG	2	6	42594	42599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450827
1004	NC_018609	TCT	2	6	42638	42643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450827
1005	NC_018609	A	6	6	42647	42652	100 %	0 %	0 %	0 %	407450827
1006	NC_018609	A	7	7	42720	42726	100 %	0 %	0 %	0 %	407450827
1007	NC_018609	TAT	2	6	42727	42732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450827
1008	NC_018609	CAT	2	6	42748	42753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450827
1009	NC_018609	TAAAA	2	10	42769	42778	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018609	A	6	6	42781	42786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018609	AGA	2	6	42804	42809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018609	TAA	2	6	42816	42821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018609	ATTT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	407450828
1014	NC_018609	TAAA	2	8	42882	42889	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
1015	NC_018609	TTA	2	6	42896	42901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450828
1016	NC_018609	TAGC	2	8	42941	42948	25 %	25 %	25 %	25 %	407450828
1017	NC_018609	T	6	6	42974	42979	0 %	100 %	0 %	0 %	407450828
1018	NC_018609	TAC	2	6	43038	43043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450828
1019	NC_018609	AGAAAC	2	12	43047	43058	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	407450828
1020	NC_018609	TAT	2	6	43079	43084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450828
1021	NC_018609	A	6	6	43085	43090	100 %	0 %	0 %	0 %	407450828
1022	NC_018609	TAAA	2	8	43101	43108	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
1023	NC_018609	AGC	2	6	43137	43142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1024	NC_018609	TCTAA	2	10	43222	43231	40 %	40 %	0 %	20 %	407450828
1025	NC_018609	TTA	2	6	43237	43242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450828
1026	NC_018609	TAAA	2	8	43359	43366	75 %	25 %	0 %	0 %	407450828
1027	NC_018609	ATG	3	9	43394	43402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450828
1028	NC_018609	TGC	2	6	43593	43598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1029	NC_018609	TAC	2	6	43623	43628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450828
1030	NC_018609	CTG	2	6	43673	43678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1031	NC_018609	CTA	2	6	43699	43704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450828
1032	NC_018609	TAA	2	6	43766	43771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450828
1033	NC_018609	CTG	2	6	43772	43777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1034	NC_018609	TGC	2	6	43779	43784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1035	NC_018609	TTCA	2	8	43797	43804	25 %	50 %	0 %	25 %	407450828
1036	NC_018609	TCTATC	2	12	43827	43838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	407450828
1037	NC_018609	CTG	2	6	43874	43879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450828
1038	NC_018609	AGCTAT	2	12	43923	43934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	407450828
1039	NC_018609	CAA	2	6	44061	44066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018609	A	6	6	44080	44085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018609	T	7	7	44099	44105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018609	TAAT	2	8	44120	44127	50 %	50 %	0 %	0 %	407450829
1043	NC_018609	AT	3	6	44126	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	407450829
1044	NC_018609	ACT	2	6	44138	44143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450829
1045	NC_018609	TCA	2	6	44217	44222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450829
1046	NC_018609	AGA	2	6	44225	44230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450829
1047	NC_018609	TC	3	6	44249	44254	0 %	50 %	0 %	50 %	407450829
1048	NC_018609	TAA	2	6	44359	44364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450829
1049	NC_018609	ATA	2	6	44399	44404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450829
1050	NC_018609	AAT	2	6	44474	44479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450829
1051	NC_018609	ATA	2	6	44519	44524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450829
1052	NC_018609	GAG	2	6	44554	44559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450829
1053	NC_018609	CTTT	2	8	44566	44573	0 %	75 %	0 %	25 %	407450829
1054	NC_018609	TTCT	2	8	44597	44604	0 %	75 %	0 %	25 %	407450829
1055	NC_018609	ATA	2	6	44623	44628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450829
1056	NC_018609	CAA	2	6	44653	44658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450829
1057	NC_018609	CTA	2	6	44734	44739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450829
1058	NC_018609	TAT	2	6	44831	44836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450829
1059	NC_018609	CTT	2	6	44844	44849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450829
1060	NC_018609	GTT	2	6	44881	44886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450829
1061	NC_018609	CTT	2	6	44890	44895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450829
1062	NC_018609	CCG	2	6	44965	44970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407450829
1063	NC_018609	TAT	2	6	44974	44979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450829
1064	NC_018609	TTGA	2	8	44993	45000	25 %	50 %	25 %	0 %	407450829
1065	NC_018609	T	8	8	45049	45056	0 %	100 %	0 %	0 %	407450830
1066	NC_018609	TCT	2	6	45066	45071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450830
1067	NC_018609	TCA	2	6	45109	45114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450830
1068	NC_018609	ATA	2	6	45169	45174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450830
1069	NC_018609	ATT	2	6	45189	45194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450830
1070	NC_018609	ACTGT	2	10	45209	45218	20 %	40 %	20 %	20 %	407450830
1071	NC_018609	CCT	2	6	45256	45261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450830
1072	NC_018609	CCA	2	6	45297	45302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450830
1073	NC_018609	CTTCT	2	10	45323	45332	0 %	60 %	0 %	40 %	407450830
1074	NC_018609	CCG	2	6	45371	45376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407450830
1075	NC_018609	TCA	2	6	45383	45388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450830
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1077	NC_018609	ATA	2	6	45442	45447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450830
1078	NC_018609	AAAG	2	8	45460	45467	75 %	0 %	25 %	0 %	407450830
1079	NC_018609	TAC	2	6	45471	45476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450830
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1081	NC_018609	CAT	2	6	45494	45499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450830
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1083	NC_018609	CCA	2	6	45540	45545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450830
1084	NC_018609	GAT	2	6	45582	45587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450830
1085	NC_018609	CCAA	2	8	45617	45624	50 %	0 %	0 %	50 %	407450830
1086	NC_018609	TAG	2	6	45644	45649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450830
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1089	NC_018609	CCA	2	6	45755	45760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450830
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1093	NC_018609	CAA	2	6	45968	45973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450830
1094	NC_018609	TTA	2	6	46021	46026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450830
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1096	NC_018609	A	6	6	46157	46162	100 %	0 %	0 %	0 %	407450830
1097	NC_018609	ATAA	2	8	46177	46184	75 %	25 %	0 %	0 %	407450830
1098	NC_018609	TA	3	6	46214	46219	50 %	50 %	0 %	0 %	407450830
1099	NC_018609	CAAA	2	8	46256	46263	75 %	0 %	0 %	25 %	407450830
1100	NC_018609	GAT	2	6	46267	46272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450830
1101	NC_018609	CTT	2	6	46303	46308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450830
1102	NC_018609	TAT	2	6	46325	46330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450830
1103	NC_018609	TAA	2	6	46334	46339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450830
1104	NC_018609	ATA	2	6	46345	46350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450830
1105	NC_018609	A	6	6	46368	46373	100 %	0 %	0 %	0 %	407450830
1106	NC_018609	GCT	2	6	46384	46389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450830
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1108	NC_018609	A	6	6	46434	46439	100 %	0 %	0 %	0 %	407450830
1109	NC_018609	TTA	2	6	46471	46476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450830
1110	NC_018609	TTGT	2	8	46525	46532	0 %	75 %	25 %	0 %	407450830
1111	NC_018609	T	6	6	46550	46555	0 %	100 %	0 %	0 %	407450831
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1114	NC_018609	TTTTG	2	10	46612	46621	0 %	80 %	20 %	0 %	407450831
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1119	NC_018609	CAT	2	6	46811	46816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450831
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