MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018609	TGTCTA	2	12	21599	21610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407450812
502	NC_018609	TTTG	2	8	21632	21639	0 %	75 %	25 %	0 %	407450812
503	NC_018609	CAAT	2	8	21644	21651	50 %	25 %	0 %	25 %	407450812
504	NC_018609	TGT	2	6	21655	21660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450812
505	NC_018609	AAAT	2	8	21677	21684	75 %	25 %	0 %	0 %	407450812
506	NC_018609	CAA	2	6	21692	21697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450812
507	NC_018609	AT	3	6	21736	21741	50 %	50 %	0 %	0 %	407450812
508	NC_018609	CTT	2	6	21742	21747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450812
509	NC_018609	TAT	2	6	21767	21772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450812
510	NC_018609	AAT	2	6	21838	21843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450812
511	NC_018609	GTT	2	6	21910	21915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450812
512	NC_018609	ATT	2	6	21967	21972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450812
513	NC_018609	GTT	2	6	22090	22095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450812
514	NC_018609	T	6	6	22131	22136	0 %	100 %	0 %	0 %	407450812
515	NC_018609	TCAT	2	8	22138	22145	25 %	50 %	0 %	25 %	407450812
516	NC_018609	ATT	2	6	22161	22166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018609	TGG	2	6	22224	22229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450813
518	NC_018609	GAA	2	6	22238	22243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450813
519	NC_018609	A	6	6	22250	22255	100 %	0 %	0 %	0 %	407450813
520	NC_018609	CCA	2	6	22256	22261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450813
521	NC_018609	CAA	2	6	22270	22275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450813
522	NC_018609	TAA	2	6	22284	22289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450813
523	NC_018609	CAAA	2	8	22305	22312	75 %	0 %	0 %	25 %	407450813
524	NC_018609	T	6	6	22325	22330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018609	TAC	2	6	22521	22526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018609	GTT	2	6	22556	22561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018609	A	6	6	22617	22622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018609	AGT	2	6	22724	22729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018609	GCTTT	2	10	22750	22759	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
530	NC_018609	CGGG	2	8	22760	22767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
531	NC_018609	AGT	2	6	22867	22872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018609	TTGTC	2	10	22884	22893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
533	NC_018609	GTC	2	6	22895	22900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450814
534	NC_018609	CTC	2	6	22928	22933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450814
535	NC_018609	AAT	2	6	22962	22967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450814
536	NC_018609	CTG	2	6	23009	23014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450814
537	NC_018609	CTTG	2	8	23062	23069	0 %	50 %	25 %	25 %	407450814
538	NC_018609	CTT	2	6	23078	23083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450814
539	NC_018609	AATA	2	8	23101	23108	75 %	25 %	0 %	0 %	407450814
540	NC_018609	CGAAA	2	10	23142	23151	60 %	0 %	20 %	20 %	407450814
541	NC_018609	AAG	2	6	23226	23231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450814
542	NC_018609	T	6	6	23266	23271	0 %	100 %	0 %	0 %	407450814
543	NC_018609	ACT	2	6	23275	23280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450814
544	NC_018609	CAGC	2	8	23324	23331	25 %	0 %	25 %	50 %	407450814
545	NC_018609	A	6	6	23404	23409	100 %	0 %	0 %	0 %	407450814
546	NC_018609	TAT	2	6	23412	23417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450814
547	NC_018609	TTTC	2	8	23437	23444	0 %	75 %	0 %	25 %	407450814
548	NC_018609	GA	3	6	23491	23496	50 %	0 %	50 %	0 %	407450814
549	NC_018609	ATT	2	6	23544	23549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450814
550	NC_018609	TTC	2	6	23643	23648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450814
551	NC_018609	T	6	6	23684	23689	0 %	100 %	0 %	0 %	407450814
552	NC_018609	GTC	2	6	23714	23719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_018609	TTTG	2	8	23849	23856	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018609	TTC	2	6	23945	23950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450815
555	NC_018609	CTT	2	6	23956	23961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450815
556	NC_018609	CATC	2	8	24055	24062	25 %	25 %	0 %	50 %	407450815
557	NC_018609	AGG	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407450815
558	NC_018609	AGC	2	6	24107	24112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450815
559	NC_018609	ATC	2	6	24120	24125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450815
560	NC_018609	GAT	2	6	24198	24203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450815
561	NC_018609	T	6	6	24248	24253	0 %	100 %	0 %	0 %	407450815
562	NC_018609	TCA	2	6	24315	24320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450815
563	NC_018609	ATGCA	2	10	24344	24353	40 %	20 %	20 %	20 %	407450815
564	NC_018609	ATT	3	9	24356	24364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450815
565	NC_018609	ATA	2	6	24376	24381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450815
566	NC_018609	TGA	2	6	24390	24395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450815
567	NC_018609	A	6	6	24428	24433	100 %	0 %	0 %	0 %	407450815
568	NC_018609	TGA	2	6	24456	24461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450815
569	NC_018609	TTC	2	6	24491	24496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450815
570	NC_018609	CCA	2	6	24537	24542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450815
571	NC_018609	AAT	2	6	24548	24553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450815
572	NC_018609	CTG	2	6	24562	24567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450815
573	NC_018609	CTT	3	9	24602	24610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450815
574	NC_018609	CAA	2	6	24671	24676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450815
575	NC_018609	T	6	6	24738	24743	0 %	100 %	0 %	0 %	407450815
576	NC_018609	TCA	2	6	24765	24770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450815
577	NC_018609	ATA	2	6	24803	24808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450815
578	NC_018609	T	6	6	24827	24832	0 %	100 %	0 %	0 %	407450815
579	NC_018609	CCTGA	2	10	24841	24850	20 %	20 %	20 %	40 %	407450815
580	NC_018609	CCA	2	6	24873	24878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450815
581	NC_018609	TAA	2	6	24941	24946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450815
582	NC_018609	AGTC	2	8	24956	24963	25 %	25 %	25 %	25 %	407450815
583	NC_018609	CCA	3	9	24972	24980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450815
584	NC_018609	ATT	2	6	24981	24986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450815
585	NC_018609	TTTG	2	8	25015	25022	0 %	75 %	25 %	0 %	407450815
586	NC_018609	TTA	2	6	25090	25095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018609	A	7	7	25147	25153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018609	TTG	2	6	25180	25185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018609	TTTTA	2	10	25197	25206	20 %	80 %	0 %	0 %	407450816
590	NC_018609	CTT	2	6	25228	25233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450816
591	NC_018609	AAT	2	6	25250	25255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450816
592	NC_018609	A	6	6	25302	25307	100 %	0 %	0 %	0 %	407450816
593	NC_018609	AACC	2	8	25341	25348	50 %	0 %	0 %	50 %	407450816
594	NC_018609	A	6	6	25488	25493	100 %	0 %	0 %	0 %	407450816
595	NC_018609	TTG	2	6	25499	25504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450816
596	NC_018609	TAATT	2	10	25578	25587	40 %	60 %	0 %	0 %	407450816
597	NC_018609	T	6	6	25586	25591	0 %	100 %	0 %	0 %	407450816
598	NC_018609	T	6	6	25670	25675	0 %	100 %	0 %	0 %	407450816
599	NC_018609	TCT	2	6	25686	25691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450816
600	NC_018609	CCATT	2	10	25719	25728	20 %	40 %	0 %	40 %	407450816
601	NC_018609	ATT	2	6	25752	25757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450816
602	NC_018609	AAT	2	6	25772	25777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450816
603	NC_018609	ATT	2	6	25809	25814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450816
604	NC_018609	AAT	2	6	25843	25848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450816
605	NC_018609	GTTTT	2	10	25851	25860	0 %	80 %	20 %	0 %	407450816
606	NC_018609	T	6	6	25857	25862	0 %	100 %	0 %	0 %	407450816
607	NC_018609	CAT	2	6	25864	25869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450816
608	NC_018609	AT	3	6	25906	25911	50 %	50 %	0 %	0 %	407450816
609	NC_018609	TAA	2	6	25982	25987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450816
610	NC_018609	T	7	7	26011	26017	0 %	100 %	0 %	0 %	407450816
611	NC_018609	T	7	7	26030	26036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018609	ACT	2	6	26157	26162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_018609	T	6	6	26173	26178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018609	GTT	2	6	26199	26204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018609	ATT	2	6	26244	26249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450817
616	NC_018609	ATC	2	6	26258	26263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450817
617	NC_018609	T	6	6	26317	26322	0 %	100 %	0 %	0 %	407450817
618	NC_018609	A	6	6	26328	26333	100 %	0 %	0 %	0 %	407450817
619	NC_018609	GTC	2	6	26360	26365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407450817
620	NC_018609	GTT	2	6	26389	26394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450817
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622	NC_018609	ACC	2	6	26426	26431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450817
623	NC_018609	TA	3	6	26459	26464	50 %	50 %	0 %	0 %	407450817
624	NC_018609	TTG	2	6	26466	26471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450817
625	NC_018609	CTT	2	6	26505	26510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450817
626	NC_018609	TGA	2	6	26675	26680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450817
627	NC_018609	CAA	2	6	26821	26826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407450817
628	NC_018609	TGT	2	6	26878	26883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450817
629	NC_018609	A	6	6	26897	26902	100 %	0 %	0 %	0 %	407450817
630	NC_018609	TTG	2	6	26918	26923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407450817
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