MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018609	TCA	2	6	244337	244342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451012
5502	NC_018609	GCTAT	2	10	244397	244406	20 %	40 %	20 %	20 %	407451012
5503	NC_018609	A	7	7	244413	244419	100 %	0 %	0 %	0 %	407451012
5504	NC_018609	TCTA	2	8	244425	244432	25 %	50 %	0 %	25 %	407451012
5505	NC_018609	A	6	6	244537	244542	100 %	0 %	0 %	0 %	407451012
5506	NC_018609	AT	4	8	244589	244596	50 %	50 %	0 %	0 %	407451012
5507	NC_018609	A	6	6	244608	244613	100 %	0 %	0 %	0 %	407451012
5508	NC_018609	AGAC	2	8	244644	244651	50 %	0 %	25 %	25 %	407451012
5509	NC_018609	AAC	2	6	244682	244687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407451012
5510	NC_018609	ATC	2	6	244716	244721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_018609	TAG	2	6	244736	244741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_018609	AAG	2	6	244807	244812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451013
5513	NC_018609	A	6	6	244875	244880	100 %	0 %	0 %	0 %	407451013
5514	NC_018609	TGA	2	6	244901	244906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451013
5515	NC_018609	CGAA	2	8	244921	244928	50 %	0 %	25 %	25 %	407451013
5516	NC_018609	A	8	8	244930	244937	100 %	0 %	0 %	0 %	407451013
5517	NC_018609	AAAT	2	8	244951	244958	75 %	25 %	0 %	0 %	407451013
5518	NC_018609	AGA	2	6	244988	244993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451013
5519	NC_018609	TAG	2	6	245023	245028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451013
5520	NC_018609	AGA	2	6	245033	245038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451013
5521	NC_018609	ATT	2	6	245106	245111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451013
5522	NC_018609	GAC	2	6	245163	245168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407451013
5523	NC_018609	T	6	6	245231	245236	0 %	100 %	0 %	0 %	407451013
5524	NC_018609	AC	4	8	245268	245275	50 %	0 %	0 %	50 %	407451013
5525	NC_018609	CCT	2	6	245313	245318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451013
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5530	NC_018609	CTC	2	6	245712	245717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451013
5531	NC_018609	T	6	6	245825	245830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_018609	TGC	2	6	245847	245852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407451014
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5535	NC_018609	AGATA	2	10	245979	245988	60 %	20 %	20 %	0 %	407451014
5536	NC_018609	T	7	7	245993	245999	0 %	100 %	0 %	0 %	407451014
5537	NC_018609	TTTGG	2	10	246038	246047	0 %	60 %	40 %	0 %	407451014
5538	NC_018609	TTG	2	6	246059	246064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407451014
5539	NC_018609	CTGG	2	8	246086	246093	0 %	25 %	50 %	25 %	407451014
5540	NC_018609	ATA	2	6	246097	246102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451014
5541	NC_018609	TGA	2	6	246220	246225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407451014
5542	NC_018609	CCA	2	6	246233	246238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407451014
5543	NC_018609	A	6	6	246292	246297	100 %	0 %	0 %	0 %	407451014
5544	NC_018609	GAAA	2	8	246348	246355	75 %	0 %	25 %	0 %	407451014
5545	NC_018609	CTT	2	6	246362	246367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407451014
5546	NC_018609	T	7	7	246448	246454	0 %	100 %	0 %	0 %	407451014
5547	NC_018609	AT	3	6	246529	246534	50 %	50 %	0 %	0 %	407451014
5548	NC_018609	AAT	2	6	246536	246541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_018609	TTCT	2	8	246570	246577	0 %	75 %	0 %	25 %	407451015
5550	NC_018609	ATA	2	6	246609	246614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451015
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5552	NC_018609	CTA	2	6	246653	246658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451015
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5555	NC_018609	TCA	2	6	246808	246813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451015
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5557	NC_018609	TAC	2	6	247056	247061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451015
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5564	NC_018609	ATC	2	6	247260	247265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451015
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5592	NC_018609	GTTTA	2	10	248604	248613	20 %	60 %	20 %	0 %	407451016
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5597	NC_018609	TGCT	2	8	248979	248986	0 %	50 %	25 %	25 %	407451016
5598	NC_018609	AT	3	6	249115	249120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5615	NC_018609	TATT	2	8	249950	249957	25 %	75 %	0 %	0 %	407451018
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5620	NC_018609	AAT	2	6	250020	250025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451018
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5623	NC_018609	ATC	2	6	250118	250123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451018
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5625	NC_018609	T	6	6	250360	250365	0 %	100 %	0 %	0 %	407451019
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5634	NC_018609	T	7	7	251132	251138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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