MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 52002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018609	TGG	2	6	222260	222265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450995
5003	NC_018609	GAA	2	6	222407	222412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5004	NC_018609	GCC	2	6	222678	222683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407450995
5005	NC_018609	CTA	2	6	222727	222732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450995
5006	NC_018609	CAAAA	2	10	222823	222832	80 %	0 %	0 %	20 %	407450995
5007	NC_018609	CAT	3	9	222872	222880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450995
5008	NC_018609	CCA	2	6	222887	222892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450995
5009	NC_018609	GAA	2	6	222945	222950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5010	NC_018609	GA	3	6	223067	223072	50 %	0 %	50 %	0 %	407450995
5011	NC_018609	ACTCA	2	10	223119	223128	40 %	20 %	0 %	40 %	407450995
5012	NC_018609	TGA	2	6	223136	223141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450995
5013	NC_018609	TCA	2	6	223198	223203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450995
5014	NC_018609	ATA	2	6	223204	223209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450995
5015	NC_018609	AGC	2	6	223300	223305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407450995
5016	NC_018609	AGA	2	6	223307	223312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5017	NC_018609	GGAA	2	8	223331	223338	50 %	0 %	50 %	0 %	407450995
5018	NC_018609	ATG	2	6	223342	223347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450995
5019	NC_018609	GTG	2	6	223375	223380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450995
5020	NC_018609	TTA	2	6	223408	223413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450995
5021	NC_018609	CCA	2	6	223445	223450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450995
5022	NC_018609	ACC	2	6	223505	223510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450995
5023	NC_018609	GTG	2	6	223615	223620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450995
5024	NC_018609	AAG	2	6	223696	223701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5025	NC_018609	AGA	2	6	223706	223711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5026	NC_018609	A	6	6	223764	223769	100 %	0 %	0 %	0 %	407450995
5027	NC_018609	AGT	2	6	223839	223844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450995
5028	NC_018609	AAAT	2	8	223882	223889	75 %	25 %	0 %	0 %	407450995
5029	NC_018609	AGA	2	6	223925	223930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5030	NC_018609	AGA	2	6	223949	223954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407450995
5031	NC_018609	CTA	2	6	223965	223970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450995
5032	NC_018609	TCT	2	6	224038	224043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450995
5033	NC_018609	ATT	2	6	224103	224108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450995
5034	NC_018609	ATG	2	6	224178	224183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450995
5035	NC_018609	TGAA	2	8	224215	224222	50 %	25 %	25 %	0 %	407450995
5036	NC_018609	A	6	6	224290	224295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_018609	ATTT	2	8	224301	224308	25 %	75 %	0 %	0 %	407450996
5038	NC_018609	TAA	2	6	224353	224358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450996
5039	NC_018609	TCT	2	6	224397	224402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450996
5040	NC_018609	CT	3	6	224401	224406	0 %	50 %	0 %	50 %	407450996
5041	NC_018609	TCC	2	6	224445	224450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450996
5042	NC_018609	GAT	2	6	224568	224573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450996
5043	NC_018609	CAT	2	6	224644	224649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450996
5044	NC_018609	CT	3	6	224700	224705	0 %	50 %	0 %	50 %	407450996
5045	NC_018609	TAT	2	6	224767	224772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407450996
5046	NC_018609	CAC	2	6	224780	224785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450996
5047	NC_018609	GTA	3	9	224850	224858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407450996
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5049	NC_018609	TAA	2	6	224936	224941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407450996
5050	NC_018609	TTC	2	6	224955	224960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450996
5051	NC_018609	CAAA	2	8	225022	225029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5052	NC_018609	CCT	2	6	225159	225164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407450997
5053	NC_018609	ACT	2	6	225179	225184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450997
5054	NC_018609	CT	3	6	225183	225188	0 %	50 %	0 %	50 %	407450997
5055	NC_018609	ACC	2	6	225261	225266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407450997
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5057	NC_018609	TC	3	6	225310	225315	0 %	50 %	0 %	50 %	407450997
5058	NC_018609	T	6	6	225367	225372	0 %	100 %	0 %	0 %	407450997
5059	NC_018609	ACT	2	6	225401	225406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450997
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5061	NC_018609	A	6	6	225450	225455	100 %	0 %	0 %	0 %	407450997
5062	NC_018609	TTTC	2	8	225463	225470	0 %	75 %	0 %	25 %	407450997
5063	NC_018609	TCA	2	6	225559	225564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407450997
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5065	NC_018609	TCT	2	6	225618	225623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450997
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5071	NC_018609	A	6	6	225885	225890	100 %	0 %	0 %	0 %	407450997
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5081	NC_018609	CAAAT	2	10	226257	226266	60 %	20 %	0 %	20 %	407450998
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5092	NC_018609	CTT	2	6	226670	226675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450998
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5096	NC_018609	T	6	6	226786	226791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_018609	AC	3	6	226804	226809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5098	NC_018609	CAT	2	6	226841	226846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_018609	ATT	2	6	226856	226861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_018609	TAA	2	6	226937	226942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_018609	TCC	2	6	226993	226998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5103	NC_018609	GAAAA	2	10	227047	227056	80 %	0 %	20 %	0 %	407450999
5104	NC_018609	A	7	7	227089	227095	100 %	0 %	0 %	0 %	407450999
5105	NC_018609	A	6	6	227122	227127	100 %	0 %	0 %	0 %	407450999
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5109	NC_018609	A	6	6	227321	227326	100 %	0 %	0 %	0 %	407450999
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5114	NC_018609	AATA	2	8	227776	227783	75 %	25 %	0 %	0 %	407450999
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5119	NC_018609	TCT	2	6	227884	227889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407450999
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5122	NC_018609	TGG	2	6	228111	228116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407450999
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5242	NC_018609	CTC	2	6	232855	232860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407451002
5243	NC_018609	T	7	7	232932	232938	0 %	100 %	0 %	0 %	407451002
5244	NC_018609	TAT	2	6	232948	232953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_018609	TAT	2	6	232967	232972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5495	NC_018609	AGA	2	6	244093	244098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407451011
5496	NC_018609	ATT	2	6	244121	244126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451011
5497	NC_018609	TTTG	2	8	244132	244139	0 %	75 %	25 %	0 %	407451011
5498	NC_018609	TTA	2	6	244196	244201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407451012
5499	NC_018609	TAC	2	6	244205	244210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407451012
5500	NC_018609	TAA	2	6	244323	244328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407451012

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