MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	G	6	6	321	326	0 %	0 %	100 %	0 %	386844948
2	NC_017807	A	7	7	1323	1329	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
3	NC_017807	G	6	6	1430	1435	0 %	0 %	100 %	0 %	386844949
4	NC_017807	A	7	7	1545	1551	100 %	0 %	0 %	0 %	386844949
5	NC_017807	T	6	6	1819	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	386844950
6	NC_017807	A	6	6	3361	3366	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
7	NC_017807	A	6	6	3480	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	386844952
8	NC_017807	T	6	6	3992	3997	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
9	NC_017807	T	6	6	4183	4188	0 %	100 %	0 %	0 %	386844953
10	NC_017807	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017807	T	13	13	4488	4500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017807	A	6	6	5197	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	386844955
13	NC_017807	A	6	6	5501	5506	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
14	NC_017807	A	6	6	5692	5697	100 %	0 %	0 %	0 %	386844956
15	NC_017807	G	6	6	7176	7181	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
16	NC_017807	G	6	6	7263	7268	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
17	NC_017807	G	6	6	7502	7507	0 %	0 %	100 %	0 %	386844958
18	NC_017807	A	6	6	7954	7959	100 %	0 %	0 %	0 %	386844958
19	NC_017807	A	6	6	8404	8409	100 %	0 %	0 %	0 %	386844959
20	NC_017807	G	6	6	8979	8984	0 %	0 %	100 %	0 %	386844961
21	NC_017807	G	6	6	9183	9188	0 %	0 %	100 %	0 %	386844961
22	NC_017807	C	6	6	9936	9941	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_017807	T	6	6	9966	9971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017807	C	6	6	10281	10286	0 %	0 %	0 %	100 %	386844963
25	NC_017807	A	6	6	10673	10678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017807	A	6	6	10834	10839	100 %	0 %	0 %	0 %	386844964
27	NC_017807	A	7	7	10944	10950	100 %	0 %	0 %	0 %	386844964
28	NC_017807	G	6	6	12601	12606	0 %	0 %	100 %	0 %	386844964
29	NC_017807	A	6	6	12745	12750	100 %	0 %	0 %	0 %	386844964
30	NC_017807	A	6	6	12774	12779	100 %	0 %	0 %	0 %	386844964
31	NC_017807	T	6	6	13422	13427	0 %	100 %	0 %	0 %	386844965
32	NC_017807	T	7	7	15171	15177	0 %	100 %	0 %	0 %	386844969
33	NC_017807	T	6	6	15849	15854	0 %	100 %	0 %	0 %	386844970
34	NC_017807	A	6	6	18808	18813	100 %	0 %	0 %	0 %	386844972
35	NC_017807	T	6	6	21088	21093	0 %	100 %	0 %	0 %	386844977
36	NC_017807	C	6	6	21323	21328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_017807	A	6	6	21400	21405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017807	C	6	6	21551	21556	0 %	0 %	0 %	100 %	386844978
39	NC_017807	A	6	6	22268	22273	100 %	0 %	0 %	0 %	386844979
40	NC_017807	G	6	6	24999	25004	0 %	0 %	100 %	0 %	386844980
41	NC_017807	G	7	7	25106	25112	0 %	0 %	100 %	0 %	386844980
42	NC_017807	A	6	6	26433	26438	100 %	0 %	0 %	0 %	386844980
43	NC_017807	T	6	6	26662	26667	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
44	NC_017807	T	6	6	26696	26701	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
45	NC_017807	T	7	7	26794	26800	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
46	NC_017807	T	6	6	27001	27006	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
47	NC_017807	A	6	6	27065	27070	100 %	0 %	0 %	0 %	386844981
48	NC_017807	T	6	6	27202	27207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017807	A	6	6	27308	27313	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
50	NC_017807	A	6	6	27372	27377	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
51	NC_017807	G	6	6	28653	28658	0 %	0 %	100 %	0 %	386844984
52	NC_017807	A	7	7	29061	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
53	NC_017807	G	6	6	29282	29287	0 %	0 %	100 %	0 %	386844984
54	NC_017807	A	6	6	29639	29644	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
55	NC_017807	A	6	6	29936	29941	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
56	NC_017807	A	6	6	32422	32427	100 %	0 %	0 %	0 %	386844985
57	NC_017807	A	6	6	33912	33917	100 %	0 %	0 %	0 %	386844985
58	NC_017807	A	6	6	36253	36258	100 %	0 %	0 %	0 %	386844985
59	NC_017807	T	6	6	37371	37376	0 %	100 %	0 %	0 %	386844986
60	NC_017807	T	6	6	37944	37949	0 %	100 %	0 %	0 %	386844987
61	NC_017807	T	6	6	39875	39880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017807	A	6	6	40278	40283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017807	C	6	6	40323	40328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017807	C	6	6	40771	40776	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_017807	G	6	6	41314	41319	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017807	A	6	6	41915	41920	100 %	0 %	0 %	0 %	386844991
67	NC_017807	T	6	6	42053	42058	0 %	100 %	0 %	0 %	386844991
68	NC_017807	T	6	6	42615	42620	0 %	100 %	0 %	0 %	386844991
69	NC_017807	T	8	8	42681	42688	0 %	100 %	0 %	0 %	386844991
70	NC_017807	T	6	6	44221	44226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017807	T	6	6	46227	46232	0 %	100 %	0 %	0 %	386844994
72	NC_017807	T	6	6	46356	46361	0 %	100 %	0 %	0 %	386844994
73	NC_017807	A	7	7	46426	46432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017807	A	6	6	46789	46794	100 %	0 %	0 %	0 %	386844995
75	NC_017807	A	7	7	46982	46988	100 %	0 %	0 %	0 %	386844995
76	NC_017807	A	6	6	47585	47590	100 %	0 %	0 %	0 %	386844995

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.