MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017807	CCG	2	6	1	6	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017807	CGC	2	6	41	46	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017807	CCG	2	6	135	140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017807	GCG	2	6	173	178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017807	CGT	2	6	197	202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017807	GAA	2	6	267	272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844948
7	NC_017807	CCG	2	6	294	299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844948
8	NC_017807	ACG	2	6	335	340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844948
9	NC_017807	TTC	2	6	370	375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844948
10	NC_017807	GGC	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844948
11	NC_017807	GCG	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017807	CAT	2	6	710	715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017807	CCG	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844949
14	NC_017807	CGT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
15	NC_017807	GAA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
16	NC_017807	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
17	NC_017807	AAG	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844949
18	NC_017807	TGC	2	6	985	990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
19	NC_017807	ACG	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
20	NC_017807	GCA	3	9	1060	1068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844949
21	NC_017807	TGC	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844949
22	NC_017807	GGC	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844949
23	NC_017807	CAC	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844949
24	NC_017807	GAT	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844949
25	NC_017807	GCA	2	6	1645	1650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844950
26	NC_017807	TGC	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844950
27	NC_017807	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844950
28	NC_017807	ATA	2	6	1966	1971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017807	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
30	NC_017807	ATT	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
31	NC_017807	TTG	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844951
32	NC_017807	CTG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844951
33	NC_017807	CAG	2	6	2147	2152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844951
34	NC_017807	TCT	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844951
35	NC_017807	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844951
36	NC_017807	ATT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844951
37	NC_017807	GCG	2	6	2616	2621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017807	TCA	2	6	2713	2718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017807	ATC	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017807	AAT	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017807	CCA	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017807	TCC	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386844952
43	NC_017807	ATG	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
44	NC_017807	ATG	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844952
45	NC_017807	GGA	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844952
46	NC_017807	GCC	2	6	3675	3680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844952
47	NC_017807	AGA	2	6	3713	3718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844952
48	NC_017807	CTG	2	6	3895	3900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
49	NC_017807	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
50	NC_017807	CTG	2	6	4013	4018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844953
51	NC_017807	ATC	2	6	4057	4062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
52	NC_017807	CAC	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
53	NC_017807	GCA	2	6	4095	4100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844953
54	NC_017807	TCA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844953
55	NC_017807	TAA	2	6	4147	4152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
56	NC_017807	TAA	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844953
57	NC_017807	CAC	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844953
58	NC_017807	GGC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844953
59	NC_017807	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844953
60	NC_017807	CTA	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017807	TGA	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844954
62	NC_017807	CGC	2	6	4738	4743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844954
63	NC_017807	GGT	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844954
64	NC_017807	TTA	2	6	4920	4925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
65	NC_017807	TTA	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844954
66	NC_017807	TTC	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844954
67	NC_017807	CAG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844955
68	NC_017807	GAA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844955
69	NC_017807	TTC	2	6	5128	5133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
70	NC_017807	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844955
71	NC_017807	TGG	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844955
72	NC_017807	CTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844955
73	NC_017807	TGG	2	6	5450	5455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844956
74	NC_017807	CAC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844956
75	NC_017807	CAA	2	6	5574	5579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844956
76	NC_017807	CGC	2	6	5646	5651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844956
77	NC_017807	AAG	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844956
78	NC_017807	CAT	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844956
79	NC_017807	CTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844957
80	NC_017807	TCG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
81	NC_017807	GCT	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
82	NC_017807	GGT	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844957
83	NC_017807	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
84	NC_017807	GCG	2	6	6452	6457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
85	NC_017807	CTG	2	6	6527	6532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844957
86	NC_017807	TGT	2	6	6621	6626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844957
87	NC_017807	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844957
88	NC_017807	TCT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844957
89	NC_017807	CGC	2	6	6724	6729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
90	NC_017807	CCA	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844958
91	NC_017807	GAA	2	6	6819	6824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844958
92	NC_017807	CGG	2	6	6855	6860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
93	NC_017807	CGG	2	6	6896	6901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
94	NC_017807	CAG	2	6	6910	6915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
95	NC_017807	AGC	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
96	NC_017807	CAG	3	9	6967	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
97	NC_017807	GCC	2	6	7041	7046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
98	NC_017807	CAG	2	6	7399	7404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
99	NC_017807	TCA	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844958
100	NC_017807	ACA	2	6	7466	7471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844958
101	NC_017807	ATC	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844958
102	NC_017807	GCT	2	6	7683	7688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844958
103	NC_017807	GCC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
104	NC_017807	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844958
105	NC_017807	CAG	2	6	7903	7908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
106	NC_017807	GCA	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844958
107	NC_017807	CGC	2	6	8028	8033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844958
108	NC_017807	TGA	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844958
109	NC_017807	TCG	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844959
110	NC_017807	CAG	2	6	8165	8170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844959
111	NC_017807	ATT	2	6	8222	8227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844959
112	NC_017807	GCG	2	6	8249	8254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844959
113	NC_017807	CAC	3	9	8311	8319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844959
114	NC_017807	CGT	2	6	8343	8348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844959
115	NC_017807	TAA	2	6	8349	8354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844959
116	NC_017807	TGG	2	6	8359	8364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844959
117	NC_017807	CAT	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844959
118	NC_017807	TGC	2	6	8535	8540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844959
119	NC_017807	TGA	2	6	8547	8552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844959
120	NC_017807	GTG	2	6	8651	8656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844960
121	NC_017807	AAC	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844960
122	NC_017807	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844961
123	NC_017807	AAC	2	6	8854	8859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844961
124	NC_017807	GGC	2	6	8905	8910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844961
125	NC_017807	GCT	2	6	8970	8975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844961
126	NC_017807	TTC	2	6	9004	9009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844961
127	NC_017807	ATC	2	6	9100	9105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844961
128	NC_017807	CTG	2	6	9168	9173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844961
129	NC_017807	GGC	2	6	9192	9197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844961
130	NC_017807	GCG	2	6	9249	9254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844962
131	NC_017807	GTG	2	6	9257	9262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844962
132	NC_017807	GGT	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844962
133	NC_017807	CGG	2	6	9374	9379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844962
134	NC_017807	GGT	3	9	9383	9391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844962
135	NC_017807	TGA	2	6	9512	9517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844962
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140	NC_017807	GAA	2	6	9843	9848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844962
141	NC_017807	GGC	2	6	9983	9988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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