MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017807	CAG	2	6	23074	23079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844979
502	NC_017807	CTG	2	6	23080	23085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844979
503	NC_017807	CGG	2	6	23105	23110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844979
504	NC_017807	CAG	3	9	23158	23166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844979
505	NC_017807	ATT	2	6	23176	23181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844979
506	NC_017807	GGC	2	6	23259	23264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
507	NC_017807	CGT	2	6	23278	23283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844980
508	NC_017807	CG	3	6	23382	23387	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
509	NC_017807	CTGG	2	8	23398	23405	0 %	25 %	50 %	25 %	386844980
510	NC_017807	TTA	2	6	23418	23423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844980
511	NC_017807	CTG	3	9	23478	23486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844980
512	NC_017807	ACC	2	6	23537	23542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844980
513	NC_017807	AAC	2	6	23738	23743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844980
514	NC_017807	GCT	2	6	23761	23766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844980
515	NC_017807	CGCTGA	2	12	23781	23792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386844980
516	NC_017807	CAG	2	6	23864	23869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
517	NC_017807	GCG	2	6	23916	23921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
518	NC_017807	AGTAA	2	10	23957	23966	60 %	20 %	20 %	0 %	386844980
519	NC_017807	GCC	2	6	24068	24073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844980
520	NC_017807	GCG	2	6	24176	24181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
521	NC_017807	TGA	2	6	24225	24230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
522	NC_017807	CTGATT	2	12	24233	24244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386844980
523	NC_017807	CGG	2	6	24322	24327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
524	NC_017807	GGC	2	6	24529	24534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
525	NC_017807	GGT	2	6	24550	24555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844980
526	NC_017807	TGA	2	6	24564	24569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
527	NC_017807	CGG	2	6	24573	24578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
528	NC_017807	CGG	2	6	24589	24594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
529	NC_017807	TAA	2	6	24631	24636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844980
530	NC_017807	CAA	2	6	24661	24666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844980
531	NC_017807	CAA	2	6	24698	24703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844980
532	NC_017807	CCA	2	6	24706	24711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844980
533	NC_017807	AGC	2	6	24821	24826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
534	NC_017807	GCA	2	6	24853	24858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
535	NC_017807	G	6	6	24999	25004	0 %	0 %	100 %	0 %	386844980
536	NC_017807	ATG	3	9	25010	25018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
537	NC_017807	AGG	2	6	25062	25067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844980
538	NC_017807	G	7	7	25106	25112	0 %	0 %	100 %	0 %	386844980
539	NC_017807	GTGG	2	8	25193	25200	0 %	25 %	75 %	0 %	386844980
540	NC_017807	ACTG	2	8	25217	25224	25 %	25 %	25 %	25 %	386844980
541	NC_017807	ACTC	2	8	25262	25269	25 %	25 %	0 %	50 %	386844980
542	NC_017807	GC	3	6	25349	25354	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
543	NC_017807	ATG	2	6	25425	25430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
544	NC_017807	ATC	2	6	25443	25448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844980
545	NC_017807	CAG	2	6	25459	25464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
546	NC_017807	TGGAC	2	10	25551	25560	20 %	20 %	40 %	20 %	386844980
547	NC_017807	AAT	2	6	25577	25582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844980
548	NC_017807	CG	3	6	25612	25617	0 %	0 %	50 %	50 %	386844980
549	NC_017807	ACGG	2	8	25681	25688	25 %	0 %	50 %	25 %	386844980
550	NC_017807	AC	3	6	25698	25703	50 %	0 %	0 %	50 %	386844980
551	NC_017807	AGG	2	6	25762	25767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844980
552	NC_017807	AAC	2	6	25855	25860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844980
553	NC_017807	GCG	2	6	25931	25936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
554	NC_017807	CAC	2	6	25976	25981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844980
555	NC_017807	CAG	2	6	25994	25999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
556	NC_017807	TGA	2	6	26092	26097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844980
557	NC_017807	GA	4	8	26117	26124	50 %	0 %	50 %	0 %	386844980
558	NC_017807	GGT	2	6	26138	26143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844980
559	NC_017807	CAG	2	6	26178	26183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
560	NC_017807	GGAG	2	8	26206	26213	25 %	0 %	75 %	0 %	386844980
561	NC_017807	GGC	2	6	26233	26238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844980
562	NC_017807	CAG	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844980
563	NC_017807	AAAC	2	8	26402	26409	75 %	0 %	0 %	25 %	386844980
564	NC_017807	A	6	6	26433	26438	100 %	0 %	0 %	0 %	386844980
565	NC_017807	AGA	2	6	26473	26478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844980
566	NC_017807	CTT	2	6	26490	26495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844980
567	NC_017807	AT	3	6	26523	26528	50 %	50 %	0 %	0 %	386844981
568	NC_017807	ATT	2	6	26622	26627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386844981
569	NC_017807	TTAT	2	8	26638	26645	25 %	75 %	0 %	0 %	386844981
570	NC_017807	GTT	2	6	26649	26654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
571	NC_017807	T	6	6	26662	26667	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
572	NC_017807	T	6	6	26696	26701	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
573	NC_017807	GGA	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386844981
574	NC_017807	TCT	2	6	26742	26747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386844981
575	NC_017807	GATG	2	8	26752	26759	25 %	25 %	50 %	0 %	386844981
576	NC_017807	TTG	2	6	26762	26767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
577	NC_017807	GTT	2	6	26779	26784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844981
578	NC_017807	T	7	7	26794	26800	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
579	NC_017807	TAA	2	6	26822	26827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386844981
580	NC_017807	AAAG	2	8	26883	26890	75 %	0 %	25 %	0 %	386844981
581	NC_017807	T	6	6	27001	27006	0 %	100 %	0 %	0 %	386844981
582	NC_017807	A	6	6	27065	27070	100 %	0 %	0 %	0 %	386844981
583	NC_017807	CAGC	2	8	27072	27079	25 %	0 %	25 %	50 %	386844981
584	NC_017807	TGCC	2	8	27190	27197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_017807	T	6	6	27202	27207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017807	GGC	2	6	27247	27252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844982
587	NC_017807	GTC	2	6	27257	27262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844982
588	NC_017807	A	6	6	27308	27313	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
589	NC_017807	A	6	6	27372	27377	100 %	0 %	0 %	0 %	386844982
590	NC_017807	ACGTC	2	10	27468	27477	20 %	20 %	20 %	40 %	386844982
591	NC_017807	TGC	2	6	27580	27585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844982
592	NC_017807	GGC	2	6	27682	27687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844982
593	NC_017807	TGG	2	6	27696	27701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386844982
594	NC_017807	ACTA	2	8	27707	27714	50 %	25 %	0 %	25 %	386844982
595	NC_017807	GCA	2	6	27747	27752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844982
596	NC_017807	ACA	2	6	27764	27769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844982
597	NC_017807	CGC	2	6	27778	27783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844982
598	NC_017807	CAG	2	6	27820	27825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386844982
599	NC_017807	GAA	2	6	27827	27832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844982
600	NC_017807	CG	3	6	27855	27860	0 %	0 %	50 %	50 %	386844982
601	NC_017807	CAA	2	6	27874	27879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386844982
602	NC_017807	TAT	2	6	27967	27972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017807	TGT	2	6	27976	27981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017807	CTG	2	6	28272	28277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
605	NC_017807	TCA	2	6	28282	28287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386844983
606	NC_017807	TGC	2	6	28345	28350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
607	NC_017807	CTG	2	6	28371	28376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
608	NC_017807	ATG	2	6	28377	28382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844983
609	NC_017807	GGTG	2	8	28394	28401	0 %	25 %	75 %	0 %	386844983
610	NC_017807	GTC	2	6	28409	28414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
611	NC_017807	CGT	3	9	28501	28509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844983
612	NC_017807	CTT	2	6	28554	28559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017807	GGC	2	6	28588	28593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017807	G	6	6	28653	28658	0 %	0 %	100 %	0 %	386844984
615	NC_017807	TGT	2	6	28727	28732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386844984
616	NC_017807	CCG	2	6	28772	28777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844984
617	NC_017807	TGA	2	6	28838	28843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386844984
618	NC_017807	CAC	2	6	28905	28910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386844984
619	NC_017807	GCT	2	6	28929	28934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
620	NC_017807	GGC	2	6	28960	28965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
621	NC_017807	GCC	2	6	28993	28998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844984
622	NC_017807	GT	3	6	29011	29016	0 %	50 %	50 %	0 %	386844984
623	NC_017807	TGC	2	6	29018	29023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386844984
624	NC_017807	A	7	7	29061	29067	100 %	0 %	0 %	0 %	386844984
625	NC_017807	TC	3	6	29085	29090	0 %	50 %	0 %	50 %	386844984
626	NC_017807	CGG	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
627	NC_017807	GAA	2	6	29187	29192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386844984
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629	NC_017807	CGG	2	6	29310	29315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386844984
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772	NC_017807	CGC	2	6	36719	36724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386844985
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