MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA2

Total Repeats: 1482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017773	TGC	2	6	26673	26678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845024
502	NC_017773	AGA	2	6	26753	26758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845024
503	NC_017773	CGT	2	6	26759	26764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845024
504	NC_017773	GCT	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845024
505	NC_017773	CGG	2	6	26802	26807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845024
506	NC_017773	GAC	2	6	26888	26893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845024
507	NC_017773	CGA	2	6	26994	26999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845024
508	NC_017773	TGAA	2	8	27150	27157	50 %	25 %	25 %	0 %	386845024
509	NC_017773	GTCA	2	8	27173	27180	25 %	25 %	25 %	25 %	386845024
510	NC_017773	CCGC	2	8	27226	27233	0 %	0 %	25 %	75 %	386845024
511	NC_017773	GCG	2	6	27269	27274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845024
512	NC_017773	AC	3	6	27362	27367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017773	TGTT	3	12	27392	27403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017773	ACA	2	6	27406	27411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017773	TCA	2	6	27454	27459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017773	ATT	2	6	27467	27472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017773	GA	3	6	27550	27555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017773	CCA	3	9	27610	27618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845025
519	NC_017773	CAT	2	6	27731	27736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845025
520	NC_017773	GGC	2	6	27804	27809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845025
521	NC_017773	GAA	3	9	27891	27899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845025
522	NC_017773	ACG	2	6	27934	27939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845025
523	NC_017773	GCG	2	6	27958	27963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845025
524	NC_017773	ATG	2	6	28026	28031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845025
525	NC_017773	TATG	2	8	28034	28041	25 %	50 %	25 %	0 %	386845025
526	NC_017773	CAA	2	6	28046	28051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845025
527	NC_017773	ATC	2	6	28149	28154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845025
528	NC_017773	GCTG	2	8	28157	28164	0 %	25 %	50 %	25 %	386845025
529	NC_017773	ACA	2	6	28204	28209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845025
530	NC_017773	CGC	2	6	28230	28235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845025
531	NC_017773	GCAG	2	8	28268	28275	25 %	0 %	50 %	25 %	386845025
532	NC_017773	CAA	2	6	28307	28312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845025
533	NC_017773	TGG	2	6	28321	28326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845025
534	NC_017773	GAA	3	9	28386	28394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845025
535	NC_017773	TCG	2	6	28405	28410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845025
536	NC_017773	CCG	3	9	28417	28425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845025
537	NC_017773	ATG	2	6	28603	28608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845026
538	NC_017773	ACC	2	6	28609	28614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845026
539	NC_017773	TGA	2	6	28676	28681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845026
540	NC_017773	CA	3	6	28745	28750	50 %	0 %	0 %	50 %	386845026
541	NC_017773	GGTT	2	8	28764	28771	0 %	50 %	50 %	0 %	386845026
542	NC_017773	GCG	2	6	28820	28825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845026
543	NC_017773	GGC	2	6	28885	28890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845026
544	NC_017773	ATTG	2	8	28908	28915	25 %	50 %	25 %	0 %	386845026
545	NC_017773	TGT	2	6	28928	28933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845026
546	NC_017773	CGGT	2	8	28973	28980	0 %	25 %	50 %	25 %	386845026
547	NC_017773	TGA	2	6	28989	28994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845026
548	NC_017773	CAG	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845026
549	NC_017773	GT	3	6	29072	29077	0 %	50 %	50 %	0 %	386845026
550	NC_017773	ACG	2	6	29168	29173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845026
551	NC_017773	TAT	2	6	29178	29183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845026
552	NC_017773	ACA	2	6	29192	29197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845026
553	NC_017773	CGG	2	6	29199	29204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845026
554	NC_017773	GAA	2	6	29233	29238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845026
555	NC_017773	GTG	2	6	29251	29256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845026
556	NC_017773	GAA	2	6	29365	29370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845026
557	NC_017773	CTT	2	6	29400	29405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386845026
558	NC_017773	TGT	2	6	29561	29566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386845026
559	NC_017773	CGG	2	6	29571	29576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845026
560	NC_017773	CAT	2	6	29592	29597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845026
561	NC_017773	ATC	2	6	29626	29631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386845026
562	NC_017773	AAG	2	6	29690	29695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845026
563	NC_017773	CGA	2	6	29709	29714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845026
564	NC_017773	CGTT	2	8	29738	29745	0 %	50 %	25 %	25 %	386845026
565	NC_017773	ATT	2	6	29840	29845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845026
566	NC_017773	ACG	2	6	29864	29869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845026
567	NC_017773	GACATG	2	12	29890	29901	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386845026
568	NC_017773	GAC	2	6	29963	29968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017773	GA	3	6	30006	30011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017773	CAA	2	6	30089	30094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845027
571	NC_017773	CG	3	6	30096	30101	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
572	NC_017773	GAA	2	6	30105	30110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845027
573	NC_017773	GGCGA	2	10	30117	30126	20 %	0 %	60 %	20 %	386845027
574	NC_017773	ACC	2	6	30150	30155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
575	NC_017773	GCCA	2	8	30220	30227	25 %	0 %	25 %	50 %	386845027
576	NC_017773	GC	3	6	30244	30249	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
577	NC_017773	TG	3	6	30294	30299	0 %	50 %	50 %	0 %	386845027
578	NC_017773	TGC	2	6	30374	30379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845027
579	NC_017773	AAC	2	6	30396	30401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845027
580	NC_017773	GC	3	6	30427	30432	0 %	0 %	50 %	50 %	386845027
581	NC_017773	ATT	2	6	30447	30452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845027
582	NC_017773	CCA	2	6	30460	30465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
583	NC_017773	TGA	2	6	30488	30493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845027
584	NC_017773	CGCCAA	2	12	30509	30520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386845027
585	NC_017773	A	6	6	30519	30524	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
586	NC_017773	ACA	2	6	30604	30609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845027
587	NC_017773	ACC	2	6	30636	30641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
588	NC_017773	GTG	2	6	30687	30692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845027
589	NC_017773	ATG	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845027
590	NC_017773	CGG	2	6	30830	30835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845027
591	NC_017773	CAC	2	6	30836	30841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
592	NC_017773	TGC	3	9	30883	30891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845027
593	NC_017773	A	6	6	30915	30920	100 %	0 %	0 %	0 %	386845027
594	NC_017773	GTG	2	6	30921	30926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845027
595	NC_017773	GAC	2	6	30930	30935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845027
596	NC_017773	GGC	2	6	30977	30982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845027
597	NC_017773	TGA	2	6	30997	31002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845027
598	NC_017773	TGG	2	6	31063	31068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845027
599	NC_017773	ATG	2	6	31071	31076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845027
600	NC_017773	GT	3	6	31114	31119	0 %	50 %	50 %	0 %	386845027
601	NC_017773	CTG	2	6	31158	31163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845027
602	NC_017773	ACC	2	6	31182	31187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
603	NC_017773	CAA	2	6	31205	31210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386845027
604	NC_017773	GAA	2	6	31229	31234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386845027
605	NC_017773	GCTG	2	8	31238	31245	0 %	25 %	50 %	25 %	386845027
606	NC_017773	CGCT	2	8	31302	31309	0 %	25 %	25 %	50 %	386845027
607	NC_017773	ATTC	2	8	31358	31365	25 %	50 %	0 %	25 %	386845027
608	NC_017773	ACC	2	6	31458	31463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386845027
609	NC_017773	TAA	2	6	31685	31690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845028
610	NC_017773	GTG	2	6	31734	31739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845028
611	NC_017773	AGG	2	6	31790	31795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386845028
612	NC_017773	CGT	2	6	31831	31836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845028
613	NC_017773	GAG	2	6	31875	31880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017773	CTG	2	6	31904	31909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845029
615	NC_017773	GTG	2	6	31928	31933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386845029
616	NC_017773	ATT	2	6	31936	31941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386845029
617	NC_017773	CGC	2	6	31953	31958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845029
618	NC_017773	CTGGC	2	10	31967	31976	0 %	20 %	40 %	40 %	386845029
619	NC_017773	TGA	2	6	32106	32111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386845029
620	NC_017773	CTGC	2	8	32113	32120	0 %	25 %	25 %	50 %	386845029
621	NC_017773	CGC	2	6	32159	32164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386845029
622	NC_017773	CAG	2	6	32171	32176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386845029
623	NC_017773	TC	3	6	32195	32200	0 %	50 %	0 %	50 %	386845029
624	NC_017773	GGC	2	6	32384	32389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845029
625	NC_017773	GCG	2	6	32396	32401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386845029
626	NC_017773	ATA	2	6	32415	32420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386845029
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628	NC_017773	TGC	2	6	32467	32472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386845029
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