MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 35539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017589	CGG	2	6	38	43	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017589	AAC	2	6	133	138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017589	TGA	2	6	226	231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017589	GTA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017589	CCG	2	6	703	708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017589	ACG	2	6	720	725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017589	CAT	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
8	NC_017589	CAT	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
9	NC_017589	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
10	NC_017589	CGC	2	6	1037	1042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
11	NC_017589	TGA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683948
12	NC_017589	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
13	NC_017589	GAA	3	9	1227	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683948
14	NC_017589	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
15	NC_017589	CCG	2	6	1266	1271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
16	NC_017589	GGC	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
17	NC_017589	CAG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
18	NC_017589	CCA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683948
19	NC_017589	CAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683948
20	NC_017589	TGG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
21	NC_017589	GTG	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
22	NC_017589	CTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683948
23	NC_017589	TGG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
24	NC_017589	GCC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017589	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017589	CGA	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017589	GCA	3	9	2414	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683949
28	NC_017589	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683950
29	NC_017589	TGA	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683950
30	NC_017589	GAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017589	CAT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017589	AGA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017589	TTC	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017589	AAT	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017589	GCC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017589	GGA	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017589	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
38	NC_017589	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
39	NC_017589	TCG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683951
40	NC_017589	GGC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
41	NC_017589	GTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683951
42	NC_017589	CAT	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
43	NC_017589	CGC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683951
44	NC_017589	GCG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
45	NC_017589	GCA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
46	NC_017589	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683951
47	NC_017589	CAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
48	NC_017589	GTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683951
49	NC_017589	CGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
50	NC_017589	GCG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
51	NC_017589	GTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
52	NC_017589	CAG	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
53	NC_017589	CAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
54	NC_017589	TGC	3	9	4417	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
55	NC_017589	AGC	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
56	NC_017589	CTT	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683952
57	NC_017589	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
58	NC_017589	GAA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683952
59	NC_017589	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683952
60	NC_017589	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
61	NC_017589	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683952
62	NC_017589	GCC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
63	NC_017589	CTG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
64	NC_017589	GAC	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
65	NC_017589	GGC	2	6	4966	4971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
66	NC_017589	TGG	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683952
67	NC_017589	TCT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017589	GGC	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017589	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017589	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
71	NC_017589	GCC	2	6	5539	5544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
72	NC_017589	GGC	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683953
73	NC_017589	ACG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
74	NC_017589	CAG	2	6	6027	6032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
75	NC_017589	CGT	3	9	6169	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683953
76	NC_017589	CGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017589	ACG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017589	CCG	2	6	6348	6353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017589	TGC	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017589	ACA	2	6	6415	6420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017589	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
82	NC_017589	GGA	2	6	6568	6573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
83	NC_017589	GCA	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
84	NC_017589	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683954
85	NC_017589	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683954
86	NC_017589	CGA	2	6	6811	6816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
87	NC_017589	CTG	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
88	NC_017589	GCC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
89	NC_017589	GCA	2	6	6871	6876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
90	NC_017589	TCG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
91	NC_017589	CGC	2	6	6933	6938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
92	NC_017589	GTG	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683954
93	NC_017589	TCG	2	6	7008	7013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
94	NC_017589	GGA	2	6	7027	7032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
95	NC_017589	CGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683954
96	NC_017589	GAG	2	6	7163	7168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
97	NC_017589	GCA	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
98	NC_017589	AAG	2	6	7370	7375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683954
99	NC_017589	TGC	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
100	NC_017589	CTA	2	6	7407	7412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017589	GCC	2	6	7488	7493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017589	CTT	2	6	7570	7575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017589	GCC	2	6	7646	7651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017589	ACG	2	6	7720	7725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683955
105	NC_017589	TCT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
106	NC_017589	TCG	2	6	7795	7800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
107	NC_017589	CTT	2	6	7853	7858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
108	NC_017589	CGG	3	9	7894	7902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
109	NC_017589	CCA	2	6	8050	8055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683955
110	NC_017589	GCT	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
111	NC_017589	CTG	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
112	NC_017589	GCG	2	6	8116	8121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
113	NC_017589	GCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
114	NC_017589	TGC	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
115	NC_017589	TTC	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
116	NC_017589	GGA	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683955
117	NC_017589	GAA	2	6	8396	8401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683955
118	NC_017589	GGT	2	6	8450	8455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683955
119	NC_017589	GGC	2	6	8469	8474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
120	NC_017589	GCT	3	9	8573	8581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
121	NC_017589	CTG	2	6	8589	8594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
122	NC_017589	GGT	2	6	8600	8605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683955
123	NC_017589	GGC	2	6	8607	8612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
124	NC_017589	CGT	2	6	8631	8636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
125	NC_017589	CAT	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683955
126	NC_017589	TTC	2	6	8727	8732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683955
127	NC_017589	GGC	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
128	NC_017589	GGC	2	6	8865	8870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683955
129	NC_017589	GCT	2	6	8957	8962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683955
130	NC_017589	CGC	2	6	9062	9067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683956
131	NC_017589	GGC	2	6	9107	9112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683956
132	NC_017589	CTG	2	6	9113	9118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683956
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249	NC_017589	GCT	2	6	14639	14644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683960
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258	NC_017589	GTC	2	6	15153	15158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683960
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286	NC_017589	CGA	2	6	16208	16213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683960
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288	NC_017589	GTG	2	6	16317	16322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683960
289	NC_017589	GGC	2	6	16391	16396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683960
290	NC_017589	GTT	2	6	16436	16441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683960
291	NC_017589	GCC	2	6	16544	16549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_017589	ATC	2	6	16980	16985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683961
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316	NC_017589	ACG	2	6	18067	18072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683961
317	NC_017589	TCA	2	6	18216	18221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
318	NC_017589	TCA	2	6	18225	18230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683962
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322	NC_017589	GCC	2	6	18431	18436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683962
323	NC_017589	GCG	2	6	18438	18443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683962
324	NC_017589	TCA	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683962
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334	NC_017589	GGC	3	9	18760	18768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683962
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362	NC_017589	GCG	2	6	19972	19977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683963
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372	NC_017589	CGC	2	6	20388	20393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683964
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374	NC_017589	GCT	4	12	20535	20546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683964
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378	NC_017589	CAA	2	6	20739	20744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683964
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500	NC_017589	TGC	2	6	27468	27473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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