MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 52412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017589	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017589	CGG	2	6	38	43	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017589	TCCC	2	8	112	119	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_017589	AAC	2	6	133	138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017589	GCTT	2	8	201	208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017589	TGA	2	6	226	231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017589	A	7	7	394	400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017589	GC	3	6	553	558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017589	AGGC	2	8	586	593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017589	GTA	2	6	631	636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017589	GTAT	2	8	646	653	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017589	CCGT	2	8	673	680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017589	CCG	2	6	703	708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017589	ACG	2	6	720	725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017589	A	6	6	729	734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017589	CAT	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
17	NC_017589	GACT	2	8	824	831	25 %	25 %	25 %	25 %	410683948
18	NC_017589	CAT	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683948
19	NC_017589	G	6	6	882	887	0 %	0 %	100 %	0 %	410683948
20	NC_017589	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
21	NC_017589	CG	3	6	1021	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	410683948
22	NC_017589	CGC	2	6	1037	1042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
23	NC_017589	TGA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683948
24	NC_017589	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
25	NC_017589	GAA	3	9	1227	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683948
26	NC_017589	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
27	NC_017589	CCG	2	6	1266	1271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683948
28	NC_017589	GGC	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683948
29	NC_017589	CAG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683948
30	NC_017589	CCA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410683948
31	NC_017589	CAA	2	6	1425	1430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683948
32	NC_017589	ATCG	3	12	1449	1460	25 %	25 %	25 %	25 %	410683948
33	NC_017589	TGG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
34	NC_017589	GTG	2	6	1543	1548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
35	NC_017589	T	6	6	1561	1566	0 %	100 %	0 %	0 %	410683948
36	NC_017589	GC	4	8	1602	1609	0 %	0 %	50 %	50 %	410683948
37	NC_017589	CTT	2	6	1668	1673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683948
38	NC_017589	TGG	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683948
39	NC_017589	CACG	2	8	1853	1860	25 %	0 %	25 %	50 %	410683948
40	NC_017589	AAAG	2	8	1899	1906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017589	GCC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017589	GGGCA	2	10	2231	2240	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017589	CGGC	2	8	2252	2259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017589	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017589	CGA	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017589	C	7	7	2406	2412	0 %	0 %	0 %	100 %	410683949
47	NC_017589	GCA	3	9	2414	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683949
48	NC_017589	GACCA	2	10	2481	2490	40 %	0 %	20 %	40 %	410683949
49	NC_017589	GC	3	6	2542	2547	0 %	0 %	50 %	50 %	410683949
50	NC_017589	AAAAG	2	10	2697	2706	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017589	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683950
52	NC_017589	TGA	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683950
53	NC_017589	A	6	6	2980	2985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017589	CAACT	2	10	2986	2995	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017589	GAC	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017589	CAT	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017589	AGA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017589	TTC	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017589	AAT	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017589	GCC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017589	GGA	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017589	GAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
63	NC_017589	GCAT	2	8	3424	3431	25 %	25 %	25 %	25 %	410683951
64	NC_017589	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
65	NC_017589	TCG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683951
66	NC_017589	GGC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
67	NC_017589	GACTAC	2	12	3609	3620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410683951
68	NC_017589	GTG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683951
69	NC_017589	CAT	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
70	NC_017589	CGC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683951
71	NC_017589	GCG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683951
72	NC_017589	GCA	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683951
73	NC_017589	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683951
74	NC_017589	CAT	2	6	3983	3988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683951
75	NC_017589	GTT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410683951
76	NC_017589	GGCA	2	8	4021	4028	25 %	0 %	50 %	25 %	410683951
77	NC_017589	CGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
78	NC_017589	GCCC	3	12	4165	4176	0 %	0 %	25 %	75 %	410683952
79	NC_017589	GCG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
80	NC_017589	GTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
81	NC_017589	CAG	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
82	NC_017589	CAG	2	6	4331	4336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
83	NC_017589	GC	3	6	4408	4413	0 %	0 %	50 %	50 %	410683952
84	NC_017589	TGC	3	9	4417	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
85	NC_017589	AGC	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
86	NC_017589	CTT	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410683952
87	NC_017589	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
88	NC_017589	A	7	7	4576	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	410683952
89	NC_017589	GAA	2	6	4583	4588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683952
90	NC_017589	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410683952
91	NC_017589	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683952
92	NC_017589	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683952
93	NC_017589	GCC	2	6	4866	4871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683952
94	NC_017589	CTG	2	6	4901	4906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683952
95	NC_017589	GAC	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683952
96	NC_017589	GGC	2	6	4966	4971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683952
97	NC_017589	TGG	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410683952
98	NC_017589	AGCC	2	8	5031	5038	25 %	0 %	25 %	50 %	410683952
99	NC_017589	TCT	2	6	5044	5049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017589	T	8	8	5077	5084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017589	GGC	2	6	5152	5157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017589	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017589	TGTT	2	8	5274	5281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017589	GC	3	6	5349	5354	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
105	NC_017589	CCAT	2	8	5401	5408	25 %	25 %	0 %	50 %	410683953
106	NC_017589	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
107	NC_017589	CTGG	2	8	5516	5523	0 %	25 %	50 %	25 %	410683953
108	NC_017589	GCC	2	6	5539	5544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683953
109	NC_017589	G	6	6	5593	5598	0 %	0 %	100 %	0 %	410683953
110	NC_017589	CCCG	3	12	5685	5696	0 %	0 %	25 %	75 %	410683953
111	NC_017589	CG	3	6	5698	5703	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
112	NC_017589	ATCGGT	2	12	5724	5735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	410683953
113	NC_017589	ATGG	2	8	5756	5763	25 %	25 %	50 %	0 %	410683953
114	NC_017589	CG	3	6	5793	5798	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
115	NC_017589	GC	3	6	5814	5819	0 %	0 %	50 %	50 %	410683953
116	NC_017589	GGC	2	6	5834	5839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683953
117	NC_017589	ACG	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
118	NC_017589	CAG	2	6	6027	6032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683953
119	NC_017589	G	6	6	6136	6141	0 %	0 %	100 %	0 %	410683953
120	NC_017589	GGGT	2	8	6156	6163	0 %	25 %	75 %	0 %	410683953
121	NC_017589	CGT	3	9	6169	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683953
122	NC_017589	CGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017589	A	6	6	6306	6311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017589	TAGG	2	8	6312	6319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017589	ACG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017589	CCG	2	6	6348	6353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017589	TGC	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017589	ACA	2	6	6415	6420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017589	AGCC	2	8	6511	6518	25 %	0 %	25 %	50 %	410683954
130	NC_017589	GAAA	2	8	6520	6527	75 %	0 %	25 %	0 %	410683954
131	NC_017589	TGC	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683954
132	NC_017589	GGA	2	6	6568	6573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683954
133	NC_017589	GCA	2	6	6581	6586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683954
134	NC_017589	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683954
135	NC_017589	GAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410683954
136	NC_017589	GTCCA	2	10	6710	6719	20 %	20 %	20 %	40 %	410683954
137	NC_017589	GCCG	2	8	6724	6731	0 %	0 %	50 %	50 %	410683954
138	NC_017589	CTGGGC	2	12	6767	6778	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	410683954
139	NC_017589	TGTGT	2	10	6784	6793	0 %	60 %	40 %	0 %	410683954
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271	NC_017589	TCG	2	6	11546	11551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683957
272	NC_017589	GCG	2	6	11563	11568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683957
273	NC_017589	GGCG	2	8	11610	11617	0 %	0 %	75 %	25 %	410683957
274	NC_017589	CCG	2	6	11634	11639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410683957
275	NC_017589	CGG	2	6	11667	11672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683957
276	NC_017589	CGA	2	6	11685	11690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683957
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279	NC_017589	GCA	2	6	11747	11752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683957
280	NC_017589	GCA	2	6	11765	11770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683957
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288	NC_017589	GCT	2	6	11928	11933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683957
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291	NC_017589	GC	3	6	11993	11998	0 %	0 %	50 %	50 %	410683957
292	NC_017589	ATG	2	6	12004	12009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683957
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297	NC_017589	GGCC	2	8	12126	12133	0 %	0 %	50 %	50 %	410683957
298	NC_017589	ATG	2	6	12136	12141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410683957
299	NC_017589	GC	3	6	12150	12155	0 %	0 %	50 %	50 %	410683957
300	NC_017589	GAG	2	6	12163	12168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410683957
301	NC_017589	CG	3	6	12199	12204	0 %	0 %	50 %	50 %	410683957
302	NC_017589	CTG	2	6	12211	12216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410683957
303	NC_017589	CGGCA	2	10	12253	12262	20 %	0 %	40 %	40 %	410683957
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348	NC_017589	CGGC	3	12	13709	13720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
349	NC_017589	GCCG	2	8	13775	13782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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400	NC_017589	GCAGC	2	10	15584	15593	20 %	0 %	40 %	40 %	410683960
401	NC_017589	GATGC	2	10	15618	15627	20 %	20 %	40 %	20 %	410683960
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473	NC_017589	ACG	2	6	18067	18072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410683961
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482	NC_017589	GCG	2	6	18438	18443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410683962
483	NC_017589	TCA	2	6	18453	18458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410683962
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