MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid CMR15_mp

Total Repeats: 52412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017589	AGA	2	6	213823	213828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410684120
5502	NC_017589	GGC	2	6	213890	213895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684120
5503	NC_017589	GAT	2	6	213908	213913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410684120
5504	NC_017589	GCG	2	6	213917	213922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684120
5505	NC_017589	TGTT	2	8	213936	213943	0 %	75 %	25 %	0 %	410684120
5506	NC_017589	GCCT	2	8	213968	213975	0 %	25 %	25 %	50 %	410684120
5507	NC_017589	GCT	2	6	214065	214070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5508	NC_017589	GC	3	6	214107	214112	0 %	0 %	50 %	50 %	410684120
5509	NC_017589	CG	4	8	214124	214131	0 %	0 %	50 %	50 %	410684120
5510	NC_017589	GCA	2	6	214144	214149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5511	NC_017589	AGC	2	6	214179	214184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5512	NC_017589	GCC	2	6	214203	214208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684120
5513	NC_017589	GCC	2	6	214243	214248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684120
5514	NC_017589	CCA	2	6	214259	214264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684120
5515	NC_017589	GCA	2	6	214328	214333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5516	NC_017589	GCA	2	6	214352	214357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5517	NC_017589	CAG	2	6	214365	214370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684120
5518	NC_017589	AGCGCG	2	12	214393	214404	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410684120
5519	NC_017589	GC	3	6	214429	214434	0 %	0 %	50 %	50 %	410684120
5520	NC_017589	CCA	2	6	214481	214486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684120
5521	NC_017589	CG	3	6	214569	214574	0 %	0 %	50 %	50 %	410684120
5522	NC_017589	CG	3	6	214642	214647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_017589	CGG	2	6	214660	214665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5524	NC_017589	CCA	2	6	214705	214710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684121
5525	NC_017589	CCG	2	6	214731	214736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684121
5526	NC_017589	CCA	2	6	214744	214749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684121
5527	NC_017589	CGG	2	6	214752	214757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5528	NC_017589	TGG	2	6	214798	214803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410684121
5529	NC_017589	AGA	2	6	214804	214809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410684121
5530	NC_017589	GCG	2	6	214823	214828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5531	NC_017589	TTC	2	6	214950	214955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410684121
5532	NC_017589	CAG	2	6	214979	214984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5533	NC_017589	CGA	2	6	214996	215001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5534	NC_017589	GCTCGC	2	12	215038	215049	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	410684121
5535	NC_017589	G	6	6	215104	215109	0 %	0 %	100 %	0 %	410684121
5536	NC_017589	CCG	2	6	215117	215122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684121
5537	NC_017589	CGG	2	6	215243	215248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5538	NC_017589	GCA	2	6	215287	215292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5539	NC_017589	CG	3	6	215303	215308	0 %	0 %	50 %	50 %	410684121
5540	NC_017589	CGG	2	6	215317	215322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5541	NC_017589	TCG	2	6	215335	215340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5542	NC_017589	GCG	2	6	215344	215349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5543	NC_017589	CGC	2	6	215372	215377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684121
5544	NC_017589	GAT	2	6	215426	215431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410684121
5545	NC_017589	GAC	2	6	215450	215455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5546	NC_017589	CGGG	2	8	215458	215465	0 %	0 %	75 %	25 %	410684121
5547	NC_017589	CCG	3	9	215497	215505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684121
5548	NC_017589	CGC	2	6	215524	215529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684121
5549	NC_017589	GCG	3	9	215562	215570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5550	NC_017589	AGC	2	6	215589	215594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5551	NC_017589	GCA	2	6	215605	215610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5552	NC_017589	CGT	2	6	215618	215623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5553	NC_017589	AGC	3	9	215715	215723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5554	NC_017589	CAGC	2	8	215737	215744	25 %	0 %	25 %	50 %	410684121
5555	NC_017589	AGG	2	6	215749	215754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410684121
5556	NC_017589	CAGC	2	8	215759	215766	25 %	0 %	25 %	50 %	410684121
5557	NC_017589	GTC	2	6	215771	215776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5558	NC_017589	CGGCAG	2	12	215819	215830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410684121
5559	NC_017589	CCCAG	2	10	215839	215848	20 %	0 %	20 %	60 %	410684121
5560	NC_017589	CG	3	6	215862	215867	0 %	0 %	50 %	50 %	410684121
5561	NC_017589	GGC	2	6	215870	215875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684121
5562	NC_017589	CAGG	2	8	215915	215922	25 %	0 %	50 %	25 %	410684121
5563	NC_017589	CGA	2	6	215938	215943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5564	NC_017589	GC	3	6	215955	215960	0 %	0 %	50 %	50 %	410684121
5565	NC_017589	CG	3	6	215968	215973	0 %	0 %	50 %	50 %	410684121
5566	NC_017589	GAACAG	2	12	215996	216007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410684121
5567	NC_017589	CGA	2	6	216008	216013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684121
5568	NC_017589	AGCCA	2	10	216050	216059	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5569	NC_017589	AGGG	2	8	216060	216067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_017589	AGT	2	6	216105	216110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017589	T	6	6	216151	216156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017589	GGT	2	6	216200	216205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017589	GCC	2	6	216231	216236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_017589	AGC	2	6	216289	216294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684122
5575	NC_017589	GCC	2	6	216382	216387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684122
5576	NC_017589	GGA	2	6	216434	216439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410684122
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5578	NC_017589	GCGCA	2	10	216495	216504	20 %	0 %	40 %	40 %	410684122
5579	NC_017589	GC	4	8	216507	216514	0 %	0 %	50 %	50 %	410684122
5580	NC_017589	TGG	2	6	216544	216549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410684122
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5582	NC_017589	GGC	2	6	216668	216673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684122
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5584	NC_017589	GC	3	6	216799	216804	0 %	0 %	50 %	50 %	410684122
5585	NC_017589	CAG	2	6	216813	216818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684122
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5587	NC_017589	GCT	2	6	216876	216881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684122
5588	NC_017589	GC	4	8	216932	216939	0 %	0 %	50 %	50 %	410684122
5589	NC_017589	GCT	2	6	216956	216961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684122
5590	NC_017589	GC	3	6	217032	217037	0 %	0 %	50 %	50 %	410684122
5591	NC_017589	GGC	2	6	217080	217085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684122
5592	NC_017589	AATG	2	8	217176	217183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017589	CAT	2	6	217189	217194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_017589	C	6	6	217266	217271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5595	NC_017589	CGA	2	6	217324	217329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5596	NC_017589	GCC	2	6	217350	217355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684123
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5598	NC_017589	AGG	2	6	217392	217397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410684123
5599	NC_017589	GC	3	6	217437	217442	0 %	0 %	50 %	50 %	410684123
5600	NC_017589	GGC	2	6	217547	217552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5601	NC_017589	GGT	2	6	217576	217581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410684123
5602	NC_017589	CGG	3	9	217684	217692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5603	NC_017589	CACG	2	8	217747	217754	25 %	0 %	25 %	50 %	410684123
5604	NC_017589	CCA	2	6	217770	217775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684123
5605	NC_017589	GGC	2	6	217801	217806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5606	NC_017589	CGT	2	6	217834	217839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5607	NC_017589	CAT	2	6	217861	217866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410684123
5608	NC_017589	GCC	3	9	217867	217875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684123
5609	NC_017589	GCG	2	6	217896	217901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5610	NC_017589	CGTGC	2	10	217918	217927	0 %	20 %	40 %	40 %	410684123
5611	NC_017589	CGC	2	6	217953	217958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684123
5612	NC_017589	GGC	2	6	218003	218008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5613	NC_017589	GCA	2	6	218037	218042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5614	NC_017589	TCA	2	6	218055	218060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410684123
5615	NC_017589	CGAGAC	2	12	218065	218076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5616	NC_017589	GC	3	6	218102	218107	0 %	0 %	50 %	50 %	410684123
5617	NC_017589	GAC	2	6	218120	218125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5618	NC_017589	GCG	2	6	218126	218131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684123
5619	NC_017589	GCCAGG	2	12	218148	218159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	410684123
5620	NC_017589	GCA	2	6	218197	218202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5621	NC_017589	CTG	2	6	218210	218215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5622	NC_017589	GCTCAA	2	12	218236	218247	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410684123
5623	NC_017589	CGC	2	6	218273	218278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684123
5624	NC_017589	GCT	2	6	218290	218295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684123
5625	NC_017589	AGC	2	6	218304	218309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684123
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5627	NC_017589	CGC	2	6	218355	218360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684124
5628	NC_017589	GGC	2	6	218398	218403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5629	NC_017589	GC	3	6	218402	218407	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5630	NC_017589	GCC	2	6	218409	218414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684124
5631	NC_017589	CGGC	2	8	218420	218427	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5632	NC_017589	GC	3	6	218426	218431	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5633	NC_017589	CGG	2	6	218486	218491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5634	NC_017589	TGC	2	6	218516	218521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684124
5635	NC_017589	CG	3	6	218534	218539	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5636	NC_017589	GC	3	6	218591	218596	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5637	NC_017589	GAA	2	6	218598	218603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410684124
5638	NC_017589	G	6	6	218650	218655	0 %	0 %	100 %	0 %	410684124
5639	NC_017589	CGC	2	6	218666	218671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684124
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5642	NC_017589	CAT	2	6	218708	218713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410684124
5643	NC_017589	GC	4	8	218731	218738	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5644	NC_017589	GGC	3	9	218769	218777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5645	NC_017589	GC	3	6	218794	218799	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5646	NC_017589	GGC	2	6	218841	218846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5647	NC_017589	CCG	2	6	218894	218899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684124
5648	NC_017589	GC	5	10	218926	218935	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5649	NC_017589	CGGCG	2	10	218973	218982	0 %	0 %	60 %	40 %	410684124
5650	NC_017589	GCC	2	6	218988	218993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684124
5651	NC_017589	GGC	2	6	218994	218999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5652	NC_017589	GCG	2	6	219047	219052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5653	NC_017589	TCG	2	6	219086	219091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684124
5654	NC_017589	GCG	2	6	219104	219109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684124
5655	NC_017589	GACG	2	8	219201	219208	25 %	0 %	50 %	25 %	410684124
5656	NC_017589	GC	3	6	219213	219218	0 %	0 %	50 %	50 %	410684124
5657	NC_017589	CTG	2	6	219259	219264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684124
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5659	NC_017589	CCG	2	6	219301	219306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5660	NC_017589	ACGC	2	8	219326	219333	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5661	NC_017589	CGG	2	6	219341	219346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5662	NC_017589	TTTGG	2	10	219369	219378	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5663	NC_017589	AGC	2	6	219435	219440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5664	NC_017589	GTT	2	6	219489	219494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410684125
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5677	NC_017589	CGT	2	6	220174	220179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684125
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5680	NC_017589	TGC	2	6	220311	220316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684125
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5682	NC_017589	GC	3	6	220470	220475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5683	NC_017589	GCT	2	6	220479	220484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5686	NC_017589	AG	3	6	220598	220603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5687	NC_017589	CCG	2	6	220632	220637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5688	NC_017589	GC	3	6	220648	220653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5689	NC_017589	CCG	2	6	220698	220703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5690	NC_017589	CGG	2	6	220738	220743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5691	NC_017589	TGA	2	6	220755	220760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5692	NC_017589	TGGG	2	8	220762	220769	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5693	NC_017589	AAC	2	6	220884	220889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5694	NC_017589	TTA	2	6	220908	220913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5695	NC_017589	CTG	2	6	221014	221019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684126
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5701	NC_017589	TGC	2	6	221245	221250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5702	NC_017589	AGCC	2	8	221290	221297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5703	NC_017589	CGC	2	6	221351	221356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5704	NC_017589	TCG	2	6	221378	221383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5705	NC_017589	GTC	2	6	221424	221429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5708	NC_017589	CTG	2	6	221564	221569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684127
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5723	NC_017589	TTGC	2	8	222057	222064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5724	NC_017589	TGA	2	6	222122	222127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5725	NC_017589	GAT	2	6	222260	222265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410684128
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5730	NC_017589	GCAGTG	2	12	222425	222436	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410684128
5731	NC_017589	GCT	2	6	222440	222445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684128
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5735	NC_017589	CGG	2	6	222538	222543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684128
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5737	NC_017589	CGCGC	2	10	222633	222642	0 %	0 %	40 %	60 %	410684128
5738	NC_017589	CAT	2	6	222650	222655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410684128
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5741	NC_017589	GCT	2	6	222761	222766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684128
5742	NC_017589	GGT	2	6	222779	222784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410684128
5743	NC_017589	CGA	2	6	222926	222931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410684128
5744	NC_017589	GC	3	6	222965	222970	0 %	0 %	50 %	50 %	410684128
5745	NC_017589	CA	3	6	222988	222993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5747	NC_017589	A	6	6	223001	223006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5991	NC_017589	G	6	6	230975	230980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5992	NC_017589	CG	3	6	230991	230996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5993	NC_017589	TC	3	6	231026	231031	0 %	50 %	0 %	50 %	410684134
5994	NC_017589	ACC	2	6	231044	231049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410684134
5995	NC_017589	CTG	2	6	231050	231055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684134
5996	NC_017589	GCC	2	6	231056	231061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410684134
5997	NC_017589	GGC	2	6	231113	231118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410684134
5998	NC_017589	TTC	2	6	231125	231130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410684134
5999	NC_017589	GC	3	6	231135	231140	0 %	0 %	50 %	50 %	410684134
6000	NC_017589	TCG	2	6	231168	231173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410684134

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