MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 12298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017584	CGCT	2	8	474	481	0 %	25 %	25 %	50 %	386348021
2	NC_017584	CGGC	2	8	615	622	0 %	0 %	50 %	50 %	386348021
3	NC_017584	ATGC	2	8	897	904	25 %	25 %	25 %	25 %	386348021
4	NC_017584	ATCT	2	8	948	955	25 %	50 %	0 %	25 %	386348021
5	NC_017584	CATG	2	8	1664	1671	25 %	25 %	25 %	25 %	386348021
6	NC_017584	CGGT	2	8	1942	1949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017584	GCCC	2	8	1984	1991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_017584	TGCC	2	8	2322	2329	0 %	25 %	25 %	50 %	386348022
9	NC_017584	GATC	2	8	2408	2415	25 %	25 %	25 %	25 %	386348022
10	NC_017584	ATCT	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	386348022
11	NC_017584	CCGA	2	8	2754	2761	25 %	0 %	25 %	50 %	386348022
12	NC_017584	CTCG	2	8	2948	2955	0 %	25 %	25 %	50 %	386348022
13	NC_017584	GCCC	2	8	3381	3388	0 %	0 %	25 %	75 %	386348023
14	NC_017584	GCGA	2	8	3596	3603	25 %	0 %	50 %	25 %	386348023
15	NC_017584	CGCC	2	8	3694	3701	0 %	0 %	25 %	75 %	386348023
16	NC_017584	GCTG	2	8	3729	3736	0 %	25 %	50 %	25 %	386348023
17	NC_017584	GATC	2	8	3856	3863	25 %	25 %	25 %	25 %	386348023
18	NC_017584	GGCT	2	8	3881	3888	0 %	25 %	50 %	25 %	386348023
19	NC_017584	CCGC	2	8	4098	4105	0 %	0 %	25 %	75 %	386348023
20	NC_017584	CGGG	2	8	4699	4706	0 %	0 %	75 %	25 %	386348024
21	NC_017584	CCAG	2	8	5368	5375	25 %	0 %	25 %	50 %	386348024
22	NC_017584	CGCC	2	8	6125	6132	0 %	0 %	25 %	75 %	386348024
23	NC_017584	CTTG	2	8	6179	6186	0 %	50 %	25 %	25 %	386348024
24	NC_017584	CGCC	2	8	6266	6273	0 %	0 %	25 %	75 %	386348024
25	NC_017584	TTTG	2	8	6935	6942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017584	CCTT	2	8	7986	7993	0 %	50 %	0 %	50 %	386348026
27	NC_017584	CTCG	2	8	8449	8456	0 %	25 %	25 %	50 %	386348026
28	NC_017584	TTTG	2	8	8746	8753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017584	GGCC	2	8	8894	8901	0 %	0 %	50 %	50 %	386348027
30	NC_017584	CGGG	2	8	9186	9193	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017584	TTCC	2	8	10583	10590	0 %	50 %	0 %	50 %	386348031
32	NC_017584	TATT	2	8	10813	10820	25 %	75 %	0 %	0 %	386348031
33	NC_017584	CCAG	2	8	11120	11127	25 %	0 %	25 %	50 %	386348031
34	NC_017584	GAGC	2	8	11385	11392	25 %	0 %	50 %	25 %	386348031
35	NC_017584	CGGG	2	8	11405	11412	0 %	0 %	75 %	25 %	386348031
36	NC_017584	GGGC	2	8	12110	12117	0 %	0 %	75 %	25 %	386348032
37	NC_017584	GGCG	2	8	12538	12545	0 %	0 %	75 %	25 %	386348032
38	NC_017584	AGAT	2	8	12585	12592	50 %	25 %	25 %	0 %	386348032
39	NC_017584	TCCC	2	8	12918	12925	0 %	25 %	0 %	75 %	386348033
40	NC_017584	CGGC	2	8	13215	13222	0 %	0 %	50 %	50 %	386348033
41	NC_017584	GGTC	2	8	14360	14367	0 %	25 %	50 %	25 %	386348034
42	NC_017584	GATC	2	8	14408	14415	25 %	25 %	25 %	25 %	386348034
43	NC_017584	GCCG	2	8	14571	14578	0 %	0 %	50 %	50 %	386348034
44	NC_017584	ACCG	2	8	14741	14748	25 %	0 %	25 %	50 %	386348035
45	NC_017584	TGGC	2	8	15417	15424	0 %	25 %	50 %	25 %	386348035
46	NC_017584	GGCG	2	8	15640	15647	0 %	0 %	75 %	25 %	386348035
47	NC_017584	TCAG	2	8	15975	15982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017584	CGGT	2	8	16058	16065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017584	CCTC	2	8	16079	16086	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_017584	ATGG	2	8	16829	16836	25 %	25 %	50 %	0 %	386348036
51	NC_017584	CGGA	2	8	17323	17330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017584	GGCA	2	8	17401	17408	25 %	0 %	50 %	25 %	386348037
53	NC_017584	CGGC	2	8	17610	17617	0 %	0 %	50 %	50 %	386348037
54	NC_017584	GATC	2	8	17934	17941	25 %	25 %	25 %	25 %	386348037
55	NC_017584	GCAT	2	8	20791	20798	25 %	25 %	25 %	25 %	386348039
56	NC_017584	GATC	2	8	20966	20973	25 %	25 %	25 %	25 %	386348039
57	NC_017584	CCGG	2	8	21510	21517	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
58	NC_017584	TGGC	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
59	NC_017584	CCGG	3	12	22167	22178	0 %	0 %	50 %	50 %	386348040
60	NC_017584	GTGG	2	8	22561	22568	0 %	25 %	75 %	0 %	386348040
61	NC_017584	TCAG	2	8	22809	22816	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
62	NC_017584	GCCA	2	8	22910	22917	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
63	NC_017584	CTGG	2	8	23305	23312	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
64	NC_017584	CGCT	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
65	NC_017584	CTGG	2	8	23555	23562	0 %	25 %	50 %	25 %	386348040
66	NC_017584	CGAC	2	8	23715	23722	25 %	0 %	25 %	50 %	386348040
67	NC_017584	TCGA	2	8	23822	23829	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
68	NC_017584	GGGC	2	8	24127	24134	0 %	0 %	75 %	25 %	386348040
69	NC_017584	TCGA	2	8	24233	24240	25 %	25 %	25 %	25 %	386348040
70	NC_017584	GCTC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	386348040
71	NC_017584	GGCA	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	386348041
72	NC_017584	TCCT	2	8	27215	27222	0 %	50 %	0 %	50 %	386348043
73	NC_017584	CGGG	2	8	27493	27500	0 %	0 %	75 %	25 %	386348043
74	NC_017584	GCTG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	386348043
75	NC_017584	CCGG	2	8	28523	28530	0 %	0 %	50 %	50 %	386348045
76	NC_017584	ACCA	2	8	28835	28842	50 %	0 %	0 %	50 %	386348045
77	NC_017584	CAGG	2	8	29736	29743	25 %	0 %	50 %	25 %	386348046
78	NC_017584	AGCG	2	8	30133	30140	25 %	0 %	50 %	25 %	386348046
79	NC_017584	CGCC	2	8	32364	32371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_017584	TGGG	2	8	33727	33734	0 %	25 %	75 %	0 %	386348049
81	NC_017584	GGGC	2	8	34564	34571	0 %	0 %	75 %	25 %	386348051
82	NC_017584	CGAC	2	8	35051	35058	25 %	0 %	25 %	50 %	386348052
83	NC_017584	GGCG	2	8	36806	36813	0 %	0 %	75 %	25 %	386348053
84	NC_017584	GCGG	2	8	37071	37078	0 %	0 %	75 %	25 %	386348053
85	NC_017584	GCGG	2	8	37208	37215	0 %	0 %	75 %	25 %	386348053
86	NC_017584	CGGC	2	8	37272	37279	0 %	0 %	50 %	50 %	386348054
87	NC_017584	CGGG	2	8	37291	37298	0 %	0 %	75 %	25 %	386348054
88	NC_017584	GATC	2	8	37920	37927	25 %	25 %	25 %	25 %	386348055
89	NC_017584	CGGG	2	8	38327	38334	0 %	0 %	75 %	25 %	386348055
90	NC_017584	GGCC	2	8	38791	38798	0 %	0 %	50 %	50 %	386348056
91	NC_017584	GCCG	2	8	39127	39134	0 %	0 %	50 %	50 %	386348056
92	NC_017584	TCCA	2	8	40296	40303	25 %	25 %	0 %	50 %	386348056
93	NC_017584	GCCC	2	8	40623	40630	0 %	0 %	25 %	75 %	386348057
94	NC_017584	CATC	2	8	40631	40638	25 %	25 %	0 %	50 %	386348057
95	NC_017584	TCGG	2	8	40831	40838	0 %	25 %	50 %	25 %	386348057
96	NC_017584	CCGG	2	8	40985	40992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017584	CGGG	2	8	41064	41071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017584	CAAG	2	8	41153	41160	50 %	0 %	25 %	25 %	386348058
99	NC_017584	AGAA	2	8	41576	41583	75 %	0 %	25 %	0 %	386348059
100	NC_017584	CAGA	2	8	41665	41672	50 %	0 %	25 %	25 %	386348059
101	NC_017584	GCGG	2	8	41707	41714	0 %	0 %	75 %	25 %	386348059
102	NC_017584	ACAT	2	8	41813	41820	50 %	25 %	0 %	25 %	386348059
103	NC_017584	CGGG	2	8	41850	41857	0 %	0 %	75 %	25 %	386348059
104	NC_017584	GGCG	2	8	42944	42951	0 %	0 %	75 %	25 %	386348061
105	NC_017584	GCCG	2	8	43292	43299	0 %	0 %	50 %	50 %	386348061
106	NC_017584	GCAC	2	8	43433	43440	25 %	0 %	25 %	50 %	386348061
107	NC_017584	GGCG	2	8	43606	43613	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017584	GGCG	2	8	44011	44018	0 %	0 %	75 %	25 %	386348062
109	NC_017584	GGGC	3	12	44024	44035	0 %	0 %	75 %	25 %	386348062
110	NC_017584	GCGG	2	8	44096	44103	0 %	0 %	75 %	25 %	386348062
111	NC_017584	GATC	2	8	44295	44302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017584	CGCC	2	8	45095	45102	0 %	0 %	25 %	75 %	386348063
113	NC_017584	CGTC	2	8	45208	45215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017584	TTCC	2	8	45293	45300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017584	CCGC	2	8	45621	45628	0 %	0 %	25 %	75 %	386348064
116	NC_017584	CATG	2	8	45674	45681	25 %	25 %	25 %	25 %	386348064
117	NC_017584	GCCC	2	8	45704	45711	0 %	0 %	25 %	75 %	386348064
118	NC_017584	CATC	2	8	45725	45732	25 %	25 %	0 %	50 %	386348064
119	NC_017584	CTGC	2	8	45881	45888	0 %	25 %	25 %	50 %	386348064
120	NC_017584	CCGG	2	8	46024	46031	0 %	0 %	50 %	50 %	386348064
121	NC_017584	ATCG	2	8	46122	46129	25 %	25 %	25 %	25 %	386348064
122	NC_017584	GGCC	2	8	46280	46287	0 %	0 %	50 %	50 %	386348064
123	NC_017584	ATCG	2	8	46599	46606	25 %	25 %	25 %	25 %	386348065
124	NC_017584	ACCG	2	8	47066	47073	25 %	0 %	25 %	50 %	386348066
125	NC_017584	CCAT	2	8	47679	47686	25 %	25 %	0 %	50 %	386348066
126	NC_017584	TGAC	2	8	48852	48859	25 %	25 %	25 %	25 %	386348068
127	NC_017584	TGGT	2	8	48927	48934	0 %	50 %	50 %	0 %	386348068
128	NC_017584	GCCG	2	8	49855	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	386348068
129	NC_017584	CGGG	2	8	50025	50032	0 %	0 %	75 %	25 %	386348068
130	NC_017584	CAGC	2	8	50168	50175	25 %	0 %	25 %	50 %	386348068
131	NC_017584	GCGA	2	8	50487	50494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017584	GTTT	2	8	51218	51225	0 %	75 %	25 %	0 %	386348070
133	NC_017584	CGGG	2	8	51483	51490	0 %	0 %	75 %	25 %	386348070
134	NC_017584	GCGG	2	8	51502	51509	0 %	0 %	75 %	25 %	386348070
135	NC_017584	GTCC	2	8	51630	51637	0 %	25 %	25 %	50 %	386348071
136	NC_017584	TCCT	2	8	51728	51735	0 %	50 %	0 %	50 %	386348071
137	NC_017584	GCGG	2	8	52562	52569	0 %	0 %	75 %	25 %	386348072
138	NC_017584	ATCG	2	8	52799	52806	25 %	25 %	25 %	25 %	386348072
139	NC_017584	CCGG	2	8	53335	53342	0 %	0 %	50 %	50 %	386348072
140	NC_017584	CGAC	2	8	53934	53941	25 %	0 %	25 %	50 %	386348073
141	NC_017584	TCGA	2	8	54356	54363	25 %	25 %	25 %	25 %	386348073
142	NC_017584	TGGT	2	8	54380	54387	0 %	50 %	50 %	0 %	386348073
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