MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017584	GCCA	2	8	154219	154226	25 %	0 %	25 %	50 %	386348153
4002	NC_017584	CCA	2	6	154232	154237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348153
4003	NC_017584	CAGC	2	8	154266	154273	25 %	0 %	25 %	50 %	386348153
4004	NC_017584	GCG	3	9	154279	154287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4005	NC_017584	CGCC	2	8	154290	154297	0 %	0 %	25 %	75 %	386348153
4006	NC_017584	CGT	2	6	154298	154303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4007	NC_017584	TCG	2	6	154318	154323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4008	NC_017584	GCG	2	6	154329	154334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4009	NC_017584	GAA	2	6	154353	154358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348153
4010	NC_017584	CCCG	2	8	154409	154416	0 %	0 %	25 %	75 %	386348153
4011	NC_017584	GGC	2	6	154451	154456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4012	NC_017584	GCA	2	6	154511	154516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4013	NC_017584	GCC	2	6	154675	154680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4014	NC_017584	CCGG	2	8	154713	154720	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
4015	NC_017584	CCG	2	6	154725	154730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4016	NC_017584	ATC	2	6	154747	154752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348153
4017	NC_017584	TTG	2	6	154765	154770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348153
4018	NC_017584	GCC	2	6	154783	154788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4019	NC_017584	GCG	2	6	154805	154810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4020	NC_017584	GC	3	6	154837	154842	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
4021	NC_017584	GGCGG	2	10	154843	154852	0 %	0 %	80 %	20 %	386348153
4022	NC_017584	GCG	2	6	154865	154870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4023	NC_017584	G	7	7	155006	155012	0 %	0 %	100 %	0 %	386348153
4024	NC_017584	CGG	2	6	155033	155038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4025	NC_017584	G	6	6	155046	155051	0 %	0 %	100 %	0 %	386348153
4026	NC_017584	CGG	2	6	155139	155144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4027	NC_017584	GCC	2	6	155172	155177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4028	NC_017584	CGG	2	6	155252	155257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4029	NC_017584	GCTG	2	8	155258	155265	0 %	25 %	50 %	25 %	386348153
4030	NC_017584	TCA	2	6	155299	155304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348153
4031	NC_017584	CG	3	6	155325	155330	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
4032	NC_017584	CCG	2	6	155336	155341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4033	NC_017584	CCG	2	6	155370	155375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4034	NC_017584	CCA	2	6	155402	155407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348153
4035	NC_017584	ACG	2	6	155437	155442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4036	NC_017584	AGG	2	6	155477	155482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348153
4037	NC_017584	GCG	2	6	155500	155505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4038	NC_017584	GTC	2	6	155509	155514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4039	NC_017584	CAGC	2	8	155568	155575	25 %	0 %	25 %	50 %	386348153
4040	NC_017584	G	6	6	155615	155620	0 %	0 %	100 %	0 %	386348153
4041	NC_017584	CGG	2	6	155645	155650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348153
4042	NC_017584	TCG	2	6	155651	155656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4043	NC_017584	GCCGG	2	10	155665	155674	0 %	0 %	60 %	40 %	386348153
4044	NC_017584	CCG	4	12	155675	155686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4045	NC_017584	TGG	2	6	155693	155698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348153
4046	NC_017584	CG	3	6	155702	155707	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
4047	NC_017584	CGGC	2	8	155711	155718	0 %	0 %	50 %	50 %	386348153
4048	NC_017584	CGC	3	9	155727	155735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348153
4049	NC_017584	CAG	2	6	155736	155741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348153
4050	NC_017584	TCG	2	6	155808	155813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017584	GCCG	2	8	155839	155846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_017584	GC	3	6	155860	155865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_017584	G	6	6	155896	155901	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017584	GGC	2	6	155903	155908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017584	GAT	2	6	155917	155922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017584	CG	4	8	155936	155943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4057	NC_017584	TGGC	2	8	155945	155952	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_017584	GTG	2	6	156075	156080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348154
4059	NC_017584	GGT	2	6	156083	156088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348154
4060	NC_017584	GTT	2	6	156149	156154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348154
4061	NC_017584	CTG	2	6	156198	156203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348154
4062	NC_017584	CCGGC	2	10	156204	156213	0 %	0 %	40 %	60 %	386348154
4063	NC_017584	GAT	2	6	156224	156229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348154
4064	NC_017584	GGC	2	6	156284	156289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348154
4065	NC_017584	GC	3	6	156288	156293	0 %	0 %	50 %	50 %	386348154
4066	NC_017584	CAC	2	6	156323	156328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348154
4067	NC_017584	CACC	2	8	156368	156375	25 %	0 %	0 %	75 %	386348154
4068	NC_017584	GCG	2	6	156404	156409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348154
4069	NC_017584	CGT	2	6	156421	156426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348154
4070	NC_017584	CGG	2	6	156427	156432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348154
4071	NC_017584	CCCTCG	2	12	156441	156452	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386348154
4072	NC_017584	CGGG	2	8	156470	156477	0 %	0 %	75 %	25 %	386348154
4073	NC_017584	CGGG	2	8	156581	156588	0 %	0 %	75 %	25 %	386348154
4074	NC_017584	CCTT	2	8	156613	156620	0 %	50 %	0 %	50 %	386348154
4075	NC_017584	GCA	2	6	156637	156642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348154
4076	NC_017584	TCGGG	2	10	156652	156661	0 %	20 %	60 %	20 %	386348154
4077	NC_017584	GCG	2	6	156683	156688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348154
4078	NC_017584	CGC	3	9	156746	156754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348154
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4080	NC_017584	GACCG	2	10	156848	156857	20 %	0 %	40 %	40 %	386348154
4081	NC_017584	CG	3	6	156856	156861	0 %	0 %	50 %	50 %	386348154
4082	NC_017584	GCC	2	6	156873	156878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348154
4083	NC_017584	CGA	2	6	156893	156898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348154
4084	NC_017584	GGC	2	6	156911	156916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348154
4085	NC_017584	TGA	2	6	156989	156994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348154
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4087	NC_017584	C	6	6	157033	157038	0 %	0 %	0 %	100 %	386348154
4088	NC_017584	GC	3	6	157047	157052	0 %	0 %	50 %	50 %	386348154
4089	NC_017584	TGG	2	6	157133	157138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017584	CGC	2	6	157202	157207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4091	NC_017584	CGTG	2	8	157217	157224	0 %	25 %	50 %	25 %	386348155
4092	NC_017584	CGA	2	6	157277	157282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348155
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4094	NC_017584	CCG	2	6	157361	157366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4095	NC_017584	GCC	4	12	157377	157388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4096	NC_017584	GCCT	2	8	157394	157401	0 %	25 %	25 %	50 %	386348155
4097	NC_017584	GGCG	2	8	157402	157409	0 %	0 %	75 %	25 %	386348155
4098	NC_017584	CGC	2	6	157427	157432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4099	NC_017584	TGA	2	6	157489	157494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348155
4100	NC_017584	CCG	2	6	157495	157500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4101	NC_017584	GCCC	2	8	157604	157611	0 %	0 %	25 %	75 %	386348155
4102	NC_017584	CGC	2	6	157661	157666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4103	NC_017584	GGC	2	6	157724	157729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4104	NC_017584	GGT	2	6	157739	157744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348155
4105	NC_017584	GCCG	2	8	157751	157758	0 %	0 %	50 %	50 %	386348155
4106	NC_017584	CGC	2	6	157765	157770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
4107	NC_017584	TGG	2	6	157786	157791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348155
4108	NC_017584	GGCC	2	8	157805	157812	0 %	0 %	50 %	50 %	386348155
4109	NC_017584	ACC	2	6	157839	157844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348155
4110	NC_017584	GCG	2	6	157864	157869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4111	NC_017584	GAA	2	6	157961	157966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348155
4112	NC_017584	GGC	2	6	157983	157988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4113	NC_017584	CGA	2	6	158009	158014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348155
4114	NC_017584	GGC	2	6	158027	158032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4115	NC_017584	CAG	2	6	158193	158198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348155
4116	NC_017584	CAA	2	6	158210	158215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348155
4117	NC_017584	GGTT	2	8	158239	158246	0 %	50 %	50 %	0 %	386348155
4118	NC_017584	CGG	2	6	158272	158277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4119	NC_017584	CGG	2	6	158282	158287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4120	NC_017584	GGC	2	6	158304	158309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348155
4121	NC_017584	CGA	2	6	158323	158328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348155
4122	NC_017584	CCG	2	6	158344	158349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348155
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4124	NC_017584	CCGAGG	2	12	158410	158421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386348155
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4242	NC_017584	GGTGC	2	10	163077	163086	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4243	NC_017584	ATA	2	6	163162	163167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_017584	TA	3	6	163252	163257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_017584	AAT	3	9	163263	163271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_017584	TGT	2	6	163288	163293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348160
4247	NC_017584	GCGT	2	8	163344	163351	0 %	25 %	50 %	25 %	386348160
4248	NC_017584	TGC	2	6	163389	163394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348160
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4368	NC_017584	GGT	2	6	168505	168510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348165
4369	NC_017584	GAT	3	9	168547	168555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348165
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4495	NC_017584	CGA	2	6	173617	173622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348169
4496	NC_017584	GAT	2	6	173651	173656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348169
4497	NC_017584	GGT	2	6	173672	173677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348169
4498	NC_017584	T	7	7	173685	173691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4499	NC_017584	AGCTT	2	10	173700	173709	20 %	40 %	20 %	20 %	386348170
4500	NC_017584	ACG	2	6	173725	173730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348170

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