MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017584	CGG	2	6	98379	98384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348106
2503	NC_017584	ATC	2	6	98409	98414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348106
2504	NC_017584	GCC	2	6	98436	98441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348106
2505	NC_017584	ATC	2	6	98445	98450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348106
2506	NC_017584	GATC	2	8	98483	98490	25 %	25 %	25 %	25 %	386348106
2507	NC_017584	TGC	2	6	98494	98499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348106
2508	NC_017584	TCG	2	6	98521	98526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348106
2509	NC_017584	GGT	2	6	98555	98560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348106
2510	NC_017584	TGG	2	6	98659	98664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348106
2511	NC_017584	CCG	2	6	98672	98677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348106
2512	NC_017584	CCA	2	6	98693	98698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348106
2513	NC_017584	TCG	3	9	98707	98715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348106
2514	NC_017584	GAG	2	6	98796	98801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386348106
2515	NC_017584	GCCCTG	2	12	98802	98813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348106
2516	NC_017584	GGC	2	6	98816	98821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348106
2517	NC_017584	ATT	2	6	98851	98856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348106
2518	NC_017584	ATC	2	6	98928	98933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348106
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2521	NC_017584	TCA	2	6	98998	99003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348106
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2524	NC_017584	GATC	2	8	99095	99102	25 %	25 %	25 %	25 %	386348106
2525	NC_017584	CCG	2	6	99122	99127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348106
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2539	NC_017584	CGATGC	2	12	99649	99660	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386348107
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2542	NC_017584	GAT	2	6	99803	99808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348107
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2554	NC_017584	GAT	2	6	100325	100330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348108
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2558	NC_017584	GCTG	2	8	100501	100508	0 %	25 %	50 %	25 %	386348108
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2614	NC_017584	CCG	2	6	102731	102736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_017584	CCCG	2	8	102739	102746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2623	NC_017584	CGC	2	6	103018	103023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348110
2624	NC_017584	GATG	2	8	103026	103033	25 %	25 %	50 %	0 %	386348110
2625	NC_017584	GCG	2	6	103040	103045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348110
2626	NC_017584	GCT	2	6	103056	103061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348110
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2628	NC_017584	CTG	2	6	103105	103110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348110
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2662	NC_017584	GA	3	6	104694	104699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2663	NC_017584	GATT	2	8	104709	104716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2693	NC_017584	A	7	7	105849	105855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_017584	GCC	2	6	108091	108096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348115
2747	NC_017584	CCG	2	6	108107	108112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348115
2748	NC_017584	CG	3	6	108117	108122	0 %	0 %	50 %	50 %	386348115
2749	NC_017584	G	6	6	108149	108154	0 %	0 %	100 %	0 %	386348115
2750	NC_017584	TTA	2	6	108205	108210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386348115
2751	NC_017584	TGC	2	6	108231	108236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348115
2752	NC_017584	CTG	3	9	108386	108394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348115
2753	NC_017584	GTG	2	6	108395	108400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348115
2754	NC_017584	CGG	2	6	108402	108407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348115
2755	NC_017584	GGT	2	6	108523	108528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348115
2756	NC_017584	GCA	2	6	108573	108578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348115
2757	NC_017584	CAC	2	6	108622	108627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348115
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2759	NC_017584	CGA	2	6	108661	108666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348115
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2761	NC_017584	CTT	2	6	108700	108705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348115
2762	NC_017584	T	7	7	108713	108719	0 %	100 %	0 %	0 %	386348115
2763	NC_017584	CTG	2	6	108725	108730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348115
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2765	NC_017584	ATC	2	6	108746	108751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348115
2766	NC_017584	GTC	2	6	108752	108757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348115
2767	NC_017584	CAT	2	6	108760	108765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348115
2768	NC_017584	GCG	2	6	108822	108827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348115
2769	NC_017584	AAT	2	6	108851	108856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386348115
2770	NC_017584	GCC	3	9	108902	108910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348115
2771	NC_017584	TGG	2	6	108933	108938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348115
2772	NC_017584	CGGC	2	8	108978	108985	0 %	0 %	50 %	50 %	386348115
2773	NC_017584	CGA	2	6	109084	109089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348116
2774	NC_017584	ATC	2	6	109148	109153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348116
2775	NC_017584	GCGAGG	2	12	109173	109184	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386348116
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2778	NC_017584	CG	3	6	109221	109226	0 %	0 %	50 %	50 %	386348116
2779	NC_017584	CGA	2	6	109269	109274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348116
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2787	NC_017584	T	7	7	109467	109473	0 %	100 %	0 %	0 %	386348116
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2790	NC_017584	TCG	2	6	109692	109697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348116
2791	NC_017584	CTG	2	6	109739	109744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348116
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2794	NC_017584	GGCC	2	8	109850	109857	0 %	0 %	50 %	50 %	386348116
2795	NC_017584	GGC	2	6	109891	109896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348116
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2802	NC_017584	CCG	2	6	110151	110156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
2803	NC_017584	CAAGG	2	10	110164	110173	40 %	0 %	40 %	20 %	386348117
2804	NC_017584	ATCGG	2	10	110239	110248	20 %	20 %	40 %	20 %	386348117
2805	NC_017584	GCC	2	6	110281	110286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
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2810	NC_017584	CCG	2	6	110527	110532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
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2814	NC_017584	GCA	2	6	110717	110722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348117
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2818	NC_017584	CTCGGC	2	12	110766	110777	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348117
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2820	NC_017584	GCC	2	6	110803	110808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
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2822	NC_017584	GC	3	6	110871	110876	0 %	0 %	50 %	50 %	386348117
2823	NC_017584	CTC	2	6	110907	110912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348117
2824	NC_017584	GCC	2	6	110934	110939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
2825	NC_017584	G	6	6	110942	110947	0 %	0 %	100 %	0 %	386348117
2826	NC_017584	CG	3	6	110963	110968	0 %	0 %	50 %	50 %	386348117
2827	NC_017584	CGA	3	9	110987	110995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348117
2828	NC_017584	TCA	2	6	111017	111022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348117
2829	NC_017584	GCCA	3	12	111034	111045	25 %	0 %	25 %	50 %	386348117
2830	NC_017584	CCG	3	9	111046	111054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348117
2831	NC_017584	ACG	2	6	111055	111060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348117
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2833	NC_017584	A	6	6	111138	111143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2834	NC_017584	CCG	2	6	111161	111166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2835	NC_017584	CCG	2	6	111195	111200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2836	NC_017584	GTT	2	6	111216	111221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2837	NC_017584	CGT	2	6	111253	111258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348118
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2839	NC_017584	GGC	2	6	111384	111389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348118
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2841	NC_017584	CGG	2	6	111424	111429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348118
2842	NC_017584	CAGCAC	2	12	111462	111473	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386348118
2843	NC_017584	TTG	2	6	111586	111591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386348118
2844	NC_017584	CGT	2	6	111644	111649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348118
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2850	NC_017584	GC	3	6	111839	111844	0 %	0 %	50 %	50 %	386348119
2851	NC_017584	GTC	2	6	111845	111850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2852	NC_017584	ACG	2	6	111865	111870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2853	NC_017584	TCGG	2	8	111885	111892	0 %	25 %	50 %	25 %	386348119
2854	NC_017584	AAC	2	6	111900	111905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386348119
2855	NC_017584	CGT	2	6	111985	111990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348119
2856	NC_017584	CGG	2	6	111991	111996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
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2858	NC_017584	GCC	2	6	112113	112118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2859	NC_017584	CCG	3	9	112120	112128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2860	NC_017584	GGCC	2	8	112141	112148	0 %	0 %	50 %	50 %	386348119
2861	NC_017584	GGC	2	6	112190	112195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2862	NC_017584	CCG	2	6	112212	112217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2863	NC_017584	GGC	2	6	112244	112249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348119
2864	NC_017584	GAT	2	6	112268	112273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348119
2865	NC_017584	GCC	2	6	112277	112282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348119
2866	NC_017584	CGA	2	6	112327	112332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348119
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2987	NC_017584	CGGC	2	8	117610	117617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2988	NC_017584	TTA	2	6	117648	117653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_017584	CGG	2	6	117668	117673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2990	NC_017584	CAG	2	6	117683	117688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_017584	GCG	2	6	117711	117716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348126
2992	NC_017584	GCTC	2	8	117731	117738	0 %	25 %	25 %	50 %	386348126
2993	NC_017584	CGG	2	6	117788	117793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348126
2994	NC_017584	GCCCT	2	10	117836	117845	0 %	20 %	20 %	60 %	386348126
2995	NC_017584	CGC	2	6	117856	117861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348126
2996	NC_017584	CGC	2	6	117880	117885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348126
2997	NC_017584	ACG	2	6	117960	117965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348126
2998	NC_017584	GCC	2	6	117986	117991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348126
2999	NC_017584	GC	3	6	117995	118000	0 %	0 %	50 %	50 %	386348126
3000	NC_017584	GC	3	6	118057	118062	0 %	0 %	50 %	50 %	386348126

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