MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017584	CGA	2	6	192765	192770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017584	GCCA	2	8	192794	192801	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_017584	GCA	2	6	192839	192844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017584	GTGA	2	8	192892	192899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017584	GAT	2	6	192938	192943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017584	AGA	2	6	192956	192961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017584	CAG	2	6	192982	192987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017584	GTT	2	6	193013	193018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017584	GTG	2	6	193131	193136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017584	GGA	2	6	193173	193178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017584	GGC	2	6	193193	193198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017584	TGC	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017584	GTC	2	6	193523	193528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017584	TCGTG	2	10	193532	193541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5015	NC_017584	GGA	2	6	193637	193642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017584	GGGCT	2	10	193678	193687	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5017	NC_017584	AC	3	6	193688	193693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_017584	AC	3	6	193856	193861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_017584	AGG	2	6	193915	193920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017584	CCT	2	6	193997	194002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_017584	AAG	2	6	194069	194074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017584	CGG	2	6	194131	194136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017584	GGT	2	6	194162	194167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017584	GGT	2	6	194203	194208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017584	CCA	2	6	194260	194265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017584	GTC	2	6	194377	194382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017584	CCA	2	6	194402	194407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_017584	CCT	2	6	194447	194452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_017584	CCA	2	6	194484	194489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_017584	CT	3	6	194545	194550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_017584	CTG	2	6	194575	194580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017584	T	6	6	194601	194606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017584	CGT	2	6	194607	194612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_017584	TTC	2	6	194703	194708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017584	CAAG	2	8	194780	194787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5036	NC_017584	TGG	2	6	194799	194804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017584	ACCC	2	8	194903	194910	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5038	NC_017584	GGA	2	6	194983	194988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017584	TAG	2	6	195012	195017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017584	GCGA	2	8	195020	195027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_017584	G	6	6	195167	195172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017584	ACC	2	6	195173	195178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_017584	GAC	2	6	195200	195205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_017584	TCG	2	6	195418	195423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017584	GGA	2	6	195485	195490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017584	GAT	2	6	195602	195607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017584	ACC	2	6	195609	195614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_017584	CAGA	2	8	195698	195705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_017584	AAC	2	6	195738	195743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017584	ACC	2	6	195748	195753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_017584	AAC	2	6	195805	195810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017584	AGG	2	6	195812	195817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017584	AGC	2	6	195828	195833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_017584	AAAG	2	8	195842	195849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017584	TTCT	2	8	195927	195934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_017584	CCG	2	6	196054	196059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_017584	GTT	2	6	196190	196195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017584	CCT	2	6	196196	196201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_017584	GCAG	2	8	196217	196224	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_017584	GA	3	6	196305	196310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017584	GTG	2	6	196368	196373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017584	CAT	2	6	196380	196385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_017584	G	7	7	196386	196392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017584	GAC	2	6	196450	196455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017584	AGAGG	2	10	196493	196502	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017584	CGG	2	6	196532	196537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017584	TAC	2	6	196706	196711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017584	GATG	2	8	196733	196740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017584	TG	3	6	196781	196786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017584	TCCGGG	2	12	196843	196854	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017584	GTG	2	6	196862	196867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017584	GC	3	6	196910	196915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_017584	TGG	2	6	196918	196923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017584	TGA	2	6	196947	196952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017584	GGT	2	6	197026	197031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017584	TCA	2	6	197141	197146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_017584	CGT	2	6	197221	197226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017584	GAG	2	6	197270	197275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017584	CCTC	2	8	197397	197404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5080	NC_017584	ACC	2	6	197437	197442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_017584	TTGA	2	8	197511	197518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017584	GAA	2	6	197576	197581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017584	GAAC	2	8	197593	197600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_017584	ACACA	2	10	197605	197614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5085	NC_017584	TGG	2	6	197649	197654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017584	ATCCC	2	10	197678	197687	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5087	NC_017584	CGC	2	6	197751	197756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_017584	CAA	2	6	197787	197792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017584	CAG	2	6	197800	197805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017584	AGC	2	6	197868	197873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017584	CGT	2	6	198015	198020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017584	CGG	2	6	198054	198059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017584	GCC	2	6	198165	198170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_017584	GCC	2	6	198259	198264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348186
5095	NC_017584	GGC	2	6	198282	198287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348186
5096	NC_017584	CGG	2	6	198311	198316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348186
5097	NC_017584	CAC	2	6	198321	198326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348186
5098	NC_017584	GC	3	6	198422	198427	0 %	0 %	50 %	50 %	386348186
5099	NC_017584	TAA	2	6	198548	198553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017584	AGT	2	6	198605	198610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017584	AGA	2	6	198620	198625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017584	CAT	2	6	198632	198637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017584	GAG	2	6	198730	198735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017584	CG	3	6	198796	198801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017584	CGGCCT	2	12	199264	199275	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017584	TGA	2	6	199342	199347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017584	CCG	2	6	199394	199399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_017584	CG	3	6	199458	199463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_017584	CGG	2	6	199637	199642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017584	GCT	2	6	199708	199713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017584	TCA	2	6	199867	199872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017584	A	6	6	199910	199915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017584	CGG	2	6	199959	199964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017584	GCT	2	6	199965	199970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017584	TCG	2	6	199986	199991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017584	GCG	2	6	199999	200004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017584	GGC	2	6	200019	200024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348187
5118	NC_017584	CGG	2	6	200079	200084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348187
5119	NC_017584	ATC	2	6	200160	200165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348187
5120	NC_017584	CGG	2	6	200199	200204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348187
5121	NC_017584	GCCA	2	8	200241	200248	25 %	0 %	25 %	50 %	386348187
5122	NC_017584	CGGGG	2	10	200271	200280	0 %	0 %	80 %	20 %	386348187
5123	NC_017584	CAT	2	6	200300	200305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348187
5124	NC_017584	CTC	2	6	200316	200321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386348188
5125	NC_017584	GC	3	6	200380	200385	0 %	0 %	50 %	50 %	386348188
5126	NC_017584	CGGG	2	8	200471	200478	0 %	0 %	75 %	25 %	386348188
5127	NC_017584	GTC	2	6	200481	200486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348188
5128	NC_017584	CGG	2	6	200495	200500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348188
5129	NC_017584	ACG	2	6	200533	200538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348188
5130	NC_017584	CGT	2	6	200564	200569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348188
5131	NC_017584	CGC	2	6	200625	200630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348188
5132	NC_017584	GCC	2	6	200671	200676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348188
5133	NC_017584	GACA	2	8	200677	200684	50 %	0 %	25 %	25 %	386348188
5134	NC_017584	T	6	6	200754	200759	0 %	100 %	0 %	0 %	386348188
5135	NC_017584	ACCG	2	8	200818	200825	25 %	0 %	25 %	50 %	386348188
5136	NC_017584	GCGG	3	12	200826	200837	0 %	0 %	75 %	25 %	386348188
5137	NC_017584	GTC	3	9	200838	200846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348188
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5139	NC_017584	TCA	2	6	200893	200898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348188
5140	NC_017584	GC	3	6	200907	200912	0 %	0 %	50 %	50 %	386348188
5141	NC_017584	AAT	2	6	200920	200925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386348188
5142	NC_017584	GCC	2	6	200940	200945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348188
5143	NC_017584	CGG	2	6	200954	200959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348188
5144	NC_017584	CG	3	6	201010	201015	0 %	0 %	50 %	50 %	386348188
5145	NC_017584	GGC	2	6	201027	201032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348188
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5147	NC_017584	GCCC	2	8	201074	201081	0 %	0 %	25 %	75 %	386348188
5148	NC_017584	GATC	2	8	201110	201117	25 %	25 %	25 %	25 %	386348188
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5153	NC_017584	GCC	2	6	201380	201385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348189
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5156	NC_017584	CTG	2	6	201455	201460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348189
5157	NC_017584	AGC	2	6	201468	201473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348189
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5161	NC_017584	GCC	2	6	201667	201672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348189
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5163	NC_017584	CG	3	6	201751	201756	0 %	0 %	50 %	50 %	386348189
5164	NC_017584	ATC	2	6	201767	201772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348189
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5167	NC_017584	GGTT	2	8	201972	201979	0 %	50 %	50 %	0 %	386348190
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5169	NC_017584	CGG	2	6	202035	202040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348190
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5171	NC_017584	CCCG	2	8	202087	202094	0 %	0 %	25 %	75 %	386348190
5172	NC_017584	GC	3	6	202114	202119	0 %	0 %	50 %	50 %	386348190
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5194	NC_017584	CAG	2	6	203066	203071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348191
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5203	NC_017584	GCTT	2	8	203317	203324	0 %	50 %	25 %	25 %	386348191
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5207	NC_017584	GCCTT	2	10	203439	203448	0 %	40 %	20 %	40 %	386348191
5208	NC_017584	GGCTTC	2	12	203501	203512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348191
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5223	NC_017584	GGC	2	6	204106	204111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348192
5224	NC_017584	G	7	7	204232	204238	0 %	0 %	100 %	0 %	386348192
5225	NC_017584	GCC	2	6	204272	204277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348192
5226	NC_017584	CGT	2	6	204297	204302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348192
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5232	NC_017584	CGG	2	6	204622	204627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348193
5233	NC_017584	TGG	2	6	204668	204673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348193
5234	NC_017584	CGG	2	6	204680	204685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348193
5235	NC_017584	GCTG	2	8	204779	204786	0 %	25 %	50 %	25 %	386348193
5236	NC_017584	ATC	2	6	204805	204810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348193
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5238	NC_017584	CAT	2	6	205004	205009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348193
5239	NC_017584	CCAA	2	8	205022	205029	50 %	0 %	0 %	50 %	386348193
5240	NC_017584	CGC	2	6	205041	205046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348193
5241	NC_017584	GCC	2	6	205047	205052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348193
5242	NC_017584	GATG	2	8	205058	205065	25 %	25 %	50 %	0 %	386348193
5243	NC_017584	GTC	2	6	205086	205091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348193
5244	NC_017584	ATG	2	6	205165	205170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348193
5245	NC_017584	CCG	2	6	205175	205180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348193
5246	NC_017584	CCG	2	6	205183	205188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348193
5247	NC_017584	GGT	2	6	205199	205204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348193
5248	NC_017584	CAAGCG	2	12	205227	205238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348193
5249	NC_017584	A	6	6	205251	205256	100 %	0 %	0 %	0 %	386348193
5250	NC_017584	TCG	2	6	205268	205273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348193
5251	NC_017584	CGA	2	6	205286	205291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348193
5252	NC_017584	CGC	2	6	205314	205319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348193
5253	NC_017584	GCCA	2	8	205321	205328	25 %	0 %	25 %	50 %	386348193
5254	NC_017584	GATCG	2	10	205374	205383	20 %	20 %	40 %	20 %	386348193
5255	NC_017584	GCCA	2	8	205452	205459	25 %	0 %	25 %	50 %	386348193
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5360	NC_017584	GCCG	2	8	208861	208868	0 %	0 %	50 %	50 %	386348194
5361	NC_017584	AGA	2	6	208876	208881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348194
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5364	NC_017584	GC	3	6	208956	208961	0 %	0 %	50 %	50 %	386348194
5365	NC_017584	TCA	2	6	208997	209002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386348194
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5367	NC_017584	GCA	2	6	209184	209189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348195
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5370	NC_017584	GCCGC	2	10	209321	209330	0 %	0 %	40 %	60 %	386348195
5371	NC_017584	AGGC	2	8	209339	209346	25 %	0 %	50 %	25 %	386348195
5372	NC_017584	GCC	3	9	209359	209367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348195
5373	NC_017584	GAC	2	6	209398	209403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348195
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5375	NC_017584	AAG	2	6	209513	209518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386348195
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