MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodospirillum rubrum F11 chromosome

Total Repeats: 111217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017584	CCG	2	6	173767	173772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348170
4502	NC_017584	CGG	2	6	173839	173844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4503	NC_017584	GGT	2	6	173864	173869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386348170
4504	NC_017584	CGA	2	6	173872	173877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348170
4505	NC_017584	GAT	2	6	173878	173883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386348170
4506	NC_017584	CGG	2	6	173893	173898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4507	NC_017584	ACG	2	6	173955	173960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348170
4508	NC_017584	GCG	2	6	173985	173990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4509	NC_017584	AAGG	2	8	174080	174087	50 %	0 %	50 %	0 %	386348170
4510	NC_017584	CGACAG	2	12	174119	174130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348170
4511	NC_017584	GCG	2	6	174162	174167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4512	NC_017584	GGC	2	6	174188	174193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4513	NC_017584	TCG	2	6	174261	174266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348170
4514	NC_017584	GCG	2	6	174367	174372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348170
4515	NC_017584	TCG	2	6	174432	174437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348170
4516	NC_017584	CGAG	2	8	174469	174476	25 %	0 %	50 %	25 %	386348170
4517	NC_017584	GCC	2	6	174498	174503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348170
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4519	NC_017584	GCC	2	6	174581	174586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348170
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4522	NC_017584	GCGG	2	8	174721	174728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4523	NC_017584	TCGA	2	8	174735	174742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_017584	TGGG	2	8	174760	174767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017584	CGG	2	6	174826	174831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_017584	CGG	2	6	174841	174846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_017584	AACCC	2	10	174902	174911	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4528	NC_017584	CCGC	2	8	174956	174963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4529	NC_017584	TTC	2	6	175052	175057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386348171
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4538	NC_017584	GCCCTG	2	12	175504	175515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	386348171
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4542	NC_017584	CTT	2	6	175714	175719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_017584	GA	4	8	175720	175727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017584	CCG	2	6	175779	175784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_017584	CCG	2	6	175845	175850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_017584	CTC	2	6	175863	175868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_017584	GGC	2	6	175921	175926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_017584	CCG	2	6	175928	175933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_017584	CGC	2	6	176040	176045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348172
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4555	NC_017584	CGT	2	6	176282	176287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348172
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4563	NC_017584	CGGC	2	8	176463	176470	0 %	0 %	50 %	50 %	386348172
4564	NC_017584	TCG	2	6	176483	176488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348173
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4589	NC_017584	TAA	2	6	177299	177304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4591	NC_017584	GTT	2	6	177412	177417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017584	A	6	6	177437	177442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017584	TA	3	6	177445	177450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4595	NC_017584	T	8	8	177535	177542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017584	GAA	2	6	177589	177594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017584	CCG	2	6	177692	177697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_017584	CAC	2	6	177831	177836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4599	NC_017584	GCA	2	6	177899	177904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348174
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4601	NC_017584	TCG	2	6	178105	178110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348174
4602	NC_017584	GCG	2	6	178179	178184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348174
4603	NC_017584	CGC	2	6	178201	178206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386348174
4604	NC_017584	TCG	2	6	178212	178217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348174
4605	NC_017584	GC	3	6	178247	178252	0 %	0 %	50 %	50 %	386348174
4606	NC_017584	CCA	2	6	178312	178317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386348174
4607	NC_017584	CGGTC	2	10	178349	178358	0 %	20 %	40 %	40 %	386348174
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4611	NC_017584	GCC	2	6	178518	178523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_017584	TCTTG	2	10	178554	178563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4613	NC_017584	GGC	2	6	178573	178578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_017584	CGT	2	6	178602	178607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348175
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4617	NC_017584	CGG	2	6	178722	178727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348175
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4621	NC_017584	CGG	4	12	178860	178871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386348175
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4627	NC_017584	CGA	2	6	179097	179102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386348175
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4745	NC_017584	G	6	6	183272	183277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_017584	GCC	2	6	183285	183290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4854	NC_017584	CG	3	6	187225	187230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4855	NC_017584	TCCTC	2	10	187235	187244	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4856	NC_017584	GATG	2	8	187267	187274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4857	NC_017584	A	6	6	187283	187288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4858	NC_017584	AGC	2	6	187311	187316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4861	NC_017584	CGGG	2	8	187425	187432	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4862	NC_017584	GT	3	6	187437	187442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4863	NC_017584	AGA	2	6	187453	187458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_017584	GGA	2	6	187465	187470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4869	NC_017584	G	6	6	187618	187623	0 %	0 %	100 %	0 %	386348182
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4872	NC_017584	GGA	2	6	187798	187803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4873	NC_017584	CTG	2	6	187853	187858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386348183
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4982	NC_017584	GGT	2	6	191878	191883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4984	NC_017584	A	6	6	191978	191983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4985	NC_017584	CGA	2	6	192036	192041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4986	NC_017584	GCG	2	6	192047	192052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4993	NC_017584	GCT	2	6	192299	192304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4994	NC_017584	CGAA	2	8	192328	192335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4995	NC_017584	GGGC	2	8	192342	192349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4996	NC_017584	TTCC	2	8	192394	192401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4997	NC_017584	TATAAG	2	12	192434	192445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_017584	GGC	2	6	192558	192563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_017584	AAT	2	6	192650	192655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5000	NC_017584	CCA	2	6	192756	192761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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