MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_017569	ATAA	2	8	2150200	2150207	75 %	25 %	0 %	0 %	386322356
48003	NC_017569	AG	3	6	2150235	2150240	50 %	0 %	50 %	0 %	386322356
48004	NC_017569	A	8	8	2150244	2150251	100 %	0 %	0 %	0 %	386322356
48005	NC_017569	TA	3	6	2150332	2150337	50 %	50 %	0 %	0 %	386322356
48006	NC_017569	A	6	6	2150343	2150348	100 %	0 %	0 %	0 %	386322356
48007	NC_017569	ATGA	2	8	2150380	2150387	50 %	25 %	25 %	0 %	386322356
48008	NC_017569	A	7	7	2150409	2150415	100 %	0 %	0 %	0 %	386322356
48009	NC_017569	A	6	6	2150440	2150445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48010	NC_017569	A	7	7	2150513	2150519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48011	NC_017569	TTA	2	6	2150520	2150525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48012	NC_017569	GGCG	2	8	2150658	2150665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48013	NC_017569	TTG	2	6	2150694	2150699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48014	NC_017569	AGA	2	6	2150730	2150735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48015	NC_017569	TTTA	2	8	2150746	2150753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48016	NC_017569	A	6	6	2150772	2150777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48017	NC_017569	TGA	2	6	2150873	2150878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322357
48018	NC_017569	ATG	3	9	2150917	2150925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322357
48019	NC_017569	AACCAA	2	12	2150976	2150987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322357
48020	NC_017569	CCG	2	6	2150995	2151000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386322357
48021	NC_017569	ACA	2	6	2151058	2151063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322357
48022	NC_017569	A	7	7	2151096	2151102	100 %	0 %	0 %	0 %	386322357
48023	NC_017569	GTT	2	6	2151218	2151223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322357
48024	NC_017569	GCG	2	6	2151246	2151251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386322357
48025	NC_017569	CAA	2	6	2151276	2151281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386322357
48026	NC_017569	GAAAAA	2	12	2151306	2151317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386322357
48027	NC_017569	GAC	2	6	2151414	2151419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386322357
48028	NC_017569	CTG	2	6	2151429	2151434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322357
48029	NC_017569	GAA	2	6	2151469	2151474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48030	NC_017569	A	8	8	2151479	2151486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48031	NC_017569	T	6	6	2151509	2151514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48032	NC_017569	T	6	6	2151518	2151523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48033	NC_017569	TCT	2	6	2151543	2151548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322358
48034	NC_017569	ATAC	2	8	2151566	2151573	50 %	25 %	0 %	25 %	386322358
48035	NC_017569	ACC	2	6	2151768	2151773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322358
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48038	NC_017569	ATC	2	6	2151913	2151918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322358
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48040	NC_017569	ATA	2	6	2152075	2152080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322358
48041	NC_017569	TTC	2	6	2152083	2152088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322358
48042	NC_017569	CACTA	2	10	2152092	2152101	40 %	20 %	0 %	40 %	386322358
48043	NC_017569	AGA	3	9	2152102	2152110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322358
48044	NC_017569	CCA	3	9	2152115	2152123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386322358
48045	NC_017569	ATTC	2	8	2152267	2152274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48046	NC_017569	ATC	2	6	2152314	2152319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386322359
48047	NC_017569	ATT	2	6	2152521	2152526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322359
48048	NC_017569	TTG	2	6	2152579	2152584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322359
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48051	NC_017569	CAAA	2	8	2152631	2152638	75 %	0 %	0 %	25 %	386322359
48052	NC_017569	TTC	2	6	2152734	2152739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322359
48053	NC_017569	AAT	2	6	2152788	2152793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322359
48054	NC_017569	ATG	2	6	2152913	2152918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386322359
48055	NC_017569	AAAAG	2	10	2152930	2152939	80 %	0 %	20 %	0 %	386322359
48056	NC_017569	TAA	2	6	2152970	2152975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322359
48057	NC_017569	T	6	6	2153058	2153063	0 %	100 %	0 %	0 %	386322359
48058	NC_017569	ATT	2	6	2153097	2153102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386322359
48059	NC_017569	TTC	2	6	2153109	2153114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386322359
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48062	NC_017569	T	6	6	2153243	2153248	0 %	100 %	0 %	0 %	386322359
48063	NC_017569	TTA	2	6	2153360	2153365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48064	NC_017569	TAA	2	6	2153428	2153433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386322360
48065	NC_017569	AT	3	6	2153438	2153443	50 %	50 %	0 %	0 %	386322360
48066	NC_017569	AGATGC	2	12	2153521	2153532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386322360
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48068	NC_017569	GAA	2	6	2153606	2153611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386322360
48069	NC_017569	TGC	2	6	2153620	2153625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386322360
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48073	NC_017569	TCGC	2	8	2153731	2153738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48074	NC_017569	GGCG	2	8	2153754	2153761	0 %	0 %	75 %	25 %	386322361
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48088	NC_017569	AAAG	2	8	2154414	2154421	75 %	0 %	25 %	0 %	386322361
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48103	NC_017569	TGG	2	6	2154777	2154782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386322361
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48107	NC_017569	TTG	2	6	2154947	2154952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386322362
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48112	NC_017569	TGCC	2	8	2155056	2155063	0 %	25 %	25 %	50 %	386322362
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