MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017569	GGT	2	6	151915	151920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320523
3502	NC_017569	TA	3	6	151937	151942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_017569	A	7	7	151946	151952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017569	TAAA	2	8	151960	151967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017569	TGG	2	6	152095	152100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320524
3506	NC_017569	CTC	2	6	152119	152124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320524
3507	NC_017569	ATT	2	6	152217	152222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320524
3508	NC_017569	TAT	2	6	152264	152269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320524
3509	NC_017569	AG	3	6	152294	152299	50 %	0 %	50 %	0 %	386320524
3510	NC_017569	AGCGGA	2	12	152327	152338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	386320524
3511	NC_017569	CAAGA	2	10	152365	152374	60 %	0 %	20 %	20 %	386320524
3512	NC_017569	AAG	2	6	152391	152396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320524
3513	NC_017569	ATT	2	6	152418	152423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320524
3514	NC_017569	CAG	2	6	152445	152450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320524
3515	NC_017569	GAC	2	6	152478	152483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320524
3516	NC_017569	AAG	2	6	152497	152502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320524
3517	NC_017569	T	6	6	152554	152559	0 %	100 %	0 %	0 %	386320525
3518	NC_017569	TAAAA	2	10	152587	152596	80 %	20 %	0 %	0 %	386320525
3519	NC_017569	CAT	2	6	152611	152616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320525
3520	NC_017569	TCT	2	6	152617	152622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320525
3521	NC_017569	AT	3	6	152632	152637	50 %	50 %	0 %	0 %	386320525
3522	NC_017569	T	7	7	152697	152703	0 %	100 %	0 %	0 %	386320525
3523	NC_017569	CAA	2	6	152704	152709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320525
3524	NC_017569	TTC	2	6	152717	152722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320525
3525	NC_017569	CAT	2	6	152764	152769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320525
3526	NC_017569	TTG	2	6	152776	152781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320525
3527	NC_017569	CAA	2	6	152794	152799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320525
3528	NC_017569	AAAT	2	8	152842	152849	75 %	25 %	0 %	0 %	386320525
3529	NC_017569	TGATT	2	10	152851	152860	20 %	60 %	20 %	0 %	386320525
3530	NC_017569	TCA	2	6	152904	152909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320525
3531	NC_017569	CCA	2	6	152939	152944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320525
3532	NC_017569	AAAT	2	8	153001	153008	75 %	25 %	0 %	0 %	386320525
3533	NC_017569	TGT	2	6	153060	153065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320525
3534	NC_017569	CAA	2	6	153091	153096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320525
3535	NC_017569	TCA	2	6	153154	153159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320525
3536	NC_017569	AAT	2	6	153176	153181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320525
3537	NC_017569	T	6	6	153209	153214	0 %	100 %	0 %	0 %	386320525
3538	NC_017569	GTA	2	6	153329	153334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017569	TA	3	6	153343	153348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017569	T	6	6	153387	153392	0 %	100 %	0 %	0 %	386320526
3541	NC_017569	TGA	2	6	153399	153404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320526
3542	NC_017569	ATT	2	6	153428	153433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320526
3543	NC_017569	TGA	2	6	153469	153474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320526
3544	NC_017569	ATT	2	6	153491	153496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320526
3545	NC_017569	CAATAT	2	12	153508	153519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386320526
3546	NC_017569	CTT	2	6	153529	153534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320526
3547	NC_017569	CTA	2	6	153666	153671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320526
3548	NC_017569	TTTA	2	8	153713	153720	25 %	75 %	0 %	0 %	386320526
3549	NC_017569	TAT	2	6	153748	153753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320526
3550	NC_017569	TAT	2	6	153820	153825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320526
3551	NC_017569	GAT	2	6	153830	153835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320526
3552	NC_017569	ATAAAA	2	12	153854	153865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	386320526
3553	NC_017569	TCTTTC	2	12	153876	153887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320526
3554	NC_017569	AAAG	2	8	153908	153915	75 %	0 %	25 %	0 %	386320526
3555	NC_017569	CTA	2	6	153949	153954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320526
3556	NC_017569	AAAT	2	8	154072	154079	75 %	25 %	0 %	0 %	386320526
3557	NC_017569	CTAT	2	8	154104	154111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_017569	T	7	7	154111	154117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017569	T	6	6	154122	154127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017569	TA	3	6	154171	154176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017569	ATA	2	6	154189	154194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017569	ATTTT	2	10	154212	154221	20 %	80 %	0 %	0 %	386320527
3563	NC_017569	A	6	6	154222	154227	100 %	0 %	0 %	0 %	386320527
3564	NC_017569	TCA	2	6	154255	154260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320527
3565	NC_017569	AAT	2	6	154287	154292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320527
3566	NC_017569	CCA	2	6	154294	154299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320527
3567	NC_017569	ATTAA	2	10	154399	154408	60 %	40 %	0 %	0 %	386320527
3568	NC_017569	ATT	3	9	154476	154484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320527
3569	NC_017569	T	6	6	154490	154495	0 %	100 %	0 %	0 %	386320527
3570	NC_017569	T	7	7	154513	154519	0 %	100 %	0 %	0 %	386320527
3571	NC_017569	TC	3	6	154604	154609	0 %	50 %	0 %	50 %	386320527
3572	NC_017569	A	6	6	154688	154693	100 %	0 %	0 %	0 %	386320527
3573	NC_017569	CCA	2	6	154723	154728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320527
3574	NC_017569	T	7	7	154739	154745	0 %	100 %	0 %	0 %	386320527
3575	NC_017569	GTA	2	6	154783	154788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320527
3576	NC_017569	T	6	6	154838	154843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_017569	T	7	7	154886	154892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017569	AACA	2	8	155009	155016	75 %	0 %	0 %	25 %	386320528
3579	NC_017569	CCT	2	6	155023	155028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320528
3580	NC_017569	TTGT	2	8	155069	155076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_017569	AAAT	2	8	155121	155128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017569	TATTTT	2	12	155141	155152	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_017569	T	7	7	155149	155155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_017569	T	6	6	155170	155175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017569	TCT	2	6	155195	155200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_017569	ATTT	2	8	155256	155263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_017569	T	6	6	155297	155302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017569	TAT	2	6	155332	155337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017569	GTTT	2	8	155354	155361	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017569	TAA	2	6	155375	155380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_017569	CCA	2	6	155403	155408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_017569	T	6	6	155412	155417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_017569	AAT	2	6	155426	155431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_017569	T	6	6	155436	155441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017569	TTTA	2	8	155492	155499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017569	TAA	2	6	155519	155524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017569	A	6	6	155523	155528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017569	T	6	6	155554	155559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_017569	ACTAT	2	10	155563	155572	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_017569	TTA	2	6	155588	155593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_017569	AAGAC	2	10	155597	155606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3602	NC_017569	ATA	2	6	155666	155671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_017569	GTA	2	6	155680	155685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017569	T	6	6	155729	155734	0 %	100 %	0 %	0 %	386320529
3605	NC_017569	TTTGTC	2	12	155737	155748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	386320529
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3607	NC_017569	TG	3	6	155786	155791	0 %	50 %	50 %	0 %	386320529
3608	NC_017569	TTC	2	6	155875	155880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320529
3609	NC_017569	ATG	2	6	155931	155936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320529
3610	NC_017569	TCCAA	2	10	155973	155982	40 %	20 %	0 %	40 %	386320529
3611	NC_017569	AAAT	2	8	155988	155995	75 %	25 %	0 %	0 %	386320529
3612	NC_017569	TTG	2	6	156002	156007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320529
3613	NC_017569	TCTT	2	8	156086	156093	0 %	75 %	0 %	25 %	386320529
3614	NC_017569	TTCA	2	8	156151	156158	25 %	50 %	0 %	25 %	386320529
3615	NC_017569	A	6	6	156158	156163	100 %	0 %	0 %	0 %	386320529
3616	NC_017569	TCT	2	6	156173	156178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_017569	TTC	2	6	156190	156195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_017569	CTTT	2	8	156198	156205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_017569	T	7	7	156203	156209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_017569	CAA	3	9	156216	156224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_017569	CAA	2	6	156246	156251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_017569	T	6	6	156253	156258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_017569	TTAT	2	8	156310	156317	25 %	75 %	0 %	0 %	386320530
3624	NC_017569	TCC	2	6	156352	156357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320530
3625	NC_017569	AAATA	2	10	156396	156405	80 %	20 %	0 %	0 %	386320530
3626	NC_017569	GGAA	2	8	156412	156419	50 %	0 %	50 %	0 %	386320530
3627	NC_017569	ATC	2	6	156427	156432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320530
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