MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017569	CTC	2	6	106644	106649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320486
2502	NC_017569	TAA	2	6	106719	106724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320486
2503	NC_017569	T	6	6	106779	106784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_017569	A	6	6	106789	106794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_017569	TATT	2	8	106831	106838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_017569	CAG	2	6	106851	106856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320487
2507	NC_017569	TTC	2	6	106857	106862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320487
2508	NC_017569	TCT	2	6	106885	106890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320487
2509	NC_017569	TTGG	2	8	106893	106900	0 %	50 %	50 %	0 %	386320487
2510	NC_017569	TCT	2	6	106966	106971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_017569	GCA	2	6	107097	107102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_017569	GGATT	2	10	107205	107214	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_017569	TCA	2	6	107312	107317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_017569	T	6	6	107335	107340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_017569	A	6	6	107504	107509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_017569	AGAA	3	12	107529	107540	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_017569	TCC	2	6	107561	107566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320488
2518	NC_017569	CTT	2	6	107586	107591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320488
2519	NC_017569	A	7	7	107605	107611	100 %	0 %	0 %	0 %	386320488
2520	NC_017569	T	6	6	107633	107638	0 %	100 %	0 %	0 %	386320488
2521	NC_017569	T	7	7	107697	107703	0 %	100 %	0 %	0 %	386320488
2522	NC_017569	TCT	2	6	107726	107731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320488
2523	NC_017569	A	6	6	107732	107737	100 %	0 %	0 %	0 %	386320488
2524	NC_017569	CTT	2	6	107779	107784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320488
2525	NC_017569	T	7	7	107827	107833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_017569	T	7	7	107835	107841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_017569	A	6	6	107869	107874	100 %	0 %	0 %	0 %	386320489
2528	NC_017569	AT	3	6	107896	107901	50 %	50 %	0 %	0 %	386320489
2529	NC_017569	ATT	2	6	108014	108019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320489
2530	NC_017569	TGA	2	6	108060	108065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320489
2531	NC_017569	TC	3	6	108074	108079	0 %	50 %	0 %	50 %	386320489
2532	NC_017569	A	7	7	108089	108095	100 %	0 %	0 %	0 %	386320489
2533	NC_017569	TTA	2	6	108144	108149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320489
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2535	NC_017569	CTTC	2	8	108211	108218	0 %	50 %	0 %	50 %	386320489
2536	NC_017569	T	6	6	108268	108273	0 %	100 %	0 %	0 %	386320489
2537	NC_017569	GTT	2	6	108348	108353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320489
2538	NC_017569	CCA	2	6	108397	108402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320489
2539	NC_017569	TAT	2	6	108559	108564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320489
2540	NC_017569	ATA	2	6	108696	108701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320489
2541	NC_017569	TCA	2	6	108705	108710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320489
2542	NC_017569	TTA	3	9	108711	108719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320489
2543	NC_017569	AAT	2	6	108763	108768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320489
2544	NC_017569	TGA	2	6	108810	108815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320489
2545	NC_017569	TCT	2	6	108819	108824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320489
2546	NC_017569	ATG	2	6	108830	108835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320489
2547	NC_017569	A	7	7	108893	108899	100 %	0 %	0 %	0 %	386320489
2548	NC_017569	AAT	2	6	108922	108927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320489
2549	NC_017569	A	9	9	109021	109029	100 %	0 %	0 %	0 %	386320489
2550	NC_017569	TGC	2	6	109037	109042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320489
2551	NC_017569	TGT	2	6	109059	109064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320489
2552	NC_017569	T	6	6	109102	109107	0 %	100 %	0 %	0 %	386320489
2553	NC_017569	TAC	2	6	109142	109147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320489
2554	NC_017569	TAA	2	6	109148	109153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320489
2555	NC_017569	TTA	2	6	109204	109209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017569	ATGAA	2	10	109224	109233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_017569	A	7	7	109232	109238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_017569	GTT	2	6	109244	109249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017569	AAC	2	6	109300	109305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_017569	AT	3	6	109315	109320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_017569	T	6	6	109346	109351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_017569	AGA	2	6	109378	109383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_017569	CTG	2	6	109427	109432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_017569	CT	3	6	109482	109487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2565	NC_017569	AAG	2	6	109503	109508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_017569	TTC	2	6	109680	109685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_017569	ATTT	2	8	109896	109903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_017569	TC	3	6	110010	110015	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2569	NC_017569	CCG	2	6	110097	110102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2570	NC_017569	AT	3	6	110116	110121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_017569	ATC	2	6	110151	110156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_017569	TAT	2	6	110167	110172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_017569	T	6	6	110190	110195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_017569	ATT	2	6	110196	110201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_017569	CTAC	2	8	110227	110234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2576	NC_017569	A	8	8	110244	110251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_017569	A	7	7	110321	110327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_017569	TAA	2	6	110331	110336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_017569	ATC	2	6	110342	110347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_017569	A	7	7	110367	110373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_017569	TTA	2	6	110374	110379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_017569	AGT	2	6	110390	110395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_017569	TCT	2	6	110396	110401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_017569	TAAA	2	8	110452	110459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_017569	TCT	2	6	110504	110509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_017569	ATA	2	6	110684	110689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017569	CGG	2	6	110705	110710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_017569	CTT	2	6	110728	110733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_017569	T	7	7	110758	110764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017569	ATT	2	6	110810	110815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017569	CTT	2	6	110836	110841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_017569	TAT	3	9	110842	110850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_017569	ATC	2	6	110888	110893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_017569	TTC	2	6	111020	111025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_017569	TCT	2	6	111070	111075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_017569	ATA	2	6	111101	111106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017569	ATCT	2	8	111134	111141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_017569	AAT	2	6	111146	111151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_017569	TCT	2	6	111207	111212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_017569	CCG	2	6	111256	111261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2601	NC_017569	GTT	2	6	111359	111364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_017569	CT	4	8	111482	111489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_017569	CTG	2	6	111514	111519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_017569	CGA	2	6	111626	111631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_017569	TTG	2	6	111655	111660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_017569	AAG	2	6	111706	111711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_017569	ATA	2	6	111716	111721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_017569	TTTC	2	8	111725	111732	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_017569	TAA	2	6	111742	111747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_017569	GAA	2	6	111765	111770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_017569	T	6	6	111833	111838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_017569	TCTT	2	8	111840	111847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_017569	T	6	6	111857	111862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_017569	AAG	2	6	112015	112020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_017569	ATA	2	6	112056	112061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_017569	ACC	2	6	112133	112138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_017569	TAC	2	6	112196	112201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_017569	AT	3	6	112236	112241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_017569	TC	3	6	112247	112252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_017569	T	7	7	112285	112291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_017569	TTC	2	6	112406	112411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_017569	TCT	2	6	112443	112448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_017569	CTG	2	6	112522	112527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_017569	TAT	2	6	112579	112584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_017569	CTG	2	6	112694	112699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_017569	ATTTAC	2	12	112721	112732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2627	NC_017569	ATAA	2	8	112759	112766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_017569	CAT	2	6	112774	112779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_017569	TA	3	6	112790	112795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_017569	ATAA	2	8	112813	112820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_017569	TCT	2	6	112962	112967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2633	NC_017569	ATG	2	6	113045	113050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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