MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017569	GTTT	2	8	42299	42306	0 %	75 %	25 %	0 %	386320428
1002	NC_017569	ATC	2	6	42319	42324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320428
1003	NC_017569	AAT	2	6	42344	42349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320428
1004	NC_017569	A	6	6	42360	42365	100 %	0 %	0 %	0 %	386320428
1005	NC_017569	ATG	2	6	42392	42397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320428
1006	NC_017569	TACA	2	8	42455	42462	50 %	25 %	0 %	25 %	386320429
1007	NC_017569	TACT	2	8	42526	42533	25 %	50 %	0 %	25 %	386320429
1008	NC_017569	CAT	2	6	42547	42552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320429
1009	NC_017569	TC	3	6	42584	42589	0 %	50 %	0 %	50 %	386320429
1010	NC_017569	ACA	2	6	42606	42611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320429
1011	NC_017569	ACA	2	6	42660	42665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320429
1012	NC_017569	TCA	2	6	42669	42674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320429
1013	NC_017569	TCT	2	6	42688	42693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320429
1014	NC_017569	A	6	6	42695	42700	100 %	0 %	0 %	0 %	386320429
1015	NC_017569	CATA	2	8	42742	42749	50 %	25 %	0 %	25 %	386320429
1016	NC_017569	T	7	7	42799	42805	0 %	100 %	0 %	0 %	386320429
1017	NC_017569	ACC	2	6	42842	42847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320429
1018	NC_017569	TCA	2	6	42906	42911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320429
1019	NC_017569	TAT	2	6	42916	42921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320429
1020	NC_017569	A	7	7	42960	42966	100 %	0 %	0 %	0 %	386320429
1021	NC_017569	CAG	2	6	42988	42993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320429
1022	NC_017569	AAT	2	6	43000	43005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320429
1023	NC_017569	ACT	2	6	43023	43028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320429
1024	NC_017569	ATAAGC	2	12	43091	43102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386320429
1025	NC_017569	CGC	2	6	43118	43123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320429
1026	NC_017569	GAA	2	6	43126	43131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320429
1027	NC_017569	AGT	2	6	43290	43295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017569	TA	3	6	43327	43332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017569	A	6	6	43332	43337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017569	ATC	2	6	43416	43421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017569	GT	3	6	43451	43456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017569	TACC	2	8	43535	43542	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_017569	TCC	2	6	43557	43562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_017569	GTG	2	6	43711	43716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017569	TTA	2	6	43780	43785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017569	CAT	2	6	43802	43807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017569	CCA	2	6	43813	43818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_017569	ATC	2	6	43854	43859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017569	TGAT	2	8	43950	43957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017569	TAT	2	6	44003	44008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017569	CGAA	2	8	44031	44038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_017569	AGTA	2	8	44063	44070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017569	AATC	2	8	44096	44103	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_017569	CCTT	2	8	44128	44135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_017569	CTA	2	6	44150	44155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017569	AGT	2	6	44186	44191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017569	CTC	2	6	44217	44222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017569	A	7	7	44230	44236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017569	AGA	2	6	44255	44260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017569	AT	3	6	44262	44267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017569	CAG	2	6	44310	44315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017569	TGC	2	6	44341	44346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017569	CCT	2	6	44402	44407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017569	TCCTAA	2	12	44497	44508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017569	AGT	2	6	44510	44515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017569	T	7	7	44515	44521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017569	T	6	6	44554	44559	0 %	100 %	0 %	0 %	386320430
1058	NC_017569	AGA	2	6	44570	44575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320430
1059	NC_017569	TGAT	2	8	44592	44599	25 %	50 %	25 %	0 %	386320430
1060	NC_017569	ATC	2	6	44654	44659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1061	NC_017569	TTA	2	6	44826	44831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1062	NC_017569	TAC	2	6	44864	44869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1063	NC_017569	TCC	2	6	44877	44882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320430
1064	NC_017569	ATT	2	6	44924	44929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1065	NC_017569	CA	3	6	45032	45037	50 %	0 %	0 %	50 %	386320430
1066	NC_017569	TCCC	2	8	45044	45051	0 %	25 %	0 %	75 %	386320430
1067	NC_017569	ATC	2	6	45155	45160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1068	NC_017569	TAT	2	6	45220	45225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1069	NC_017569	AGG	2	6	45245	45250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320430
1070	NC_017569	ACC	2	6	45281	45286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320430
1071	NC_017569	CATC	2	8	45313	45320	25 %	25 %	0 %	50 %	386320430
1072	NC_017569	CTT	3	9	45448	45456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320430
1073	NC_017569	CCA	2	6	45480	45485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320430
1074	NC_017569	ATT	2	6	45488	45493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1075	NC_017569	T	7	7	45499	45505	0 %	100 %	0 %	0 %	386320430
1076	NC_017569	CTA	2	6	45532	45537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1077	NC_017569	CT	3	6	45621	45626	0 %	50 %	0 %	50 %	386320430
1078	NC_017569	GAT	2	6	45715	45720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320430
1079	NC_017569	ATT	2	6	45737	45742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1080	NC_017569	T	6	6	45794	45799	0 %	100 %	0 %	0 %	386320430
1081	NC_017569	GAAT	2	8	45815	45822	50 %	25 %	25 %	0 %	386320430
1082	NC_017569	TCT	2	6	45830	45835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320430
1083	NC_017569	CTA	2	6	45858	45863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1084	NC_017569	ATC	2	6	45870	45875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1085	NC_017569	TAAA	2	8	45901	45908	75 %	25 %	0 %	0 %	386320430
1086	NC_017569	TC	3	6	45910	45915	0 %	50 %	0 %	50 %	386320430
1087	NC_017569	GTC	2	6	45935	45940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320430
1088	NC_017569	TAG	2	6	45964	45969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320430
1089	NC_017569	GTT	2	6	46004	46009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320430
1090	NC_017569	CT	4	8	46039	46046	0 %	50 %	0 %	50 %	386320430
1091	NC_017569	CCCA	2	8	46051	46058	25 %	0 %	0 %	75 %	386320430
1092	NC_017569	CCA	2	6	46065	46070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320430
1093	NC_017569	AGT	2	6	46154	46159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320430
1094	NC_017569	TAAA	2	8	46178	46185	75 %	25 %	0 %	0 %	386320430
1095	NC_017569	CAAA	2	8	46228	46235	75 %	0 %	0 %	25 %	386320430
1096	NC_017569	AATT	2	8	46249	46256	50 %	50 %	0 %	0 %	386320430
1097	NC_017569	ACA	2	6	46296	46301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320430
1098	NC_017569	ATTC	2	8	46310	46317	25 %	50 %	0 %	25 %	386320430
1099	NC_017569	GTA	2	6	46358	46363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320430
1100	NC_017569	TATC	2	8	46375	46382	25 %	50 %	0 %	25 %	386320430
1101	NC_017569	CAGGT	2	10	46430	46439	20 %	20 %	40 %	20 %	386320430
1102	NC_017569	CTT	2	6	46461	46466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320430
1103	NC_017569	ATC	2	6	46490	46495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1104	NC_017569	CTTTCA	2	12	46527	46538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386320430
1105	NC_017569	AAT	2	6	46602	46607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320430
1106	NC_017569	ATT	2	6	46628	46633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1107	NC_017569	TA	3	6	46696	46701	50 %	50 %	0 %	0 %	386320430
1108	NC_017569	T	7	7	46737	46743	0 %	100 %	0 %	0 %	386320430
1109	NC_017569	TAA	3	9	46795	46803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320430
1110	NC_017569	CCTA	2	8	46847	46854	25 %	25 %	0 %	50 %	386320430
1111	NC_017569	ACT	2	6	47027	47032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1112	NC_017569	TTA	2	6	47202	47207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1113	NC_017569	AGA	2	6	47222	47227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320430
1114	NC_017569	TAC	2	6	47281	47286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1115	NC_017569	ACT	2	6	47402	47407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1116	NC_017569	CAT	2	6	47413	47418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320430
1117	NC_017569	ATT	2	6	47447	47452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1118	NC_017569	TAA	2	6	47491	47496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320430
1119	NC_017569	GGTC	2	8	47497	47504	0 %	25 %	50 %	25 %	386320430
1120	NC_017569	GTA	2	6	47511	47516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320430
1121	NC_017569	ATA	2	6	47567	47572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320430
1122	NC_017569	TCTA	2	8	47609	47616	25 %	50 %	0 %	25 %	386320430
1123	NC_017569	ATT	2	6	47636	47641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1124	NC_017569	TAT	2	6	47644	47649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320430
1125	NC_017569	A	6	6	47680	47685	100 %	0 %	0 %	0 %	386320430
1126	NC_017569	TCT	2	6	47694	47699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320430
1127	NC_017569	TCT	3	9	47715	47723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320430
1128	NC_017569	CT	3	6	47742	47747	0 %	50 %	0 %	50 %	386320430
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1130	NC_017569	AT	3	6	47807	47812	50 %	50 %	0 %	0 %	386320430
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