MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017569	ACC	2	6	21124	21129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320408
502	NC_017569	ATT	2	6	21135	21140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320408
503	NC_017569	CAA	2	6	21202	21207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320408
504	NC_017569	AAG	2	6	21239	21244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320408
505	NC_017569	ACGCC	2	10	21267	21276	20 %	0 %	20 %	60 %	386320408
506	NC_017569	ATA	2	6	21353	21358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320408
507	NC_017569	A	6	6	21361	21366	100 %	0 %	0 %	0 %	386320408
508	NC_017569	AAG	2	6	21408	21413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320408
509	NC_017569	TTAA	2	8	21415	21422	50 %	50 %	0 %	0 %	386320408
510	NC_017569	A	6	6	21454	21459	100 %	0 %	0 %	0 %	386320408
511	NC_017569	A	6	6	21547	21552	100 %	0 %	0 %	0 %	386320408
512	NC_017569	AAT	2	6	21660	21665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017569	TTAGAA	2	12	21666	21677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017569	A	7	7	21716	21722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017569	ATT	3	9	21727	21735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017569	TGG	2	6	21803	21808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017569	TGA	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017569	A	7	7	21862	21868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017569	AGG	2	6	21902	21907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320409
520	NC_017569	CCAAA	2	10	21962	21971	60 %	0 %	0 %	40 %	386320409
521	NC_017569	ACC	2	6	21979	21984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320409
522	NC_017569	T	7	7	21998	22004	0 %	100 %	0 %	0 %	386320409
523	NC_017569	TCT	2	6	22221	22226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320409
524	NC_017569	TCA	2	6	22240	22245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320409
525	NC_017569	AAGT	2	8	22264	22271	50 %	25 %	25 %	0 %	386320409
526	NC_017569	ATTTA	2	10	22296	22305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017569	A	7	7	22308	22314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017569	AAG	2	6	22318	22323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017569	T	6	6	22336	22341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017569	ATTA	2	8	22366	22373	50 %	50 %	0 %	0 %	386320410
531	NC_017569	TAT	2	6	22429	22434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320410
532	NC_017569	TAC	2	6	22448	22453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320410
533	NC_017569	T	6	6	22474	22479	0 %	100 %	0 %	0 %	386320410
534	NC_017569	TGA	2	6	22533	22538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320410
535	NC_017569	CTTC	2	8	22552	22559	0 %	50 %	0 %	50 %	386320410
536	NC_017569	A	6	6	22560	22565	100 %	0 %	0 %	0 %	386320410
537	NC_017569	T	6	6	22594	22599	0 %	100 %	0 %	0 %	386320410
538	NC_017569	TAT	2	6	22624	22629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320410
539	NC_017569	CTT	2	6	22714	22719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320410
540	NC_017569	AAGA	2	8	22758	22765	75 %	0 %	25 %	0 %	386320410
541	NC_017569	ATA	2	6	22776	22781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320410
542	NC_017569	TA	3	6	22780	22785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017569	A	6	6	22791	22796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017569	T	6	6	22860	22865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017569	TATT	2	8	22883	22890	25 %	75 %	0 %	0 %	386320411
546	NC_017569	TCC	2	6	22968	22973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320411
547	NC_017569	T	6	6	23099	23104	0 %	100 %	0 %	0 %	386320411
548	NC_017569	T	6	6	23124	23129	0 %	100 %	0 %	0 %	386320411
549	NC_017569	GTAT	2	8	23146	23153	25 %	50 %	25 %	0 %	386320411
550	NC_017569	ATG	2	6	23163	23168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320411
551	NC_017569	CGAT	2	8	23193	23200	25 %	25 %	25 %	25 %	386320411
552	NC_017569	ACG	2	6	23203	23208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320411
553	NC_017569	TA	3	6	23297	23302	50 %	50 %	0 %	0 %	386320411
554	NC_017569	CAA	2	6	23337	23342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017569	A	7	7	23351	23357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017569	T	6	6	23410	23415	0 %	100 %	0 %	0 %	386320412
557	NC_017569	TC	3	6	23433	23438	0 %	50 %	0 %	50 %	386320412
558	NC_017569	TCC	3	9	23443	23451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320412
559	NC_017569	TAC	2	6	23463	23468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
560	NC_017569	CTA	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
561	NC_017569	TAG	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
562	NC_017569	TTC	2	6	23619	23624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320412
563	NC_017569	TAT	2	6	23637	23642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320412
564	NC_017569	CAT	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320412
565	NC_017569	TAG	2	6	23668	23673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
566	NC_017569	TTTA	2	8	23716	23723	25 %	75 %	0 %	0 %	386320412
567	NC_017569	TAG	2	6	23796	23801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320412
568	NC_017569	AATA	2	8	23845	23852	75 %	25 %	0 %	0 %	386320412
569	NC_017569	TTTA	2	8	23872	23879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017569	T	6	6	23953	23958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017569	TAAAT	2	10	23973	23982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017569	TCC	2	6	24020	24025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_017569	ATA	2	6	24071	24076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017569	GTA	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017569	GGA	2	6	24185	24190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017569	TA	4	8	24207	24214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017569	TAA	2	6	24289	24294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017569	TTAC	2	8	24313	24320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
579	NC_017569	ATA	2	6	24322	24327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017569	CAT	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_017569	AAT	3	9	24368	24376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017569	A	6	6	24446	24451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017569	TTC	2	6	24488	24493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320413
584	NC_017569	CAAC	2	8	24548	24555	50 %	0 %	0 %	50 %	386320413
585	NC_017569	GAG	2	6	24583	24588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320413
586	NC_017569	TTTG	2	8	24656	24663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017569	TAA	2	6	24673	24678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017569	CCA	2	6	24708	24713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017569	CAC	2	6	24715	24720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_017569	ACA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017569	ATT	2	6	24881	24886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017569	TCA	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320414
593	NC_017569	CTT	2	6	25040	25045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
594	NC_017569	AAG	2	6	25062	25067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320414
595	NC_017569	CTT	2	6	25082	25087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
596	NC_017569	TAA	2	6	25103	25108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
597	NC_017569	TA	3	6	25137	25142	50 %	50 %	0 %	0 %	386320414
598	NC_017569	T	6	6	25156	25161	0 %	100 %	0 %	0 %	386320414
599	NC_017569	TTCTT	2	10	25174	25183	0 %	80 %	0 %	20 %	386320414
600	NC_017569	TATTT	2	10	25284	25293	20 %	80 %	0 %	0 %	386320414
601	NC_017569	AAAT	2	8	25377	25384	75 %	25 %	0 %	0 %	386320414
602	NC_017569	TAG	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
603	NC_017569	CTG	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320414
604	NC_017569	TATT	2	8	25403	25410	25 %	75 %	0 %	0 %	386320414
605	NC_017569	T	6	6	25409	25414	0 %	100 %	0 %	0 %	386320414
606	NC_017569	CGG	2	6	25451	25456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320414
607	NC_017569	CCA	2	6	25498	25503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
608	NC_017569	CTT	2	6	25514	25519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
609	NC_017569	TAG	2	6	25532	25537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
610	NC_017569	TCC	2	6	25567	25572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320414
611	NC_017569	AAT	2	6	25620	25625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
612	NC_017569	TAA	2	6	25674	25679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
613	NC_017569	ACC	2	6	25680	25685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
614	NC_017569	TAA	2	6	25707	25712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
615	NC_017569	TCT	2	6	25747	25752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320414
616	NC_017569	ACC	2	6	25833	25838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320414
617	NC_017569	TGC	2	6	25866	25871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320414
618	NC_017569	GTA	2	6	26059	26064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320414
619	NC_017569	TAA	2	6	26225	26230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320414
620	NC_017569	ATTC	2	8	26286	26293	25 %	50 %	0 %	25 %	386320414
621	NC_017569	AAT	2	6	26315	26320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017569	AAAG	2	8	26331	26338	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017569	TTCT	2	8	26375	26382	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
624	NC_017569	CCA	2	6	26424	26429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320415
625	NC_017569	TCTT	2	8	26485	26492	0 %	75 %	0 %	25 %	386320415
626	NC_017569	AAC	2	6	26552	26557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320415
627	NC_017569	TGC	2	6	26569	26574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320415
628	NC_017569	TAT	2	6	26593	26598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320415
629	NC_017569	A	6	6	26605	26610	100 %	0 %	0 %	0 %	386320415
630	NC_017569	TAA	2	6	26623	26628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320415
631	NC_017569	TA	3	6	26653	26658	50 %	50 %	0 %	0 %	386320415
632	NC_017569	TCA	2	6	26672	26677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320415
633	NC_017569	TCTG	2	8	26692	26699	0 %	50 %	25 %	25 %	386320415
634	NC_017569	ATG	2	6	26729	26734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320415
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