MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017569	CATT	2	8	217794	217801	25 %	50 %	0 %	25 %	386320620
5002	NC_017569	A	6	6	217810	217815	100 %	0 %	0 %	0 %	386320620
5003	NC_017569	CTG	2	6	217840	217845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320620
5004	NC_017569	TAT	2	6	217857	217862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320620
5005	NC_017569	TGT	2	6	217910	217915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320620
5006	NC_017569	CGGAA	2	10	218081	218090	40 %	0 %	40 %	20 %	386320620
5007	NC_017569	CGAA	2	8	218101	218108	50 %	0 %	25 %	25 %	386320620
5008	NC_017569	ACT	2	6	218284	218289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320620
5009	NC_017569	ATA	2	6	218336	218341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320620
5010	NC_017569	TAAA	2	8	218394	218401	75 %	25 %	0 %	0 %	386320620
5011	NC_017569	TAA	2	6	218463	218468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320620
5012	NC_017569	ACC	2	6	218537	218542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320620
5013	NC_017569	A	6	6	218626	218631	100 %	0 %	0 %	0 %	386320620
5014	NC_017569	CGA	2	6	218635	218640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320620
5015	NC_017569	TCC	2	6	218683	218688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320620
5016	NC_017569	TTA	2	6	218697	218702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320620
5017	NC_017569	AAT	2	6	218763	218768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017569	TTA	2	6	218794	218799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017569	TTAA	2	8	218850	218857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017569	T	6	6	218946	218951	0 %	100 %	0 %	0 %	386320621
5021	NC_017569	CTT	2	6	218952	218957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
5022	NC_017569	ATC	2	6	219007	219012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320621
5023	NC_017569	TAA	2	6	219016	219021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5024	NC_017569	TCT	2	6	219136	219141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
5025	NC_017569	CCG	2	6	219195	219200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320621
5026	NC_017569	TAA	2	6	219240	219245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5027	NC_017569	GTC	2	6	219343	219348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320621
5028	NC_017569	ACA	2	6	219354	219359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320621
5029	NC_017569	CTG	2	6	219384	219389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320621
5030	NC_017569	ATA	2	6	219421	219426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5031	NC_017569	AAG	2	6	219448	219453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320621
5032	NC_017569	AAT	2	6	219550	219555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5033	NC_017569	T	7	7	219558	219564	0 %	100 %	0 %	0 %	386320621
5034	NC_017569	TTC	2	6	219601	219606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
5035	NC_017569	TAA	2	6	219646	219651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5036	NC_017569	ATC	2	6	219668	219673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320621
5037	NC_017569	AAC	2	6	219874	219879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320621
5038	NC_017569	ATAA	2	8	219890	219897	75 %	25 %	0 %	0 %	386320621
5039	NC_017569	ACC	2	6	220094	220099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320621
5040	NC_017569	AAT	2	6	220103	220108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5041	NC_017569	TCAT	2	8	220127	220134	25 %	50 %	0 %	25 %	386320621
5042	NC_017569	ATAC	2	8	220146	220153	50 %	25 %	0 %	25 %	386320621
5043	NC_017569	CTT	2	6	220269	220274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
5044	NC_017569	AAT	2	6	220298	220303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5045	NC_017569	ACA	2	6	220335	220340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320621
5046	NC_017569	T	7	7	220382	220388	0 %	100 %	0 %	0 %	386320621
5047	NC_017569	AGA	2	6	220417	220422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320621
5048	NC_017569	AAGCC	2	10	220523	220532	40 %	0 %	20 %	40 %	386320621
5049	NC_017569	AAT	2	6	220585	220590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320621
5050	NC_017569	CAC	2	6	220603	220608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320621
5051	NC_017569	TCT	2	6	220634	220639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320621
5052	NC_017569	CCT	2	6	220682	220687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320621
5053	NC_017569	AT	3	6	220689	220694	50 %	50 %	0 %	0 %	386320621
5054	NC_017569	A	7	7	220739	220745	100 %	0 %	0 %	0 %	386320621
5055	NC_017569	TAAA	2	8	220776	220783	75 %	25 %	0 %	0 %	386320621
5056	NC_017569	CT	3	6	220784	220789	0 %	50 %	0 %	50 %	386320621
5057	NC_017569	CTT	2	6	220835	220840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017569	T	8	8	220844	220851	0 %	100 %	0 %	0 %	386320622
5059	NC_017569	GCG	2	6	220857	220862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386320622
5060	NC_017569	TCT	2	6	220932	220937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320622
5061	NC_017569	TCC	2	6	220955	220960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320622
5062	NC_017569	T	6	6	221009	221014	0 %	100 %	0 %	0 %	386320622
5063	NC_017569	TTTG	2	8	221035	221042	0 %	75 %	25 %	0 %	386320622
5064	NC_017569	GGA	2	6	221091	221096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386320622
5065	NC_017569	ATA	2	6	221290	221295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320622
5066	NC_017569	T	6	6	221302	221307	0 %	100 %	0 %	0 %	386320622
5067	NC_017569	TACTT	2	10	221309	221318	20 %	60 %	0 %	20 %	386320622
5068	NC_017569	TA	3	6	221327	221332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017569	TAT	2	6	221399	221404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017569	TAA	3	9	221462	221470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5071	NC_017569	TAA	2	6	221488	221493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5072	NC_017569	AGAT	2	8	221519	221526	50 %	25 %	25 %	0 %	386320623
5073	NC_017569	ATA	2	6	221527	221532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5074	NC_017569	AT	3	6	221573	221578	50 %	50 %	0 %	0 %	386320623
5075	NC_017569	AAT	2	6	221598	221603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5076	NC_017569	TAA	2	6	221684	221689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5077	NC_017569	TAA	2	6	221743	221748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5078	NC_017569	A	6	6	221747	221752	100 %	0 %	0 %	0 %	386320623
5079	NC_017569	ACAA	2	8	221758	221765	75 %	0 %	0 %	25 %	386320623
5080	NC_017569	TAA	2	6	221792	221797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320623
5081	NC_017569	TAT	2	6	221807	221812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320623
5082	NC_017569	TG	3	6	221830	221835	0 %	50 %	50 %	0 %	386320623
5083	NC_017569	GGCT	2	8	221874	221881	0 %	25 %	50 %	25 %	386320623
5084	NC_017569	CCT	2	6	221883	221888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320623
5085	NC_017569	A	6	6	221951	221956	100 %	0 %	0 %	0 %	386320623
5086	NC_017569	TAGGTT	2	12	222020	222031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386320623
5087	NC_017569	CT	3	6	222033	222038	0 %	50 %	0 %	50 %	386320623
5088	NC_017569	T	7	7	222102	222108	0 %	100 %	0 %	0 %	386320624
5089	NC_017569	CAT	2	6	222193	222198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320624
5090	NC_017569	GCTC	2	8	222206	222213	0 %	25 %	25 %	50 %	386320624
5091	NC_017569	T	6	6	222227	222232	0 %	100 %	0 %	0 %	386320624
5092	NC_017569	AAG	2	6	222244	222249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320624
5093	NC_017569	TTG	2	6	222256	222261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320624
5094	NC_017569	TAT	2	6	222291	222296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320624
5095	NC_017569	GTTT	2	8	222316	222323	0 %	75 %	25 %	0 %	386320624
5096	NC_017569	TCT	2	6	222470	222475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320624
5097	NC_017569	TTGA	2	8	222517	222524	25 %	50 %	25 %	0 %	386320624
5098	NC_017569	TAA	2	6	222528	222533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320624
5099	NC_017569	TCTTTT	2	12	222545	222556	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386320624
5100	NC_017569	TAC	2	6	222565	222570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017569	AT	3	6	222603	222608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017569	A	7	7	222626	222632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017569	CTT	2	6	222703	222708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017569	ATT	2	6	222753	222758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017569	AT	3	6	222764	222769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017569	TTA	2	6	222801	222806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017569	CACT	2	8	222844	222851	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_017569	ATA	2	6	222861	222866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017569	TCA	3	9	222883	222891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017569	TGT	2	6	222929	222934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017569	AAG	2	6	222966	222971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017569	AAT	2	6	223004	223009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017569	TCA	2	6	223081	223086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017569	T	7	7	223094	223100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017569	ATA	2	6	223171	223176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017569	CCA	2	6	223190	223195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_017569	A	6	6	223237	223242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017569	GCA	2	6	223273	223278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_017569	AAG	2	6	223297	223302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017569	T	6	6	223352	223357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017569	AAG	2	6	223364	223369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017569	TGG	2	6	223392	223397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017569	CAA	2	6	223428	223433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_017569	CTA	2	6	223439	223444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_017569	CGC	2	6	223446	223451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_017569	CAT	2	6	223562	223567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017569	ATG	2	6	223569	223574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5129	NC_017569	AAAG	2	8	223656	223663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_017569	A	6	6	223906	223911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_017569	ATT	2	6	224732	224737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_017569	TAA	2	6	225237	225242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5168	NC_017569	TA	3	6	225549	225554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_017569	ATT	2	6	225566	225571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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