MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017560	TAA	2	6	148246	148251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081953
4003	NC_017560	GAT	2	6	148275	148280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081953
4004	NC_017560	TAT	2	6	148297	148302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081953
4005	NC_017560	A	6	6	148314	148319	100 %	0 %	0 %	0 %	386081953
4006	NC_017560	GT	3	6	148366	148371	0 %	50 %	50 %	0 %	386081953
4007	NC_017560	ACTT	2	8	148412	148419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_017560	TAAGC	2	10	148461	148470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4009	NC_017560	TAAAT	2	10	148482	148491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017560	ATGA	2	8	148499	148506	50 %	25 %	25 %	0 %	386081954
4011	NC_017560	ATA	2	6	148544	148549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081954
4012	NC_017560	A	9	9	148589	148597	100 %	0 %	0 %	0 %	386081954
4013	NC_017560	GCTA	2	8	148618	148625	25 %	25 %	25 %	25 %	386081954
4014	NC_017560	GTA	2	6	148704	148709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081954
4015	NC_017560	AAAT	2	8	148725	148732	75 %	25 %	0 %	0 %	386081954
4016	NC_017560	AG	4	8	148776	148783	50 %	0 %	50 %	0 %	386081954
4017	NC_017560	TA	3	6	148835	148840	50 %	50 %	0 %	0 %	386081954
4018	NC_017560	ACAAA	2	10	148868	148877	80 %	0 %	0 %	20 %	386081954
4019	NC_017560	ACT	2	6	148999	149004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081954
4020	NC_017560	AAG	2	6	149012	149017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081954
4021	NC_017560	AGA	2	6	149128	149133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081954
4022	NC_017560	AC	3	6	149135	149140	50 %	0 %	0 %	50 %	386081954
4023	NC_017560	AAT	2	6	149147	149152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081954
4024	NC_017560	TGA	2	6	149179	149184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081954
4025	NC_017560	GAT	2	6	149201	149206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081954
4026	NC_017560	ATAG	2	8	149235	149242	50 %	25 %	25 %	0 %	386081954
4027	NC_017560	ATC	2	6	149247	149252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017560	ATA	2	6	149287	149292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017560	T	6	6	149311	149316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017560	TAT	2	6	149357	149362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017560	TAAAA	2	10	149385	149394	80 %	20 %	0 %	0 %	386081955
4032	NC_017560	TAA	2	6	149406	149411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081955
4033	NC_017560	CAC	2	6	149423	149428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386081955
4034	NC_017560	TA	4	8	149436	149443	50 %	50 %	0 %	0 %	386081955
4035	NC_017560	T	6	6	149500	149505	0 %	100 %	0 %	0 %	386081955
4036	NC_017560	TGGTG	2	10	149519	149528	0 %	40 %	60 %	0 %	386081955
4037	NC_017560	AAT	2	6	149551	149556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081955
4038	NC_017560	TAT	2	6	149580	149585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081955
4039	NC_017560	TAG	2	6	149597	149602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081955
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4041	NC_017560	AGT	2	6	149712	149717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081955
4042	NC_017560	TAT	2	6	149726	149731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081955
4043	NC_017560	TTA	2	6	149740	149745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081955
4044	NC_017560	T	6	6	149798	149803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017560	TGAAA	2	10	149835	149844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017560	TAA	2	6	149856	149861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017560	AAT	2	6	149866	149871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017560	AT	3	6	149916	149921	50 %	50 %	0 %	0 %	386081956
4049	NC_017560	CAT	2	6	149979	149984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081956
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4051	NC_017560	CAA	2	6	150056	150061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081956
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4054	NC_017560	ATTA	2	8	150122	150129	50 %	50 %	0 %	0 %	386081956
4055	NC_017560	GTA	2	6	150171	150176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081956
4056	NC_017560	TA	3	6	150186	150191	50 %	50 %	0 %	0 %	386081956
4057	NC_017560	ATT	2	6	150233	150238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081956
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4061	NC_017560	TAA	2	6	150360	150365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081957
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4063	NC_017560	A	6	6	150410	150415	100 %	0 %	0 %	0 %	386081957
4064	NC_017560	TATAA	2	10	150436	150445	60 %	40 %	0 %	0 %	386081958
4065	NC_017560	TCA	2	6	150447	150452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081958
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4091	NC_017560	TAG	2	6	151961	151966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081958
4092	NC_017560	CAG	2	6	152018	152023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081958
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4094	NC_017560	TGA	2	6	152115	152120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081958
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4096	NC_017560	ATTA	3	12	152210	152221	50 %	50 %	0 %	0 %	386081958
4097	NC_017560	TA	3	6	152220	152225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017560	TAT	2	6	152227	152232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017560	TTTA	2	8	152233	152240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017560	AAC	2	6	152254	152259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081959
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4105	NC_017560	TA	3	6	152321	152326	50 %	50 %	0 %	0 %	386081959
4106	NC_017560	TATT	2	8	152343	152350	25 %	75 %	0 %	0 %	386081959
4107	NC_017560	TAT	2	6	152375	152380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081959
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4109	NC_017560	TAT	2	6	152549	152554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081960
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4111	NC_017560	GCT	2	6	152697	152702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081960
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4116	NC_017560	GTT	2	6	152917	152922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081960
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4118	NC_017560	A	7	7	152970	152976	100 %	0 %	0 %	0 %	386081960
4119	NC_017560	TTAA	2	8	152983	152990	50 %	50 %	0 %	0 %	386081960
4120	NC_017560	ATAATT	2	12	153015	153026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017560	AG	3	6	153080	153085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017560	TAAG	2	8	153125	153132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017560	T	6	6	153133	153138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4376	NC_017560	GTA	2	6	162488	162493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081971
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4378	NC_017560	GTA	2	6	162662	162667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081971
4379	NC_017560	T	6	6	162691	162696	0 %	100 %	0 %	0 %	386081971
4380	NC_017560	ATG	3	9	162702	162710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081971
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4382	NC_017560	ATG	2	6	162843	162848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081971
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4499	NC_017560	TTG	2	6	167904	167909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081972
4500	NC_017560	TATAC	2	10	167960	167969	40 %	40 %	0 %	20 %	386081972

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