MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017560	AT	3	6	111261	111266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017560	ATTT	2	8	111275	111282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017560	GGTGTT	2	12	111338	111349	0 %	50 %	50 %	0 %	386081927
3004	NC_017560	TAA	2	6	111358	111363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081927
3005	NC_017560	AGA	2	6	111389	111394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081927
3006	NC_017560	TA	3	6	111450	111455	50 %	50 %	0 %	0 %	386081927
3007	NC_017560	AT	3	6	111514	111519	50 %	50 %	0 %	0 %	386081927
3008	NC_017560	ATG	2	6	111531	111536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081927
3009	NC_017560	A	6	6	111570	111575	100 %	0 %	0 %	0 %	386081927
3010	NC_017560	AGC	2	6	111589	111594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081927
3011	NC_017560	GTA	2	6	111754	111759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081928
3012	NC_017560	AATC	2	8	111760	111767	50 %	25 %	0 %	25 %	386081928
3013	NC_017560	TAA	2	6	111768	111773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081928
3014	NC_017560	TAA	2	6	111789	111794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081928
3015	NC_017560	TCTT	2	8	111807	111814	0 %	75 %	0 %	25 %	386081928
3016	NC_017560	AAGA	2	8	111823	111830	75 %	0 %	25 %	0 %	386081928
3017	NC_017560	AGTAG	2	10	111892	111901	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017560	CTA	2	6	111913	111918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_017560	ATA	2	6	111927	111932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017560	TAG	2	6	112062	112067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017560	TGA	2	6	112078	112083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017560	CACTA	2	10	112153	112162	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3023	NC_017560	CATA	2	8	112272	112279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_017560	AATAC	2	10	112297	112306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_017560	TA	3	6	112328	112333	50 %	50 %	0 %	0 %	386081929
3026	NC_017560	TAA	2	6	112338	112343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081929
3027	NC_017560	ATA	2	6	112358	112363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081929
3028	NC_017560	A	6	6	112363	112368	100 %	0 %	0 %	0 %	386081929
3029	NC_017560	GATT	2	8	112371	112378	25 %	50 %	25 %	0 %	386081929
3030	NC_017560	TCA	2	6	112395	112400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081929
3031	NC_017560	AAATC	2	10	112431	112440	60 %	20 %	0 %	20 %	386081929
3032	NC_017560	TTG	2	6	112469	112474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081929
3033	NC_017560	ATA	2	6	112501	112506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081929
3034	NC_017560	TAA	3	9	112518	112526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081929
3035	NC_017560	TTA	2	6	112598	112603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081929
3036	NC_017560	TTA	2	6	112677	112682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081929
3037	NC_017560	GTTA	2	8	112707	112714	25 %	50 %	25 %	0 %	386081929
3038	NC_017560	AAG	2	6	112731	112736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081929
3039	NC_017560	AAG	2	6	112756	112761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081929
3040	NC_017560	TTA	2	6	112771	112776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081929
3041	NC_017560	ATT	2	6	112801	112806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081929
3042	NC_017560	ACT	2	6	112880	112885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081929
3043	NC_017560	TA	3	6	112896	112901	50 %	50 %	0 %	0 %	386081929
3044	NC_017560	AGT	2	6	112906	112911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081929
3045	NC_017560	AAG	2	6	112919	112924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081929
3046	NC_017560	GA	3	6	112929	112934	50 %	0 %	50 %	0 %	386081929
3047	NC_017560	TAG	2	6	112993	112998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017560	AT	3	6	113043	113048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017560	AT	3	6	113051	113056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017560	CTA	2	6	113141	113146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017560	TA	3	6	113150	113155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017560	AAT	2	6	113156	113161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017560	TAT	3	9	113164	113172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017560	ATG	2	6	113226	113231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017560	TAAA	2	8	113248	113255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017560	ATT	2	6	113287	113292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081930
3057	NC_017560	TAT	2	6	113310	113315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081930
3058	NC_017560	TTA	2	6	113387	113392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017560	TAA	2	6	113409	113414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017560	TAA	2	6	113459	113464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017560	ATA	2	6	113536	113541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017560	AGTA	2	8	113629	113636	50 %	25 %	25 %	0 %	386081931
3063	NC_017560	TATT	2	8	113676	113683	25 %	75 %	0 %	0 %	386081931
3064	NC_017560	TAG	2	6	113730	113735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081931
3065	NC_017560	TTATA	2	10	113737	113746	40 %	60 %	0 %	0 %	386081931
3066	NC_017560	TAAA	2	8	113781	113788	75 %	25 %	0 %	0 %	386081931
3067	NC_017560	TAA	2	6	113812	113817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081931
3068	NC_017560	TAC	2	6	113822	113827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081931
3069	NC_017560	AT	3	6	113844	113849	50 %	50 %	0 %	0 %	386081931
3070	NC_017560	T	6	6	113859	113864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017560	GTAAT	2	10	113875	113884	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017560	AGG	2	6	113936	113941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017560	ATA	2	6	113942	113947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_017560	A	6	6	113983	113988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017560	A	6	6	114010	114015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017560	AGC	2	6	114056	114061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081932
3077	NC_017560	AAGA	2	8	114082	114089	75 %	0 %	25 %	0 %	386081932
3078	NC_017560	TTA	2	6	114159	114164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081932
3079	NC_017560	TTA	2	6	114169	114174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081932
3080	NC_017560	GAT	2	6	114204	114209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081932
3081	NC_017560	TGCTT	2	10	114242	114251	0 %	60 %	20 %	20 %	386081932
3082	NC_017560	AGA	2	6	114297	114302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081932
3083	NC_017560	GAC	2	6	114321	114326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081932
3084	NC_017560	TTA	2	6	114370	114375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081932
3085	NC_017560	T	6	6	114423	114428	0 %	100 %	0 %	0 %	386081932
3086	NC_017560	TA	3	6	114436	114441	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3087	NC_017560	TA	3	6	114451	114456	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3088	NC_017560	TGG	2	6	114467	114472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386081932
3089	NC_017560	TGC	2	6	114473	114478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081932
3090	NC_017560	T	6	6	114491	114496	0 %	100 %	0 %	0 %	386081932
3091	NC_017560	AAG	2	6	114498	114503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081932
3092	NC_017560	TAA	2	6	114518	114523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081932
3093	NC_017560	GAAA	2	8	114554	114561	75 %	0 %	25 %	0 %	386081932
3094	NC_017560	TAAT	2	8	114682	114689	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3095	NC_017560	TGA	2	6	114734	114739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081932
3096	NC_017560	TACC	2	8	114745	114752	25 %	25 %	0 %	50 %	386081932
3097	NC_017560	ATT	2	6	114758	114763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081932
3098	NC_017560	T	6	6	114762	114767	0 %	100 %	0 %	0 %	386081932
3099	NC_017560	AAG	2	6	114788	114793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081932
3100	NC_017560	ATC	2	6	114819	114824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081932
3101	NC_017560	ACA	2	6	114956	114961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081932
3102	NC_017560	TTG	2	6	115003	115008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081932
3103	NC_017560	CTA	2	6	115033	115038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081932
3104	NC_017560	GCG	2	6	115039	115044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386081932
3105	NC_017560	ATC	2	6	115060	115065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081932
3106	NC_017560	AGA	2	6	115106	115111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081932
3107	NC_017560	TAT	2	6	115114	115119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081932
3108	NC_017560	GCA	2	6	115125	115130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081932
3109	NC_017560	TA	3	6	115221	115226	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3110	NC_017560	CTA	2	6	115237	115242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081932
3111	NC_017560	TTTTA	2	10	115359	115368	20 %	80 %	0 %	0 %	386081932
3112	NC_017560	T	6	6	115485	115490	0 %	100 %	0 %	0 %	386081932
3113	NC_017560	ATA	2	6	115675	115680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081932
3114	NC_017560	A	8	8	115720	115727	100 %	0 %	0 %	0 %	386081932
3115	NC_017560	GAT	2	6	115848	115853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081932
3116	NC_017560	TA	3	6	115936	115941	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3117	NC_017560	AT	3	6	115957	115962	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
3118	NC_017560	A	6	6	115975	115980	100 %	0 %	0 %	0 %	386081932
3119	NC_017560	TGA	2	6	115994	115999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081932
3120	NC_017560	AGA	2	6	116105	116110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081932
3121	NC_017560	TGC	2	6	116111	116116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081932
3122	NC_017560	AGT	2	6	116121	116126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081932
3123	NC_017560	CAA	2	6	116145	116150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386081932
3124	NC_017560	CA	3	6	116156	116161	50 %	0 %	0 %	50 %	386081932
3125	NC_017560	T	7	7	116164	116170	0 %	100 %	0 %	0 %	386081932
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3127	NC_017560	TTAA	2	8	116235	116242	50 %	50 %	0 %	0 %	386081932
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3354	NC_017560	TGC	2	6	124614	124619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386081935
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3359	NC_017560	A	7	7	124795	124801	100 %	0 %	0 %	0 %	386081935
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3362	NC_017560	CAT	2	6	124856	124861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3364	NC_017560	CA	3	6	124900	124905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3365	NC_017560	GTAA	2	8	124919	124926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3366	NC_017560	TAA	2	6	124949	124954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3367	NC_017560	A	7	7	124953	124959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_017560	AGTTT	2	10	125016	125025	20 %	60 %	20 %	0 %	386081936
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3372	NC_017560	AAAT	2	8	125233	125240	75 %	25 %	0 %	0 %	386081936
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3497	NC_017560	GAAT	2	8	130028	130035	50 %	25 %	25 %	0 %	386081937
3498	NC_017560	TAAAAG	2	12	130036	130047	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386081937
3499	NC_017560	AAAT	2	8	130094	130101	75 %	25 %	0 %	0 %	386081937
3500	NC_017560	ATG	2	6	130102	130107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081937

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