MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017560	ACA	2	6	18409	18414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017560	AGATA	2	10	18463	18472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017560	ATT	2	6	18474	18479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017560	TCAAA	2	10	18493	18502	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
505	NC_017560	CAT	2	6	18515	18520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017560	AATTAT	2	12	18551	18562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017560	TAT	3	9	18577	18585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017560	TA	3	6	18630	18635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017560	AAT	2	6	18683	18688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017560	AT	3	6	18687	18692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017560	TAA	2	6	18748	18753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017560	TTA	2	6	18822	18827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017560	ATA	2	6	18837	18842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017560	TAT	2	6	18904	18909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017560	AAT	2	6	18920	18925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017560	ATT	2	6	18948	18953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017560	TAAA	2	8	18957	18964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017560	TCA	2	6	18976	18981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017560	ATA	2	6	19097	19102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017560	ACC	2	6	19147	19152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017560	ATA	2	6	19244	19249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017560	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017560	AAG	2	6	19279	19284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017560	TTA	2	6	19321	19326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017560	ATTTA	2	10	19331	19340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017560	CTT	2	6	19395	19400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017560	TATT	2	8	19401	19408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017560	ATCTAA	2	12	19410	19421	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_017560	ATT	2	6	19422	19427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017560	TAG	2	6	19458	19463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017560	AGTTT	2	10	19529	19538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017560	A	6	6	19561	19566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017560	GTAA	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017560	AAT	2	6	19587	19592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017560	TTAT	2	8	19653	19660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017560	TCAA	2	8	19685	19692	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
537	NC_017560	AT	3	6	19694	19699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017560	CAT	2	6	19745	19750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017560	TATAA	2	10	19762	19771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017560	GTAA	2	8	19854	19861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017560	TA	4	8	19881	19888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017560	AT	3	6	19896	19901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017560	TAG	2	6	19916	19921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017560	GTA	2	6	20040	20045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017560	TAA	2	6	20046	20051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017560	ATAG	2	8	20091	20098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017560	AAT	2	6	20123	20128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017560	A	8	8	20136	20143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017560	A	8	8	20159	20166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017560	ATTA	2	8	20195	20202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017560	GAA	2	6	20223	20228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017560	TAA	2	6	20241	20246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017560	A	9	9	20252	20260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017560	TAG	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017560	AGT	2	6	20354	20359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017560	TAT	2	6	20415	20420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017560	A	6	6	20431	20436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017560	AAT	2	6	20442	20447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017560	TA	3	6	20452	20457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017560	AT	3	6	20548	20553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017560	AATCT	2	10	20574	20583	40 %	40 %	0 %	20 %	386081849
562	NC_017560	ATT	2	6	20601	20606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081849
563	NC_017560	AAG	2	6	20660	20665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386081849
564	NC_017560	GTT	2	6	20690	20695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386081849
565	NC_017560	AAT	2	6	20727	20732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017560	ATCA	2	8	20757	20764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017560	ATA	2	6	20787	20792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017560	TA	3	6	20873	20878	50 %	50 %	0 %	0 %	386081850
569	NC_017560	TCT	2	6	20920	20925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081850
570	NC_017560	TAAAA	2	10	20935	20944	80 %	20 %	0 %	0 %	386081850
571	NC_017560	ATC	2	6	20950	20955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081850
572	NC_017560	A	6	6	21034	21039	100 %	0 %	0 %	0 %	386081850
573	NC_017560	T	6	6	21046	21051	0 %	100 %	0 %	0 %	386081850
574	NC_017560	A	8	8	21053	21060	100 %	0 %	0 %	0 %	386081850
575	NC_017560	A	6	6	21097	21102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017560	TGA	2	6	21109	21114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017560	AACA	2	8	21118	21125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017560	GTAT	2	8	21157	21164	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017560	T	6	6	21270	21275	0 %	100 %	0 %	0 %	386081851
580	NC_017560	TCA	2	6	21323	21328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081851
581	NC_017560	TTTTGA	2	12	21365	21376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386081851
582	NC_017560	T	6	6	21397	21402	0 %	100 %	0 %	0 %	386081851
583	NC_017560	TTC	2	6	21415	21420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081851
584	NC_017560	TTTGT	2	10	21447	21456	0 %	80 %	20 %	0 %	386081851
585	NC_017560	TCT	2	6	21470	21475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081851
586	NC_017560	TTTGTA	2	12	21504	21515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386081851
587	NC_017560	AGC	2	6	21538	21543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081851
588	NC_017560	TCT	2	6	21545	21550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081851
589	NC_017560	T	6	6	21556	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	386081851
590	NC_017560	T	7	7	21622	21628	0 %	100 %	0 %	0 %	386081851
591	NC_017560	TAAAT	2	10	21638	21647	60 %	40 %	0 %	0 %	386081851
592	NC_017560	ATT	2	6	21701	21706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081851
593	NC_017560	T	7	7	21718	21724	0 %	100 %	0 %	0 %	386081852
594	NC_017560	GTA	2	6	21725	21730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081852
595	NC_017560	T	6	6	21758	21763	0 %	100 %	0 %	0 %	386081852
596	NC_017560	AAT	2	6	21765	21770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081852
597	NC_017560	ATC	2	6	21787	21792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081852
598	NC_017560	TTA	2	6	21802	21807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081852
599	NC_017560	TGAT	2	8	21850	21857	25 %	50 %	25 %	0 %	386081852
600	NC_017560	T	8	8	21886	21893	0 %	100 %	0 %	0 %	386081852
601	NC_017560	T	6	6	21923	21928	0 %	100 %	0 %	0 %	386081852
602	NC_017560	T	7	7	21930	21936	0 %	100 %	0 %	0 %	386081852
603	NC_017560	TTTGT	2	10	21955	21964	0 %	80 %	20 %	0 %	386081852
604	NC_017560	TCT	2	6	22003	22008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081852
605	NC_017560	AGC	2	6	22014	22019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081852
606	NC_017560	TAT	2	6	22055	22060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081852
607	NC_017560	TTC	2	6	22068	22073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386081852
608	NC_017560	A	6	6	22136	22141	100 %	0 %	0 %	0 %	386081852
609	NC_017560	AAT	2	6	22148	22153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081852
610	NC_017560	TATCAA	2	12	22157	22168	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386081852
611	NC_017560	A	6	6	22196	22201	100 %	0 %	0 %	0 %	386081853
612	NC_017560	A	6	6	22226	22231	100 %	0 %	0 %	0 %	386081853
613	NC_017560	AG	3	6	22321	22326	50 %	0 %	50 %	0 %	386081853
614	NC_017560	TAAT	2	8	22430	22437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017560	CAT	2	6	22466	22471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081854
616	NC_017560	ATAC	2	8	22476	22483	50 %	25 %	0 %	25 %	386081854
617	NC_017560	CAT	2	6	22635	22640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386081854
618	NC_017560	GCA	2	6	22645	22650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386081854
619	NC_017560	AACT	2	8	22664	22671	50 %	25 %	0 %	25 %	386081854
620	NC_017560	A	7	7	22744	22750	100 %	0 %	0 %	0 %	386081854
621	NC_017560	A	6	6	22756	22761	100 %	0 %	0 %	0 %	386081854
622	NC_017560	TAG	2	6	22844	22849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081854
623	NC_017560	AATAA	2	10	22888	22897	80 %	20 %	0 %	0 %	386081854
624	NC_017560	AAAT	2	8	22898	22905	75 %	25 %	0 %	0 %	386081854
625	NC_017560	CACT	2	8	22994	23001	25 %	25 %	0 %	50 %	386081854
626	NC_017560	AAGT	2	8	23047	23054	50 %	25 %	25 %	0 %	386081854
627	NC_017560	GTA	2	6	23065	23070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386081854
628	NC_017560	T	6	6	23139	23144	0 %	100 %	0 %	0 %	386081854
629	NC_017560	TAT	2	6	23221	23226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081855
630	NC_017560	ATA	2	6	23234	23239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386081855
631	NC_017560	T	6	6	23343	23348	0 %	100 %	0 %	0 %	386081855
632	NC_017560	TTAGAA	2	12	23357	23368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386081855
633	NC_017560	ATTA	2	8	23429	23436	50 %	50 %	0 %	0 %	386081855
634	NC_017560	TTA	3	9	23476	23484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386081856
635	NC_017560	ATTT	2	8	23488	23495	25 %	75 %	0 %	0 %	386081856
636	NC_017560	T	6	6	23498	23503	0 %	100 %	0 %	0 %	386081856
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