MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017559	CG	3	6	154165	154170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_017559	GCA	2	6	154171	154176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017559	GTTCG	2	10	154204	154213	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4004	NC_017559	CG	3	6	154212	154217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_017559	ATG	2	6	154287	154292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017559	CTT	3	9	154300	154308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017559	CAGC	2	8	154314	154321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_017559	TCG	2	6	154350	154355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017559	GCC	2	6	154427	154432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408368
4010	NC_017559	TGCA	2	8	154435	154442	25 %	25 %	25 %	25 %	523408368
4011	NC_017559	CTG	2	6	154542	154547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
4012	NC_017559	TG	3	6	154546	154551	0 %	50 %	50 %	0 %	523408368
4013	NC_017559	CGG	2	6	154600	154605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
4014	NC_017559	GGC	2	6	154610	154615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
4015	NC_017559	CTG	2	6	154626	154631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
4016	NC_017559	GGC	3	9	154632	154640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408368
4017	NC_017559	TG	3	6	154644	154649	0 %	50 %	50 %	0 %	523408368
4018	NC_017559	TGG	3	9	154714	154722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408368
4019	NC_017559	GCT	2	6	154754	154759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408368
4020	NC_017559	GGT	2	6	154760	154765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408368
4021	NC_017559	GGCA	2	8	154886	154893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_017559	CGG	2	6	154913	154918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017559	GGT	2	6	154982	154987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017559	CG	4	8	155037	155044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_017559	GAA	2	6	155061	155066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017559	TCA	2	6	155089	155094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017559	AGC	2	6	155114	155119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017559	CGC	2	6	155126	155131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_017559	TCG	2	6	155212	155217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4030	NC_017559	TCA	2	6	155227	155232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
4031	NC_017559	CG	3	6	155297	155302	0 %	0 %	50 %	50 %	523408369
4032	NC_017559	TCG	2	6	155341	155346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4033	NC_017559	TCG	3	9	155350	155358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4034	NC_017559	CAT	2	6	155384	155389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
4035	NC_017559	CGC	2	6	155413	155418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408369
4036	NC_017559	TGA	2	6	155449	155454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408369
4037	NC_017559	ACC	2	6	155497	155502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
4038	NC_017559	CAC	2	6	155532	155537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
4039	NC_017559	CG	3	6	155538	155543	0 %	0 %	50 %	50 %	523408369
4040	NC_017559	CGG	2	6	155551	155556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408369
4041	NC_017559	TGC	2	6	155593	155598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4042	NC_017559	TGA	2	6	155599	155604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408369
4043	NC_017559	TAC	2	6	155607	155612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
4044	NC_017559	GCGG	2	8	155631	155638	0 %	0 %	75 %	25 %	523408369
4045	NC_017559	GCT	2	6	155651	155656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4046	NC_017559	CAT	2	6	155711	155716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408369
4047	NC_017559	GTT	2	6	155753	155758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408369
4048	NC_017559	CTG	2	6	155790	155795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4049	NC_017559	GCT	2	6	155801	155806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4050	NC_017559	GTG	2	6	155862	155867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408369
4051	NC_017559	TGC	3	9	155905	155913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408369
4052	NC_017559	CTTCAT	2	12	155918	155929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	523408369
4053	NC_017559	ACC	2	6	155965	155970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408369
4054	NC_017559	TTC	2	6	156024	156029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017559	TCA	2	6	156051	156056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
4056	NC_017559	CAT	3	9	156106	156114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
4057	NC_017559	GCCT	2	8	156134	156141	0 %	25 %	25 %	50 %	523408370
4058	NC_017559	GGC	2	6	156158	156163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408370
4059	NC_017559	TGA	2	6	156198	156203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408370
4060	NC_017559	CTG	2	6	156227	156232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
4061	NC_017559	GGCGTG	2	12	156263	156274	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	523408370
4062	NC_017559	GTTCGC	2	12	156283	156294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
4063	NC_017559	GCT	2	6	156301	156306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408370
4064	NC_017559	TCA	2	6	156312	156317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408370
4065	NC_017559	ATG	2	6	156338	156343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017559	CGC	2	6	156380	156385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_017559	AC	3	6	156422	156427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_017559	TCG	2	6	156448	156453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408371
4069	NC_017559	TTC	2	6	156468	156473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408371
4070	NC_017559	TGG	2	6	156480	156485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408371
4071	NC_017559	GTT	2	6	156486	156491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408371
4072	NC_017559	GCC	2	6	156506	156511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408371
4073	NC_017559	CGA	2	6	156527	156532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408371
4074	NC_017559	CG	3	6	156534	156539	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
4075	NC_017559	TGGCT	2	10	156554	156563	0 %	40 %	40 %	20 %	523408371
4076	NC_017559	GAGCTG	2	12	156585	156596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523408371
4077	NC_017559	CAA	2	6	156599	156604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408371
4078	NC_017559	GC	3	6	156630	156635	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
4079	NC_017559	GC	3	6	156643	156648	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
4080	NC_017559	CG	3	6	156722	156727	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
4081	NC_017559	TCG	2	6	156730	156735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408371
4082	NC_017559	CAG	2	6	156759	156764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408371
4083	NC_017559	GC	4	8	156770	156777	0 %	0 %	50 %	50 %	523408371
4084	NC_017559	CTCA	2	8	156873	156880	25 %	25 %	0 %	50 %	523408371
4085	NC_017559	CCGT	2	8	156925	156932	0 %	25 %	25 %	50 %	523408372
4086	NC_017559	CGC	2	6	157012	157017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
4087	NC_017559	GAT	2	6	157043	157048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408372
4088	NC_017559	CTG	2	6	157136	157141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
4089	NC_017559	CAA	2	6	157147	157152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408372
4090	NC_017559	GCT	2	6	157162	157167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
4091	NC_017559	TGC	2	6	157194	157199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408372
4092	NC_017559	GCC	2	6	157217	157222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
4093	NC_017559	GC	3	6	157257	157262	0 %	0 %	50 %	50 %	523408372
4094	NC_017559	AAG	2	6	157304	157309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408372
4095	NC_017559	CGAT	2	8	157326	157333	25 %	25 %	25 %	25 %	523408372
4096	NC_017559	CGG	2	6	157345	157350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408372
4097	NC_017559	CGA	2	6	157369	157374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408372
4098	NC_017559	GC	5	10	157393	157402	0 %	0 %	50 %	50 %	523408372
4099	NC_017559	CCG	2	6	157428	157433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408372
4100	NC_017559	CCGC	2	8	157463	157470	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4101	NC_017559	GAA	2	6	157481	157486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017559	GACG	2	8	157601	157608	25 %	0 %	50 %	25 %	523408373
4103	NC_017559	GTG	2	6	157719	157724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408373
4104	NC_017559	AGCC	2	8	157926	157933	25 %	0 %	25 %	50 %	523408373
4105	NC_017559	TCGA	2	8	157953	157960	25 %	25 %	25 %	25 %	523408373
4106	NC_017559	CCG	2	6	158026	158031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408373
4107	NC_017559	CAT	2	6	158045	158050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408373
4108	NC_017559	AAGGGC	2	12	158058	158069	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	523408373
4109	NC_017559	TCT	2	6	158071	158076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408373
4110	NC_017559	CGA	2	6	158107	158112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4111	NC_017559	GTG	2	6	158121	158126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408373
4112	NC_017559	GC	3	6	158146	158151	0 %	0 %	50 %	50 %	523408373
4113	NC_017559	GTG	2	6	158166	158171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408373
4114	NC_017559	GCCGCT	2	12	158172	158183	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523408373
4115	NC_017559	GAC	2	6	158280	158285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4116	NC_017559	CAAG	2	8	158291	158298	50 %	0 %	25 %	25 %	523408373
4117	NC_017559	GCT	3	9	158321	158329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4118	NC_017559	GCC	2	6	158332	158337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408373
4119	NC_017559	CTG	2	6	158388	158393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4120	NC_017559	TGC	2	6	158399	158404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4121	NC_017559	CCGCC	2	10	158591	158600	0 %	0 %	20 %	80 %	523408373
4122	NC_017559	GTGG	2	8	158628	158635	0 %	25 %	75 %	0 %	523408373
4123	NC_017559	TGC	2	6	158636	158641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4124	NC_017559	GTC	2	6	158652	158657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408373
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4127	NC_017559	AGC	2	6	158755	158760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408373
4128	NC_017559	GCC	2	6	158770	158775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408373
4129	NC_017559	AGC	2	6	158794	158799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408373
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4133	NC_017559	GCC	2	6	158991	158996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408373
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4137	NC_017559	CGC	2	6	159186	159191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408374
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4144	NC_017559	GTC	2	6	159502	159507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408374
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4152	NC_017559	GGT	2	6	159759	159764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408374
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4206	NC_017559	CGGTT	2	10	161942	161951	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4207	NC_017559	AGC	2	6	161977	161982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4208	NC_017559	GCT	2	6	161991	161996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4210	NC_017559	CTG	3	9	162008	162016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4214	NC_017559	GGGCCG	2	12	162086	162097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
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4227	NC_017559	GCT	3	9	162548	162556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4228	NC_017559	TGC	2	6	162582	162587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4229	NC_017559	TCA	2	6	162593	162598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408377
4230	NC_017559	GCG	2	6	162605	162610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
4231	NC_017559	CG	3	6	162680	162685	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4232	NC_017559	CGGC	2	8	162725	162732	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4233	NC_017559	CG	4	8	162806	162813	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4234	NC_017559	CG	3	6	162823	162828	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4235	NC_017559	GCC	2	6	162834	162839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408377
4236	NC_017559	GC	3	6	162866	162871	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4237	NC_017559	GCCC	2	8	162908	162915	0 %	0 %	25 %	75 %	523408377
4238	NC_017559	GCG	2	6	162926	162931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
4239	NC_017559	CG	3	6	162930	162935	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4240	NC_017559	AGA	2	6	162956	162961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408377
4241	NC_017559	GGC	2	6	162970	162975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
4242	NC_017559	GGC	3	9	162993	163001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
4243	NC_017559	GCT	2	6	163014	163019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4244	NC_017559	GC	4	8	163070	163077	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4245	NC_017559	GTC	2	6	163096	163101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4246	NC_017559	CCGG	2	8	163115	163122	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4247	NC_017559	CCG	2	6	163148	163153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408377
4248	NC_017559	GTT	2	6	163167	163172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408377
4249	NC_017559	GTT	2	6	163209	163214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408377
4250	NC_017559	GAT	2	6	163215	163220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408377
4251	NC_017559	TTG	2	6	163225	163230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408377
4252	NC_017559	GTT	2	6	163239	163244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408377
4253	NC_017559	ACC	3	9	163246	163254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408377
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4255	NC_017559	CGC	2	6	163379	163384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408377
4256	NC_017559	CACCGC	2	12	163385	163396	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	523408377
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4258	NC_017559	CAC	2	6	163462	163467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408377
4259	NC_017559	TCG	2	6	163525	163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4260	NC_017559	CGGCA	2	10	163596	163605	20 %	0 %	40 %	40 %	523408377
4261	NC_017559	CACCG	2	10	163617	163626	20 %	0 %	20 %	60 %	523408377
4262	NC_017559	GC	3	6	163698	163703	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4263	NC_017559	CG	3	6	163730	163735	0 %	0 %	50 %	50 %	523408377
4264	NC_017559	GCC	2	6	163803	163808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408377
4265	NC_017559	CTG	2	6	163818	163823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
4266	NC_017559	CGG	2	6	163826	163831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
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4274	NC_017559	GTG	2	6	164044	164049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408377
4275	NC_017559	GTC	2	6	164052	164057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408377
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4280	NC_017559	CGG	2	6	164270	164275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408377
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4283	NC_017559	GA	3	6	164356	164361	50 %	0 %	50 %	0 %	523408377
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4287	NC_017559	TTA	2	6	164436	164441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4288	NC_017559	GCG	2	6	164448	164453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4289	NC_017559	TCG	2	6	164490	164495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4290	NC_017559	GCG	2	6	164500	164505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4291	NC_017559	GGA	2	6	164515	164520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_017559	A	8	8	164570	164577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4293	NC_017559	CG	3	6	164578	164583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4294	NC_017559	G	6	6	164588	164593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4295	NC_017559	CGC	2	6	164594	164599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4296	NC_017559	AGG	2	6	164635	164640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4297	NC_017559	CAA	2	6	164716	164721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4298	NC_017559	C	6	6	164768	164773	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4299	NC_017559	CG	3	6	164882	164887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4300	NC_017559	GAG	2	6	164974	164979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4301	NC_017559	ATGC	2	8	164981	164988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4302	NC_017559	GC	3	6	165010	165015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4303	NC_017559	GAT	2	6	165056	165061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408378
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4349	NC_017559	CTC	2	6	166650	166655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4352	NC_017559	GACCT	2	10	166828	166837	20 %	20 %	20 %	40 %	523408380
4353	NC_017559	CTG	2	6	166903	166908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408380
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4355	NC_017559	CG	3	6	166944	166949	0 %	0 %	50 %	50 %	523408380
4356	NC_017559	CAC	2	6	166950	166955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408380
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4361	NC_017559	CGA	2	6	167055	167060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408380
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4363	NC_017559	GCGG	2	8	167146	167153	0 %	0 %	75 %	25 %	523408380
4364	NC_017559	GGC	2	6	167160	167165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408380
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4491	NC_017559	TGC	2	6	172284	172289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408385
4492	NC_017559	GC	3	6	172297	172302	0 %	0 %	50 %	50 %	523408385
4493	NC_017559	CGAGAT	2	12	172333	172344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	523408385
4494	NC_017559	ACC	2	6	172424	172429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408385
4495	NC_017559	GAA	2	6	172435	172440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408385
4496	NC_017559	CCG	2	6	172443	172448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408385
4497	NC_017559	GCC	2	6	172451	172456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408385
4498	NC_017559	GGC	2	6	172492	172497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408385
4499	NC_017559	GCG	3	9	172503	172511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408385
4500	NC_017559	GGT	2	6	172513	172518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408385

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