MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017559	GCG	2	6	136216	136221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408349
3502	NC_017559	TCG	2	6	136231	136236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408349
3503	NC_017559	GC	3	6	136267	136272	0 %	0 %	50 %	50 %	523408349
3504	NC_017559	GCCGA	2	10	136332	136341	20 %	0 %	40 %	40 %	523408349
3505	NC_017559	GCG	2	6	136345	136350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408349
3506	NC_017559	TGGC	2	8	136374	136381	0 %	25 %	50 %	25 %	523408349
3507	NC_017559	AAAAC	2	10	136413	136422	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3508	NC_017559	AGCA	2	8	136430	136437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_017559	CAT	3	9	136461	136469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408350
3510	NC_017559	CGG	2	6	136481	136486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3511	NC_017559	TGC	3	9	136532	136540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3512	NC_017559	CGG	2	6	136548	136553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3513	NC_017559	GAC	2	6	136558	136563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3514	NC_017559	CGCA	2	8	136633	136640	25 %	0 %	25 %	50 %	523408350
3515	NC_017559	CG	3	6	136679	136684	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3516	NC_017559	GCT	2	6	136700	136705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3517	NC_017559	GAT	2	6	136719	136724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408350
3518	NC_017559	ACG	2	6	136751	136756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3519	NC_017559	GCG	2	6	136762	136767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3520	NC_017559	TTC	2	6	136810	136815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408350
3521	NC_017559	CGG	2	6	136836	136841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3522	NC_017559	GGCAC	2	10	136853	136862	20 %	0 %	40 %	40 %	523408350
3523	NC_017559	CGG	2	6	136863	136868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3524	NC_017559	GGA	2	6	136956	136961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408350
3525	NC_017559	CGGC	2	8	137050	137057	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3526	NC_017559	CGGC	2	8	137118	137125	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3527	NC_017559	CGCGG	2	10	137146	137155	0 %	0 %	60 %	40 %	523408350
3528	NC_017559	CGG	2	6	137168	137173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3529	NC_017559	CG	4	8	137175	137182	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3530	NC_017559	AAG	2	6	137183	137188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408350
3531	NC_017559	CGG	2	6	137198	137203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3532	NC_017559	CGC	2	6	137216	137221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408350
3533	NC_017559	GCT	2	6	137223	137228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3534	NC_017559	ACC	2	6	137321	137326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408350
3535	NC_017559	CG	3	6	137375	137380	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3536	NC_017559	TGG	2	6	137389	137394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408350
3537	NC_017559	GTCG	2	8	137490	137497	0 %	25 %	50 %	25 %	523408350
3538	NC_017559	CG	3	6	137496	137501	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3539	NC_017559	CG	3	6	137609	137614	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3540	NC_017559	GACG	2	8	137679	137686	25 %	0 %	50 %	25 %	523408350
3541	NC_017559	CGC	3	9	137700	137708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408350
3542	NC_017559	CGC	2	6	137725	137730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408350
3543	NC_017559	CCGG	2	8	137760	137767	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3544	NC_017559	CGA	2	6	137799	137804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3545	NC_017559	GC	4	8	137812	137819	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3546	NC_017559	GAC	2	6	137881	137886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408350
3547	NC_017559	GGT	2	6	137895	137900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408350
3548	NC_017559	CAT	2	6	137997	138002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408350
3549	NC_017559	GAT	2	6	138024	138029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408350
3550	NC_017559	CG	3	6	138031	138036	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3551	NC_017559	GCG	2	6	138039	138044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408350
3552	NC_017559	CG	4	8	138049	138056	0 %	0 %	50 %	50 %	523408350
3553	NC_017559	ATGG	2	8	138117	138124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017559	GGGC	2	8	138167	138174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_017559	GGC	2	6	138200	138205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_017559	TGT	2	6	138244	138249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_017559	CAG	2	6	138256	138261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017559	ATC	2	6	138271	138276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_017559	TA	3	6	138280	138285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017559	AGA	2	6	138286	138291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017559	CGG	2	6	138292	138297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_017559	CAT	2	6	138325	138330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408351
3563	NC_017559	CG	3	6	138339	138344	0 %	0 %	50 %	50 %	523408351
3564	NC_017559	CCG	2	6	138372	138377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408351
3565	NC_017559	GCG	2	6	138400	138405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408351
3566	NC_017559	TCCA	2	8	138410	138417	25 %	25 %	0 %	50 %	523408351
3567	NC_017559	ACC	2	6	138449	138454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408351
3568	NC_017559	CTG	2	6	138464	138469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408351
3569	NC_017559	CG	3	6	138489	138494	0 %	0 %	50 %	50 %	523408351
3570	NC_017559	CGGC	2	8	138533	138540	0 %	0 %	50 %	50 %	523408351
3571	NC_017559	CG	3	6	138547	138552	0 %	0 %	50 %	50 %	523408351
3572	NC_017559	CCG	2	6	138582	138587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408351
3573	NC_017559	GCT	2	6	138709	138714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408351
3574	NC_017559	ACGGTG	2	12	138746	138757	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	523408351
3575	NC_017559	GC	4	8	138778	138785	0 %	0 %	50 %	50 %	523408351
3576	NC_017559	CCA	2	6	138795	138800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408351
3577	NC_017559	TGC	2	6	138825	138830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408351
3578	NC_017559	CGA	2	6	138832	138837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408351
3579	NC_017559	GTG	2	6	138941	138946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408351
3580	NC_017559	TGC	2	6	138972	138977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408351
3581	NC_017559	GAA	2	6	139021	139026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408351
3582	NC_017559	CCG	2	6	139056	139061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408351
3583	NC_017559	GCG	2	6	139064	139069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408351
3584	NC_017559	CGC	2	6	139085	139090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_017559	GCACG	2	10	139110	139119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3586	NC_017559	AC	3	6	139152	139157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_017559	GTC	2	6	139265	139270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3588	NC_017559	GCT	2	6	139273	139278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3589	NC_017559	CAC	3	9	139300	139308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408352
3590	NC_017559	GC	3	6	139312	139317	0 %	0 %	50 %	50 %	523408352
3591	NC_017559	CAT	2	6	139318	139323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408352
3592	NC_017559	TCG	2	6	139353	139358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3593	NC_017559	ACG	2	6	139362	139367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3594	NC_017559	GGCC	2	8	139369	139376	0 %	0 %	50 %	50 %	523408352
3595	NC_017559	GGA	2	6	139441	139446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408352
3596	NC_017559	GAG	2	6	139475	139480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408352
3597	NC_017559	CTG	3	9	139484	139492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3598	NC_017559	CCG	2	6	139493	139498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408352
3599	NC_017559	AGC	2	6	139620	139625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3600	NC_017559	CTG	3	9	139667	139675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3601	NC_017559	CGA	2	6	139678	139683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3602	NC_017559	AAG	2	6	139745	139750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408352
3603	NC_017559	GGT	2	6	139762	139767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408352
3604	NC_017559	TGG	2	6	139770	139775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408352
3605	NC_017559	TCG	2	6	139839	139844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3606	NC_017559	GGC	2	6	139855	139860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408352
3607	NC_017559	GCT	2	6	139894	139899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408352
3608	NC_017559	TCCG	2	8	139941	139948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_017559	GC	3	6	139949	139954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_017559	AAG	2	6	139984	139989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408353
3611	NC_017559	CTGG	2	8	139990	139997	0 %	25 %	50 %	25 %	523408353
3612	NC_017559	GGC	2	6	140007	140012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3613	NC_017559	GC	3	6	140036	140041	0 %	0 %	50 %	50 %	523408353
3614	NC_017559	TC	3	6	140088	140093	0 %	50 %	0 %	50 %	523408353
3615	NC_017559	GCG	2	6	140123	140128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3616	NC_017559	GCGG	2	8	140158	140165	0 %	0 %	75 %	25 %	523408353
3617	NC_017559	ACC	2	6	140204	140209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408353
3618	NC_017559	CGC	2	6	140226	140231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
3619	NC_017559	TGGA	2	8	140248	140255	25 %	25 %	50 %	0 %	523408353
3620	NC_017559	CAG	2	6	140257	140262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3621	NC_017559	TGC	2	6	140273	140278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3622	NC_017559	GGC	2	6	140281	140286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3623	NC_017559	GGC	2	6	140322	140327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3624	NC_017559	GAA	2	6	140331	140336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408353
3625	NC_017559	CATCGG	2	12	140346	140357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3626	NC_017559	GAG	2	6	140383	140388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408353
3627	NC_017559	GGT	2	6	140454	140459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408353
3628	NC_017559	GGC	2	6	140467	140472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3629	NC_017559	TTC	2	6	140482	140487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408353
3630	NC_017559	CCG	2	6	140492	140497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
3631	NC_017559	CCG	3	9	140531	140539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
3632	NC_017559	CGG	2	6	140553	140558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3633	NC_017559	GGT	2	6	140562	140567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408353
3634	NC_017559	TCG	2	6	140605	140610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3635	NC_017559	CTG	2	6	140614	140619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
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3637	NC_017559	GCG	2	6	140666	140671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3638	NC_017559	GGC	2	6	140691	140696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408353
3639	NC_017559	CTG	2	6	140737	140742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3640	NC_017559	TCA	2	6	140747	140752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408353
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3642	NC_017559	CCG	2	6	140780	140785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
3643	NC_017559	CTG	2	6	140791	140796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
3644	NC_017559	CGC	2	6	140844	140849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408353
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3648	NC_017559	CGGC	2	8	140939	140946	0 %	0 %	50 %	50 %	523408353
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3651	NC_017559	GAA	2	6	141084	141089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408353
3652	NC_017559	GCCG	2	8	141147	141154	0 %	0 %	50 %	50 %	523408353
3653	NC_017559	GCT	2	6	141168	141173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408353
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3656	NC_017559	GCG	2	6	141221	141226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
3657	NC_017559	CAGC	2	8	141292	141299	25 %	0 %	25 %	50 %	523408354
3658	NC_017559	TGC	2	6	141300	141305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
3659	NC_017559	GCT	2	6	141367	141372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
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3662	NC_017559	GCCGC	2	10	141476	141485	0 %	0 %	40 %	60 %	523408354
3663	NC_017559	GTG	2	6	141497	141502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3664	NC_017559	GTG	2	6	141506	141511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408354
3665	NC_017559	TGC	2	6	141525	141530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408354
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3673	NC_017559	GGC	2	6	141877	141882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408354
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3690	NC_017559	CTG	2	6	142301	142306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3691	NC_017559	GCT	2	6	142321	142326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3695	NC_017559	CGG	2	6	142431	142436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408355
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3703	NC_017559	GCT	2	6	142597	142602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3704	NC_017559	GTC	2	6	142618	142623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3707	NC_017559	CTG	2	6	142673	142678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
3708	NC_017559	CCAT	2	8	142689	142696	25 %	25 %	0 %	50 %	523408355
3709	NC_017559	CG	4	8	142740	142747	0 %	0 %	50 %	50 %	523408355
3710	NC_017559	ACCG	2	8	142766	142773	25 %	0 %	25 %	50 %	523408355
3711	NC_017559	GCT	2	6	142780	142785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408355
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3714	NC_017559	TGA	2	6	142899	142904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408355
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3720	NC_017559	T	6	6	143152	143157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3721	NC_017559	AGATG	2	10	143160	143169	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3722	NC_017559	TGC	2	6	143229	143234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3723	NC_017559	AAT	2	6	143278	143283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3724	NC_017559	GAG	2	6	143295	143300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3725	NC_017559	CA	3	6	143308	143313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3726	NC_017559	TGG	2	6	143383	143388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3727	NC_017559	CCGT	2	8	143400	143407	0 %	25 %	25 %	50 %	523408356
3728	NC_017559	GCC	2	6	143417	143422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408356
3729	NC_017559	GGCCC	2	10	143428	143437	0 %	0 %	40 %	60 %	523408356
3730	NC_017559	GC	3	6	143469	143474	0 %	0 %	50 %	50 %	523408356
3731	NC_017559	CCA	2	6	143478	143483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408356
3732	NC_017559	TCC	2	6	143501	143506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408356
3733	NC_017559	GCA	2	6	143586	143591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408356
3734	NC_017559	CTC	2	6	143633	143638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3735	NC_017559	GCC	2	6	143747	143752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408357
3736	NC_017559	CGCC	2	8	143783	143790	0 %	0 %	25 %	75 %	523408357
3737	NC_017559	GCCGC	2	10	143820	143829	0 %	0 %	40 %	60 %	523408357
3738	NC_017559	GCT	2	6	143855	143860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408357
3739	NC_017559	CTG	2	6	143886	143891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408357
3740	NC_017559	GAG	2	6	143895	143900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408357
3741	NC_017559	TGG	2	6	143911	143916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408357
3742	NC_017559	GGGC	2	8	143954	143961	0 %	0 %	75 %	25 %	523408357
3743	NC_017559	TGG	2	6	143962	143967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408357
3744	NC_017559	GCCG	2	8	143975	143982	0 %	0 %	50 %	50 %	523408357
3745	NC_017559	CGG	3	9	143996	144004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408357
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3991	NC_017559	CGC	2	6	153831	153836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408367
3992	NC_017559	CAG	2	6	153867	153872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3993	NC_017559	CGA	2	6	153876	153881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3994	NC_017559	CGA	2	6	153921	153926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408367
3995	NC_017559	TGCG	2	8	154035	154042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_017559	GTG	2	6	154071	154076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_017559	GGGT	2	8	154113	154120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3998	NC_017559	GCA	3	9	154132	154140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_017559	GC	3	6	154148	154153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4000	NC_017559	GAACG	2	10	154157	154166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

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