MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017559	TCT	4	12	118586	118597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408331
3002	NC_017559	CAG	2	6	118602	118607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408331
3003	NC_017559	GCC	2	6	118641	118646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408332
3004	NC_017559	GGC	3	9	118737	118745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408332
3005	NC_017559	GCA	2	6	118796	118801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3006	NC_017559	AGC	2	6	118912	118917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3007	NC_017559	GGCGC	2	10	118950	118959	0 %	0 %	60 %	40 %	523408332
3008	NC_017559	GAC	2	6	118966	118971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3009	NC_017559	CGA	2	6	119004	119009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3010	NC_017559	ACG	2	6	119026	119031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3011	NC_017559	TCG	2	6	119038	119043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408332
3012	NC_017559	CCGG	2	8	119080	119087	0 %	0 %	50 %	50 %	523408332
3013	NC_017559	TGA	2	6	119132	119137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408332
3014	NC_017559	CG	3	6	119174	119179	0 %	0 %	50 %	50 %	523408332
3015	NC_017559	CTT	2	6	119214	119219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408332
3016	NC_017559	ATG	2	6	119302	119307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408332
3017	NC_017559	CGG	2	6	119345	119350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408332
3018	NC_017559	CGG	2	6	119375	119380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408332
3019	NC_017559	TGG	2	6	119393	119398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408332
3020	NC_017559	GAT	2	6	119436	119441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408332
3021	NC_017559	GCAC	2	8	119481	119488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_017559	AGA	2	6	119643	119648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408333
3023	NC_017559	GC	3	6	119650	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	523408333
3024	NC_017559	CGCC	2	8	119673	119680	0 %	0 %	25 %	75 %	523408333
3025	NC_017559	CGC	2	6	119772	119777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408333
3026	NC_017559	GC	3	6	119776	119781	0 %	0 %	50 %	50 %	523408333
3027	NC_017559	GAT	2	6	119815	119820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408333
3028	NC_017559	CGG	2	6	119854	119859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3029	NC_017559	GGC	2	6	119860	119865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3030	NC_017559	CGG	2	6	119877	119882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3031	NC_017559	CGC	2	6	119919	119924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408333
3032	NC_017559	CGG	2	6	119930	119935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3033	NC_017559	CAG	2	6	119947	119952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408333
3034	NC_017559	CCA	2	6	119997	120002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408333
3035	NC_017559	GGCGCG	2	12	120010	120021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3036	NC_017559	CCA	2	6	120039	120044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408333
3037	NC_017559	CGG	2	6	120069	120074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3038	NC_017559	GGC	2	6	120078	120083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3039	NC_017559	CGT	2	6	120102	120107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408333
3040	NC_017559	CGG	2	6	120150	120155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3041	NC_017559	GCG	2	6	120180	120185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3042	NC_017559	CAG	3	9	120187	120195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408333
3043	NC_017559	GCG	2	6	120228	120233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408333
3044	NC_017559	TCT	2	6	120237	120242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408333
3045	NC_017559	GTT	2	6	120285	120290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017559	T	6	6	120307	120312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017559	CG	3	6	120318	120323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_017559	C	6	6	120324	120329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3049	NC_017559	GC	3	6	120352	120357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_017559	CGC	2	6	120413	120418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_017559	CCG	2	6	120460	120465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_017559	TC	3	6	120467	120472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_017559	CA	3	6	120511	120516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_017559	A	7	7	120516	120522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017559	GTC	2	6	120557	120562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3056	NC_017559	GGC	2	6	120563	120568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3057	NC_017559	TGC	2	6	120571	120576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3058	NC_017559	GCC	2	6	120579	120584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3059	NC_017559	TGTCGC	2	12	120589	120600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3060	NC_017559	GCC	2	6	120603	120608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3061	NC_017559	GCA	2	6	120613	120618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3062	NC_017559	CGA	2	6	120620	120625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3063	NC_017559	CCGC	2	8	120627	120634	0 %	0 %	25 %	75 %	523408334
3064	NC_017559	CGCC	2	8	120646	120653	0 %	0 %	25 %	75 %	523408334
3065	NC_017559	ACC	2	6	120684	120689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408334
3066	NC_017559	ACT	2	6	120718	120723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408334
3067	NC_017559	GCC	2	6	120732	120737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3068	NC_017559	GCTC	2	8	120742	120749	0 %	25 %	25 %	50 %	523408334
3069	NC_017559	GC	3	6	120783	120788	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3070	NC_017559	GCT	3	9	120806	120814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3071	NC_017559	TGA	2	6	120910	120915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408334
3072	NC_017559	CGC	2	6	120917	120922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3073	NC_017559	ACG	2	6	120928	120933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3074	NC_017559	GCG	2	6	120934	120939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3075	NC_017559	CAG	2	6	121032	121037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3076	NC_017559	TGA	2	6	121081	121086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408334
3077	NC_017559	GC	3	6	121099	121104	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3078	NC_017559	GCA	2	6	121162	121167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3079	NC_017559	GC	3	6	121174	121179	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3080	NC_017559	CAT	2	6	121193	121198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408334
3081	NC_017559	AGG	2	6	121273	121278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408334
3082	NC_017559	GCA	2	6	121283	121288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3083	NC_017559	GC	4	8	121304	121311	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3084	NC_017559	GTG	2	6	121323	121328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408334
3085	NC_017559	CGG	2	6	121343	121348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3086	NC_017559	CGA	2	6	121372	121377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3087	NC_017559	TGG	2	6	121392	121397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408334
3088	NC_017559	ACT	2	6	121546	121551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408334
3089	NC_017559	ACG	2	6	121591	121596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3090	NC_017559	CA	3	6	121598	121603	50 %	0 %	0 %	50 %	523408334
3091	NC_017559	GGTC	2	8	121606	121613	0 %	25 %	50 %	25 %	523408334
3092	NC_017559	GCC	2	6	121674	121679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3093	NC_017559	CGC	2	6	121703	121708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3094	NC_017559	GCA	2	6	121750	121755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3095	NC_017559	TTC	2	6	121776	121781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408334
3096	NC_017559	CAGGCG	2	12	121821	121832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	523408334
3097	NC_017559	GC	3	6	121900	121905	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3098	NC_017559	CGG	3	9	121922	121930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3099	NC_017559	CGGC	2	8	121951	121958	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3100	NC_017559	CAA	2	6	121970	121975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408334
3101	NC_017559	CGG	2	6	121978	121983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3102	NC_017559	ACCTGT	2	12	121984	121995	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	523408334
3103	NC_017559	CTGG	2	8	122045	122052	0 %	25 %	50 %	25 %	523408334
3104	NC_017559	CGACC	2	10	122081	122090	20 %	0 %	20 %	60 %	523408334
3105	NC_017559	TCG	2	6	122110	122115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3106	NC_017559	CAC	2	6	122147	122152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408334
3107	NC_017559	TCG	2	6	122254	122259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3108	NC_017559	CCA	2	6	122260	122265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408334
3109	NC_017559	GCG	3	9	122281	122289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3110	NC_017559	GCA	2	6	122311	122316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408334
3111	NC_017559	AAG	2	6	122370	122375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408334
3112	NC_017559	CG	4	8	122389	122396	0 %	0 %	50 %	50 %	523408334
3113	NC_017559	CGCAG	2	10	122407	122416	20 %	0 %	40 %	40 %	523408334
3114	NC_017559	CCG	2	6	122494	122499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408334
3115	NC_017559	CGG	2	6	122527	122532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408334
3116	NC_017559	TTCGT	2	10	122605	122614	0 %	60 %	20 %	20 %	523408335
3117	NC_017559	GCCG	2	8	122632	122639	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3118	NC_017559	GC	3	6	122651	122656	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3119	NC_017559	GCT	2	6	122674	122679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408335
3120	NC_017559	GCT	2	6	122687	122692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408335
3121	NC_017559	GGCT	2	8	122720	122727	0 %	25 %	50 %	25 %	523408335
3122	NC_017559	GC	4	8	122733	122740	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3123	NC_017559	GC	3	6	122779	122784	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3124	NC_017559	CG	4	8	122836	122843	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3125	NC_017559	GCT	2	6	122881	122886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408335
3126	NC_017559	GCTG	2	8	122925	122932	0 %	25 %	50 %	25 %	523408335
3127	NC_017559	GCC	2	6	122936	122941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408335
3128	NC_017559	GCCG	2	8	122947	122954	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3129	NC_017559	GC	3	6	122958	122963	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3130	NC_017559	CG	3	6	122971	122976	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3131	NC_017559	GCT	3	9	123001	123009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408335
3132	NC_017559	CGG	2	6	123016	123021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408335
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3134	NC_017559	CG	4	8	123039	123046	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3135	NC_017559	GCC	2	6	123065	123070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408335
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3139	NC_017559	CGACGG	2	12	123226	123237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	523408335
3140	NC_017559	CG	3	6	123243	123248	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3141	NC_017559	GCGCTG	2	12	123260	123271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408335
3142	NC_017559	GCC	2	6	123281	123286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408335
3143	NC_017559	CG	4	8	123352	123359	0 %	0 %	50 %	50 %	523408335
3144	NC_017559	GCC	2	6	123365	123370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408335
3145	NC_017559	CGCA	2	8	123396	123403	25 %	0 %	25 %	50 %	523408335
3146	NC_017559	GATC	2	8	123456	123463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3147	NC_017559	CCA	2	6	123571	123576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408336
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3149	NC_017559	GC	3	6	123665	123670	0 %	0 %	50 %	50 %	523408336
3150	NC_017559	CGC	2	6	123673	123678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408336
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3152	NC_017559	GTC	2	6	123761	123766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408336
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3158	NC_017559	GCCG	2	8	123958	123965	0 %	0 %	50 %	50 %	523408336
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3162	NC_017559	GCG	2	6	124174	124179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408336
3163	NC_017559	CGG	2	6	124186	124191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408336
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3170	NC_017559	GCC	2	6	124517	124522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3171	NC_017559	CATG	2	8	124615	124622	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3172	NC_017559	GCG	2	6	124646	124651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3173	NC_017559	TAC	2	6	124656	124661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3175	NC_017559	CTG	2	6	124807	124812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408337
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3182	NC_017559	GGCC	2	8	125079	125086	0 %	0 %	50 %	50 %	523408337
3183	NC_017559	GCT	2	6	125142	125147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408337
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3198	NC_017559	GCG	2	6	125672	125677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3199	NC_017559	CGT	2	6	125691	125696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3202	NC_017559	CGT	2	6	125756	125761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3215	NC_017559	TAG	4	12	126366	126377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3218	NC_017559	CCGT	2	8	126467	126474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3219	NC_017559	GTT	2	6	126521	126526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_017559	GACAG	2	10	126538	126547	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3221	NC_017559	TGG	2	6	126610	126615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_017559	CG	3	6	126627	126632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3223	NC_017559	GAC	2	6	126643	126648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3224	NC_017559	TCC	2	6	126710	126715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3225	NC_017559	CCCG	2	8	126774	126781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3226	NC_017559	CGTG	2	8	126816	126823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3227	NC_017559	GGC	2	6	126858	126863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3228	NC_017559	AAG	2	6	126877	126882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3229	NC_017559	ATC	2	6	126883	126888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3230	NC_017559	GGAA	2	8	126914	126921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_017559	GAC	2	6	126949	126954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3232	NC_017559	CGG	2	6	127011	127016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3233	NC_017559	CG	4	8	127021	127028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3234	NC_017559	GC	3	6	127063	127068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3235	NC_017559	GAG	2	6	127120	127125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_017559	GCG	2	6	127199	127204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3237	NC_017559	GAA	2	6	127206	127211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_017559	CGC	2	6	127232	127237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3239	NC_017559	GAA	2	6	127242	127247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_017559	AAG	2	6	127252	127257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_017559	AGG	2	6	127319	127324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_017559	GCG	2	6	127345	127350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_017559	GCC	2	6	127400	127405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408339
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3246	NC_017559	TG	3	6	127455	127460	0 %	50 %	50 %	0 %	523408339
3247	NC_017559	TGA	2	6	127494	127499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408339
3248	NC_017559	AAC	2	6	127530	127535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408339
3249	NC_017559	GCGG	2	8	127549	127556	0 %	0 %	75 %	25 %	523408339
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3251	NC_017559	CG	3	6	127626	127631	0 %	0 %	50 %	50 %	523408340
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3376	NC_017559	GCTC	2	8	132112	132119	0 %	25 %	25 %	50 %	523408345
3377	NC_017559	GGT	2	6	132125	132130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408345
3378	NC_017559	CGAAG	2	10	132254	132263	40 %	0 %	40 %	20 %	523408345
3379	NC_017559	GTCG	2	8	132293	132300	0 %	25 %	50 %	25 %	523408345
3380	NC_017559	A	8	8	132329	132336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3381	NC_017559	ACG	2	6	132345	132350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3382	NC_017559	T	8	8	132358	132365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3383	NC_017559	CGC	2	6	132444	132449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408346
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3390	NC_017559	GCC	2	6	132735	132740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408347
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3462	NC_017559	GTG	2	6	134817	134822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408347
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3480	NC_017559	CG	3	6	135289	135294	0 %	0 %	50 %	50 %	523408348
3481	NC_017559	CGA	2	6	135355	135360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408348
3482	NC_017559	CTG	2	6	135409	135414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408348
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3484	NC_017559	CAGCG	2	10	135477	135486	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3485	NC_017559	GAG	2	6	135522	135527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3486	NC_017559	GCATG	2	10	135665	135674	20 %	20 %	40 %	20 %	523408349
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3491	NC_017559	TCG	2	6	135898	135903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408349
3492	NC_017559	CG	3	6	135902	135907	0 %	0 %	50 %	50 %	523408349
3493	NC_017559	CG	4	8	135917	135924	0 %	0 %	50 %	50 %	523408349
3494	NC_017559	GCG	2	6	135937	135942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408349
3495	NC_017559	TGC	2	6	135943	135948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408349
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3499	NC_017559	GCA	2	6	136169	136174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408349
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