MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017559	ATC	2	6	480636	480641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408668
13002	NC_017559	CCTG	2	8	480643	480650	0 %	25 %	25 %	50 %	523408668
13003	NC_017559	GGT	2	6	480668	480673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408668
13004	NC_017559	TCG	2	6	480688	480693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408668
13005	NC_017559	CG	3	6	480725	480730	0 %	0 %	50 %	50 %	523408668
13006	NC_017559	ACG	2	6	480736	480741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408668
13007	NC_017559	CAT	2	6	480812	480817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408668
13008	NC_017559	CGG	3	9	480857	480865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408668
13009	NC_017559	GC	4	8	480869	480876	0 %	0 %	50 %	50 %	523408668
13010	NC_017559	GCT	2	6	480893	480898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408668
13011	NC_017559	GC	3	6	480982	480987	0 %	0 %	50 %	50 %	523408668
13012	NC_017559	GTG	2	6	480996	481001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408668
13013	NC_017559	AAG	2	6	481014	481019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408668
13014	NC_017559	GCC	2	6	481037	481042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408668
13015	NC_017559	CACG	2	8	481058	481065	25 %	0 %	25 %	50 %	523408668
13016	NC_017559	GGCGC	3	15	481115	481129	0 %	0 %	60 %	40 %	523408668
13017	NC_017559	CTG	2	6	481140	481145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408668
13018	NC_017559	CG	4	8	481195	481202	0 %	0 %	50 %	50 %	523408668
13019	NC_017559	TGCCG	2	10	481211	481220	0 %	20 %	40 %	40 %	523408668
13020	NC_017559	CGGG	2	8	481237	481244	0 %	0 %	75 %	25 %	523408668
13021	NC_017559	GCA	2	6	481256	481261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408668
13022	NC_017559	CGC	2	6	481304	481309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408668
13023	NC_017559	AC	3	6	481331	481336	50 %	0 %	0 %	50 %	523408668
13024	NC_017559	CAA	2	6	481365	481370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408668
13025	NC_017559	CAA	2	6	481411	481416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408669
13026	NC_017559	GCA	2	6	481467	481472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408669
13027	NC_017559	AGA	2	6	481515	481520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408669
13028	NC_017559	TCGCGC	2	12	481550	481561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523408669
13029	NC_017559	GAG	2	6	481583	481588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408669
13030	NC_017559	CAG	2	6	481601	481606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408669
13031	NC_017559	CGG	2	6	481666	481671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408669
13032	NC_017559	GCC	2	6	481689	481694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408669
13033	NC_017559	CTT	2	6	481702	481707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408669
13034	NC_017559	GAA	2	6	481730	481735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408669
13035	NC_017559	GAC	2	6	481775	481780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408669
13036	NC_017559	GCC	2	6	481825	481830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408670
13037	NC_017559	CGG	2	6	481865	481870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408670
13038	NC_017559	CGCC	2	8	481892	481899	0 %	0 %	25 %	75 %	523408670
13039	NC_017559	CGA	2	6	481913	481918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408670
13040	NC_017559	AAG	2	6	481929	481934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408670
13041	NC_017559	GCC	2	6	481965	481970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408670
13042	NC_017559	CGC	2	6	481982	481987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408670
13043	NC_017559	CGA	2	6	481997	482002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408670
13044	NC_017559	GC	3	6	482004	482009	0 %	0 %	50 %	50 %	523408670
13045	NC_017559	GTC	2	6	482016	482021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408670
13046	NC_017559	TGC	2	6	482056	482061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408670
13047	NC_017559	CGA	2	6	482084	482089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408670
13048	NC_017559	GC	3	6	482106	482111	0 %	0 %	50 %	50 %	523408670
13049	NC_017559	GGA	2	6	482132	482137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408670
13050	NC_017559	CG	3	6	482161	482166	0 %	0 %	50 %	50 %	523408670
13051	NC_017559	TGAC	2	8	482193	482200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_017559	CGG	2	6	482202	482207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_017559	AGG	2	6	482220	482225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017559	GACG	2	8	482259	482266	25 %	0 %	50 %	25 %	523408671
13055	NC_017559	GCG	2	6	482289	482294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408671
13056	NC_017559	CGG	2	6	482340	482345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408671
13057	NC_017559	CAT	2	6	482364	482369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408671
13058	NC_017559	CGA	2	6	482388	482393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408671
13059	NC_017559	CGTT	2	8	482437	482444	0 %	50 %	25 %	25 %	523408671
13060	NC_017559	TGG	2	6	482446	482451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408671
13061	NC_017559	TGC	2	6	482477	482482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408671
13062	NC_017559	GCTG	2	8	482558	482565	0 %	25 %	50 %	25 %	523408671
13063	NC_017559	GCC	2	6	482618	482623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13064	NC_017559	GCG	2	6	482630	482635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_017559	TGC	2	6	482700	482705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408672
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13067	NC_017559	ATG	2	6	482714	482719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408672
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13069	NC_017559	AAGG	2	8	482783	482790	50 %	0 %	50 %	0 %	523408672
13070	NC_017559	GCCG	2	8	482815	482822	0 %	0 %	50 %	50 %	523408672
13071	NC_017559	GCA	2	6	482827	482832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408672
13072	NC_017559	GCA	2	6	482836	482841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408672
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13077	NC_017559	CAAG	2	8	482911	482918	50 %	0 %	25 %	25 %	523408672
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13079	NC_017559	GTC	2	6	482996	483001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408673
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13081	NC_017559	CG	3	6	483056	483061	0 %	0 %	50 %	50 %	523408673
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13084	NC_017559	CG	3	6	483151	483156	0 %	0 %	50 %	50 %	523408673
13085	NC_017559	CCA	2	6	483175	483180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408673
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13090	NC_017559	TCG	2	6	483423	483428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408673
13091	NC_017559	CG	3	6	483438	483443	0 %	0 %	50 %	50 %	523408673
13092	NC_017559	TCTT	2	8	483449	483456	0 %	75 %	0 %	25 %	523408673
13093	NC_017559	GAAT	2	8	483458	483465	50 %	25 %	25 %	0 %	523408673
13094	NC_017559	TCG	2	6	483468	483473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_017559	GCC	2	6	483478	483483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_017559	GCG	2	6	483487	483492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_017559	TGC	2	6	483632	483637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408674
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13100	NC_017559	TGG	2	6	483881	483886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408674
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13102	NC_017559	GCG	2	6	483911	483916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408674
13103	NC_017559	CGC	2	6	483977	483982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408674
13104	NC_017559	CGAC	2	8	483998	484005	25 %	0 %	25 %	50 %	523408674
13105	NC_017559	ACC	2	6	484033	484038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408674
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13108	NC_017559	CGT	2	6	484170	484175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408674
13109	NC_017559	CGC	2	6	484178	484183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408674
13110	NC_017559	GATGT	2	10	484186	484195	20 %	40 %	40 %	0 %	523408674
13111	NC_017559	CTG	3	9	484201	484209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408674
13112	NC_017559	TGT	2	6	484226	484231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408674
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13114	NC_017559	CGT	2	6	484349	484354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_017559	AAAAG	2	10	484357	484366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_017559	T	6	6	484382	484387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_017559	CG	3	6	484433	484438	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13118	NC_017559	TCGCCG	2	12	484456	484467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	523408675
13119	NC_017559	GC	3	6	484486	484491	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13120	NC_017559	GCCG	2	8	484500	484507	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13121	NC_017559	CGC	2	6	484658	484663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408675
13122	NC_017559	GC	3	6	484662	484667	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13123	NC_017559	GCC	2	6	484686	484691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408675
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13125	NC_017559	GTT	2	6	484752	484757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408675
13126	NC_017559	CGG	2	6	484772	484777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408675
13127	NC_017559	GC	3	6	484793	484798	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13128	NC_017559	AGC	2	6	484846	484851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408675
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13130	NC_017559	CGTG	2	8	484889	484896	0 %	25 %	50 %	25 %	523408675
13131	NC_017559	CAG	2	6	484995	485000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408675
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13133	NC_017559	GC	3	6	485024	485029	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13134	NC_017559	GCT	3	9	485045	485053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408675
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13140	NC_017559	GC	3	6	485241	485246	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13141	NC_017559	CGGC	2	8	485249	485256	0 %	0 %	50 %	50 %	523408675
13142	NC_017559	CGG	2	6	485267	485272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408675
13143	NC_017559	CGT	2	6	485273	485278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408675
13144	NC_017559	GCT	2	6	485313	485318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408675
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13150	NC_017559	GTT	2	6	485436	485441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408675
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13152	NC_017559	CAGCG	2	10	485551	485560	20 %	0 %	40 %	40 %	523408676
13153	NC_017559	GCC	2	6	485575	485580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408676
13154	NC_017559	CAG	2	6	485629	485634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408676
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13157	NC_017559	GC	3	6	485741	485746	0 %	0 %	50 %	50 %	523408676
13158	NC_017559	CCGA	2	8	485753	485760	25 %	0 %	25 %	50 %	523408676
13159	NC_017559	GCGG	2	8	485761	485768	0 %	0 %	75 %	25 %	523408676
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13162	NC_017559	CAC	2	6	485836	485841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408676
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13190	NC_017559	GAT	4	12	486772	486783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408676
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13194	NC_017559	ATC	2	6	486914	486919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408676
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13197	NC_017559	GCC	2	6	486982	486987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408676
13198	NC_017559	GAA	2	6	487111	487116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408676
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13200	NC_017559	GCG	2	6	487155	487160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408676
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13203	NC_017559	GCG	2	6	487256	487261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408676
13204	NC_017559	CCCG	2	8	487311	487318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13205	NC_017559	GAG	2	6	487352	487357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13210	NC_017559	CGG	3	9	487497	487505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408677
13211	NC_017559	CGT	2	6	487521	487526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408677
13212	NC_017559	TTG	2	6	487550	487555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408677
13213	NC_017559	TGC	2	6	487619	487624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408677
13214	NC_017559	ATC	2	6	487637	487642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408677
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13223	NC_017559	GCA	2	6	487800	487805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408677
13224	NC_017559	TGA	2	6	487827	487832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408677
13225	NC_017559	GCG	2	6	487845	487850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408677
13226	NC_017559	CAT	2	6	487873	487878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408677
13227	NC_017559	CGG	2	6	487887	487892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408677
13228	NC_017559	GGT	2	6	487909	487914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408677
13229	NC_017559	GGCT	2	8	487937	487944	0 %	25 %	50 %	25 %	523408677
13230	NC_017559	GCGT	2	8	487967	487974	0 %	25 %	50 %	25 %	523408677
13231	NC_017559	TTG	2	6	488006	488011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408677
13232	NC_017559	CGGC	2	8	488022	488029	0 %	0 %	50 %	50 %	523408677
13233	NC_017559	CGT	2	6	488035	488040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408677
13234	NC_017559	AGGCC	2	10	488046	488055	20 %	0 %	40 %	40 %	523408677
13235	NC_017559	CGA	2	6	488146	488151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408677
13236	NC_017559	CAT	2	6	488158	488163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408677
13237	NC_017559	GCC	2	6	488176	488181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408677
13238	NC_017559	GGC	2	6	488182	488187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408677
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13482	NC_017559	GCT	2	6	497419	497424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13483	NC_017559	TGA	2	6	497463	497468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408686
13484	NC_017559	CGC	2	6	497494	497499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408686
13485	NC_017559	TCA	2	6	497532	497537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408686
13486	NC_017559	GCTG	2	8	497556	497563	0 %	25 %	50 %	25 %	523408686
13487	NC_017559	TTC	2	6	497597	497602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408686
13488	NC_017559	CTG	2	6	497729	497734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13489	NC_017559	GC	3	6	497760	497765	0 %	0 %	50 %	50 %	523408686
13490	NC_017559	GACGC	2	10	497849	497858	20 %	0 %	40 %	40 %	523408686
13491	NC_017559	CTT	2	6	497866	497871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408686
13492	NC_017559	TGC	2	6	497901	497906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13493	NC_017559	TGG	3	9	497913	497921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408686
13494	NC_017559	CAT	2	6	497926	497931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408686
13495	NC_017559	AAC	2	6	497954	497959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408686
13496	NC_017559	AAG	2	6	497984	497989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408686
13497	NC_017559	TAC	2	6	498032	498037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408686
13498	NC_017559	GTTCCT	2	12	498067	498078	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	523408686
13499	NC_017559	GGC	2	6	498113	498118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408686
13500	NC_017559	CAA	2	6	498133	498138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408686

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