MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017559	GCA	2	6	22243	22248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408251
502	NC_017559	CAA	2	6	22288	22293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408251
503	NC_017559	GAT	2	6	22331	22336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408251
504	NC_017559	CTT	2	6	22537	22542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408251
505	NC_017559	ACC	3	9	22587	22595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408251
506	NC_017559	ATG	2	6	22638	22643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408251
507	NC_017559	GGT	2	6	22747	22752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408251
508	NC_017559	GCC	2	6	22783	22788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408251
509	NC_017559	GC	3	6	22790	22795	0 %	0 %	50 %	50 %	523408251
510	NC_017559	CTT	2	6	22805	22810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408251
511	NC_017559	TGC	2	6	22818	22823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408251
512	NC_017559	TGA	2	6	22840	22845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408251
513	NC_017559	CCA	2	6	22977	22982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408251
514	NC_017559	GT	3	6	22995	23000	0 %	50 %	50 %	0 %	523408251
515	NC_017559	CAG	2	6	23012	23017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408251
516	NC_017559	CCA	2	6	23110	23115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408251
517	NC_017559	A	6	6	23249	23254	100 %	0 %	0 %	0 %	523408251
518	NC_017559	CCG	2	6	23311	23316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408251
519	NC_017559	CTG	2	6	23323	23328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408251
520	NC_017559	CGGT	2	8	23505	23512	0 %	25 %	50 %	25 %	523408251
521	NC_017559	GC	3	6	23553	23558	0 %	0 %	50 %	50 %	523408251
522	NC_017559	GC	3	6	23564	23569	0 %	0 %	50 %	50 %	523408251
523	NC_017559	CCG	2	6	23622	23627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408251
524	NC_017559	CTG	2	6	23678	23683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408251
525	NC_017559	CTT	2	6	23696	23701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408251
526	NC_017559	GC	3	6	23759	23764	0 %	0 %	50 %	50 %	523408251
527	NC_017559	GTT	2	6	23794	23799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408251
528	NC_017559	GC	3	6	23835	23840	0 %	0 %	50 %	50 %	523408251
529	NC_017559	GGT	2	6	24004	24009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408251
530	NC_017559	CTTGC	2	10	24012	24021	0 %	40 %	20 %	40 %	523408251
531	NC_017559	GAT	2	6	24026	24031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408251
532	NC_017559	CAG	3	9	24056	24064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408251
533	NC_017559	TCG	3	9	24081	24089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408251
534	NC_017559	GTT	2	6	24128	24133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408251
535	NC_017559	GCC	2	6	24135	24140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408251
536	NC_017559	ACGC	2	8	24158	24165	25 %	0 %	25 %	50 %	523408251
537	NC_017559	ACC	2	6	24213	24218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408251
538	NC_017559	TTG	2	6	24234	24239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408251
539	NC_017559	GCA	2	6	24244	24249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408251
540	NC_017559	GCCAC	2	10	24291	24300	20 %	0 %	20 %	60 %	523408251
541	NC_017559	GCCA	2	8	24312	24319	25 %	0 %	25 %	50 %	523408251
542	NC_017559	GGTG	2	8	24409	24416	0 %	25 %	75 %	0 %	523408251
543	NC_017559	TCT	2	6	24463	24468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408251
544	NC_017559	CTT	2	6	24492	24497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017559	ATA	2	6	24603	24608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017559	T	6	6	24609	24614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017559	CTA	2	6	24662	24667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017559	TTCT	2	8	24668	24675	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_017559	CTT	2	6	24680	24685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017559	TGC	2	6	24718	24723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017559	CCT	2	6	24821	24826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017559	CAA	2	6	24827	24832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017559	GTAG	2	8	24845	24852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017559	GAGC	2	8	24916	24923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_017559	CAAG	2	8	24926	24933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017559	TCA	2	6	25054	25059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017559	AGAA	2	8	25101	25108	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017559	CCGA	2	8	25218	25225	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_017559	CTGG	2	8	25257	25264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017559	GGT	2	6	25305	25310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017559	GTT	2	6	25331	25336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017559	TC	3	6	25364	25369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_017559	CTG	2	6	25374	25379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017559	GCGA	2	8	25503	25510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_017559	TGAT	2	8	25516	25523	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017559	CA	3	6	25684	25689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017559	GAA	2	6	25699	25704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017559	TCT	2	6	25715	25720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017559	GGT	2	6	25744	25749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017559	CCT	2	6	25757	25762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_017559	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017559	ATTC	2	8	25880	25887	25 %	50 %	0 %	25 %	523408252
573	NC_017559	CAGC	2	8	25916	25923	25 %	0 %	25 %	50 %	523408252
574	NC_017559	GC	3	6	25989	25994	0 %	0 %	50 %	50 %	523408252
575	NC_017559	CGT	2	6	26009	26014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
576	NC_017559	CAC	2	6	26037	26042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408252
577	NC_017559	GCA	2	6	26123	26128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
578	NC_017559	GAT	3	9	26169	26177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
579	NC_017559	CTTGTT	2	12	26202	26213	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	523408252
580	NC_017559	AC	3	6	26222	26227	50 %	0 %	0 %	50 %	523408252
581	NC_017559	GAT	2	6	26271	26276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
582	NC_017559	GCT	2	6	26297	26302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
583	NC_017559	GGC	2	6	26310	26315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408252
584	NC_017559	CAG	2	6	26328	26333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
585	NC_017559	CG	3	6	26459	26464	0 %	0 %	50 %	50 %	523408252
586	NC_017559	TTGT	2	8	26505	26512	0 %	75 %	25 %	0 %	523408252
587	NC_017559	CTT	2	6	26529	26534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408252
588	NC_017559	CCT	2	6	26540	26545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408252
589	NC_017559	CGG	2	6	26555	26560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408252
590	NC_017559	GCG	2	6	26570	26575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408252
591	NC_017559	CAC	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408252
592	NC_017559	CGC	2	6	26672	26677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408252
593	NC_017559	TGT	2	6	26696	26701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408252
594	NC_017559	CAG	2	6	26784	26789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
595	NC_017559	TGG	2	6	26815	26820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408252
596	NC_017559	GCC	2	6	26838	26843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408252
597	NC_017559	AGC	2	6	26890	26895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
598	NC_017559	CAC	2	6	26910	26915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408252
599	NC_017559	CGC	2	6	26936	26941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408252
600	NC_017559	CTT	2	6	26943	26948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408252
601	NC_017559	TCA	2	6	26956	26961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408252
602	NC_017559	TGA	2	6	26972	26977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
603	NC_017559	GCA	2	6	27053	27058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408252
604	NC_017559	ACA	2	6	27080	27085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408252
605	NC_017559	TGC	2	6	27121	27126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
606	NC_017559	GTG	2	6	27202	27207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408252
607	NC_017559	AGCC	2	8	27208	27215	25 %	0 %	25 %	50 %	523408252
608	NC_017559	CGG	2	6	27228	27233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408252
609	NC_017559	TTC	2	6	27315	27320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408252
610	NC_017559	TGA	2	6	27378	27383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408252
611	NC_017559	TCG	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408252
612	NC_017559	GCG	2	6	27650	27655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017559	GCT	2	6	27697	27702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017559	TC	3	6	27719	27724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017559	TCT	2	6	27788	27793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017559	TCT	2	6	27871	27876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408253
617	NC_017559	TCGG	2	8	27899	27906	0 %	25 %	50 %	25 %	523408253
618	NC_017559	GT	3	6	27919	27924	0 %	50 %	50 %	0 %	523408253
619	NC_017559	ACC	2	6	27968	27973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408253
620	NC_017559	GCA	2	6	27995	28000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408253
621	NC_017559	GT	3	6	28006	28011	0 %	50 %	50 %	0 %	523408253
622	NC_017559	CCGC	2	8	28027	28034	0 %	0 %	25 %	75 %	523408253
623	NC_017559	CAT	2	6	28035	28040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408253
624	NC_017559	GC	3	6	28102	28107	0 %	0 %	50 %	50 %	523408253
625	NC_017559	GCT	2	6	28151	28156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017559	A	8	8	28197	28204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017559	CGC	2	6	28208	28213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_017559	TCA	2	6	28230	28235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017559	TTC	2	6	28237	28242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017559	CCA	2	6	28262	28267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_017559	C	6	6	28271	28276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
632	NC_017559	T	6	6	28279	28284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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883	NC_017559	TGCA	2	8	41319	41326	25 %	25 %	25 %	25 %	523408267
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888	NC_017559	GCT	2	6	41524	41529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408267
889	NC_017559	TGC	2	6	41623	41628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408267
890	NC_017559	CGC	2	6	41659	41664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408267
891	NC_017559	GAA	2	6	41665	41670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408267
892	NC_017559	GCTG	2	8	41683	41690	0 %	25 %	50 %	25 %	523408267
893	NC_017559	CGGC	2	8	41709	41716	0 %	0 %	50 %	50 %	523408267
894	NC_017559	GA	3	6	41763	41768	50 %	0 %	50 %	0 %	523408267
895	NC_017559	GC	4	8	41859	41866	0 %	0 %	50 %	50 %	523408267
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901	NC_017559	CG	3	6	42108	42113	0 %	0 %	50 %	50 %	523408267
902	NC_017559	GCA	2	6	42135	42140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408267
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952	NC_017559	CTT	2	6	44685	44690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408268
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954	NC_017559	GC	3	6	44736	44741	0 %	0 %	50 %	50 %	523408268
955	NC_017559	GCC	2	6	44827	44832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408268
956	NC_017559	CAAG	2	8	44835	44842	50 %	0 %	25 %	25 %	523408268
957	NC_017559	TTG	2	6	44921	44926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408268
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999	NC_017559	GGA	2	6	46961	46966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408269
1000	NC_017559	GAC	2	6	46980	46985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408269

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