MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017559	TGC	2	6	189677	189682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408397
5002	NC_017559	CTT	2	6	189689	189694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017559	TGG	2	6	189752	189757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017559	TGG	2	6	189794	189799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017559	GC	3	6	189877	189882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_017559	CCT	2	6	189898	189903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_017559	GGGA	2	8	189918	189925	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017559	CT	3	6	189959	189964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_017559	TCC	2	6	189968	189973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017559	TGTT	2	8	190047	190054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017559	AC	3	6	190093	190098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_017559	A	6	6	190161	190166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017559	AGCGA	2	10	190183	190192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5014	NC_017559	CT	3	6	190201	190206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_017559	GC	3	6	190249	190254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_017559	CTTT	2	8	190255	190262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_017559	CTTT	2	8	190268	190275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_017559	AAAG	2	8	190284	190291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017559	CAC	2	6	190369	190374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017559	CCCCA	2	10	190379	190388	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5021	NC_017559	ACCA	2	8	190398	190405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017559	ACA	2	6	190417	190422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017559	CGA	2	6	190442	190447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408398
5024	NC_017559	C	7	7	190462	190468	0 %	0 %	0 %	100 %	523408398
5025	NC_017559	TGA	2	6	190523	190528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408398
5026	NC_017559	CGAG	2	8	190535	190542	25 %	0 %	50 %	25 %	523408398
5027	NC_017559	CGC	2	6	190559	190564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408398
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5029	NC_017559	CCG	2	6	190642	190647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408398
5030	NC_017559	CGG	2	6	190691	190696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408398
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5032	NC_017559	CGG	2	6	190730	190735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408398
5033	NC_017559	GC	3	6	190739	190744	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5034	NC_017559	CGG	2	6	190841	190846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408398
5035	NC_017559	CAG	2	6	190848	190853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408398
5036	NC_017559	GTA	2	6	190899	190904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408398
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5039	NC_017559	GAT	2	6	190920	190925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408398
5040	NC_017559	GCCG	2	8	190926	190933	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5041	NC_017559	TGG	2	6	190940	190945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408398
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5043	NC_017559	TTC	2	6	190977	190982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408398
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5046	NC_017559	CG	3	6	191135	191140	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5047	NC_017559	GC	3	6	191182	191187	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5048	NC_017559	CAG	2	6	191268	191273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408398
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5050	NC_017559	GC	3	6	191336	191341	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
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5054	NC_017559	GC	3	6	191379	191384	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5055	NC_017559	GCCG	2	8	191400	191407	0 %	0 %	50 %	50 %	523408398
5056	NC_017559	CGG	2	6	191458	191463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408398
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5058	NC_017559	CAG	2	6	191511	191516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408398
5059	NC_017559	CGC	2	6	191612	191617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408398
5060	NC_017559	CGAG	2	8	191648	191655	25 %	0 %	50 %	25 %	523408398
5061	NC_017559	GCGCG	2	10	191729	191738	0 %	0 %	60 %	40 %	523408398
5062	NC_017559	GCCGAT	2	12	191769	191780	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	523408398
5063	NC_017559	TGGG	2	8	191810	191817	0 %	25 %	75 %	0 %	523408398
5064	NC_017559	GTG	2	6	191829	191834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017559	GCC	2	6	191852	191857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_017559	GCC	2	6	191885	191890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_017559	GGC	2	6	191901	191906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_017559	CGG	2	6	192029	192034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408399
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5073	NC_017559	CGC	2	6	192196	192201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408399
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5077	NC_017559	ATC	2	6	192267	192272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408399
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5091	NC_017559	CCG	2	6	192807	192812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408399
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5096	NC_017559	TCG	2	6	192957	192962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408399
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5148	NC_017559	GC	3	6	194938	194943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5248	NC_017559	GCT	2	6	199277	199282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408403
5249	NC_017559	GCT	2	6	199286	199291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408403
5250	NC_017559	CGG	2	6	199295	199300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408403
5251	NC_017559	GC	4	8	199310	199317	0 %	0 %	50 %	50 %	523408403
5252	NC_017559	CGA	3	9	199337	199345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408403
5253	NC_017559	GGCGC	2	10	199363	199372	0 %	0 %	60 %	40 %	523408403
5254	NC_017559	GCT	2	6	199391	199396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408403
5255	NC_017559	TCA	2	6	199423	199428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408403
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5258	NC_017559	GCGAT	2	10	199540	199549	20 %	20 %	40 %	20 %	523408403
5259	NC_017559	GAG	2	6	199572	199577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408403
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5261	NC_017559	GCG	2	6	199625	199630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408403
5262	NC_017559	CG	3	6	199629	199634	0 %	0 %	50 %	50 %	523408403
5263	NC_017559	GCG	2	6	199700	199705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408403
5264	NC_017559	CTT	2	6	199742	199747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408403
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5272	NC_017559	CG	4	8	200015	200022	0 %	0 %	50 %	50 %	523408403
5273	NC_017559	GCCG	2	8	200024	200031	0 %	0 %	50 %	50 %	523408403
5274	NC_017559	GCT	2	6	200036	200041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408403
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5283	NC_017559	GGA	2	6	200375	200380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408403
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5285	NC_017559	CGA	2	6	200420	200425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408403
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5289	NC_017559	GC	5	10	200513	200522	0 %	0 %	50 %	50 %	523408403
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5296	NC_017559	GCCG	2	8	200914	200921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5297	NC_017559	CGG	2	6	200942	200947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5298	NC_017559	CGT	2	6	201099	201104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408404
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5335	NC_017559	ATCG	2	8	202379	202386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5336	NC_017559	GGA	2	6	202389	202394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5339	NC_017559	GGC	2	6	202438	202443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5340	NC_017559	TCT	2	6	202481	202486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5341	NC_017559	A	6	6	202684	202689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5342	NC_017559	GAG	2	6	202692	202697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5354	NC_017559	TGCT	2	8	203077	203084	0 %	50 %	25 %	25 %	523408406
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5362	NC_017559	GCGT	2	8	203283	203290	0 %	25 %	50 %	25 %	523408406
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5364	NC_017559	CG	3	6	203427	203432	0 %	0 %	50 %	50 %	523408407
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5369	NC_017559	CG	3	6	203580	203585	0 %	0 %	50 %	50 %	523408407
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5482	NC_017559	AG	3	6	207277	207282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5489	NC_017559	GCG	2	6	207505	207510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5490	NC_017559	AGG	2	6	207529	207534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_017559	AGCGA	2	10	207556	207565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5492	NC_017559	CCTCC	2	10	207571	207580	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5493	NC_017559	AGG	2	6	207601	207606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_017559	CGC	2	6	207611	207616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5495	NC_017559	GC	3	6	207622	207627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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