MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 plasmid pRSC35

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017558	GCAA	2	8	387	394	50 %	0 %	25 %	25 %	410683902
2	NC_017558	GCCG	2	8	641	648	0 %	0 %	50 %	50 %	410683902
3	NC_017558	GGCC	2	8	1444	1451	0 %	0 %	50 %	50 %	410683903
4	NC_017558	CACG	2	8	1941	1948	25 %	0 %	25 %	50 %	410683903
5	NC_017558	AAGC	2	8	2078	2085	50 %	0 %	25 %	25 %	410683903
6	NC_017558	CAGA	2	8	2189	2196	50 %	0 %	25 %	25 %	410683903
7	NC_017558	TTAT	2	8	2291	2298	25 %	75 %	0 %	0 %	410683904
8	NC_017558	AGCA	2	8	2453	2460	50 %	0 %	25 %	25 %	410683904
9	NC_017558	TCAA	2	8	3201	3208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017558	CGAA	2	8	3513	3520	50 %	0 %	25 %	25 %	410683906
11	NC_017558	GCCG	2	8	3941	3948	0 %	0 %	50 %	50 %	410683906
12	NC_017558	GCCG	2	8	4368	4375	0 %	0 %	50 %	50 %	410683907
13	NC_017558	CAGC	2	8	4919	4926	25 %	0 %	25 %	50 %	410683909
14	NC_017558	CGAG	2	8	5399	5406	25 %	0 %	50 %	25 %	410683909
15	NC_017558	GCAG	2	8	5478	5485	25 %	0 %	50 %	25 %	410683909
16	NC_017558	GCAA	2	8	5504	5511	50 %	0 %	25 %	25 %	410683909
17	NC_017558	GGCC	2	8	5619	5626	0 %	0 %	50 %	50 %	410683909
18	NC_017558	GCAA	2	8	5778	5785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017558	CCGG	2	8	5942	5949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017558	CGGT	2	8	6151	6158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017558	CCAC	2	8	6506	6513	25 %	0 %	0 %	75 %	410683910
22	NC_017558	CCGC	2	8	6561	6568	0 %	0 %	25 %	75 %	410683910
23	NC_017558	TGCC	2	8	6711	6718	0 %	25 %	25 %	50 %	410683910
24	NC_017558	CGAC	2	8	6761	6768	25 %	0 %	25 %	50 %	410683910
25	NC_017558	TTGC	2	8	6867	6874	0 %	50 %	25 %	25 %	410683910
26	NC_017558	GCCT	2	8	7233	7240	0 %	25 %	25 %	50 %	410683911
27	NC_017558	GCCG	2	8	7308	7315	0 %	0 %	50 %	50 %	410683911
28	NC_017558	CGTC	2	8	7561	7568	0 %	25 %	25 %	50 %	410683912
29	NC_017558	GGCC	2	8	7810	7817	0 %	0 %	50 %	50 %	410683912
30	NC_017558	TGCC	2	8	8365	8372	0 %	25 %	25 %	50 %	410683913
31	NC_017558	CGCA	2	8	8482	8489	25 %	0 %	25 %	50 %	410683913
32	NC_017558	TCTA	2	8	8930	8937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017558	ATCC	2	8	9014	9021	25 %	25 %	0 %	50 %	410683915
34	NC_017558	TGGC	2	8	9073	9080	0 %	25 %	50 %	25 %	410683915
35	NC_017558	GCCG	2	8	9323	9330	0 %	0 %	50 %	50 %	410683915
36	NC_017558	ACCG	2	8	9403	9410	25 %	0 %	25 %	50 %	410683916
37	NC_017558	CGGC	2	8	9547	9554	0 %	0 %	50 %	50 %	410683916
38	NC_017558	GGGA	2	8	9572	9579	25 %	0 %	75 %	0 %	410683916
39	NC_017558	GGCT	2	8	9647	9654	0 %	25 %	50 %	25 %	410683917
40	NC_017558	TCGT	2	8	10736	10743	0 %	50 %	25 %	25 %	410683917
41	NC_017558	GCCG	2	8	10744	10751	0 %	0 %	50 %	50 %	410683917
42	NC_017558	GCGA	2	8	10910	10917	25 %	0 %	50 %	25 %	410683917
43	NC_017558	CCGA	2	8	11388	11395	25 %	0 %	25 %	50 %	410683918
44	NC_017558	CGAA	2	8	11899	11906	50 %	0 %	25 %	25 %	410683918
45	NC_017558	GCCG	2	8	12191	12198	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
46	NC_017558	CAAG	2	8	12509	12516	50 %	0 %	25 %	25 %	410683918
47	NC_017558	GCCG	2	8	12527	12534	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
48	NC_017558	TCGC	2	8	13194	13201	0 %	25 %	25 %	50 %	410683918
49	NC_017558	CCGA	2	8	13233	13240	25 %	0 %	25 %	50 %	410683918
50	NC_017558	CGGC	2	8	13766	13773	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
51	NC_017558	GCCG	2	8	13985	13992	0 %	0 %	50 %	50 %	410683918
52	NC_017558	TGCG	2	8	14233	14240	0 %	25 %	50 %	25 %	410683919
53	NC_017558	GCCG	2	8	14523	14530	0 %	0 %	50 %	50 %	410683920
54	NC_017558	ACAA	2	8	15224	15231	75 %	0 %	0 %	25 %	410683921
55	NC_017558	GCCC	2	8	17490	17497	0 %	0 %	25 %	75 %	410683924
56	NC_017558	CGGT	2	8	18099	18106	0 %	25 %	50 %	25 %	410683925
57	NC_017558	CATC	2	8	18564	18571	25 %	25 %	0 %	50 %	410683927
58	NC_017558	CGGC	2	8	20298	20305	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
59	NC_017558	CGGC	2	8	20325	20332	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
60	NC_017558	GCCC	2	8	20444	20451	0 %	0 %	25 %	75 %	410683930
61	NC_017558	CCGG	2	8	20580	20587	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
62	NC_017558	GCCG	2	8	20871	20878	0 %	0 %	50 %	50 %	410683930
63	NC_017558	GTCG	2	8	21220	21227	0 %	25 %	50 %	25 %	410683931
64	NC_017558	GCCC	2	8	21406	21413	0 %	0 %	25 %	75 %	410683931
65	NC_017558	GCAG	2	8	21430	21437	25 %	0 %	50 %	25 %	410683931
66	NC_017558	GCCG	2	8	21548	21555	0 %	0 %	50 %	50 %	410683931
67	NC_017558	CTTG	2	8	21691	21698	0 %	50 %	25 %	25 %	410683931
68	NC_017558	CGGT	2	8	21873	21880	0 %	25 %	50 %	25 %	410683931
69	NC_017558	TGAA	2	8	22109	22116	50 %	25 %	25 %	0 %	410683932
70	NC_017558	ACGC	2	8	22198	22205	25 %	0 %	25 %	50 %	410683932
71	NC_017558	AGCC	2	8	22209	22216	25 %	0 %	25 %	50 %	410683932
72	NC_017558	CCGG	2	8	22488	22495	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
73	NC_017558	CGGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	50 %	50 %	410683932
74	NC_017558	GCAC	2	8	23404	23411	25 %	0 %	25 %	50 %	410683933
75	NC_017558	CGAG	2	8	24025	24032	25 %	0 %	50 %	25 %	410683933
76	NC_017558	AGCG	2	8	24101	24108	25 %	0 %	50 %	25 %	410683933
77	NC_017558	CGAG	2	8	24347	24354	25 %	0 %	50 %	25 %	410683934
78	NC_017558	TGAC	2	8	24632	24639	25 %	25 %	25 %	25 %	410683934
79	NC_017558	CACG	2	8	24922	24929	25 %	0 %	25 %	50 %	410683935
80	NC_017558	GGCC	2	8	25024	25031	0 %	0 %	50 %	50 %	410683935
81	NC_017558	GCCA	2	8	25382	25389	25 %	0 %	25 %	50 %	410683935
82	NC_017558	CGAG	2	8	26950	26957	25 %	0 %	50 %	25 %	410683938
83	NC_017558	CGGG	2	8	27225	27232	0 %	0 %	75 %	25 %	410683939
84	NC_017558	GCCG	2	8	27256	27263	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
85	NC_017558	GCCG	2	8	28269	28276	0 %	0 %	50 %	50 %	410683939
86	NC_017558	ACGA	2	8	28364	28371	50 %	0 %	25 %	25 %	410683939
87	NC_017558	AGCC	2	8	28524	28531	25 %	0 %	25 %	50 %	410683939
88	NC_017558	ACCT	2	8	29023	29030	25 %	25 %	0 %	50 %	410683939
89	NC_017558	AGGA	2	8	30152	30159	50 %	0 %	50 %	0 %	410683941
90	NC_017558	ACTG	2	8	30290	30297	25 %	25 %	25 %	25 %	410683941
91	NC_017558	ATTC	2	8	30699	30706	25 %	50 %	0 %	25 %	410683942
92	NC_017558	GCAA	2	8	30760	30767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017558	CGAC	2	8	31021	31028	25 %	0 %	25 %	50 %	410683943
94	NC_017558	CTCA	2	8	31307	31314	25 %	25 %	0 %	50 %	410683943
95	NC_017558	CGGC	2	8	31427	31434	0 %	0 %	50 %	50 %	410683943
96	NC_017558	CTCG	2	8	31508	31515	0 %	25 %	25 %	50 %	410683943
97	NC_017558	CAAA	2	8	31588	31595	75 %	0 %	0 %	25 %	410683943
98	NC_017558	GCCG	2	8	32052	32059	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
99	NC_017558	AGCA	2	8	32125	32132	50 %	0 %	25 %	25 %	410683945
100	NC_017558	GACC	2	8	32241	32248	25 %	0 %	25 %	50 %	410683945
101	NC_017558	GGCC	2	8	32334	32341	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
102	NC_017558	CGGC	2	8	32372	32379	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
103	NC_017558	CATC	2	8	32433	32440	25 %	25 %	0 %	50 %	410683945
104	NC_017558	GCCG	2	8	32829	32836	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
105	NC_017558	CGGC	2	8	32856	32863	0 %	0 %	50 %	50 %	410683945
106	NC_017558	TCAG	2	8	32943	32950	25 %	25 %	25 %	25 %	410683945
107	NC_017558	GAAG	2	8	32952	32959	50 %	0 %	50 %	0 %	410683945
108	NC_017558	ACGA	2	8	32984	32991	50 %	0 %	25 %	25 %	410683945
109	NC_017558	CCGA	2	8	33323	33330	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017558	CCCG	2	8	33528	33535	0 %	0 %	25 %	75 %	410683946
111	NC_017558	AGCA	2	8	33552	33559	50 %	0 %	25 %	25 %	410683946
112	NC_017558	GCCG	2	8	33699	33706	0 %	0 %	50 %	50 %	410683946
113	NC_017558	CGTG	2	8	33741	33748	0 %	25 %	50 %	25 %	410683946
114	NC_017558	GCGA	2	8	34048	34055	25 %	0 %	50 %	25 %	410683946
115	NC_017558	CTGC	2	8	34142	34149	0 %	25 %	25 %	50 %	410683946
116	NC_017558	CCCG	2	8	34923	34930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.