MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq203

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017092	GCC	2	6	52	57	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017092	GAG	2	6	100	105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017092	GTT	2	6	138	143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017092	TCT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192419
5	NC_017092	GGA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192419
6	NC_017092	ATC	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192419
7	NC_017092	CTG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192419
8	NC_017092	TGG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017092	TGT	2	6	765	770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017092	GGC	2	6	859	864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017092	AGC	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017092	CCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017092	CCG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017092	ATT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017092	CGC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017092	GCC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017092	CCA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192420
18	NC_017092	CCT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192420
19	NC_017092	CTG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192420
20	NC_017092	AAC	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192420
21	NC_017092	TAA	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192420
22	NC_017092	AGT	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017092	TAA	2	6	1965	1970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017092	GAA	2	6	1975	1980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017092	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017092	GTT	3	9	4123	4131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192421
27	NC_017092	TCA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
28	NC_017092	AGA	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192421
29	NC_017092	ATC	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
30	NC_017092	TCA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
31	NC_017092	ATA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192421
32	NC_017092	ATA	2	6	4812	4817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192421
33	NC_017092	TCT	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192422
34	NC_017092	TCT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192422
35	NC_017092	AAC	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192422
36	NC_017092	GGA	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192422
37	NC_017092	CAT	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
38	NC_017092	GTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192422
39	NC_017092	AAT	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192422
40	NC_017092	CAT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
41	NC_017092	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192422
42	NC_017092	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
43	NC_017092	GAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192422
44	NC_017092	CAT	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
45	NC_017092	CCT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192422
46	NC_017092	ACA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192422
47	NC_017092	AGA	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192423
48	NC_017092	CAC	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192423
49	NC_017092	ACC	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192423
50	NC_017092	ATT	2	6	6084	6089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
51	NC_017092	TGA	3	9	6207	6215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192423
52	NC_017092	ACA	2	6	6306	6311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192423
53	NC_017092	TTG	2	6	6318	6323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192423
54	NC_017092	TGG	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192423
55	NC_017092	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
56	NC_017092	TAT	2	6	6362	6367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
57	NC_017092	TGC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192423
58	NC_017092	GAT	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192423
59	NC_017092	TTG	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017092	ATA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017092	ATT	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017092	CGC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192424
63	NC_017092	ATC	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192424
64	NC_017092	CAT	2	6	7555	7560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017092	TCA	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017092	TTC	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017092	GCT	2	6	7711	7716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192425
68	NC_017092	CGC	2	6	7746	7751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
69	NC_017092	CGC	2	6	7809	7814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
70	NC_017092	GCC	3	9	7819	7827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
71	NC_017092	ATC	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192425
72	NC_017092	ACC	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192425
73	NC_017092	TTG	2	6	7913	7918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017092	CGC	2	6	8081	8086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017092	CGC	2	6	8182	8187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192426
76	NC_017092	CAC	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192426
77	NC_017092	CCT	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192426
78	NC_017092	TGA	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192426
79	NC_017092	ACG	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192426
80	NC_017092	TTC	2	6	8328	8333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192426
81	NC_017092	CCG	2	6	8345	8350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192426

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.