MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 2790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017066	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383751990
2	NC_017066	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383751990
3	NC_017066	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	383751992
4	NC_017066	TA	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	383751992
5	NC_017066	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	383751993
6	NC_017066	TC	3	6	3294	3299	0 %	50 %	0 %	50 %	383751994
7	NC_017066	GA	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	383751994
8	NC_017066	AT	4	8	3914	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
9	NC_017066	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
10	NC_017066	GA	3	6	4244	4249	50 %	0 %	50 %	0 %	383751994
11	NC_017066	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
12	NC_017066	AT	3	6	4775	4780	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
13	NC_017066	AT	3	6	5788	5793	50 %	50 %	0 %	0 %	383751994
14	NC_017066	TA	3	6	5952	5957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017066	TC	3	6	6565	6570	0 %	50 %	0 %	50 %	383751995
16	NC_017066	GA	3	6	7018	7023	50 %	0 %	50 %	0 %	383751996
17	NC_017066	AT	3	6	7353	7358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017066	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	383751997
19	NC_017066	TA	3	6	8503	8508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017066	TG	3	6	8680	8685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017066	TA	3	6	8928	8933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017066	TA	4	8	8983	8990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017066	TG	3	6	9502	9507	0 %	50 %	50 %	0 %	383751998
24	NC_017066	AT	3	6	10562	10567	50 %	50 %	0 %	0 %	383751999
25	NC_017066	AT	4	8	11627	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	383752000
26	NC_017066	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	383752000
27	NC_017066	AT	3	6	12047	12052	50 %	50 %	0 %	0 %	383752001
28	NC_017066	TA	3	6	12424	12429	50 %	50 %	0 %	0 %	383752001
29	NC_017066	CT	3	6	12515	12520	0 %	50 %	0 %	50 %	383752001
30	NC_017066	TA	3	6	13112	13117	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
31	NC_017066	AT	3	6	13494	13499	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
32	NC_017066	TA	4	8	13886	13893	50 %	50 %	0 %	0 %	383752002
33	NC_017066	TC	3	6	13991	13996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017066	AT	3	6	14063	14068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017066	AT	3	6	14556	14561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017066	AT	3	6	14597	14602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017066	TA	4	8	17671	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	383752003
38	NC_017066	AT	3	6	17730	17735	50 %	50 %	0 %	0 %	383752003
39	NC_017066	AT	3	6	18140	18145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017066	TA	4	8	18652	18659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017066	AT	3	6	19235	19240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017066	AT	3	6	19733	19738	50 %	50 %	0 %	0 %	383752004
43	NC_017066	TA	4	8	20110	20117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_017066	AT	3	6	21342	21347	50 %	50 %	0 %	0 %	383752006
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54	NC_017066	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	383752007
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65	NC_017066	TA	3	6	28097	28102	50 %	50 %	0 %	0 %	383752013
66	NC_017066	AT	3	6	28454	28459	50 %	50 %	0 %	0 %	383752014
67	NC_017066	TA	3	6	29325	29330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_017066	AT	3	6	31884	31889	50 %	50 %	0 %	0 %	383752015
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73	NC_017066	TA	3	6	32904	32909	50 %	50 %	0 %	0 %	383752015
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104	NC_017066	AT	3	6	46557	46562	50 %	50 %	0 %	0 %	383752020
105	NC_017066	TA	3	6	47085	47090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_017066	AT	3	6	48965	48970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017066	AT	3	6	49529	49534	50 %	50 %	0 %	0 %	383752024
111	NC_017066	TA	3	6	49593	49598	50 %	50 %	0 %	0 %	383752024
112	NC_017066	AT	3	6	49784	49789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017066	TA	3	6	49871	49876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017066	AT	4	8	50627	50634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017066	AT	3	6	50841	50846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_017066	TA	3	6	54949	54954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_017066	AT	3	6	56263	56268	50 %	50 %	0 %	0 %	383752030
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141	NC_017066	TA	3	6	61679	61684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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